96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_05510 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_05510  alpha-L-arabinofuranosidase  100 
 
 		 527 aa  1078    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.594598  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0755  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  56 
 
 		 507 aa  531  1e-149  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.426486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0515  Alpha-N-arabinofuranosidase  53.73 
 
 		 507 aa  528  1e-148  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000302906  hitchhiker  0.000750208 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0202  alpha-L-arabinofuranosidase domain-containing protein  54.29 
 
 		 505 aa  525  1e-148  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.957662  normal  0.0476441 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0412  Alpha-N-arabinofuranosidase  53.75 
 
 		 504 aa  526  1e-148  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.47991  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29300  alpha-L-arabinofuranosidase  54.17 
 
 		 506 aa  520  1e-146  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07120  alpha-L-arabinofuranosidase  58.85 
 
 		 525 aa  515  1.0000000000000001e-145  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.580236 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3261  Alpha-N-arabinofuranosidase  54.89 
 
 		 501 aa  513  1e-144  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.232195 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4317  Alpha-N-arabinofuranosidase  53.19 
 
 		 504 aa  514  1e-144  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.341945  hitchhiker  0.00470977 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3590  Alpha-N-arabinofuranosidase  53.08 
 
 		 507 aa  506  9.999999999999999e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.497097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2894  Alpha-N-arabinofuranosidase  50.5 
 
 		 501 aa  505  9.999999999999999e-143  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0121186  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1037  Alpha-N-arabinofuranosidase  53.09 
 
 		 503 aa  505  9.999999999999999e-143  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.400006 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2485  alpha-N-arabinofuranosidase  59.42 
 
 		 448 aa  503  1e-141  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0107043 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1930  Alpha-N-arabinofuranosidase  55.34 
 
 		 500 aa  501  1e-141  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00284341  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0383  Alpha-N-arabinofuranosidase  52.05 
 
 		 511 aa  499  1e-140  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2548  Alpha-N-arabinofuranosidase  48.42 
 
 		 503 aa  496  1e-139  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0226  Alpha-N-arabinofuranosidase  55.11 
 
 		 515 aa  493  9.999999999999999e-139  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2725  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  53.78 
 
 		 502 aa  487  1e-136  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2575  Alpha-N-arabinofuranosidase  52.51 
 
 		 512 aa  484  1e-135  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1339  alpha-L-arabinofuranosidase  50.38 
 
 		 515 aa  479  1e-134  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0195  Alpha-N-arabinofuranosidase  52.88 
 
 		 508 aa  478  1e-133  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1739  alpha-L-arabinofuranosidase  50.38 
 
 		 522 aa  478  1e-133  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3457  Alpha-N-arabinofuranosidase  48.37 
 
 		 506 aa  473  1e-132  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.467334  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5707  alpha-L-arabinofuranosidase  50.1 
 
 		 507 aa  470  1.0000000000000001e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.190024  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1221  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  47.82 
 
 		 502 aa  469  1.0000000000000001e-131  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2712  Alpha-N-arabinofuranosidase  46.94 
 
 		 502 aa  467  9.999999999999999e-131  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6803  Alpha-N-arabinofuranosidase  46.86 
 
 		 502 aa  465  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.905258 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2206  Alpha-N-arabinofuranosidase  52.97 
 
 		 510 aa  468  9.999999999999999e-131  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5890  Alpha-N-arabinofuranosidase  46.47 
 
 		 502 aa  463  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1169  Alpha-N-arabinofuranosidase  46.85 
 
 		 499 aa  461  9.999999999999999e-129  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.940985  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1735  Alpha-N-arabinofuranosidase  46.11 
 
 		 514 aa  455  1.0000000000000001e-126  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00576907  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5583  Alpha-N-arabinofuranosidase  48.41 
 
 		 502 aa  451  1e-125  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.759858  normal  0.105411 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0924  alpha-L-arabinofuranosidase  46.47 
 
 		 566 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1103  Alpha-N-arabinofuranosidase  44.25 
 
 		 505 aa  442  1e-123  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0598  Alpha-N-arabinofuranosidase  46.55 
 
 		 501 aa  391  1e-107  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.832453 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3514  Alpha-N-arabinofuranosidase  45.62 
 
 		 499 aa  386  1e-106  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0643096  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1817  Alpha-N-arabinofuranosidase  41.18 
 
 		 548 aa  372  1e-101  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.68893 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1036  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  40.83 
 
 		 501 aa  368  1e-100  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0176098  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01277  Alpha-arabinofuranosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5BDV3]  37.24 
 
 		 504 aa  263  4.999999999999999e-69  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.779703  normal  0.226736 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0631  Alpha-N-arabinofuranosidase  37.78 
 
 		 484 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0656  Alpha-N-arabinofuranosidase  37.78 
 
 		 484 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH00030  Alpha-L-arabinofuranosidase, putative  37.19 
 
 		 543 aa  234  4.0000000000000004e-60  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3225  Alpha-N-arabinofuranosidase  31.73 
 
 		 511 aa  226  7e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.111219  normal  0.134636 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6250  Alpha-N-arabinofuranosidase  33.25 
 
 		 493 aa  208  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.522312 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5217  Alpha-N-arabinofuranosidase  31.93 
 
 		 534 aa  204  3e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4470  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  31.77 
 
 		 501 aa  203  5e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0994522  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1152  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.94 
 
 		 503 aa  170  4e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.737895  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1374  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.21 
 
 		 526 aa  169  1e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.056945  normal  0.97386 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1255  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  30.07 
 
 		 492 aa  169  1e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.596115  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0181  Alpha-N-arabinofuranosidase  30.51 
 
 		 549 aa  168  2.9999999999999998e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3612  Alpha-N-arabinofuranosidase  31.06 
 
 		 521 aa  167  4e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.102736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1118  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.41 
 
 		 514 aa  166  8e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1237  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  27.54 
 
 		 513 aa  164  5.0000000000000005e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.120274 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4336  Alpha-N-arabinofuranosidase  32.34 
 
 		 662 aa  157  5.0000000000000005e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0504519  normal  0.752707 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2249  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  28.5 
 
 		 512 aa  153  5.9999999999999996e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.957203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3567  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.85 
 
 		 535 aa  152  2e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0163066 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2727  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  28.71 
 
 		 505 aa  150  7e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1767  NADH:ubiquinone oxidoreductase, Na(+)-translocating, D subunit  29.29 
 
 		 534 aa  148  3e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000390302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2415  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.7 
 
 		 529 aa  147  4.0000000000000006e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.265353 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1521  Alpha-N-arabinofuranosidase  34.72 
 
 		 778 aa  144  5e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.272039  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4460  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  37.82 
 
 		 732 aa  143  8e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.551805  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0065  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.96 
 
 		 510 aa  142  1.9999999999999998e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0753  Alpha-L-arabinofuranosidase  26.63 
 
 		 526 aa  141  3e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.406878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0475  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.62 
 
 		 525 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.726573  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29290  alpha-L-arabinofuranosidase  29.13 
 
 		 551 aa  140  3.9999999999999997e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.303495  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2410  Alpha-N-arabinofuranosidase  32.04 
 
 		 691 aa  138  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00000000106036  normal  0.27509 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02260  alpha-N-arabinofuranosidase 2  26.32 
 
 		 505 aa  139  2e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0962  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.78 
 
 		 515 aa  137  7.000000000000001e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0436846  decreased coverage  0.00620003 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2782  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.07 
 
 		 507 aa  135  1.9999999999999998e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11700  alpha-L-arabinofuranosidase  28.91 
 
 		 552 aa  134  3e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.368447  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3528  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.9 
 
 		 509 aa  130  5.0000000000000004e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.841612 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3208  Alpha-N-arabinofuranosidase  36.65 
 
 		 703 aa  129  1.0000000000000001e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.276113 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0364  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.96 
 
 		 506 aa  121  3.9999999999999996e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0328  Alpha-L-arabinofuranosidase  24.77 
 
 		 551 aa  119  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.48322  normal  0.88573 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4495  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  34.26 
 
 		 772 aa  118  1.9999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.183163  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0890  Alpha-L-arabinofuranosidase  26.16 
 
 		 508 aa  106  8e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.751997  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4027  Alpha-L-arabinofuranosidase-like protein  27.37 
 
 		 704 aa  99.4  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3179  alpha-L-arabinofuranosidase-like protein  27.88 
 
 		 704 aa  87.8  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.784382  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3212  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.31 
 
 		 684 aa  83.2  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.968996  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2048  cellulose-binding family II  27.41 
 
 		 679 aa  78.2  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1857  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.44 
 
 		 826 aa  70.9  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4289  cellulose-binding family II  28.51 
 
 		 699 aa  68.6  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00315108 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0330  Alpha-N-arabinofuranosidase  30.52 
 
 		 663 aa  65.9  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.142488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4945  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  30.57 
 
 		 660 aa  65.1  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.142964  normal  0.295957 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5739  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  27.92 
 
 		 855 aa  62.8  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.393547  normal  0.654215 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3113  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.58 
 
 		 661 aa  59.3  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1739  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.27 
 
 		 824 aa  59.3  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0331952  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1789  putative alpha-L-arabinofuranosidase  31.32 
 
 		 550 aa  58.9  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0379328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0633  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.32 
 
 		 644 aa  57.4  0.0000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1170  carbohydrate-binding CenC domain-containing protein  30.59 
 
 		 693 aa  57.4  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000394833  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0658  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.32 
 
 		 634 aa  57.4  0.0000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1541  alpha-L-arabinofuranosidase  25.62 
 
 		 821 aa  56.6  0.000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2071  alpha-L-arabinofuranosidase-like protein  24.12 
 
 		 535 aa  50.1  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3118  Alpha-L-arabinofuranosidase-like protein  26.98 
 
 		 818 aa  49.3  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.222033  normal  0.0458046 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6262  Alpha-L-arabinofuranosidase-like protein  24.4 
 
 		 483 aa  48.1  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.219739 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6365  Alpha-L-arabinofuranosidase-like protein  24.37 
 
 		 579 aa  45.1  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.15975  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>