197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1390 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_1390  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  100 
 
 
341 aa  702    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.287204  normal  0.664348 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1995  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  66.28 
 
 
355 aa  481  1e-135  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000026265  hitchhiker  0.0000968585 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1980  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  66.57 
 
 
355 aa  482  1e-135  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000532018  hitchhiker  0.000349844 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2082  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  66.57 
 
 
356 aa  482  1e-135  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000230744  hitchhiker  0.000000189943 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2156  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  67.47 
 
 
352 aa  474  1e-132  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000116592  hitchhiker  0.00999646 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2051  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  64.2 
 
 
357 aa  463  1e-129  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0786  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  61.2 
 
 
346 aa  429  1e-119  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000141301  normal  0.447167 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4284  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  54.97 
 
 
327 aa  381  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2732  glycoside hydrolase family 43  50 
 
 
315 aa  295  9e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2813  glycoside hydrolase family 43  42.38 
 
 
331 aa  235  7e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0257715  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2201  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  42.32 
 
 
343 aa  228  2e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3750  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  41.2 
 
 
319 aa  224  2e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00407758  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0516  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  40.18 
 
 
366 aa  223  4e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000112186  decreased coverage  0.000226611 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04520  beta-xylosidase  40.62 
 
 
491 aa  216  5e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.130696  normal  0.0670778 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0179  cellulose-binding family II  40.45 
 
 
598 aa  213  3.9999999999999995e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00318302 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1014  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  38.51 
 
 
472 aa  208  1e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000194163  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0989  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  40.13 
 
 
334 aa  203  3e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0127699  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0078  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  37.7 
 
 
379 aa  166  5e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.144884  normal  0.277265 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1729  glycoside hydrolase family 43  34.12 
 
 
472 aa  162  7e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.101805  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2449  glycoside hydrolase family 43  35.2 
 
 
537 aa  149  6e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114761  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06352  Endo-alpha-1,5-L-arabinanasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AZC8]  30.94 
 
 
400 aa  133  5e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.605603  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03044  Endo-arabinanase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFU2]  30.56 
 
 
386 aa  126  7e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2423  glycoside hydrolase family 43  31.62 
 
 
699 aa  123  4e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08007  Endo-alpha-1,5-arabinanasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AUM3]  31.37 
 
 
320 aa  123  5e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.766445 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4703  glycoside hydrolase family 43  31.15 
 
 
341 aa  122  6e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.184013  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02534  endoarabinanase (Eurofung)  31.99 
 
 
380 aa  122  9.999999999999999e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4496  glycoside hydrolase family 43  32.27 
 
 
503 aa  117  1.9999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0241272  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3403  glycoside hydrolase family 43  30.54 
 
 
357 aa  117  3e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000194853  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4504  glycoside hydrolase family 43  28.82 
 
 
510 aa  117  3.9999999999999997e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6081  glycoside hydrolase family 43  29.27 
 
 
480 aa  114  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0650  glycoside hydrolase family 43  27.69 
 
 
495 aa  110  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0713148  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1524  glycoside hydrolase family 43  29.14 
 
 
524 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0664  glycoside hydrolase family protein  27.84 
 
 
476 aa  108  2e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6044  glycoside hydrolase family 43  28.82 
 
 
501 aa  104  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.845022  normal  0.0554344 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0015  alpha-L-arabinofuranosidase B  25.95 
 
 
707 aa  104  3e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0637  glycoside hydrolase family protein  27.58 
 
 
471 aa  103  3e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000622549  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3360  glycoside hydrolase family 43  29.22 
 
 
522 aa  103  6e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0779432 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0639  glycoside hydrolase family protein  27.57 
 
 
475 aa  102  8e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000370471  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0510  glycoside hydrolase family 43  27.89 
 
 
456 aa  99.8  6e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0180422  hitchhiker  0.00320544 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0662  glycoside hydrolase family protein  27.61 
 
 
471 aa  97.4  3e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000191922  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0473  glycoside hydrolase family 43  28.18 
 
 
829 aa  97.1  4e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.658009  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0737  glycoside hydrolase family protein  27.1 
 
 
345 aa  96.3  6e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.612706  normal  0.340405 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29390  beta-xylosidase  28.17 
 
 
494 aa  93.6  4e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.838648  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2809  ATPase  23.96 
 
 
789 aa  93.2  6e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.153749  decreased coverage  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1393  immunoglobulin I-set domain-containing protein  27.15 
 
 
810 aa  90.9  3e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1542  beta-xylosidase  26.84 
 
 
581 aa  87.4  3e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1623  glycoside hydrolase family 43  26.09 
 
 
804 aa  86.7  6e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0299424  normal  0.680345 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2047  glycoside hydrolase family protein  27.5 
 
 
1112 aa  85.9  9e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000114958  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2639  glycoside hydrolase family 43  26.35 
 
 
472 aa  84.7  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.431626  normal  0.0143862 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1622  glycoside hydrolase family 43  26.23 
 
 
703 aa  84.3  0.000000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.372812  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2728  hypothetical protein  25 
 
 
848 aa  84  0.000000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1976  glycoside hydrolase family protein  26.89 
 
 
1121 aa  83.6  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00565193  hitchhiker  0.00420486 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1999  glycoside hydrolase family protein  25.69 
 
 
1121 aa  82.8  0.000000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000101187  decreased coverage  0.0000000170847 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2161  glycoside hydrolase family protein  25.45 
 
 
1143 aa  82.4  0.000000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000526501  hitchhiker  0.0000457644 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5511  glycoside hydrolase family 43  27.78 
 
 
536 aa  81.3  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0274092 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1543  beta-xylosidase  23.7 
 
 
531 aa  80.5  0.00000000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.000200892  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2086  beta-xylosidase-like protein  25.56 
 
 
1121 aa  80.1  0.00000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00280414  decreased coverage  0.0000000469917 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3292  glycoside hydrolase family 43  28.94 
 
 
488 aa  80.1  0.00000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.223704  hitchhiker  0.00299224 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4021  glycoside hydrolase family protein  25 
 
 
537 aa  79.7  0.00000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.701147 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3042  twin-arginine translocation pathway signal  25.71 
 
 
537 aa  77.4  0.0000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.351967  normal  0.568346 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4289  glycoside hydrolase family protein  27.36 
 
 
572 aa  77.8  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.786059  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0507  glycoside hydrolase family 43  27.59 
 
 
337 aa  76.6  0.0000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.412329 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0191  glycoside hydrolase family protein  27.88 
 
 
512 aa  76.3  0.0000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3317  Beta-xylosidase-like  25.65 
 
 
1174 aa  74.7  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00018095  hitchhiker  0.000000702951 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4788  Xylan 1,4-beta-xylosidase  25.17 
 
 
562 aa  75.1  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.771274  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4249  glycoside hydrolase family protein  23.96 
 
 
532 aa  73.9  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.158619  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3622  Xylan 1,4-beta-xylosidase  26.2 
 
 
540 aa  73.6  0.000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.573352  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2914  glycoside hydrolase family protein  24.08 
 
 
547 aa  73.2  0.000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3531  glycoside hydrolase family 43  23.33 
 
 
511 aa  72  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.185955 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0700  glycoside hydrolase family 43  24.2 
 
 
522 aa  70.9  0.00000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0935  glycoside hydrolase family 43  24.68 
 
 
522 aa  70.1  0.00000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1150  glycoside hydrolase family 43  26.91 
 
 
560 aa  69.3  0.00000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1500  glycoside hydrolase family 43  23.84 
 
 
551 aa  68.9  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.36043 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0430  glycoside hydrolase family 43  26.12 
 
 
497 aa  68.6  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.710686 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01459  xylosidase; arabinosidase  29.92 
 
 
527 aa  68.6  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.928055  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1435  glycoside hydrolase family 43  22.26 
 
 
545 aa  67.8  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2392  glycoside hydrolase family 43  25.35 
 
 
306 aa  68.6  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000540158  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3228  glycoside hydrolase family protein  26.83 
 
 
563 aa  68.2  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00674596  normal  0.0120766 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1400  glycoside hydrolase family 43  26.54 
 
 
517 aa  67.4  0.0000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.587173  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1143  Alpha-L-arabinofuranosidase  25.36 
 
 
523 aa  67  0.0000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2447  putative xylosidase  27.04 
 
 
468 aa  67  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.320135 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3811  glycoside hydrolase family 43  25.4 
 
 
535 aa  67  0.0000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2723  glycoside hydrolase family protein  25.45 
 
 
345 aa  66.6  0.0000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.469303  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4681  glycoside hydrolase family protein  23.64 
 
 
492 aa  66.6  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.026787  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3545  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.85 
 
 
547 aa  66.2  0.0000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0270111  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1992  glycoside hydrolase family protein  25.8 
 
 
315 aa  65.9  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000493506  unclonable  0.0000204974 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3522  glycoside hydrolase family protein  24.91 
 
 
534 aa  64.7  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.653851  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2069  glycoside hydrolase family protein  25.48 
 
 
315 aa  63.9  0.000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000027007  hitchhiker  0.0000035019 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3599  glycoside hydrolase family 43  25.52 
 
 
497 aa  63.9  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0127437  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3109  glycoside hydrolase family protein  27.24 
 
 
348 aa  63.5  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.158232 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2482  glycoside hydrolase family 43  26.27 
 
 
384 aa  63.2  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.24102 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3351  glycoside hydrolase family 43  24.69 
 
 
522 aa  62.8  0.000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6022  glycoside hydrolase family 43  24.62 
 
 
319 aa  62.8  0.000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0789  endo-1,4-beta-xylanase D precursor  28.12 
 
 
317 aa  62.4  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0130439  normal  0.452031 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2022  glycoside hydrolase family 43  25.78 
 
 
334 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1982  glycoside hydrolase family protein  25.48 
 
 
315 aa  62.4  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000010784  normal  0.0338284 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1616  alpha-L-arabinofuranosidase  27.6 
 
 
550 aa  61.6  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.347525  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0810  carbohydrate-binding family 6 protein  25.52 
 
 
450 aa  61.2  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.034958  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3932  glycoside hydrolase family 43  25.38 
 
 
456 aa  61.6  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.325517  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3048  Alpha-N-arabinofuranosidase  24.8 
 
 
515 aa  61.2  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0608814  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>