More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6640 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6640  cellulose-binding family II  100 
 
 		 727 aa  1432    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0877502 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4289  cellulose-binding family II  42.04 
 
 		 699 aa  473  1e-132  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00315108 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4157  cellulose-binding family II  42.84 
 
 		 719 aa  436  1e-121  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.894149  normal  0.131999 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2048  cellulose-binding family II  40.12 
 
 		 679 aa  426  1e-117  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0048  Alpha-L-arabinofuranosidase-like protein  36.06 
 
 		 959 aa  355  1e-96  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3118  Alpha-L-arabinofuranosidase-like protein  35.27 
 
 		 818 aa  239  2e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.222033  normal  0.0458046 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6262  Alpha-L-arabinofuranosidase-like protein  35.84 
 
 		 483 aa  221  5e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.219739 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2176  endoglucanase  52.43 
 
 		 880 aa  179  1e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0658592  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1830  glycoside hydrolase family 5  54.85 
 
 		 543 aa  177  5e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2792  cellulose-binding family II  42.99 
 
 		 681 aa  168  2.9999999999999998e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1627  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  44.39 
 
 		 998 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.234171  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6973  cellulose-binding family II  47.19 
 
 		 1007 aa  166  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4957  cellulose-binding family II  38.11 
 
 		 688 aa  151  5e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0505986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4881  glycoside hydrolase family 6  55.1 
 
 		 743 aa  147  7.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6974  cellulose-binding family II  50.74 
 
 		 938 aa  145  4e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1822  chitin-binding domain 3 protein  51 
 
 		 429 aa  143  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.309738  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2492  endo-1,4-beta-glucanase/xyloglucanase, putative, gly74A  44.71 
 
 		 978 aa  140  8.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0351052  normal  0.027518 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2745  cellulose-binding family II  64.36 
 
 		 376 aa  137  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.851755 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0474  glycoside hydrolase family 11  63.89 
 
 		 494 aa  135  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3563  glycoside hydrolase family 9  63.11 
 
 		 775 aa  135  3.9999999999999996e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0935  hypothetical protein  47.49 
 
 		 847 aa  132  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.619972  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4962  glycoside hydrolase family 10  62.75 
 
 		 778 aa  132  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.59486 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3591  esterase, PHB depolymerase family  63.73 
 
 		 518 aa  130  8.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.229813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4214  glycoside hydrolase family 5  45.55 
 
 		 608 aa  129  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.303504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6682  cellulose-binding family II  63.11 
 
 		 935 aa  128  4.0000000000000003e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.224663  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0352  family 12 glycoside hydrolase  57.84 
 
 		 393 aa  126  1e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1665  cellulose-binding family II protein  40.2 
 
 		 438 aa  125  3e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.862652  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2512  cellulose-binding family II protein  37.75 
 
 		 637 aa  122  3e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1701  glycoside hydrolase family protein  42.03 
 
 		 1137 aa  122  3e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102428 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0780  PHB depolymerase family esterase  52.88 
 
 		 436 aa  121  3.9999999999999996e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3959  esterase, PHB depolymerase family  54.37 
 
 		 423 aa  116  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0933  Beta-1 4-xylanase-like protein  43.33 
 
 		 543 aa  115  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.258206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6890  cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  56.44 
 
 		 767 aa  114  7.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0617  glycoside hydrolase family protein  42.86 
 
 		 1121 aa  114  8.000000000000001e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0413787  hitchhiker  0.00805779 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2684  glycoside hydrolase family protein  43.55 
 
 		 658 aa  113  1.0000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.954713  normal  0.0577257 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6555  glycoside hydrolase family 6  56.73 
 
 		 487 aa  110  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0123763  normal  0.307137 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1959  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  52.43 
 
 		 984 aa  109  1e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2729  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  50.71 
 
 		 479 aa  109  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.400956  normal  0.406938 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5339  glycoside hydrolase family 9  44.66 
 
 		 875 aa  109  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4414  glycoside hydrolase family 10  48.57 
 
 		 487 aa  108  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0936  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  53.92 
 
 		 979 aa  108  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6685  cellulose-binding family II  46.67 
 
 		 533 aa  108  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.713256 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0934  putative secreted beta-mannosidase  40.74 
 
 		 523 aa  107  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0660492  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2509  esterase, PHB depolymerase family  48.08 
 
 		 489 aa  105  3e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.821888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3604  glycoside hydrolase family 48  43.75 
 
 		 973 aa  103  8e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2138  family 48 glycoside hydrolase  45.76 
 
 		 785 aa  103  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.497206  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2449  1, 4-beta cellobiohydrolase  50 
 
 		 590 aa  102  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3983  glycoside hydrolase family protein  48.57 
 
 		 589 aa  102  3e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.000432599  normal  0.0119912 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0295  glycoside hydrolase family protein  49.15 
 
 		 854 aa  101  4e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.271703  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4288  cellulose-binding family II  50.96 
 
 		 420 aa  100  7e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.016596 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0615  glycoside hydrolase family protein  54.74 
 
 		 1209 aa  100  8e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.435681  hitchhiker  0.00420105 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3519  1, 4-beta cellobiohydrolase  46.53 
 
 		 588 aa  100  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3602  glycoside hydrolase family protein  46.09 
 
 		 620 aa  99.8  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.438732 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0616  cellulose-binding family II protein  54.74 
 
 		 763 aa  99  3e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.683683  hitchhiker  0.00244969 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0731  cellulose-binding family II  47.06 
 
 		 934 aa  98.2  4e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3462  cellulose-binding family II protein  46.09 
 
 		 773 aa  97.4  8e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0281342  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3603  cellulose-binding family II  41.41 
 
 		 460 aa  96.7  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.131796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2071  alpha-L-arabinofuranosidase-like protein  25.21 
 
 		 535 aa  96.7  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0620  cellobiohydrolase  47 
 
 		 596 aa  96.7  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.250178  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2957  glycoside hydrolase family protein  47 
 
 		 966 aa  95.9  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3180  glycoside hydrolase family protein  45.54 
 
 		 963 aa  95.9  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000076749 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2136  glycoside hydrolase family protein  47.06 
 
 		 1128 aa  96.3  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0388  PHB depolymerase family esterase  42.57 
 
 		 442 aa  95.5  3e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.140919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1612  cellulose-binding family II protein  46.15 
 
 		 925 aa  94  8e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0294  cellulose-binding family II protein  43.69 
 
 		 609 aa  94  9e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.558691  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0735  glycoside hydrolase family 6  43.27 
 
 		 623 aa  93.6  1e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0698323  normal  0.806764 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0734  glycoside hydrolase family 5  45.71 
 
 		 580 aa  93.2  1e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0560838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0614  glycoside hydrolase family protein  50 
 
 		 562 aa  94  1e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0151906 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0619  cellulose-binding family II protein  53.68 
 
 		 403 aa  94  1e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00682246 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2656  family 6 glycoside hydrolase  43.14 
 
 		 611 aa  92.4  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0016  glycoside hydrolase family 9  45.71 
 
 		 990 aa  93.2  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.114686  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6365  Alpha-L-arabinofuranosidase-like protein  25.25 
 
 		 579 aa  92.8  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.15975  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2139  family 10 glycoside hydrolase  48.48 
 
 		 474 aa  92  3e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5296  hypothetical protein  33.18 
 
 		 385 aa  92.4  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.713748 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2022  cellulose-binding family II  45.1 
 
 		 743 aa  91.7  4e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.12733 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2781  glycoside hydrolase family 5  46.15 
 
 		 681 aa  91.7  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.183868  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0618  cellulose-binding family II protein  55.68 
 
 		 1298 aa  92  4e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0939482  hitchhiker  0.00792989 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2448  glycoside hydrolase family 48  45 
 
 		 894 aa  92  4e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1134  glycoside hydrolase family 48  43.27 
 
 		 842 aa  91.7  4e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3303  glycoside hydrolase family 62  42.31 
 
 		 436 aa  91.3  6e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000382833  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1791  cellulose-binding family II  43.27 
 
 		 913 aa  90.5  9e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.381117  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1559  family 62 glycoside hydrolase  42.86 
 
 		 488 aa  90.5  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.622478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3461  cellulose-binding family II protein  46.67 
 
 		 486 aa  90.5  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560967  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4805  glycoside hydrolase family protein  42.16 
 
 		 628 aa  89.4  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0359  chitinase  31.18 
 
 		 674 aa  88.6  4e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0366  glycoside hydrolase family protein  33.15 
 
 		 674 aa  88.6  4e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3146  glycoside hydrolase family 6  50.98 
 
 		 459 aa  88.2  5e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0460  glycoside hydrolase family 9  63.95 
 
 		 1017 aa  88.2  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  41.75 
 
 		 846 aa  88.2  5e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2646  glycoside hydrolase family protein  43.4 
 
 		 812 aa  87.8  6e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00270036  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0970  glycoside hydrolase family protein  47.66 
 
 		 894 aa  87.4  8e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.184783 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0733  glycoside hydrolase family 10  42.57 
 
 		 488 aa  87.4  8e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0159525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2009  cellulose-binding family II protein  42.72 
 
 		 669 aa  87.4  9e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.872108  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0371  chitinase B  31.18 
 
 		 674 aa  86.7  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0362  chitinase  31.18 
 
 		 674 aa  86.7  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0385  chitinase B  31.18 
 
 		 674 aa  86.7  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3718  cellulose-binding family II  43.48 
 
 		 525 aa  87  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.154432 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0905  glycoside hydrolase family 10  44.34 
 
 		 690 aa  86.7  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.506442  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2912  1, 4-beta cellobiohydrolase  41.59 
 
 		 491 aa  86.7  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.426935 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0428  chitinase B  30.65 
 
 		 674 aa  85.5  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>