209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_2022 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_2022  glycoside hydrolase family 43  100 
 
 
334 aa  692    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1115  family 43 glycoside hydrolase  59.43 
 
 
338 aa  388  1e-107  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3903  glycoside hydrolase family protein  46.75 
 
 
340 aa  278  7e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.969992  normal  0.175565 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2722  glycoside hydrolase family protein  45.66 
 
 
310 aa  237  3e-61  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.123508  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20580  glycoside hydrolase family 43  31.31 
 
 
315 aa  145  1e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1302  putative beta-xylosidase  31.81 
 
 
713 aa  135  9.999999999999999e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2392  glycoside hydrolase family 43  31.42 
 
 
306 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000540158  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0206  glycoside hydrolase family 43  31.1 
 
 
304 aa  126  4.0000000000000003e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  0.253285 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2723  glycoside hydrolase family protein  28.82 
 
 
345 aa  119  6e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.469303  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0536  glycoside hydrolase family 43  28.82 
 
 
393 aa  116  6.9999999999999995e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.812392 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0737  glycoside hydrolase family protein  31.58 
 
 
345 aa  107  2e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.612706  normal  0.340405 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3360  glycoside hydrolase family 43  30.13 
 
 
522 aa  106  6e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0779432 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2384  glycoside hydrolase family 43  27.81 
 
 
330 aa  101  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2423  glycoside hydrolase family 43  29.46 
 
 
699 aa  97.8  2e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1524  glycoside hydrolase family 43  29.58 
 
 
524 aa  97.1  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3403  glycoside hydrolase family 43  27.36 
 
 
357 aa  96.7  5e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000194853  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4703  glycoside hydrolase family 43  27.66 
 
 
341 aa  96.3  6e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.184013  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2482  glycoside hydrolase family 43  27.4 
 
 
384 aa  95.9  9e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.24102 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0650  glycoside hydrolase family 43  28.43 
 
 
495 aa  94.7  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0713148  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2866  glycoside hydrolase family 43  28.8 
 
 
487 aa  94.4  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.141314  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2639  glycoside hydrolase family 43  27.66 
 
 
472 aa  93.6  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.431626  normal  0.0143862 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6022  glycoside hydrolase family 43  27.8 
 
 
319 aa  92  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0193  glycoside hydrolase family 43  26.09 
 
 
324 aa  91.7  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00680352  normal  0.581709 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0739  glycoside hydrolase family protein  26.95 
 
 
348 aa  87.4  3e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6730  glycoside hydrolase family 43  24.38 
 
 
323 aa  87.8  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575675  normal  0.920031 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2027  glycoside hydrolase family protein  26.33 
 
 
325 aa  86.3  7e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.808853  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2556  glycoside hydrolase family 43  28.02 
 
 
319 aa  84  0.000000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.149373  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0745  glycoside hydrolase family 43  28.52 
 
 
327 aa  83.6  0.000000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.465475  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0628  glycoside hydrolase family 43  28.78 
 
 
505 aa  80.5  0.00000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0507  glycoside hydrolase family 43  27.13 
 
 
337 aa  79  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.412329 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6044  glycoside hydrolase family 43  28.25 
 
 
501 aa  78.2  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.845022  normal  0.0554344 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2449  glycoside hydrolase family 43  27.62 
 
 
537 aa  77.4  0.0000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114761  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4289  glycoside hydrolase family protein  27.99 
 
 
572 aa  77.8  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.786059  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0777  ribosomal protein L11 methyltransferase  26.55 
 
 
314 aa  76.3  0.0000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.12655 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3228  glycoside hydrolase family protein  27.4 
 
 
563 aa  76.3  0.0000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00674596  normal  0.0120766 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2698  glycoside hydrolase family 43  26.38 
 
 
369 aa  75.9  0.0000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.898004  normal  0.338928 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3109  glycoside hydrolase family protein  25.84 
 
 
644 aa  75.5  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1500  glycoside hydrolase family 43  28.34 
 
 
551 aa  75.1  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.36043 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5511  glycoside hydrolase family 43  27.8 
 
 
536 aa  74.3  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0274092 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1729  glycoside hydrolase family 43  25.23 
 
 
472 aa  75.1  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.101805  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01870  xylosidase/arabinosidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04480)  27.35 
 
 
344 aa  72.8  0.000000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4504  glycoside hydrolase family 43  27.51 
 
 
510 aa  72.4  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0473  glycoside hydrolase family 43  24.2 
 
 
829 aa  72.4  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.658009  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2138  glycoside hydrolase family protein  25.16 
 
 
580 aa  72  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0191  glycoside hydrolase family protein  32.69 
 
 
512 aa  72  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3728  Alpha-L-arabinofuranosidase  26.79 
 
 
383 aa  71.6  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0353  Xylan 1,4-beta-xylosidase  24.24 
 
 
346 aa  69.7  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4249  glycoside hydrolase family protein  25.27 
 
 
532 aa  69.7  0.00000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.158619  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0501  glycoside hydrolase family 43  26.53 
 
 
525 aa  69.3  0.00000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00998877 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0455  Carbohydrate binding family 6  29.37 
 
 
618 aa  68.6  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1235  Carbohydrate binding family 6  25.64 
 
 
509 aa  68.6  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00440741  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4788  Xylan 1,4-beta-xylosidase  26.34 
 
 
562 aa  68.2  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.771274  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1150  glycoside hydrolase family 43  26.92 
 
 
560 aa  68.2  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3351  glycoside hydrolase family 43  27.71 
 
 
522 aa  67.4  0.0000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4322  glycoside hydrolase family protein  24.91 
 
 
581 aa  67.8  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0700  glycoside hydrolase family 43  25.97 
 
 
522 aa  67  0.0000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0935  glycoside hydrolase family 43  25.54 
 
 
522 aa  67  0.0000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1998  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.66 
 
 
344 aa  66.6  0.0000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0753  glycoside hydrolase family protein  23.59 
 
 
465 aa  66.2  0.0000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0359  glycoside hydrolase family protein  30 
 
 
506 aa  65.9  0.0000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0212595 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4496  glycoside hydrolase family 43  26.5 
 
 
503 aa  64.7  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0241272  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2813  glycoside hydrolase family 43  26.24 
 
 
331 aa  64.7  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0257715  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3750  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  25.82 
 
 
319 aa  64.7  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00407758  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0353  Alpha-N-arabinofuranosidase  24.24 
 
 
340 aa  65.1  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.478586  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4846  Xylan 1,4-beta-xylosidase  24.71 
 
 
367 aa  64.3  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0960373  hitchhiker  0.00474985 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2614  glycoside hydrolase family 43  25 
 
 
326 aa  64.3  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1423  Xylan 1,4-beta-xylosidase  23.95 
 
 
558 aa  63.9  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.423704 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1984  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.45 
 
 
378 aa  63.5  0.000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.807412  hitchhiker  0.00032055 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1068  glycoside hydrolase family 43  24.24 
 
 
797 aa  63.9  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000256501  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2151  Alpha-N-arabinofuranosidase  23.08 
 
 
392 aa  63.5  0.000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.923723  normal  0.103273 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0946  SecY protein  34.29 
 
 
317 aa  63.5  0.000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.409307  hitchhiker  0.0000724629 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1990  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.45 
 
 
378 aa  63.2  0.000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00291978 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4511  glycoside hydrolase family protein  25.23 
 
 
341 aa  63.5  0.000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4281  glycoside hydrolase family protein  28.1 
 
 
304 aa  63.5  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.394059  normal  0.201547 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1435  glycoside hydrolase family 43  25.55 
 
 
545 aa  63.5  0.000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10919  hypothetical protein  33.33 
 
 
383 aa  63.2  0.000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0280473  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0656  Alpha-N-arabinofuranosidase  24.4 
 
 
316 aa  63.2  0.000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2971  glycoside hydrolase family 43  24.29 
 
 
855 aa  63.2  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0529993 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2529  Alpha-N-arabinofuranosidase  23.99 
 
 
355 aa  63.2  0.000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0997912 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2318  alpha-N-arabinofuranosidase  28.4 
 
 
512 aa  62.8  0.000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.389032  normal  0.249416 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3811  glycoside hydrolase family 43  25.47 
 
 
535 aa  62.8  0.000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0795  Xylan 1,4-beta-xylosidase  26.77 
 
 
346 aa  62  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000173963  normal  0.0629112 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2077  glycoside hydrolase family protein  24.55 
 
 
377 aa  62  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000183532 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2196  carbohydrate-binding family 6 protein  28.4 
 
 
533 aa  62.4  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2447  putative xylosidase  27.17 
 
 
468 aa  62.4  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.320135 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3622  Xylan 1,4-beta-xylosidase  25.47 
 
 
540 aa  62.4  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.573352  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1366  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.17 
 
 
648 aa  62.4  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.226192 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2837  glycoside hydrolase family 43  27.59 
 
 
348 aa  62  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.61366  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3276  carbohydrate-binding family 6 protein  27.62 
 
 
401 aa  61.6  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1390  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  26.09 
 
 
341 aa  61.6  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.287204  normal  0.664348 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2156  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  26.02 
 
 
352 aa  60.8  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000116592  hitchhiker  0.00999646 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2732  glycoside hydrolase family 43  24.45 
 
 
315 aa  60.8  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3932  glycoside hydrolase family 43  26.13 
 
 
456 aa  60.8  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.325517  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2082  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  25.75 
 
 
356 aa  60.8  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000230744  hitchhiker  0.000000189943 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3944  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.13 
 
 
466 aa  60.8  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6159  Alpha-N-arabinofuranosidase  23.73 
 
 
507 aa  60.5  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.444689  normal  0.0822461 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1980  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  25.75 
 
 
355 aa  60.5  0.00000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000532018  hitchhiker  0.000349844 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0168  alpha-N-arabinofuranosidase 2  25.68 
 
 
316 aa  60.5  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0375  Alpha-N-arabinofuranosidase  24.71 
 
 
320 aa  60.5  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.194615 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1393  immunoglobulin I-set domain-containing protein  24.66 
 
 
810 aa  60.5  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>