103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0353 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0353  Xylan 1,4-beta-xylosidase  100 
 
 		 346 aa  720    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0795  Xylan 1,4-beta-xylosidase  72.17 
 
 		 346 aa  524  1e-148  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000173963  normal  0.0629112 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0822  Alpha-L-arabinofuranosidase  64.13 
 
 		 385 aa  439  9.999999999999999e-123  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000000000001862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4846  Xylan 1,4-beta-xylosidase  64.35 
 
 		 367 aa  438  9.999999999999999e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0960373  hitchhiker  0.00474985 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3728  Alpha-L-arabinofuranosidase  59.18 
 
 		 383 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1998  Alpha-N-arabinofuranosidase  58.77 
 
 		 344 aa  405  1.0000000000000001e-112  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2614  glycoside hydrolase family 43  56.6 
 
 		 326 aa  398  9.999999999999999e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0375  Alpha-N-arabinofuranosidase  56.29 
 
 		 320 aa  390  1e-107  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.194615 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1323  Alpha-N-arabinofuranosidase  57.32 
 
 		 330 aa  391  1e-107  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03869  beta-xylosidase (1,4-beta-D-xylan xylohydrolase) (Xylan1,4-beta-xylosidase) (Exo-beta-(1,4)-xylanase)  53.82 
 
 		 344 aa  381  1e-104  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01477  beta-1,4-xylosidase (Eurofung)  50.43 
 
 		 404 aa  367  1e-100  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0551  Xylan 1,4-beta-xylosidase  53.05 
 
 		 335 aa  340  2e-92  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000239269 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0810  carbohydrate-binding family 6 protein  36.78 
 
 		 450 aa  197  3e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.034958  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3224  Alpha-N-arabinofuranosidase  33.89 
 
 		 444 aa  187  2e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.136595  normal  0.135367 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4501  Alpha-N-arabinofuranosidase  34.94 
 
 		 316 aa  182  6e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.570213  normal  0.69004 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0946  SecY protein  35.98 
 
 		 317 aa  169  9e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.409307  hitchhiker  0.0000724629 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2196  carbohydrate-binding family 6 protein  31.37 
 
 		 533 aa  152  5.9999999999999996e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3612  methionine biosynthesis MetW  32.04 
 
 		 1186 aa  152  1e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0161329  hitchhiker  0.00479901 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1235  Carbohydrate binding family 6  30.81 
 
 		 509 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00440741  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2447  putative xylosidase  30.91 
 
 		 468 aa  147  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.320135 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1982  glycoside hydrolase family protein  30.84 
 
 		 315 aa  143  4e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000010784  normal  0.0338284 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1271  carbohydrate-binding family 6 protein  32.94 
 
 		 679 aa  143  4e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1992  glycoside hydrolase family protein  30.84 
 
 		 315 aa  142  7e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000493506  unclonable  0.0000204974 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0455  Carbohydrate binding family 6  28.3 
 
 		 618 aa  142  9.999999999999999e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2837  glycoside hydrolase family 43  29.04 
 
 		 348 aa  140  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.61366  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1231  Carbohydrate binding family 6  31.17 
 
 		 524 aa  140  3.9999999999999997e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0177163  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1229  Carbohydrate binding family 6  31.78 
 
 		 535 aa  140  4.999999999999999e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.166566  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2069  glycoside hydrolase family protein  30.55 
 
 		 315 aa  139  7.999999999999999e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000027007  hitchhiker  0.0000035019 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3213  glycoside hydrolase family 43  30.22 
 
 		 464 aa  138  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.331095  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2063  glycoside hydrolase family protein  30.26 
 
 		 311 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000284349  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10919  hypothetical protein  26.76 
 
 		 383 aa  127  2.0000000000000002e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0280473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0789  endo-1,4-beta-xylanase D precursor  28.98 
 
 		 317 aa  123  5e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0130439  normal  0.452031 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2143  glycoside hydrolase family 43  29.06 
 
 		 311 aa  123  5e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.209046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01459  xylosidase; arabinosidase  28.1 
 
 		 527 aa  113  4.0000000000000004e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.928055  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0182  glycoside hydrolase family 43  30.77 
 
 		 1338 aa  105  1e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2866  glycoside hydrolase family 43  28.39 
 
 		 487 aa  105  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.141314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1928  Carbohydrate-binding CenC domain protein  28.77 
 
 		 712 aa  101  1e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0823  glycoside hydrolase family 43  25.61 
 
 		 302 aa  99.8  6e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.328209 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3109  glycoside hydrolase family protein  28.86 
 
 		 644 aa  92.4  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0193  glycoside hydrolase family 43  29.03 
 
 		 324 aa  92.4  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00680352  normal  0.581709 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2384  glycoside hydrolase family 43  29.67 
 
 		 330 aa  90.1  5e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3276  carbohydrate-binding family 6 protein  27.72 
 
 		 401 aa  89.7  7e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1660  carbohydrate binding domain/beta-xylosidase family protein  28.96 
 
 		 667 aa  86.3  7e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.324921  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6730  glycoside hydrolase family 43  29.07 
 
 		 323 aa  85.9  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575675  normal  0.920031 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16970  beta-xylosidase  29.62 
 
 		 313 aa  82.8  0.000000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.374085 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1011  glycoside hydrolase family 43  28.7 
 
 		 471 aa  77.8  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0531  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.33 
 
 		 471 aa  76.3  0.0000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2022  glycoside hydrolase family 43  24.24 
 
 		 334 aa  70.1  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0536  glycoside hydrolase family 43  30.41 
 
 		 393 aa  68.9  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.812392 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2722  glycoside hydrolase family protein  23.64 
 
 		 310 aa  68.2  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.123508  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20580  glycoside hydrolase family 43  25.37 
 
 		 315 aa  67  0.0000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2482  glycoside hydrolase family 43  27.62 
 
 		 384 aa  66.6  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.24102 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01870  xylosidase/arabinosidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04480)  25.55 
 
 		 344 aa  66.2  0.0000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0359  glycoside hydrolase family protein  27.67 
 
 		 506 aa  65.5  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0212595 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0737  glycoside hydrolase family protein  25.55 
 
 		 345 aa  60.1  0.00000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.612706  normal  0.340405 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2156  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  24.52 
 
 		 352 aa  58.5  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000116592  hitchhiker  0.00999646 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2027  glycoside hydrolase family protein  25.51 
 
 		 325 aa  57.8  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.808853  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2051  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  23.6 
 
 		 357 aa  57  0.0000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3519  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  33.8 
 
 		 640 aa  54.3  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0875  glycoside hydrolase family protein  27.15 
 
 		 636 aa  54.7  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000412559  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1995  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  24.44 
 
 		 355 aa  52.8  0.000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000026265  hitchhiker  0.0000968585 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1980  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  23.75 
 
 		 355 aa  52  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000532018  hitchhiker  0.000349844 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2082  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  23.75 
 
 		 356 aa  52.4  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000230744  hitchhiker  0.000000189943 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6022  glycoside hydrolase family 43  24.47 
 
 		 319 aa  52.4  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06352  Endo-alpha-1,5-L-arabinanasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AZC8]  26.92 
 
 		 400 aa  52  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.605603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2723  glycoside hydrolase family protein  25.32 
 
 		 345 aa  51.2  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.469303  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2632  glycoside hydrolase family protein  26.37 
 
 		 543 aa  51.6  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0211688  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0745  glycoside hydrolase family 43  26.77 
 
 		 327 aa  51.2  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.465475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0786  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  25.27 
 
 		 346 aa  50.8  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000141301  normal  0.447167 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1115  family 43 glycoside hydrolase  22.43 
 
 		 338 aa  50.8  0.00004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1729  glycoside hydrolase family 43  32.93 
 
 		 472 aa  50.1  0.00005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.101805  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0206  glycoside hydrolase family 43  27.8 
 
 		 304 aa  50.1  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  0.253285 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3903  glycoside hydrolase family protein  24.62 
 
 		 340 aa  50.1  0.00006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.969992  normal  0.175565 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0507  glycoside hydrolase family 43  28.45 
 
 		 337 aa  50.1  0.00006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.412329 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0473  glycoside hydrolase family 43  21.84 
 
 		 829 aa  49.7  0.00007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.658009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0191  glycoside hydrolase family protein  37.65 
 
 		 512 aa  48.9  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1390  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  25.4 
 
 		 341 aa  48.5  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.287204  normal  0.664348 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1302  putative beta-xylosidase  25.7 
 
 		 713 aa  48.5  0.0002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3750  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  31.15 
 
 		 319 aa  47.8  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00407758  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0650  glycoside hydrolase family 43  25.09 
 
 		 495 aa  47.4  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0713148  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3932  glycoside hydrolase family 43  27.27 
 
 		 456 aa  47  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.325517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4289  glycoside hydrolase family protein  28.16 
 
 		 572 aa  47  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.786059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3109  glycoside hydrolase family protein  26.71 
 
 		 348 aa  46.6  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.158232 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2809  ATPase  23.98 
 
 		 789 aa  45.8  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.153749  decreased coverage  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1150  glycoside hydrolase family 43  30.1 
 
 		 560 aa  45.8  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1751  coagulation factor 5/8 type domain protein  47.83 
 
 		 576 aa  45.8  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2971  glycoside hydrolase family 43  28.17 
 
 		 855 aa  45.4  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0529993 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2201  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  22.75 
 
 		 343 aa  45.8  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03855  xylosidase; arabinosidase  25.13 
 
 		 556 aa  44.7  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2732  glycoside hydrolase family 43  25.43 
 
 		 315 aa  44.3  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2449  glycoside hydrolase family 43  30.84 
 
 		 537 aa  43.9  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114761  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0628  glycoside hydrolase family 43  26.32 
 
 		 505 aa  43.9  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2392  glycoside hydrolase family 43  26.4 
 
 		 306 aa  43.9  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000540158  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3298  coagulation factor 5/8 type domain protein  50 
 
 		 593 aa  43.5  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.679676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2556  glycoside hydrolase family 43  25.3 
 
 		 319 aa  43.5  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.149373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21180  beta-xylosidase  23.23 
 
 		 526 aa  43.9  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.851115  normal  0.166078 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1423  Xylan 1,4-beta-xylosidase  31.21 
 
 		 558 aa  43.5  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.423704 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4703  glycoside hydrolase family 43  34.55 
 
 		 341 aa  43.1  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.184013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2423  glycoside hydrolase family 43  30.91 
 
 		 699 aa  43.1  0.007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4788  Xylan 1,4-beta-xylosidase  25.62 
 
 		 562 aa  43.1  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.771274  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>