25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1805 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1805  hypothetical protein  100 
 
 		 300 aa  625  1e-178  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00065967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2785  hypothetical protein  64.88 
 
 		 311 aa  414  9.999999999999999e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0402448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4087  hypothetical protein  60.13 
 
 		 305 aa  388  1e-107  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2119  hypothetical protein  61.07 
 
 		 304 aa  384  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1354  hypothetical protein  45.77 
 
 		 1139 aa  273  4.0000000000000004e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3471  hypothetical protein  31.41 
 
 		 274 aa  133  3e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4606  glycoside hydrolase family 43  31.18 
 
 		 675 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.337279  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1856  hypothetical protein  31.34 
 
 		 739 aa  110  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0763554  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2139  alpha-L-arabinofuranosidase B  31.23 
 
 		 982 aa  110  4.0000000000000004e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2702  hypothetical protein  27.05 
 
 		 348 aa  91.7  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000025037  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3438  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  26.85 
 
 		 316 aa  84.3  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0527524  normal  0.0695696 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2023  hypothetical protein  25.8 
 
 		 342 aa  77  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.131758  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2076  hypothetical protein  24.84 
 
 		 314 aa  76.3  0.0000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5739  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  33.95 
 
 		 855 aa  74.3  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.393547  normal  0.654215 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36540  hypothetical protein  26.58 
 
 		 324 aa  72  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14440  hypothetical protein  32.69 
 
 		 323 aa  62  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01090  Ig-like domain-containing protein  24.38 
 
 		 583 aa  60.5  0.00000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0816  endo-1,4-beta-xylanase  24.76 
 
 		 318 aa  56.2  0.0000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.854869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1971  alpha-L-arabinofuranosidase B  27.16 
 
 		 478 aa  53.5  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000055654  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3109  glycoside hydrolase family protein  23.59 
 
 		 644 aa  53.5  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02590  hypothetical protein  26.53 
 
 		 345 aa  51.2  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7065  alpha-L-arabinofuranosidase B  24.66 
 
 		 445 aa  49.3  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0253597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7019  alpha-L-arabinofuranosidase B  25.54 
 
 		 455 aa  48.5  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3223  putative beta-xylosidase  23.51 
 
 		 377 aa  45.4  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.222849  normal  0.126141 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07781  arabinosidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G00650)  21.99 
 
 		 340 aa  43.1  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.621545 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>