97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5217 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5217  Alpha-N-arabinofuranosidase  100 
 
 		 534 aa  1113    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0656  Alpha-N-arabinofuranosidase  37.94 
 
 		 484 aa  298  1e-79  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0631  Alpha-N-arabinofuranosidase  37.73 
 
 		 484 aa  297  4e-79  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01277  Alpha-arabinofuranosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5BDV3]  35.77 
 
 		 504 aa  297  4e-79  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.779703  normal  0.226736 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0598  Alpha-N-arabinofuranosidase  33.67 
 
 		 501 aa  266  5.999999999999999e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.832453 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3514  Alpha-N-arabinofuranosidase  34.18 
 
 		 499 aa  266  1e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0643096  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1169  Alpha-N-arabinofuranosidase  33.27 
 
 		 499 aa  260  5.0000000000000005e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.940985  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1221  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  35.2 
 
 		 502 aa  252  1e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1735  Alpha-N-arabinofuranosidase  33.46 
 
 		 514 aa  248  1e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00576907  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1817  Alpha-N-arabinofuranosidase  30.51 
 
 		 548 aa  247  3e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.68893 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5890  Alpha-N-arabinofuranosidase  35.02 
 
 		 502 aa  246  6e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00030  Alpha-L-arabinofuranosidase, putative  34.35 
 
 		 543 aa  246  9e-64  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6803  Alpha-N-arabinofuranosidase  33.48 
 
 		 502 aa  244  3e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.905258 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3457  Alpha-N-arabinofuranosidase  31.72 
 
 		 506 aa  239  1e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.467334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2725  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  34.08 
 
 		 502 aa  236  1.0000000000000001e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6250  Alpha-N-arabinofuranosidase  32.85 
 
 		 493 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.522312 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4317  Alpha-N-arabinofuranosidase  30.53 
 
 		 504 aa  232  1e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.341945  hitchhiker  0.00470977 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5707  alpha-L-arabinofuranosidase  31.56 
 
 		 507 aa  231  2e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.190024  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2712  Alpha-N-arabinofuranosidase  32.24 
 
 		 502 aa  231  2e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5583  Alpha-N-arabinofuranosidase  30.74 
 
 		 502 aa  231  3e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.759858  normal  0.105411 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1103  Alpha-N-arabinofuranosidase  31.68 
 
 		 505 aa  231  3e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2894  Alpha-N-arabinofuranosidase  31.52 
 
 		 501 aa  227  5.0000000000000005e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0121186  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0755  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  30.2 
 
 		 507 aa  224  3e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.426486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0202  alpha-L-arabinofuranosidase domain-containing protein  30.48 
 
 		 505 aa  224  4e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.957662  normal  0.0476441 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4470  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  30.02 
 
 		 501 aa  219  7e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0994522  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2548  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.38 
 
 		 503 aa  219  1e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0515  Alpha-N-arabinofuranosidase  30.38 
 
 		 507 aa  218  2e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000302906  hitchhiker  0.000750208 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2206  Alpha-N-arabinofuranosidase  33.47 
 
 		 510 aa  217  5e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0226  Alpha-N-arabinofuranosidase  31.33 
 
 		 515 aa  216  9.999999999999999e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29300  alpha-L-arabinofuranosidase  30.63 
 
 		 506 aa  211  3e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3225  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.88 
 
 		 511 aa  209  8e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.111219  normal  0.134636 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3261  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.82 
 
 		 501 aa  206  1e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.232195 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05510  alpha-L-arabinofuranosidase  31.93 
 
 		 527 aa  204  3e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.594598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0412  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.89 
 
 		 504 aa  203  6e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.47991  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1036  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  29.03 
 
 		 501 aa  202  9.999999999999999e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0176098  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2575  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.49 
 
 		 512 aa  202  1.9999999999999998e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0383  Alpha-N-arabinofuranosidase  30.29 
 
 		 511 aa  200  7e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07120  alpha-L-arabinofuranosidase  29.71 
 
 		 525 aa  199  1.0000000000000001e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.580236 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1374  Alpha-N-arabinofuranosidase  31.03 
 
 		 526 aa  197  4.0000000000000005e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.056945  normal  0.97386 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1152  Alpha-N-arabinofuranosidase  30.1 
 
 		 503 aa  196  8.000000000000001e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.737895  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1255  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  30.82 
 
 		 492 aa  196  1e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.596115  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2727  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  31.78 
 
 		 505 aa  196  1e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1118  Alpha-N-arabinofuranosidase  30.83 
 
 		 514 aa  195  2e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2485  alpha-N-arabinofuranosidase  30.79 
 
 		 448 aa  192  9e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0107043 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1930  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.7 
 
 		 500 aa  191  2.9999999999999997e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00284341  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1237  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  29.86 
 
 		 513 aa  189  1e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.120274 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0195  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.58 
 
 		 508 aa  188  2e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11700  alpha-L-arabinofuranosidase  32.28 
 
 		 552 aa  188  2e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.368447  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3612  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.83 
 
 		 521 aa  187  4e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.102736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3567  Alpha-N-arabinofuranosidase  30.25 
 
 		 535 aa  186  8e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0163066 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0475  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.74 
 
 		 525 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.726573  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2782  Alpha-N-arabinofuranosidase  30.97 
 
 		 507 aa  186  1.0000000000000001e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0924  alpha-L-arabinofuranosidase  28.76 
 
 		 566 aa  184  3e-45  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2249  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  30.74 
 
 		 512 aa  184  5.0000000000000004e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.957203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1339  alpha-L-arabinofuranosidase  29.13 
 
 		 515 aa  183  7e-45  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2415  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.34 
 
 		 529 aa  182  1e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.265353 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3590  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.3 
 
 		 507 aa  182  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.497097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29290  alpha-L-arabinofuranosidase  30.53 
 
 		 551 aa  179  1e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.303495  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1739  alpha-L-arabinofuranosidase  29.39 
 
 		 522 aa  177  3e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02260  alpha-N-arabinofuranosidase 2  28.95 
 
 		 505 aa  177  4e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1767  NADH:ubiquinone oxidoreductase, Na(+)-translocating, D subunit  31.04 
 
 		 534 aa  177  6e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000390302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1037  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.79 
 
 		 503 aa  173  5.999999999999999e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.400006 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3528  Alpha-N-arabinofuranosidase  31.3 
 
 		 509 aa  172  1e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.841612 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0328  Alpha-L-arabinofuranosidase  28.72 
 
 		 551 aa  171  2e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.48322  normal  0.88573 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0753  Alpha-L-arabinofuranosidase  28.62 
 
 		 526 aa  169  1e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.406878  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0065  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.94 
 
 		 510 aa  167  2.9999999999999998e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0364  Alpha-N-arabinofuranosidase  31.08 
 
 		 506 aa  167  5e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0181  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.9 
 
 		 549 aa  166  1.0000000000000001e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0962  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.9 
 
 		 515 aa  165  2.0000000000000002e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0436846  decreased coverage  0.00620003 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4336  Alpha-N-arabinofuranosidase  30.92 
 
 		 662 aa  163  6e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0504519  normal  0.752707 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0890  Alpha-L-arabinofuranosidase  30.29 
 
 		 508 aa  160  4e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.751997  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1521  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.76 
 
 		 778 aa  143  9e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.272039  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4460  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  37.07 
 
 		 732 aa  142  9.999999999999999e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.551805  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3208  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.9 
 
 		 703 aa  125  2e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.276113 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3212  Alpha-N-arabinofuranosidase  32.44 
 
 		 684 aa  112  2.0000000000000002e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.968996  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4495  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  32.08 
 
 		 772 aa  109  1e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.183163  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2410  Alpha-N-arabinofuranosidase  24.15 
 
 		 691 aa  102  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00000000106036  normal  0.27509 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3179  alpha-L-arabinofuranosidase-like protein  31.82 
 
 		 704 aa  84  0.000000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.784382  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4027  Alpha-L-arabinofuranosidase-like protein  27.78 
 
 		 704 aa  80.5  0.00000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0633  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.02 
 
 		 644 aa  79.3  0.0000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0658  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.02 
 
 		 634 aa  79.3  0.0000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1739  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.09 
 
 		 824 aa  73.6  0.000000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0331952  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3113  Alpha-N-arabinofuranosidase  21.51 
 
 		 661 aa  73.6  0.000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0048  Alpha-L-arabinofuranosidase-like protein  22.14 
 
 		 959 aa  72  0.00000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2048  cellulose-binding family II  22.83 
 
 		 679 aa  69.7  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0330  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.75 
 
 		 663 aa  68.6  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.142488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4289  cellulose-binding family II  24.78 
 
 		 699 aa  68.6  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00315108 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0895  alpha-L-arabinofuranosidase  22.1 
 
 		 732 aa  66.2  0.000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5739  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  28.57 
 
 		 855 aa  66.2  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.393547  normal  0.654215 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1541  alpha-L-arabinofuranosidase  28 
 
 		 821 aa  64.3  0.000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1857  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.04 
 
 		 826 aa  63.5  0.000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3118  Alpha-L-arabinofuranosidase-like protein  24.17 
 
 		 818 aa  63.2  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.222033  normal  0.0458046 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6262  Alpha-L-arabinofuranosidase-like protein  23.48 
 
 		 483 aa  61.2  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.219739 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4945  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  25.71 
 
 		 660 aa  52.8  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.142964  normal  0.295957 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2071  alpha-L-arabinofuranosidase-like protein  22.84 
 
 		 535 aa  51.6  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4157  cellulose-binding family II  22.18 
 
 		 719 aa  48.9  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.894149  normal  0.131999 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1170  carbohydrate-binding CenC domain-containing protein  25 
 
 		 693 aa  46.6  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000394833  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>