23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2023 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2023  hypothetical protein  100 
 
 
342 aa  706    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.131758  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4087  hypothetical protein  27.19 
 
 
305 aa  101  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2119  hypothetical protein  26.61 
 
 
304 aa  99.8  7e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4606  glycoside hydrolase family 43  27.48 
 
 
675 aa  94.7  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.337279  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1354  hypothetical protein  26.05 
 
 
1139 aa  86.7  5e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2139  alpha-L-arabinofuranosidase B  27.11 
 
 
982 aa  81.3  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2785  hypothetical protein  24.71 
 
 
311 aa  81.6  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0402448  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2076  hypothetical protein  23.35 
 
 
314 aa  80.9  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1856  hypothetical protein  25.15 
 
 
739 aa  79.3  0.00000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0763554  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1805  hypothetical protein  25.8 
 
 
300 aa  77  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00065967  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0816  endo-1,4-beta-xylanase  22.02 
 
 
318 aa  67.4  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.854869  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01090  Ig-like domain-containing protein  26.56 
 
 
583 aa  65.1  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2702  hypothetical protein  22.95 
 
 
348 aa  58.5  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000025037  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3438  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  24.55 
 
 
316 aa  57.8  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0527524  normal  0.0695696 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01100  hypothetical protein  23.14 
 
 
992 aa  56.2  0.0000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3471  hypothetical protein  22.57 
 
 
274 aa  54.3  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36540  hypothetical protein  23.01 
 
 
324 aa  52.4  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3109  glycoside hydrolase family protein  24.71 
 
 
644 aa  52.8  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7019  alpha-L-arabinofuranosidase B  24.75 
 
 
455 aa  51.6  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3223  putative beta-xylosidase  24 
 
 
377 aa  50.8  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.222849  normal  0.126141 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02590  hypothetical protein  22.22 
 
 
345 aa  49.3  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7065  alpha-L-arabinofuranosidase B  22.89 
 
 
445 aa  45.8  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0253597  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14440  hypothetical protein  22.67 
 
 
323 aa  43.1  0.007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>