101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0656 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009486  Tpet_0631  Alpha-N-arabinofuranosidase  99.79 
 
 
484 aa  1001    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0656  Alpha-N-arabinofuranosidase  100 
 
 
484 aa  1003    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01277  Alpha-arabinofuranosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5BDV3]  41.2 
 
 
504 aa  346  5e-94  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.779703  normal  0.226736 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0598  Alpha-N-arabinofuranosidase  36.73 
 
 
501 aa  333  3e-90  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.832453 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3514  Alpha-N-arabinofuranosidase  35.98 
 
 
499 aa  324  2e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0643096  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1817  Alpha-N-arabinofuranosidase  36.27 
 
 
548 aa  322  7e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.68893 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5890  Alpha-N-arabinofuranosidase  34.96 
 
 
502 aa  319  9e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6803  Alpha-N-arabinofuranosidase  35.67 
 
 
502 aa  318  1e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.905258 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0515  Alpha-N-arabinofuranosidase  37.58 
 
 
507 aa  306  4.0000000000000004e-82  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000302906  hitchhiker  0.000750208 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3457  Alpha-N-arabinofuranosidase  34.05 
 
 
506 aa  306  5.0000000000000004e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.467334  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1103  Alpha-N-arabinofuranosidase  36.9 
 
 
505 aa  306  7e-82  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1735  Alpha-N-arabinofuranosidase  35.34 
 
 
514 aa  305  1.0000000000000001e-81  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00576907  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH00030  Alpha-L-arabinofuranosidase, putative  38.59 
 
 
543 aa  301  2e-80  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3261  Alpha-N-arabinofuranosidase  33.33 
 
 
501 aa  301  2e-80  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.232195 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2894  Alpha-N-arabinofuranosidase  36.12 
 
 
501 aa  300  4e-80  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0121186  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07120  alpha-L-arabinofuranosidase  35.29 
 
 
525 aa  300  4e-80  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.580236 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5217  Alpha-N-arabinofuranosidase  37.94 
 
 
534 aa  298  1e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1221  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  35.17 
 
 
502 aa  298  2e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0383  Alpha-N-arabinofuranosidase  35.9 
 
 
511 aa  297  3e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5583  Alpha-N-arabinofuranosidase  35.41 
 
 
502 aa  296  4e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.759858  normal  0.105411 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2725  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  37.9 
 
 
502 aa  296  8e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1169  Alpha-N-arabinofuranosidase  34.96 
 
 
499 aa  294  3e-78  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.940985  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5707  alpha-L-arabinofuranosidase  34.99 
 
 
507 aa  293  4e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.190024  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4470  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  36.66 
 
 
501 aa  292  1e-77  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0994522  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2548  Alpha-N-arabinofuranosidase  40.88 
 
 
503 aa  291  2e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0202  alpha-L-arabinofuranosidase domain-containing protein  34.6 
 
 
505 aa  291  2e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.957662  normal  0.0476441 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2206  Alpha-N-arabinofuranosidase  36.47 
 
 
510 aa  290  3e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4317  Alpha-N-arabinofuranosidase  32.61 
 
 
504 aa  290  4e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.341945  hitchhiker  0.00470977 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2712  Alpha-N-arabinofuranosidase  33.79 
 
 
502 aa  287  2.9999999999999996e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0755  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  34.89 
 
 
507 aa  286  5e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.426486  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0226  Alpha-N-arabinofuranosidase  34.57 
 
 
515 aa  282  1e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29300  alpha-L-arabinofuranosidase  34.66 
 
 
506 aa  281  2e-74  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1036  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  34.32 
 
 
501 aa  279  1e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0176098  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1255  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  36.48 
 
 
492 aa  278  2e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.596115  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0412  Alpha-N-arabinofuranosidase  35.36 
 
 
504 aa  276  5e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.47991  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1739  alpha-L-arabinofuranosidase  34.56 
 
 
522 aa  276  8e-73  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0181  Alpha-N-arabinofuranosidase  32.08 
 
 
549 aa  275  9e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1374  Alpha-N-arabinofuranosidase  34.69 
 
 
526 aa  275  2.0000000000000002e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.056945  normal  0.97386 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2575  Alpha-N-arabinofuranosidase  32.05 
 
 
512 aa  271  1e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2485  alpha-N-arabinofuranosidase  35.2 
 
 
448 aa  271  1e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0107043 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1118  Alpha-N-arabinofuranosidase  33.8 
 
 
514 aa  271  2e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6250  Alpha-N-arabinofuranosidase  34.64 
 
 
493 aa  268  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.522312 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2782  Alpha-N-arabinofuranosidase  34.66 
 
 
507 aa  266  7e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1037  Alpha-N-arabinofuranosidase  32.36 
 
 
503 aa  263  4.999999999999999e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.400006 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3225  Alpha-N-arabinofuranosidase  35.34 
 
 
511 aa  263  6e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.111219  normal  0.134636 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1930  Alpha-N-arabinofuranosidase  33 
 
 
500 aa  263  6e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00284341  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3528  Alpha-N-arabinofuranosidase  34.22 
 
 
509 aa  262  8.999999999999999e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.841612 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3590  Alpha-N-arabinofuranosidase  32.85 
 
 
507 aa  261  2e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.497097  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1152  Alpha-N-arabinofuranosidase  32.82 
 
 
503 aa  260  3e-68  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.737895  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0195  Alpha-N-arabinofuranosidase  34.1 
 
 
508 aa  260  5.0000000000000005e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1237  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  32.47 
 
 
513 aa  257  4e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.120274 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1339  alpha-L-arabinofuranosidase  33.67 
 
 
515 aa  254  3e-66  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0364  Alpha-N-arabinofuranosidase  33.74 
 
 
506 aa  254  3e-66  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0065  Alpha-N-arabinofuranosidase  32.67 
 
 
510 aa  253  4.0000000000000004e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29290  alpha-L-arabinofuranosidase  32.82 
 
 
551 aa  252  1e-65  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.303495  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2727  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  33.12 
 
 
505 aa  251  2e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0924  alpha-L-arabinofuranosidase  33.77 
 
 
566 aa  250  5e-65  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2249  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  32.91 
 
 
512 aa  249  6e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.957203  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0962  Alpha-N-arabinofuranosidase  32.99 
 
 
515 aa  248  1e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0436846  decreased coverage  0.00620003 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3567  Alpha-N-arabinofuranosidase  33.47 
 
 
535 aa  248  2e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0163066 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3612  Alpha-N-arabinofuranosidase  33.33 
 
 
521 aa  246  4.9999999999999997e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.102736  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11700  alpha-L-arabinofuranosidase  32.86 
 
 
552 aa  246  4.9999999999999997e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.368447  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05510  alpha-L-arabinofuranosidase  37.78 
 
 
527 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.594598  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4336  Alpha-N-arabinofuranosidase  35 
 
 
662 aa  243  7e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0504519  normal  0.752707 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1767  NADH:ubiquinone oxidoreductase, Na(+)-translocating, D subunit  32.84 
 
 
534 aa  241  2e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000390302  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0753  Alpha-L-arabinofuranosidase  31.27 
 
 
526 aa  236  5.0000000000000005e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.406878  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2415  Alpha-N-arabinofuranosidase  33.54 
 
 
529 aa  236  9e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.265353 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02260  alpha-N-arabinofuranosidase 2  31.1 
 
 
505 aa  234  2.0000000000000002e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0475  Alpha-N-arabinofuranosidase  31.56 
 
 
525 aa  227  4e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.726573  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0328  Alpha-L-arabinofuranosidase  29.92 
 
 
551 aa  225  1e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.48322  normal  0.88573 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0890  Alpha-L-arabinofuranosidase  28.01 
 
 
508 aa  198  2.0000000000000003e-49  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.751997  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1521  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.06 
 
 
778 aa  186  6e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.272039  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4460  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  28.67 
 
 
732 aa  184  4.0000000000000006e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.551805  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2410  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.66 
 
 
691 aa  171  2e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00000000106036  normal  0.27509 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4495  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  29.09 
 
 
772 aa  155  1e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.183163  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3212  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.14 
 
 
684 aa  154  5e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.968996  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3208  Alpha-N-arabinofuranosidase  35.68 
 
 
703 aa  153  7e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.276113 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3179  alpha-L-arabinofuranosidase-like protein  25 
 
 
704 aa  130  6e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.784382  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4027  Alpha-L-arabinofuranosidase-like protein  24.1 
 
 
704 aa  120  7e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0658  Alpha-N-arabinofuranosidase  22.69 
 
 
634 aa  101  3e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0633  Alpha-N-arabinofuranosidase  22.69 
 
 
644 aa  100  4e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2048  cellulose-binding family II  28.63 
 
 
679 aa  92.4  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4289  cellulose-binding family II  27.98 
 
 
699 aa  90.5  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00315108 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4945  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  23.38 
 
 
660 aa  81.6  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.142964  normal  0.295957 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1739  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.64 
 
 
824 aa  79.7  0.0000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0331952  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1541  alpha-L-arabinofuranosidase  23.96 
 
 
821 aa  77.4  0.0000000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6262  Alpha-L-arabinofuranosidase-like protein  25.19 
 
 
483 aa  75.1  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.219739 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3113  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.09 
 
 
661 aa  74.3  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0048  Alpha-L-arabinofuranosidase-like protein  24.41 
 
 
959 aa  74.3  0.000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5739  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  22.48 
 
 
855 aa  73.9  0.000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.393547  normal  0.654215 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1789  putative alpha-L-arabinofuranosidase  27.45 
 
 
550 aa  72.8  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0379328  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0330  Alpha-N-arabinofuranosidase  19.71 
 
 
663 aa  72.8  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.142488  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1857  Alpha-N-arabinofuranosidase  20.69 
 
 
826 aa  73.2  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3118  Alpha-L-arabinofuranosidase-like protein  25 
 
 
818 aa  72  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.222033  normal  0.0458046 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1170  carbohydrate-binding CenC domain-containing protein  25.56 
 
 
693 aa  66.6  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000394833  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2071  alpha-L-arabinofuranosidase-like protein  22.43 
 
 
535 aa  65.9  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0895  alpha-L-arabinofuranosidase  20.62 
 
 
732 aa  62  0.00000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6365  Alpha-L-arabinofuranosidase-like protein  21.89 
 
 
579 aa  57.4  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.15975  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02541  alpha-arabinofuranosidase (Eurofung)  20.7 
 
 
565 aa  51.6  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6640  cellulose-binding family II  24.75 
 
 
727 aa  48.9  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0877502 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>