52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6365 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_6365  Alpha-L-arabinofuranosidase-like protein  100 
 
 
579 aa  1194    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.15975  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6640  cellulose-binding family II  25.7 
 
 
727 aa  102  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0877502 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0048  Alpha-L-arabinofuranosidase-like protein  24.72 
 
 
959 aa  83.6  0.00000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3118  Alpha-L-arabinofuranosidase-like protein  24.32 
 
 
818 aa  80.1  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.222033  normal  0.0458046 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2048  cellulose-binding family II  25.58 
 
 
679 aa  77  0.0000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4157  cellulose-binding family II  24.95 
 
 
719 aa  73.2  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.894149  normal  0.131999 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2071  alpha-L-arabinofuranosidase-like protein  24.42 
 
 
535 aa  69.7  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6262  Alpha-L-arabinofuranosidase-like protein  23.86 
 
 
483 aa  65.9  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.219739 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0202  alpha-L-arabinofuranosidase domain-containing protein  26.32 
 
 
505 aa  65.1  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.957662  normal  0.0476441 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6803  Alpha-N-arabinofuranosidase  23.55 
 
 
502 aa  65.5  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.905258 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4289  cellulose-binding family II  25.06 
 
 
699 aa  64.7  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00315108 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5890  Alpha-N-arabinofuranosidase  22.96 
 
 
502 aa  63.5  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5583  Alpha-N-arabinofuranosidase  24.73 
 
 
502 aa  62.8  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.759858  normal  0.105411 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5707  alpha-L-arabinofuranosidase  25.35 
 
 
507 aa  62  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.190024  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2712  Alpha-N-arabinofuranosidase  23.43 
 
 
502 aa  60.5  0.00000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0656  Alpha-N-arabinofuranosidase  21.89 
 
 
484 aa  60.1  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0631  Alpha-N-arabinofuranosidase  21.89 
 
 
484 aa  60.1  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2548  Alpha-N-arabinofuranosidase  24.65 
 
 
503 aa  60.1  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0515  Alpha-N-arabinofuranosidase  24.64 
 
 
507 aa  58.5  0.0000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000302906  hitchhiker  0.000750208 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0598  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.42 
 
 
501 aa  58.5  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.832453 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4460  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  26.97 
 
 
732 aa  57.8  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.551805  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4317  Alpha-N-arabinofuranosidase  23.78 
 
 
504 aa  55.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.341945  hitchhiker  0.00470977 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3457  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.55 
 
 
506 aa  55.8  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.467334  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07120  alpha-L-arabinofuranosidase  23.57 
 
 
525 aa  55.5  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.580236 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2485  alpha-N-arabinofuranosidase  24.55 
 
 
448 aa  55.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0107043 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1521  Alpha-N-arabinofuranosidase  24.64 
 
 
778 aa  55.8  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.272039  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3514  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.8 
 
 
499 aa  56.2  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0643096  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1339  alpha-L-arabinofuranosidase  24.34 
 
 
515 aa  55.8  0.000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0924  alpha-L-arabinofuranosidase  24.58 
 
 
566 aa  55.5  0.000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4336  Alpha-N-arabinofuranosidase  23.18 
 
 
662 aa  55.1  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0504519  normal  0.752707 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1739  alpha-L-arabinofuranosidase  24.83 
 
 
522 aa  53.9  0.000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1170  carbohydrate-binding CenC domain-containing protein  23.41 
 
 
693 aa  53.5  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000394833  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0383  Alpha-N-arabinofuranosidase  24.56 
 
 
511 aa  53.1  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3590  Alpha-N-arabinofuranosidase  23.26 
 
 
507 aa  52.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.497097  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2725  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  24.2 
 
 
502 aa  52.4  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2206  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.23 
 
 
510 aa  52  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1735  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.13 
 
 
514 aa  52  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00576907  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2894  Alpha-N-arabinofuranosidase  22.42 
 
 
501 aa  52  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0121186  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1930  Alpha-N-arabinofuranosidase  24 
 
 
500 aa  50.4  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00284341  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05510  alpha-L-arabinofuranosidase  23.94 
 
 
527 aa  50.4  0.00008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.594598  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3261  Alpha-N-arabinofuranosidase  24.64 
 
 
501 aa  50.4  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.232195 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0226  Alpha-N-arabinofuranosidase  24.29 
 
 
515 aa  49.7  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1103  Alpha-N-arabinofuranosidase  21.43 
 
 
505 aa  49.3  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29300  alpha-L-arabinofuranosidase  22.96 
 
 
506 aa  48.5  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3212  Alpha-N-arabinofuranosidase  23.89 
 
 
684 aa  48.5  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.968996  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4495  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  21.85 
 
 
772 aa  48.5  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.183163  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1037  Alpha-N-arabinofuranosidase  24.01 
 
 
503 aa  47.8  0.0006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.400006 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1221  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  23.56 
 
 
502 aa  47  0.0009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0755  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  22.1 
 
 
507 aa  45.8  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.426486  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3208  Alpha-N-arabinofuranosidase  23.85 
 
 
703 aa  46.2  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.276113 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2410  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.36 
 
 
691 aa  44.7  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00000000106036  normal  0.27509 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0412  Alpha-N-arabinofuranosidase  23.02 
 
 
504 aa  43.5  0.01  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.47991  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>