261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4157 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4157  cellulose-binding family II  100 
 
 		 719 aa  1417    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.894149  normal  0.131999 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4289  cellulose-binding family II  47.13 
 
 		 699 aa  567  1e-160  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00315108 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2048  cellulose-binding family II  41.13 
 
 		 679 aa  480  1e-134  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6640  cellulose-binding family II  41.22 
 
 		 727 aa  452  1.0000000000000001e-126  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0877502 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0048  Alpha-L-arabinofuranosidase-like protein  40.85 
 
 		 959 aa  311  2e-83  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6262  Alpha-L-arabinofuranosidase-like protein  31.89 
 
 		 483 aa  205  3e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.219739 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3118  Alpha-L-arabinofuranosidase-like protein  30.89 
 
 		 818 aa  177  8e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.222033  normal  0.0458046 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1627  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  39.81 
 
 		 998 aa  121  3.9999999999999996e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.234171  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2176  endoglucanase  40.55 
 
 		 880 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0658592  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0935  hypothetical protein  40.3 
 
 		 847 aa  118  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.619972  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2792  cellulose-binding family II  35.49 
 
 		 681 aa  114  7.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1665  cellulose-binding family II protein  38.57 
 
 		 438 aa  109  2e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.862652  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1830  glycoside hydrolase family 5  41.01 
 
 		 543 aa  108  5e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1822  chitin-binding domain 3 protein  39.65 
 
 		 429 aa  105  4e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.309738  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6973  cellulose-binding family II  30.39 
 
 		 1007 aa  104  6e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2684  glycoside hydrolase family protein  35.92 
 
 		 658 aa  103  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.954713  normal  0.0577257 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0016  glycoside hydrolase family 9  54.29 
 
 		 990 aa  103  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.114686  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1791  cellulose-binding family II  49.54 
 
 		 913 aa  102  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.381117  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2912  1, 4-beta cellobiohydrolase  53.27 
 
 		 491 aa  100  8e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.426935 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2913  1, 4-beta cellobiohydrolase  51.46 
 
 		 469 aa  99.8  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.489381  normal  0.473063 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6974  cellulose-binding family II  41.31 
 
 		 938 aa  97.8  7e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2492  endo-1,4-beta-glucanase/xyloglucanase, putative, gly74A  39.8 
 
 		 978 aa  96.3  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0351052  normal  0.027518 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0936  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  48.08 
 
 		 979 aa  96.3  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4881  glycoside hydrolase family 6  36.23 
 
 		 743 aa  94.4  7e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6685  cellulose-binding family II  50 
 
 		 533 aa  93.2  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.713256 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3563  glycoside hydrolase family 9  49.06 
 
 		 775 aa  93.6  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2191  glycoside hydrolase family 6  46.73 
 
 		 605 aa  93.2  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4962  glycoside hydrolase family 10  48.08 
 
 		 778 aa  92  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.59486 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4957  cellulose-binding family II  30.85 
 
 		 688 aa  91.7  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0505986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3603  cellulose-binding family II  36.62 
 
 		 460 aa  91.7  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.131796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0324  cellulose-binding family II protein  42.06 
 
 		 694 aa  91.3  5e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3105  glycoside hydrolase family 48  47.66 
 
 		 854 aa  91.3  6e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0252708  hitchhiker  0.000502295 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4214  glycoside hydrolase family 5  40.57 
 
 		 608 aa  91.3  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.303504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0970  glycoside hydrolase family protein  48.11 
 
 		 894 aa  90.9  8e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.184783 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6890  cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  44.86 
 
 		 767 aa  90.1  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2167  glycoside hydrolase family 48  46.15 
 
 		 974 aa  89.7  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.185965  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0905  glycoside hydrolase family 10  45.79 
 
 		 690 aa  89.7  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.506442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3983  glycoside hydrolase family protein  43.93 
 
 		 589 aa  89.7  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.000432599  normal  0.0119912 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1896  1, 4-beta cellobiohydrolase  46.23 
 
 		 646 aa  88.6  3e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.776414 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0923  cellulose-binding family II  45.45 
 
 		 746 aa  88.6  4e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0984309 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0294  cellulose-binding family II protein  41.41 
 
 		 609 aa  88.2  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.558691  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2656  family 6 glycoside hydrolase  42.72 
 
 		 611 aa  88.2  5e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3043  cellulose-binding family II  46.15 
 
 		 774 aa  87.8  6e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0735  glycoside hydrolase family 6  45.71 
 
 		 623 aa  87.4  8e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0698323  normal  0.806764 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3959  esterase, PHB depolymerase family  45.45 
 
 		 423 aa  87.4  9e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5339  glycoside hydrolase family 9  42.34 
 
 		 875 aa  87  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2923  xylanase  43.81 
 
 		 491 aa  86.3  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3602  glycoside hydrolase family protein  41.12 
 
 		 620 aa  86.3  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.438732 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1868  cellulose-binding family II  43.93 
 
 		 744 aa  85.9  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0731  cellulose-binding family II  46.23 
 
 		 934 aa  86.3  0.000000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1559  family 62 glycoside hydrolase  45.45 
 
 		 488 aa  85.5  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.622478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5296  hypothetical protein  34.43 
 
 		 385 aa  85.5  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.713748 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0474  glycoside hydrolase family 11  45.79 
 
 		 494 aa  85.5  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2728  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  45.69 
 
 		 499 aa  85.5  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0684443  normal  0.907122 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1134  glycoside hydrolase family 48  45.71 
 
 		 842 aa  84.7  0.000000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5562  cellulose-binding family II  43.4 
 
 		 906 aa  84.3  0.000000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.655446 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2022  cellulose-binding family II  44.66 
 
 		 743 aa  84.3  0.000000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.12733 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2788  cellulose-binding family II protein  43.4 
 
 		 364 aa  84  0.000000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.700875  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3215  glycoside hydrolase family 6  46.15 
 
 		 438 aa  83.6  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1612  cellulose-binding family II protein  47.27 
 
 		 925 aa  83.6  0.00000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1666  cellulose-binding family II protein  42.45 
 
 		 455 aa  84  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000449243  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2509  esterase, PHB depolymerase family  43.27 
 
 		 489 aa  83.6  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.821888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0620  cellobiohydrolase  47.57 
 
 		 596 aa  83.2  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.250178  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0352  family 12 glycoside hydrolase  47.57 
 
 		 393 aa  83.2  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2166  Cellulase  47.17 
 
 		 465 aa  82.8  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1897  glycoside hydrolase family 5  48.57 
 
 		 597 aa  82.4  0.00000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.754177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1959  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  40.74 
 
 		 984 aa  82  0.00000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2138  family 48 glycoside hydrolase  42.74 
 
 		 785 aa  81.3  0.00000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.497206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3435  glycoside hydrolase family 9  36.36 
 
 		 794 aa  81.3  0.00000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.019722  normal  0.0493729 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0780  PHB depolymerase family esterase  42.45 
 
 		 436 aa  80.9  0.00000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3462  cellulose-binding family II protein  40.38 
 
 		 773 aa  80.9  0.00000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0281342  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0295  glycoside hydrolase family protein  42.73 
 
 		 854 aa  80.5  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.271703  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4805  glycoside hydrolase family protein  40.38 
 
 		 628 aa  79.3  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2729  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  39.81 
 
 		 479 aa  78.6  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.400956  normal  0.406938 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3604  glycoside hydrolase family 48  39.67 
 
 		 973 aa  78.6  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0934  putative secreted beta-mannosidase  35.48 
 
 		 523 aa  78.6  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0660492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  43.12 
 
 		 846 aa  79  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3146  glycoside hydrolase family 6  44.66 
 
 		 459 aa  79  0.0000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2781  glycoside hydrolase family 5  40.5 
 
 		 681 aa  78.6  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.183868  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4027  Alpha-L-arabinofuranosidase-like protein  29.36 
 
 		 704 aa  78.6  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4558  glycoside hydrolase family 9  39.09 
 
 		 864 aa  78.2  0.0000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4286  chitin-binding domain 3 protein  47.25 
 
 		 347 aa  78.2  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.074311 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3179  alpha-L-arabinofuranosidase-like protein  28.29 
 
 		 704 aa  78.2  0.0000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.784382  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3718  cellulose-binding family II  43.27 
 
 		 525 aa  78.2  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.154432 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2372  cellulose-binding family II protein  41.75 
 
 		 842 aa  77.8  0.0000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0538  glycoside hydrolase family 6  44.34 
 
 		 446 aa  77.4  0.0000000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.448554 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2646  glycoside hydrolase family protein  40 
 
 		 812 aa  77.4  0.0000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00270036  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2009  cellulose-binding family II protein  38.94 
 
 		 669 aa  77  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.872108  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3461  cellulose-binding family II protein  38.46 
 
 		 486 aa  76.6  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560967  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2071  alpha-L-arabinofuranosidase-like protein  25 
 
 		 535 aa  77.4  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1493  cellulose-binding domain-containing protein  39.42 
 
 		 1055 aa  76.3  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.498527  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3495  cellulose-binding family II  43.12 
 
 		 495 aa  76.3  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0734  glycoside hydrolase family 5  42.06 
 
 		 580 aa  76.3  0.000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0560838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1701  glycoside hydrolase family protein  32.42 
 
 		 1137 aa  75.9  0.000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102428 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2136  glycoside hydrolase family protein  39.09 
 
 		 1128 aa  76.3  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2745  cellulose-binding family II  43.52 
 
 		 376 aa  76.3  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.851755 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3591  esterase, PHB depolymerase family  39.42 
 
 		 518 aa  75.9  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.229813  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3024  glycoside hydrolase family 62  47.17 
 
 		 829 aa  75.5  0.000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2957  glycoside hydrolase family protein  42.72 
 
 		 966 aa  75.5  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0179  cellulose-binding family II  44.21 
 
 		 598 aa  75.5  0.000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00318302 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>