15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_7019 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_7019  alpha-L-arabinofuranosidase B  100 
 
 		 455 aa  914    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7065  alpha-L-arabinofuranosidase B  84.72 
 
 		 445 aa  755    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0253597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3927  Ricin B lectin  36.64 
 
 		 436 aa  145  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1872  alpha-L-arabinofuranosidase B  34.35 
 
 		 980 aa  65.5  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4087  hypothetical protein  28.33 
 
 		 305 aa  65.1  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2119  hypothetical protein  27.59 
 
 		 304 aa  62  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1273  alpha-L-arabinofuranosidase B  34.48 
 
 		 481 aa  54.7  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2023  hypothetical protein  24.75 
 
 		 342 aa  51.6  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.131758  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2785  hypothetical protein  26.22 
 
 		 311 aa  51.6  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0402448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1805  hypothetical protein  25.54 
 
 		 300 aa  48.5  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00065967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4606  glycoside hydrolase family 43  24.07 
 
 		 675 aa  45.1  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.337279  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1858  Alpha-N-arabinofuranosidase  37.36 
 
 		 505 aa  44.3  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1971  alpha-L-arabinofuranosidase B  23.76 
 
 		 478 aa  43.5  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000055654  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0809  beta-fructofuranosidase  28.46 
 
 		 491 aa  43.1  0.01  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5160  Xylan 1,4-beta-xylosidase  27.1 
 
 		 519 aa  43.1  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0027116 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>