82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1354 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1354  hypothetical protein  100 
 
 		 1139 aa  2299    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1856  glycoside hydrolase family protein  45.96 
 
 		 781 aa  719    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6800  Alpha-L-fucosidase  44.46 
 
 		 778 aa  692    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000092205  unclonable  0.0000000000000164312 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0071  glycoside hydrolase family protein  41.97 
 
 		 835 aa  620  1e-176  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4283  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  43.13 
 
 		 1094 aa  593  1e-168  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2699  Alpha-L-fucosidase  40.68 
 
 		 825 aa  589  1e-167  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000179914  normal  0.370363 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1484  Alpha-L-fucosidase  40.07 
 
 		 842 aa  583  1.0000000000000001e-165  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1878  Alpha-L-fucosidase  38.29 
 
 		 825 aa  546  1e-154  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4083  hypothetical protein  36.56 
 
 		 816 aa  543  1e-153  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1752  hypothetical protein  37.41 
 
 		 833 aa  537  1e-151  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.187912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7192  Alpha-L-fucosidase  38.68 
 
 		 811 aa  536  1e-151  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000769318  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5543  Alpha-L-fucosidase  38.22 
 
 		 841 aa  536  1e-150  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0324078  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1435  hypothetical protein  38.63 
 
 		 790 aa  526  1e-147  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.931563  normal  0.0505935 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2698  Alpha-L-fucosidase  36.69 
 
 		 868 aa  526  1e-147  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.447699  normal  0.17136 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1020  hypothetical protein  39.7 
 
 		 759 aa  520  1e-146  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1256  hypothetical protein  36.61 
 
 		 768 aa  520  1e-146  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.471083  normal  0.43863 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3112  hypothetical protein  36.02 
 
 		 822 aa  518  1.0000000000000001e-145  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.31763  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0772  hypothetical protein  35.94 
 
 		 802 aa  519  1.0000000000000001e-145  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2700  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39.41 
 
 		 784 aa  518  1.0000000000000001e-145  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5141  hypothetical protein  40.15 
 
 		 741 aa  511  1e-143  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0813  Alpha-L-fucosidase  34.67 
 
 		 786 aa  498  1e-139  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.363817 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5006  Alpha-L-fucosidase  34.78 
 
 		 864 aa  498  1e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.9086 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3211  alpha-fucosidase  35.86 
 
 		 1193 aa  496  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.084179  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2129  fibronectin type III domain-containing protein  36.48 
 
 		 1479 aa  489  1e-136  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2817  Alpha-L-fucosidase  37.53 
 
 		 940 aa  478  1e-133  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5679  Alpha-L-fucosidase  37.56 
 
 		 747 aa  473  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.349462  normal  0.357027 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1241  Carbohydrate binding family 6  34.47 
 
 		 1164 aa  468  9.999999999999999e-131  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2503  hypothetical protein  36.34 
 
 		 803 aa  460  9.999999999999999e-129  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.20212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8217  Alpha-L-fucosidase  37.16 
 
 		 991 aa  453  1.0000000000000001e-126  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5237  alpha-L-fucosidase, putative, afc95A  38.02 
 
 		 742 aa  435  1e-120  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.139912  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10376  conserved hypothetical protein  35.04 
 
 		 757 aa  430  1e-119  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1395  hypothetical protein  33.25 
 
 		 758 aa  422  1e-116  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00458705  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3002  Alpha-L-fucosidase  37.06 
 
 		 809 aa  413  1e-114  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0874  hypothetical protein  32.48 
 
 		 760 aa  396  1e-108  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.272656  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2411  twin-arginine translocation pathway signal  34.99 
 
 		 824 aa  386  1e-105  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05400  hypothetical protein  36.3 
 
 		 856 aa  378  1e-103  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1192  hypothetical protein  35.7 
 
 		 837 aa  364  5.0000000000000005e-99  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0429  twin-arginine translocation pathway signal  35.28 
 
 		 781 aa  352  3e-95  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.767202 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1120  hypothetical protein  30.63 
 
 		 796 aa  351  6e-95  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0186  glycoside hydrolase family 95  30.74 
 
 		 788 aa  319  2e-85  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.771982 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2174  hypothetical protein  42.11 
 
 		 646 aa  317  9e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.007459  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06673  alpha-fucosidase (Eurofung)  32.23 
 
 		 831 aa  312  2e-83  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00444703 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28510  hypothetical protein  32.6 
 
 		 773 aa  306  2.0000000000000002e-81  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29100  hypothetical protein  33.91 
 
 		 762 aa  305  3.0000000000000004e-81  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.142141  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08149  Alpha-fucosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AU81]  29.93 
 
 		 809 aa  296  1e-78  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.954517 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1805  hypothetical protein  44.3 
 
 		 300 aa  282  3e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00065967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2119  hypothetical protein  43.19 
 
 		 304 aa  274  8.000000000000001e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2785  hypothetical protein  40.91 
 
 		 311 aa  271  4e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0402448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2555  hypothetical protein  28.45 
 
 		 804 aa  271  4e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.194451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3803  Ricin B lectin  27.24 
 
 		 943 aa  261  6e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4191  twin-arginine translocation pathway signal  40.49 
 
 		 808 aa  261  8e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.411949  normal  0.364475 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4087  hypothetical protein  41.61 
 
 		 305 aa  250  9e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1765  hypothetical protein  35.96 
 
 		 819 aa  239  2e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00969873  normal  0.0262945 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0084  hypothetical protein  28.84 
 
 		 809 aa  180  2e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1614  hypothetical protein  29.56 
 
 		 753 aa  155  5e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.126205  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3471  hypothetical protein  38.87 
 
 		 274 aa  152  3e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5561  Alpha-L-fucosidase  36.2 
 
 		 757 aa  123  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.56822 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4606  glycoside hydrolase family 43  30.51 
 
 		 675 aa  123  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.337279  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1856  hypothetical protein  31.38 
 
 		 739 aa  116  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0763554  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2139  alpha-L-arabinofuranosidase B  28.12 
 
 		 982 aa  114  8.000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1563  hypothetical protein  23.1 
 
 		 770 aa  114  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.156768  normal  0.770482 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00114  expressed protein  35.98 
 
 		 262 aa  109  3e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2702  hypothetical protein  29.21 
 
 		 348 aa  98.2  8e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000025037  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36540  hypothetical protein  29.5 
 
 		 324 aa  92  6e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3438  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  26.06 
 
 		 316 aa  90.9  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0527524  normal  0.0695696 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3109  glycoside hydrolase family protein  25.07 
 
 		 644 aa  89.7  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2023  hypothetical protein  25.8 
 
 		 342 aa  87.4  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.131758  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14440  hypothetical protein  30.31 
 
 		 323 aa  86.7  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01090  Ig-like domain-containing protein  23.68 
 
 		 583 aa  82.8  0.00000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00113  hypothetical protein  43.33 
 
 		 116 aa  77.8  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.688258  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2076  hypothetical protein  24.16 
 
 		 314 aa  73.9  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1707  hypothetical protein  20.7 
 
 		 750 aa  70.9  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.358373  normal  0.023809 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5739  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  27.16 
 
 		 855 aa  66.2  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.393547  normal  0.654215 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0816  endo-1,4-beta-xylanase  27.1 
 
 		 318 aa  63.2  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.854869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1971  alpha-L-arabinofuranosidase B  26.06 
 
 		 478 aa  61.6  0.00000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000055654  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3110  hypothetical protein  23.78 
 
 		 928 aa  59.7  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0237915 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5219  hypothetical protein  30.51 
 
 		 1176 aa  53.9  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02590  hypothetical protein  25.41 
 
 		 345 aa  53.1  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2707  Trehalose and maltose hydrolase (possible phosphorylase)  20.99 
 
 		 765 aa  52  0.00007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0712554  normal  0.489106 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2737  Ricin B lectin  32.14 
 
 		 1148 aa  49.3  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.285354  normal  0.294912 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1511  surface protein  23.81 
 
 		 1065 aa  48.9  0.0005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.36671  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07781  arabinosidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G00650)  21.88 
 
 		 340 aa  45.8  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.621545 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>