209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3360 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3360  glycoside hydrolase family 43  100 
 
 		 522 aa  1070    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0779432 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1524  glycoside hydrolase family 43  58.19 
 
 		 524 aa  648    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6044  glycoside hydrolase family 43  38.09 
 
 		 501 aa  370  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.845022  normal  0.0554344 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2639  glycoside hydrolase family 43  33.88 
 
 		 472 aa  280  6e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.431626  normal  0.0143862 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0650  glycoside hydrolase family 43  33.26 
 
 		 495 aa  261  3e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0713148  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2423  glycoside hydrolase family 43  32.19 
 
 		 699 aa  140  6e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2392  glycoside hydrolase family 43  34.08 
 
 		 306 aa  136  9.999999999999999e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000540158  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3622  Xylan 1,4-beta-xylosidase  29.22 
 
 		 540 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.573352  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3811  glycoside hydrolase family 43  28.57 
 
 		 535 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0737  glycoside hydrolase family protein  32.63 
 
 		 345 aa  125  2e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.612706  normal  0.340405 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4021  glycoside hydrolase family protein  27.76 
 
 		 537 aa  125  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.701147 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4703  glycoside hydrolase family 43  30.09 
 
 		 341 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.184013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0206  glycoside hydrolase family 43  31.29 
 
 		 304 aa  121  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  0.253285 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2914  glycoside hydrolase family protein  25.3 
 
 		 547 aa  120  4.9999999999999996e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2723  glycoside hydrolase family protein  31.58 
 
 		 345 aa  119  9.999999999999999e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.469303  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0191  glycoside hydrolase family protein  30.5 
 
 		 512 aa  119  1.9999999999999998e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3522  glycoside hydrolase family protein  26.81 
 
 		 534 aa  117  6.9999999999999995e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.653851  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3403  glycoside hydrolase family 43  28.29 
 
 		 357 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000194853  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1435  glycoside hydrolase family 43  28.25 
 
 		 545 aa  114  5e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2449  glycoside hydrolase family 43  30.17 
 
 		 537 aa  110  9.000000000000001e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114761  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4504  glycoside hydrolase family 43  27.2 
 
 		 510 aa  107  4e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3042  twin-arginine translocation pathway signal  27.41 
 
 		 537 aa  107  4e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.351967  normal  0.568346 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4284  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  29.94 
 
 		 327 aa  107  4e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3531  glycoside hydrolase family 43  30.2 
 
 		 511 aa  106  8e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.185955 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3228  glycoside hydrolase family protein  25.1 
 
 		 563 aa  106  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00674596  normal  0.0120766 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1390  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  29.22 
 
 		 341 aa  102  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.287204  normal  0.664348 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3237  glycoside hydrolase family protein  27.66 
 
 		 1195 aa  102  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414155 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1616  alpha-L-arabinofuranosidase  27.45 
 
 		 550 aa  100  4e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.347525  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1710  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.92 
 
 		 541 aa  100  6e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.783601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1420  glycoside hydrolase family 43  30.12 
 
 		 530 aa  100  7e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.394008  normal  0.931127 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2022  glycoside hydrolase family 43  29.45 
 
 		 334 aa  100  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0935  glycoside hydrolase family 43  24.85 
 
 		 522 aa  99.8  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2532  glycoside hydrolase family 43  28.08 
 
 		 586 aa  99  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1143  Alpha-L-arabinofuranosidase  26.1 
 
 		 523 aa  98.2  3e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3438  glycoside hydrolase family 43  30.16 
 
 		 519 aa  98.2  3e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.990127  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0875  glycoside hydrolase family protein  28.76 
 
 		 636 aa  97.8  4e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000412559  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2028  glycoside hydrolase family protein  23.32 
 
 		 498 aa  97.8  4e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0700  glycoside hydrolase family 43  24.14 
 
 		 522 aa  97.4  5e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2556  glycoside hydrolase family 43  29.96 
 
 		 319 aa  97.4  6e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.149373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3903  glycoside hydrolase family protein  29.81 
 
 		 340 aa  97.1  7e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.969992  normal  0.175565 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0289  xylan 1,4-beta-xylosidase  25.58 
 
 		 532 aa  96.7  9e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000021727  normal  0.556687 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6022  glycoside hydrolase family 43  29.33 
 
 		 319 aa  96.7  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2027  glycoside hydrolase family protein  25.71 
 
 		 325 aa  94.7  3e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.808853  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4249  glycoside hydrolase family protein  26.63 
 
 		 532 aa  95.1  3e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.158619  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2409  hypothetical protein  25.22 
 
 		 541 aa  94.7  4e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3398  glycoside hydrolase family protein  25.32 
 
 		 514 aa  94.4  5e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0740676  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20580  glycoside hydrolase family 43  29.93 
 
 		 315 aa  94  6e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0507  glycoside hydrolase family 43  27.21 
 
 		 337 aa  93.6  7e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.412329 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0536  glycoside hydrolase family 43  28.13 
 
 		 393 aa  93.6  8e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.812392 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2156  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  27.36 
 
 		 352 aa  93.2  9e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000116592  hitchhiker  0.00999646 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2482  glycoside hydrolase family 43  28.34 
 
 		 384 aa  92.8  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.24102 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2082  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  27.69 
 
 		 356 aa  92.4  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000230744  hitchhiker  0.000000189943 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1423  Xylan 1,4-beta-xylosidase  27.75 
 
 		 558 aa  90.9  5e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.423704 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1980  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  27.36 
 
 		 355 aa  90.9  5e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000532018  hitchhiker  0.000349844 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2996  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.76 
 
 		 559 aa  90.9  5e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0786  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  27.51 
 
 		 346 aa  90.5  6e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000141301  normal  0.447167 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20520  beta-xylosidase  27.17 
 
 		 542 aa  90.5  6e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.129044  normal  0.254652 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0628  glycoside hydrolase family 43  27.01 
 
 		 505 aa  90.9  6e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07864  conserved hypothetical protein  24.68 
 
 		 540 aa  90.5  7e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0157749  normal  0.535242 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1995  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  27.36 
 
 		 355 aa  90.5  7e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000026265  hitchhiker  0.0000968585 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4289  glycoside hydrolase family protein  29.7 
 
 		 572 aa  90.1  9e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.786059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2114  glycoside hydrolase family 43  26.89 
 
 		 518 aa  89.7  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.554254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2051  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  28.34 
 
 		 357 aa  90.1  1e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4322  glycoside hydrolase family protein  24.35 
 
 		 581 aa  89.4  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2698  glycoside hydrolase family 43  29.25 
 
 		 369 aa  88.2  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.898004  normal  0.338928 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2090  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.32 
 
 		 537 aa  88.6  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00759162  normal  0.572245 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3048  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.41 
 
 		 515 aa  87.8  4e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0608814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4496  glycoside hydrolase family 43  28.29 
 
 		 503 aa  87.8  4e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0241272  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2632  glycoside hydrolase family protein  24.36 
 
 		 543 aa  88.2  4e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0211688  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3750  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  28.71 
 
 		 319 aa  87.4  5e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00407758  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3011  Alpha-N-arabinofuranosidase  25 
 
 		 538 aa  87.4  5e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2329  Xylan 1,4-beta-xylosidase  26.88 
 
 		 537 aa  87.8  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.80101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03261  xylosidase  25.74 
 
 		 365 aa  87.4  5e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.687612  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0431  glycoside hydrolase family protein  29.55 
 
 		 451 aa  87  7e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2318  alpha-N-arabinofuranosidase  29.34 
 
 		 512 aa  86.3  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.389032  normal  0.249416 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2108  glycoside hydrolase family 43  27.51 
 
 		 650 aa  86.3  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000141623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4681  glycoside hydrolase family protein  25.75 
 
 		 492 aa  86.3  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.026787  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0936  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.37 
 
 		 546 aa  86.3  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.789253 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5511  glycoside hydrolase family 43  24.29 
 
 		 536 aa  85.5  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0274092 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0739  glycoside hydrolase family protein  26.54 
 
 		 348 aa  85.5  0.000000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2699  glycoside hydrolase family 43  26.04 
 
 		 496 aa  85.5  0.000000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.276179  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1500  glycoside hydrolase family 43  28.29 
 
 		 551 aa  85.1  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.36043 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1150  glycoside hydrolase family 43  31.03 
 
 		 560 aa  84.7  0.000000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1655  translation initiation factor IF-1  30 
 
 		 566 aa  84.3  0.000000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0976225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0457  Alpha-N-arabinofuranosidase  24.02 
 
 		 539 aa  83.6  0.000000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0354643 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4788  Xylan 1,4-beta-xylosidase  27.71 
 
 		 562 aa  82.8  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.771274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0848  Beta-xylosidase  23.97 
 
 		 552 aa  82.4  0.00000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.168219  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3875  glycoside hydrolase family protein  28.7 
 
 		 518 aa  82  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0182  glycoside hydrolase family 43  28.48 
 
 		 1338 aa  82.4  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4281  glycoside hydrolase family protein  27.96 
 
 		 304 aa  82.4  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.394059  normal  0.201547 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2518  glycoside hydrolase family protein  26.05 
 
 		 516 aa  82.8  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2732  glycoside hydrolase family 43  25.65 
 
 		 315 aa  81.6  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1878  beta-xylosidase  23.12 
 
 		 539 aa  81.6  0.00000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1729  glycoside hydrolase family 43  25.26 
 
 		 472 aa  81.3  0.00000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.101805  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3545  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.85 
 
 		 547 aa  81.3  0.00000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0270111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3932  glycoside hydrolase family 43  29.1 
 
 		 456 aa  80.5  0.00000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.325517  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2459  Xylan 1,4-beta-xylosidase  25.33 
 
 		 488 aa  80.1  0.00000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2813  glycoside hydrolase family 43  25.94 
 
 		 331 aa  79.7  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0257715  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2413  glycoside hydrolase family protein  25.95 
 
 		 521 aa  79.7  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.333908  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3351  glycoside hydrolase family 43  23.83 
 
 		 522 aa  79  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>