160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3109 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3109  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 644 aa  1327    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3438  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  53.42 
 
 		 316 aa  374  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0527524  normal  0.0695696 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16970  beta-xylosidase  42.81 
 
 		 313 aa  230  5e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.374085 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0193  glycoside hydrolase family 43  40.8 
 
 		 324 aa  195  2e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00680352  normal  0.581709 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2384  glycoside hydrolase family 43  40.18 
 
 		 330 aa  192  2e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2866  glycoside hydrolase family 43  39.68 
 
 		 487 aa  187  4e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.141314  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3223  putative beta-xylosidase  33.72 
 
 		 377 aa  181  4e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.222849  normal  0.126141 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6730  glycoside hydrolase family 43  35.69 
 
 		 323 aa  165  2.0000000000000002e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575675  normal  0.920031 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01870  xylosidase/arabinosidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04480)  35.05 
 
 		 344 aa  152  3e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1235  Carbohydrate binding family 6  32.7 
 
 		 509 aa  137  8e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00440741  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2196  carbohydrate-binding family 6 protein  31.63 
 
 		 533 aa  134  3.9999999999999996e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0810  carbohydrate-binding family 6 protein  31.38 
 
 		 450 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.034958  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2837  glycoside hydrolase family 43  32.49 
 
 		 348 aa  129  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.61366  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3612  methionine biosynthesis MetW  32.91 
 
 		 1186 aa  128  4.0000000000000003e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0161329  hitchhiker  0.00479901 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1229  Carbohydrate binding family 6  32.15 
 
 		 535 aa  127  7e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.166566  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0789  endo-1,4-beta-xylanase D precursor  33.83 
 
 		 317 aa  125  2e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0130439  normal  0.452031 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2069  glycoside hydrolase family protein  32.21 
 
 		 315 aa  124  4e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000027007  hitchhiker  0.0000035019 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1231  Carbohydrate binding family 6  31.91 
 
 		 524 aa  124  5e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0177163  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2447  putative xylosidase  32.71 
 
 		 468 aa  124  7e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.320135 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0455  Carbohydrate binding family 6  31.08 
 
 		 618 aa  122  9.999999999999999e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2139  alpha-L-arabinofuranosidase B  32.32 
 
 		 982 aa  122  1.9999999999999998e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3213  glycoside hydrolase family 43  29.85 
 
 		 464 aa  122  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.331095  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3903  glycoside hydrolase family protein  27.71 
 
 		 340 aa  122  1.9999999999999998e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.969992  normal  0.175565 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1992  glycoside hydrolase family protein  31.6 
 
 		 315 aa  121  3e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000493506  unclonable  0.0000204974 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1982  glycoside hydrolase family protein  31.9 
 
 		 315 aa  121  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000010784  normal  0.0338284 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3224  Alpha-N-arabinofuranosidase  32.21 
 
 		 444 aa  119  1.9999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.136595  normal  0.135367 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10919  hypothetical protein  30.99 
 
 		 383 aa  117  6.9999999999999995e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0280473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1271  carbohydrate-binding family 6 protein  32.79 
 
 		 679 aa  117  6.9999999999999995e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2143  glycoside hydrolase family 43  32.19 
 
 		 311 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.209046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0823  glycoside hydrolase family 43  29.87 
 
 		 302 aa  113  9e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.328209 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2063  glycoside hydrolase family protein  31.78 
 
 		 311 aa  111  4.0000000000000004e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000284349  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2027  glycoside hydrolase family protein  34.74 
 
 		 325 aa  110  6e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.808853  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36540  hypothetical protein  28.53 
 
 		 324 aa  110  9.000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0946  SecY protein  33.69 
 
 		 317 aa  108  3e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.409307  hitchhiker  0.0000724629 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2076  hypothetical protein  28.53 
 
 		 314 aa  108  4e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0536  glycoside hydrolase family 43  29.45 
 
 		 393 aa  108  4e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.812392 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1856  hypothetical protein  30.09 
 
 		 739 aa  107  6e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0763554  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0507  glycoside hydrolase family 43  31.15 
 
 		 337 aa  103  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.412329 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2482  glycoside hydrolase family 43  29.55 
 
 		 384 aa  102  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.24102 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20580  glycoside hydrolase family 43  29.93 
 
 		 315 aa  102  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1928  Carbohydrate-binding CenC domain protein  28.81 
 
 		 712 aa  101  5e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3276  carbohydrate-binding family 6 protein  31.56 
 
 		 401 aa  100  7e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4501  Alpha-N-arabinofuranosidase  31.27 
 
 		 316 aa  100  8e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.570213  normal  0.69004 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1998  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.5 
 
 		 344 aa  100  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1660  carbohydrate binding domain/beta-xylosidase family protein  27.97 
 
 		 667 aa  99.4  2e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.324921  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2556  glycoside hydrolase family 43  35.68 
 
 		 319 aa  98.2  4e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.149373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1971  alpha-L-arabinofuranosidase B  27.63 
 
 		 478 aa  97.4  8e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000055654  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0206  glycoside hydrolase family 43  29.32 
 
 		 304 aa  93.2  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  0.253285 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2702  hypothetical protein  27.22 
 
 		 348 aa  93.2  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000025037  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01459  xylosidase; arabinosidase  28.82 
 
 		 527 aa  93.2  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.928055  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0353  Xylan 1,4-beta-xylosidase  28.86 
 
 		 346 aa  92.4  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4606  glycoside hydrolase family 43  26.65 
 
 		 675 aa  92  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.337279  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0182  glycoside hydrolase family 43  31.2 
 
 		 1338 aa  91.3  4e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1323  Alpha-N-arabinofuranosidase  30.63 
 
 		 330 aa  90.1  1e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2392  glycoside hydrolase family 43  29.39 
 
 		 306 aa  90.1  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000540158  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1354  hypothetical protein  25.73 
 
 		 1139 aa  89.4  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0795  Xylan 1,4-beta-xylosidase  28.65 
 
 		 346 aa  89.7  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000173963  normal  0.0629112 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3471  hypothetical protein  27.74 
 
 		 274 aa  88.2  5e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01090  Ig-like domain-containing protein  25.99 
 
 		 583 aa  86.3  0.000000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2722  glycoside hydrolase family protein  27.03 
 
 		 310 aa  84.7  0.000000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.123508  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2971  glycoside hydrolase family 43  27.05 
 
 		 855 aa  83.6  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0529993 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0737  glycoside hydrolase family protein  28.28 
 
 		 345 aa  81.3  0.00000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.612706  normal  0.340405 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0822  Alpha-L-arabinofuranosidase  28.69 
 
 		 385 aa  80.5  0.00000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000000000001862  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2723  glycoside hydrolase family protein  28.7 
 
 		 345 aa  80.1  0.0000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.469303  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2119  hypothetical protein  26.3 
 
 		 304 aa  79.3  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4846  Xylan 1,4-beta-xylosidase  28.74 
 
 		 367 aa  77.4  0.0000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0960373  hitchhiker  0.00474985 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0375  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.62 
 
 		 320 aa  77.4  0.0000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.194615 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03869  beta-xylosidase (1,4-beta-D-xylan xylohydrolase) (Xylan1,4-beta-xylosidase) (Exo-beta-(1,4)-xylanase)  27.36 
 
 		 344 aa  77  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2614  glycoside hydrolase family 43  27.03 
 
 		 326 aa  76.3  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2022  glycoside hydrolase family 43  25.53 
 
 		 334 aa  74.7  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6022  glycoside hydrolase family 43  28.52 
 
 		 319 aa  73.9  0.000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2639  glycoside hydrolase family 43  27.69 
 
 		 472 aa  71.2  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.431626  normal  0.0143862 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3728  Alpha-L-arabinofuranosidase  24.91 
 
 		 383 aa  70.9  0.00000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3403  glycoside hydrolase family 43  29.13 
 
 		 357 aa  70.9  0.00000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000194853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4703  glycoside hydrolase family 43  25.81 
 
 		 341 aa  70.1  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.184013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2785  hypothetical protein  24.25 
 
 		 311 aa  68.6  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0402448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0816  endo-1,4-beta-xylanase  23.62 
 
 		 318 aa  68.6  0.0000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.854869  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0473  glycoside hydrolase family 43  26.54 
 
 		 829 aa  68.2  0.0000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.658009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01100  hypothetical protein  23.53 
 
 		 992 aa  67.8  0.0000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1400  glycoside hydrolase family 43  26.1 
 
 		 517 aa  66.6  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.587173  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4504  glycoside hydrolase family 43  26.43 
 
 		 510 aa  66.6  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4087  hypothetical protein  26.63 
 
 		 305 aa  65.1  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2449  glycoside hydrolase family 43  28.87 
 
 		 537 aa  64.3  0.000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114761  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07781  arabinosidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G00650)  25.42 
 
 		 340 aa  63.9  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.621545 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1729  glycoside hydrolase family 43  29.41 
 
 		 472 aa  63.2  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.101805  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3360  glycoside hydrolase family 43  26.07 
 
 		 522 aa  62  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0779432 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2699  glycoside hydrolase family 43  26.97 
 
 		 496 aa  62  0.00000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.276179  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02590  hypothetical protein  24.74 
 
 		 345 aa  61.2  0.00000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0359  glycoside hydrolase family protein  22.98 
 
 		 506 aa  61.2  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0212595 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0745  glycoside hydrolase family 43  27.21 
 
 		 327 aa  61.2  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.465475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0739  glycoside hydrolase family protein  24.33 
 
 		 348 aa  60.1  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2423  glycoside hydrolase family 43  27.39 
 
 		 699 aa  60.5  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1511  surface protein  29.17 
 
 		 1065 aa  59.7  0.0000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.36671  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4496  glycoside hydrolase family 43  28.92 
 
 		 503 aa  60.5  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0241272  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0628  glycoside hydrolase family 43  25.55 
 
 		 505 aa  59.7  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2813  glycoside hydrolase family 43  25.82 
 
 		 331 aa  59.7  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0257715  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0531  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.16 
 
 		 471 aa  58.9  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01477  beta-1,4-xylosidase (Eurofung)  25.14 
 
 		 404 aa  58.5  0.0000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1011  glycoside hydrolase family 43  25.16 
 
 		 471 aa  58.5  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14440  hypothetical protein  23.82 
 
 		 323 aa  58.2  0.0000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>