22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3223 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_3223  putative beta-xylosidase  100 
 
 		 377 aa  785    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.222849  normal  0.126141 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3109  glycoside hydrolase family protein  33.43 
 
 		 644 aa  181  2e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3438  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  31.67 
 
 		 316 aa  163  5.0000000000000005e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0527524  normal  0.0695696 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0816  endo-1,4-beta-xylanase  27.38 
 
 		 318 aa  82.4  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.854869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1856  hypothetical protein  26.8 
 
 		 739 aa  74.7  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0763554  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2076  hypothetical protein  26.79 
 
 		 314 aa  71.2  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02590  hypothetical protein  35.71 
 
 		 345 aa  70.9  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07781  arabinosidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G00650)  25.53 
 
 		 340 aa  69.7  0.00000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.621545 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2139  alpha-L-arabinofuranosidase B  27.95 
 
 		 982 aa  67.8  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36540  hypothetical protein  25.43 
 
 		 324 aa  59.7  0.00000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08472  conserved hypothetical protein  23.8 
 
 		 346 aa  58.9  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.327023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2702  hypothetical protein  25.79 
 
 		 348 aa  58.5  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000025037  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2785  hypothetical protein  23.49 
 
 		 311 aa  57.8  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0402448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01090  Ig-like domain-containing protein  22.68 
 
 		 583 aa  57.4  0.0000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4087  hypothetical protein  24.42 
 
 		 305 aa  56.6  0.0000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01100  hypothetical protein  27.07 
 
 		 992 aa  56.2  0.0000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2119  hypothetical protein  24.46 
 
 		 304 aa  55.8  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4606  glycoside hydrolase family 43  24.37 
 
 		 675 aa  52  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.337279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2023  hypothetical protein  23.53 
 
 		 342 aa  52  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.131758  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1971  alpha-L-arabinofuranosidase B  23.05 
 
 		 478 aa  50.8  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000055654  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3471  hypothetical protein  25.17 
 
 		 274 aa  49.3  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1805  hypothetical protein  23.51 
 
 		 300 aa  45.8  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00065967  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>