64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0895 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_0895  alpha-L-arabinofuranosidase  100 
 
 
732 aa  1518    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4945  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  32.94 
 
 
660 aa  312  2e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.142964  normal  0.295957 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3113  Alpha-N-arabinofuranosidase  31.8 
 
 
661 aa  309  1.0000000000000001e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0330  Alpha-N-arabinofuranosidase  31.84 
 
 
663 aa  276  1.0000000000000001e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.142488  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0658  Alpha-N-arabinofuranosidase  34.35 
 
 
634 aa  267  4e-70  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0633  Alpha-N-arabinofuranosidase  34.35 
 
 
644 aa  267  4e-70  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5739  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  30.32 
 
 
855 aa  261  4e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.393547  normal  0.654215 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1739  Alpha-N-arabinofuranosidase  36.68 
 
 
824 aa  246  9.999999999999999e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0331952  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1541  alpha-L-arabinofuranosidase  32.12 
 
 
821 aa  246  9.999999999999999e-64  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1857  Alpha-N-arabinofuranosidase  34.51 
 
 
826 aa  223  8e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02541  alpha-arabinofuranosidase (Eurofung)  24.64 
 
 
565 aa  83.2  0.00000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3208  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.73 
 
 
703 aa  73.2  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.276113 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3212  Alpha-N-arabinofuranosidase  23.44 
 
 
684 aa  69.7  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.968996  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4470  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  28.83 
 
 
501 aa  68.6  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0994522  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5217  Alpha-N-arabinofuranosidase  22.1 
 
 
534 aa  66.2  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1374  Alpha-N-arabinofuranosidase  21.84 
 
 
526 aa  63.2  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.056945  normal  0.97386 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0631  Alpha-N-arabinofuranosidase  20.43 
 
 
484 aa  62.4  0.00000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0656  Alpha-N-arabinofuranosidase  20.43 
 
 
484 aa  62  0.00000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4495  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  28.1 
 
 
772 aa  62  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.183163  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2249  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  26.06 
 
 
512 aa  61.6  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.957203  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2727  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  26.83 
 
 
505 aa  61.6  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3528  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.27 
 
 
509 aa  60.8  0.00000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.841612 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0065  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.88 
 
 
510 aa  60.8  0.00000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1521  Alpha-N-arabinofuranosidase  31.08 
 
 
778 aa  60.5  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.272039  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1255  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  22.1 
 
 
492 aa  59.7  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.596115  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3514  Alpha-N-arabinofuranosidase  23.37 
 
 
499 aa  59.7  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0643096  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0515  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.61 
 
 
507 aa  60.1  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000302906  hitchhiker  0.000750208 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2782  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.83 
 
 
507 aa  58.9  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2410  Alpha-N-arabinofuranosidase  21.2 
 
 
691 aa  58.9  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00000000106036  normal  0.27509 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6250  Alpha-N-arabinofuranosidase  24.72 
 
 
493 aa  58.5  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.522312 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1118  Alpha-N-arabinofuranosidase  20.51 
 
 
514 aa  57  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3567  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.09 
 
 
535 aa  57  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0163066 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3261  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.99 
 
 
501 aa  56.2  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.232195 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0755  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  26.26 
 
 
507 aa  56.2  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.426486  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1237  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  22 
 
 
513 aa  55.1  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.120274 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29290  alpha-L-arabinofuranosidase  22.61 
 
 
551 aa  55.1  0.000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.303495  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3612  Alpha-N-arabinofuranosidase  21.88 
 
 
521 aa  55.5  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.102736  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0412  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.38 
 
 
504 aa  53.5  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.47991  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1739  alpha-L-arabinofuranosidase  24.85 
 
 
522 aa  53.5  0.00001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0328  Alpha-L-arabinofuranosidase  21.2 
 
 
551 aa  53.5  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.48322  normal  0.88573 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1767  NADH:ubiquinone oxidoreductase, Na(+)-translocating, D subunit  21.53 
 
 
534 aa  52.8  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000390302  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11700  alpha-L-arabinofuranosidase  24.5 
 
 
552 aa  52.8  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.368447  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0598  Alpha-N-arabinofuranosidase  22.19 
 
 
501 aa  53.1  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.832453 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0962  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.11 
 
 
515 aa  52.4  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0436846  decreased coverage  0.00620003 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07120  alpha-L-arabinofuranosidase  25.87 
 
 
525 aa  52.4  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.580236 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3225  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.15 
 
 
511 aa  51.6  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.111219  normal  0.134636 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0475  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.99 
 
 
525 aa  51.2  0.00007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.726573  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1152  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.61 
 
 
503 aa  50.8  0.00009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.737895  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2415  Alpha-N-arabinofuranosidase  22.22 
 
 
529 aa  50.1  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.265353 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2575  Alpha-N-arabinofuranosidase  23.98 
 
 
512 aa  50.1  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4460  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  22.62 
 
 
732 aa  49.7  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.551805  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1339  alpha-L-arabinofuranosidase  25.77 
 
 
515 aa  49.3  0.0002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29300  alpha-L-arabinofuranosidase  23.93 
 
 
506 aa  49.3  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0364  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.61 
 
 
506 aa  47.8  0.0007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2894  Alpha-N-arabinofuranosidase  23.93 
 
 
501 aa  47.4  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0121186  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01277  Alpha-arabinofuranosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5BDV3]  21.51 
 
 
504 aa  46.6  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.779703  normal  0.226736 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2548  Alpha-N-arabinofuranosidase  24.54 
 
 
503 aa  46.6  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6803  Alpha-N-arabinofuranosidase  23.2 
 
 
502 aa  45.4  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.905258 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5707  alpha-L-arabinofuranosidase  22.5 
 
 
507 aa  45.8  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.190024  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0202  alpha-L-arabinofuranosidase domain-containing protein  21.51 
 
 
505 aa  45.4  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.957662  normal  0.0476441 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0226  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.48 
 
 
515 aa  44.7  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5583  Alpha-N-arabinofuranosidase  22.22 
 
 
502 aa  44.7  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.759858  normal  0.105411 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0753  Alpha-L-arabinofuranosidase  19.88 
 
 
526 aa  44.7  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.406878  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5890  Alpha-N-arabinofuranosidase  23.35 
 
 
502 aa  44.7  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>