103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_03261 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_03261  xylosidase  100 
 
 		 365 aa  747    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.687612  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3042  twin-arginine translocation pathway signal  58.12 
 
 		 537 aa  353  2e-96  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.351967  normal  0.568346 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2914  glycoside hydrolase family protein  57.53 
 
 		 547 aa  337  1.9999999999999998e-91  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4021  glycoside hydrolase family protein  58.7 
 
 		 537 aa  336  3.9999999999999995e-91  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.701147 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3531  glycoside hydrolase family 43  57.75 
 
 		 511 aa  330  3e-89  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.185955 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3622  Xylan 1,4-beta-xylosidase  52.22 
 
 		 540 aa  326  5e-88  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.573352  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3811  glycoside hydrolase family 43  51.57 
 
 		 535 aa  325  7e-88  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3522  glycoside hydrolase family protein  55.37 
 
 		 534 aa  320  1.9999999999999998e-86  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.653851  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1435  glycoside hydrolase family 43  51.59 
 
 		 545 aa  313  2.9999999999999996e-84  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0875  glycoside hydrolase family protein  35.27 
 
 		 636 aa  136  7.000000000000001e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000412559  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0431  glycoside hydrolase family protein  35.48 
 
 		 451 aa  134  3e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0191  glycoside hydrolase family protein  32.26 
 
 		 512 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3599  glycoside hydrolase family 43  33.21 
 
 		 497 aa  122  8e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0127437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1400  glycoside hydrolase family 43  33.81 
 
 		 517 aa  122  8e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.587173  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3011  Alpha-N-arabinofuranosidase  32.27 
 
 		 538 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0430  glycoside hydrolase family 43  33.21 
 
 		 497 aa  115  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.710686 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0598  Alpha-L-arabinofuranosidase  32.92 
 
 		 577 aa  112  1.0000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.628109 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2532  glycoside hydrolase family 43  31.41 
 
 		 586 aa  111  2.0000000000000002e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21180  beta-xylosidase  32.11 
 
 		 526 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.851115  normal  0.166078 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4681  glycoside hydrolase family protein  32.62 
 
 		 492 aa  110  3e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.026787  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4289  glycoside hydrolase family protein  32.26 
 
 		 572 aa  110  5e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.786059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3438  glycoside hydrolase family 43  32.3 
 
 		 519 aa  108  1e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.990127  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3569  glycoside hydrolase family 43  32.36 
 
 		 484 aa  107  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0058203  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2699  glycoside hydrolase family 43  33.92 
 
 		 496 aa  108  2e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.276179  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1616  alpha-L-arabinofuranosidase  32.65 
 
 		 550 aa  105  1e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.347525  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1655  translation initiation factor IF-1  29.79 
 
 		 566 aa  105  1e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0976225  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3228  glycoside hydrolase family protein  30.93 
 
 		 563 aa  104  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00674596  normal  0.0120766 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0289  xylan 1,4-beta-xylosidase  32.44 
 
 		 532 aa  104  2e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000021727  normal  0.556687 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2459  Xylan 1,4-beta-xylosidase  32.12 
 
 		 488 aa  104  3e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2028  glycoside hydrolase family protein  30 
 
 		 498 aa  102  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03855  xylosidase; arabinosidase  30.94 
 
 		 556 aa  101  2e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5511  glycoside hydrolase family 43  32.63 
 
 		 536 aa  102  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0274092 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4788  Xylan 1,4-beta-xylosidase  33.33 
 
 		 562 aa  101  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.771274  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2318  alpha-N-arabinofuranosidase  32.76 
 
 		 512 aa  99.4  9e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.389032  normal  0.249416 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4322  glycoside hydrolase family protein  30.74 
 
 		 581 aa  98.6  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1150  glycoside hydrolase family 43  31.75 
 
 		 560 aa  97.1  5e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0935  glycoside hydrolase family 43  34.5 
 
 		 522 aa  96.3  7e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3880  glycoside hydrolase family protein  27.61 
 
 		 571 aa  95.9  9e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3398  glycoside hydrolase family protein  29.68 
 
 		 514 aa  95.5  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0740676  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0936  Alpha-N-arabinofuranosidase  30.2 
 
 		 546 aa  95.5  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.789253 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1500  glycoside hydrolase family 43  32.9 
 
 		 551 aa  95.5  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.36043 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4249  glycoside hydrolase family protein  30.71 
 
 		 532 aa  94.7  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.158619  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0700  glycoside hydrolase family 43  34.06 
 
 		 522 aa  94.7  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3545  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.88 
 
 		 547 aa  93.2  6e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0270111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2632  glycoside hydrolase family protein  32.34 
 
 		 543 aa  91.7  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0211688  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3360  glycoside hydrolase family 43  26.14 
 
 		 522 aa  90.1  5e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0779432 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2518  glycoside hydrolase family protein  30.5 
 
 		 516 aa  89  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3048  Alpha-N-arabinofuranosidase  30.61 
 
 		 515 aa  89  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0608814  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07864  conserved hypothetical protein  29.23 
 
 		 540 aa  88.2  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0157749  normal  0.535242 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0457  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.24 
 
 		 539 aa  85.9  9e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0354643 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3237  glycoside hydrolase family protein  27.53 
 
 		 1195 aa  85.9  9e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414155 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08477  xylosidase : arabinofuranosidase (AFU_orthologue; AFUA_2G13190)  28.96 
 
 		 546 aa  85.5  0.000000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3334  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.38 
 
 		 536 aa  85.5  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.783434  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3351  glycoside hydrolase family 43  32.31 
 
 		 522 aa  85.5  0.000000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1143  Alpha-L-arabinofuranosidase  27.59 
 
 		 523 aa  84.7  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0650  glycoside hydrolase family 43  27.64 
 
 		 495 aa  85.1  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0713148  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1423  Xylan 1,4-beta-xylosidase  26.26 
 
 		 558 aa  82  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.423704 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1291  Beta-xylosidase  26.92 
 
 		 553 aa  80.9  0.00000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2413  glycoside hydrolase family protein  29.18 
 
 		 521 aa  81.3  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.333908  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0842  Alpha-L-arabinofuranosidase  28.37 
 
 		 546 aa  80.1  0.00000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.122484  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29240  beta-xylosidase  31.27 
 
 		 527 aa  80.1  0.00000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2329  Xylan 1,4-beta-xylosidase  28.85 
 
 		 537 aa  80.1  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.80101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2090  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.39 
 
 		 537 aa  78.2  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00759162  normal  0.572245 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2409  hypothetical protein  27.06 
 
 		 541 aa  78.2  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6044  glycoside hydrolase family 43  25.08 
 
 		 501 aa  78.6  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.845022  normal  0.0554344 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0848  Beta-xylosidase  26.52 
 
 		 552 aa  75.9  0.0000000000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.168219  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2639  glycoside hydrolase family 43  26.64 
 
 		 472 aa  75.9  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.431626  normal  0.0143862 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2044  beta-xylosidase/alpha-L-arabinofuranosidase- like protein  25.26 
 
 		 1474 aa  75.1  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1710  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.8 
 
 		 541 aa  75.1  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.783601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3718  glycoside hydrolase family protein  27.48 
 
 		 504 aa  75.1  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.456589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0501  glycoside hydrolase family 43  31.02 
 
 		 525 aa  75.1  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00998877 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20520  beta-xylosidase  27.69 
 
 		 542 aa  74.3  0.000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.129044  normal  0.254652 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2504  Xylan 1,4-beta-xylosidase  31.22 
 
 		 558 aa  73.2  0.000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2108  glycoside hydrolase family 43  31.31 
 
 		 650 aa  72  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000141623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1878  beta-xylosidase  28.52 
 
 		 539 aa  69.7  0.00000000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1524  glycoside hydrolase family 43  25.62 
 
 		 524 aa  69.3  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1068  glycoside hydrolase family 43  26.3 
 
 		 797 aa  68.6  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000256501  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1251  glycoside hydrolase family protein  32.43 
 
 		 665 aa  67.8  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1233  Carbohydrate binding family 6  41.18 
 
 		 746 aa  65.5  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.555313  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2996  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.82 
 
 		 559 aa  62.8  0.000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0473  glycoside hydrolase family 43  31.13 
 
 		 829 aa  60.8  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.658009  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0182  glycoside hydrolase family 43  30.13 
 
 		 1338 aa  57.4  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1231  Carbohydrate binding family 6  24.25 
 
 		 524 aa  57  0.0000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0177163  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0737  glycoside hydrolase family protein  23.88 
 
 		 345 aa  55.8  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.612706  normal  0.340405 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2114  glycoside hydrolase family 43  28.7 
 
 		 518 aa  55.8  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.554254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2723  glycoside hydrolase family protein  26.3 
 
 		 345 aa  54.3  0.000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.469303  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06751  glycosyl hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G06110)  25.28 
 
 		 591 aa  53.1  0.000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.326162 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0206  glycoside hydrolase family 43  27.37 
 
 		 304 aa  52.4  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  0.253285 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2392  glycoside hydrolase family 43  26.15 
 
 		 306 aa  52  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000540158  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3612  methionine biosynthesis MetW  22.18 
 
 		 1186 aa  51.2  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0161329  hitchhiker  0.00479901 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2027  glycoside hydrolase family protein  22.56 
 
 		 325 aa  50.8  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.808853  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2529  Alpha-N-arabinofuranosidase  24.04 
 
 		 355 aa  48.9  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0997912 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2196  carbohydrate-binding family 6 protein  23.55 
 
 		 533 aa  48.5  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3875  glycoside hydrolase family protein  23.35 
 
 		 518 aa  47.8  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2423  glycoside hydrolase family 43  25.59 
 
 		 699 aa  47.8  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1420  glycoside hydrolase family 43  26.84 
 
 		 530 aa  46.6  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.394008  normal  0.931127 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1280  glycoside hydrolase family 43  25.78 
 
 		 691 aa  46.6  0.0008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.286369  hitchhiker  0.00183728 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4504  glycoside hydrolase family 43  22.38 
 
 		 510 aa  45.8  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1302  putative beta-xylosidase  27.65 
 
 		 713 aa  45.1  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2449  glycoside hydrolase family 43  23.39 
 
 		 537 aa  44.7  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114761  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>