32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_01090 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_01090  Ig-like domain-containing protein  100 
 
 		 583 aa  1180    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1856  hypothetical protein  43.84 
 
 		 739 aa  267  4e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0763554  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36540  hypothetical protein  39.04 
 
 		 324 aa  204  5e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01100  hypothetical protein  31.48 
 
 		 992 aa  194  3e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2702  hypothetical protein  36.21 
 
 		 348 aa  191  2.9999999999999997e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000025037  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02590  hypothetical protein  33.43 
 
 		 345 aa  154  5e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14440  hypothetical protein  32.09 
 
 		 323 aa  153  8.999999999999999e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1511  surface protein  38.29 
 
 		 1065 aa  148  3e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.36671  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07781  arabinosidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G00650)  40.45 
 
 		 340 aa  130  5.0000000000000004e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.621545 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0816  endo-1,4-beta-xylanase  29.65 
 
 		 318 aa  121  3e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.854869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2139  alpha-L-arabinofuranosidase B  28.98 
 
 		 982 aa  118  3e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08472  conserved hypothetical protein  26.83 
 
 		 346 aa  116  1.0000000000000001e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.327023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2076  hypothetical protein  27.42 
 
 		 314 aa  101  3e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1971  alpha-L-arabinofuranosidase B  28.02 
 
 		 478 aa  89.7  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000055654  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3109  glycoside hydrolase family protein  25.99 
 
 		 644 aa  85.9  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3438  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  25.79 
 
 		 316 aa  84  0.000000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0527524  normal  0.0695696 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1354  hypothetical protein  24.93 
 
 		 1139 aa  82.8  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3471  hypothetical protein  29.11 
 
 		 274 aa  80.5  0.00000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4087  hypothetical protein  25.68 
 
 		 305 aa  72.8  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2785  hypothetical protein  24.15 
 
 		 311 aa  72  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0402448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2119  hypothetical protein  29.38 
 
 		 304 aa  71.6  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4606  glycoside hydrolase family 43  26.36 
 
 		 675 aa  71.2  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.337279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2023  hypothetical protein  26.56 
 
 		 342 aa  65.1  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.131758  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1805  hypothetical protein  24.38 
 
 		 300 aa  60.8  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00065967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3223  putative beta-xylosidase  22.94 
 
 		 377 aa  55.1  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.222849  normal  0.126141 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0685  fibronectin type III domain-containing protein  34.21 
 
 		 1686 aa  50.8  0.00007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01850  Ig-like domain-containing protein  37.89 
 
 		 1323 aa  46.6  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.854355  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0102  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  39.76 
 
 		 1781 aa  45.4  0.003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.432951 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1555  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  30.12 
 
 		 612 aa  45.4  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.428291  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1617  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  30.12 
 
 		 606 aa  45.4  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0588913  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0857  Arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  24.68 
 
 		 619 aa  44.3  0.006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01458  hypothetical protein  41.54 
 
 		 1419 aa  43.9  0.008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.523698  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>