24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_14440 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_14440  hypothetical protein  100 
 
 		 323 aa  635    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36540  hypothetical protein  48.4 
 
 		 324 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1856  hypothetical protein  44.19 
 
 		 739 aa  251  1e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0763554  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2702  hypothetical protein  43.75 
 
 		 348 aa  229  4e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000025037  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0816  endo-1,4-beta-xylanase  36.04 
 
 		 318 aa  155  1e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.854869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01090  Ig-like domain-containing protein  32.09 
 
 		 583 aa  153  4e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02590  hypothetical protein  37.62 
 
 		 345 aa  152  8e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2076  hypothetical protein  32.52 
 
 		 314 aa  114  3e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08472  conserved hypothetical protein  39.13 
 
 		 346 aa  110  3e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.327023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01100  hypothetical protein  28.18 
 
 		 992 aa  106  5e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07781  arabinosidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G00650)  28.21 
 
 		 340 aa  104  2e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.621545 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1511  surface protein  27.82 
 
 		 1065 aa  94  3e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.36671  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2139  alpha-L-arabinofuranosidase B  25 
 
 		 982 aa  90.1  5e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3471  hypothetical protein  32.57 
 
 		 274 aa  86.3  7e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1354  hypothetical protein  30.19 
 
 		 1139 aa  85.1  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1971  alpha-L-arabinofuranosidase B  23.53 
 
 		 478 aa  73.6  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000055654  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2119  hypothetical protein  33.12 
 
 		 304 aa  71.6  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4087  hypothetical protein  28.11 
 
 		 305 aa  66.6  0.0000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3438  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  24.76 
 
 		 316 aa  66.6  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0527524  normal  0.0695696 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2785  hypothetical protein  29.53 
 
 		 311 aa  63.2  0.000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0402448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1805  hypothetical protein  32.69 
 
 		 300 aa  62  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00065967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3109  glycoside hydrolase family protein  23.82 
 
 		 644 aa  58.2  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4606  glycoside hydrolase family 43  25.87 
 
 		 675 aa  57  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.337279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2023  hypothetical protein  22.67 
 
 		 342 aa  43.1  0.007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.131758  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>