217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2423 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_2423  glycoside hydrolase family 43  100 
 
 
699 aa  1394    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4504  glycoside hydrolase family 43  55.59 
 
 
510 aa  379  1e-103  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4496  glycoside hydrolase family 43  43.97 
 
 
503 aa  285  2.0000000000000002e-75  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0241272  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2449  glycoside hydrolase family 43  42.58 
 
 
537 aa  268  2e-70  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114761  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0988  glycoside hydrolase family 10  59.59 
 
 
975 aa  237  5.0000000000000005e-61  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.661558  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4703  glycoside hydrolase family 43  38.58 
 
 
341 aa  207  7e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.184013  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3403  glycoside hydrolase family 43  37.54 
 
 
357 aa  205  2e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000194853  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0473  glycoside hydrolase family 43  31.2 
 
 
829 aa  144  6e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.658009  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3360  glycoside hydrolase family 43  29.81 
 
 
522 aa  140  6e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0779432 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4284  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  33.33 
 
 
327 aa  137  8e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1524  glycoside hydrolase family 43  32.43 
 
 
524 aa  136  9.999999999999999e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0737  glycoside hydrolase family protein  31.5 
 
 
345 aa  130  7.000000000000001e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.612706  normal  0.340405 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1995  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  28.65 
 
 
355 aa  123  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000026265  hitchhiker  0.0000968585 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04520  beta-xylosidase  32.6 
 
 
491 aa  123  9.999999999999999e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.130696  normal  0.0670778 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1390  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  31.62 
 
 
341 aa  122  1.9999999999999998e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.287204  normal  0.664348 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2156  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  27.99 
 
 
352 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000116592  hitchhiker  0.00999646 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1980  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  28.37 
 
 
355 aa  122  3e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000532018  hitchhiker  0.000349844 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2082  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  28.37 
 
 
356 aa  121  4.9999999999999996e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000230744  hitchhiker  0.000000189943 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2051  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  27.25 
 
 
357 aa  120  7.999999999999999e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2732  glycoside hydrolase family 43  33.22 
 
 
315 aa  117  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6044  glycoside hydrolase family 43  27.65 
 
 
501 aa  116  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.845022  normal  0.0554344 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2639  glycoside hydrolase family 43  27.96 
 
 
472 aa  113  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.431626  normal  0.0143862 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0786  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  30.72 
 
 
346 aa  113  1.0000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000141301  normal  0.447167 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3750  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  31.37 
 
 
319 aa  108  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00407758  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0179  cellulose-binding family II  31.64 
 
 
598 aa  108  3e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00318302 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2201  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  30.77 
 
 
343 aa  103  8e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0078  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  32.84 
 
 
379 aa  102  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.144884  normal  0.277265 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2813  glycoside hydrolase family 43  29.09 
 
 
331 aa  100  9e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0257715  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1014  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  32.12 
 
 
472 aa  96.3  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000194163  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0507  glycoside hydrolase family 43  28.53 
 
 
337 aa  96.3  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.412329 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2022  glycoside hydrolase family 43  29.76 
 
 
334 aa  94.4  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1729  glycoside hydrolase family 43  28.17 
 
 
472 aa  94  8e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.101805  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0206  glycoside hydrolase family 43  29.41 
 
 
304 aa  93.2  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  0.253285 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3438  glycoside hydrolase family 43  27.16 
 
 
519 aa  90.9  6e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.990127  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0650  glycoside hydrolase family 43  27.11 
 
 
495 aa  87.4  7e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0713148  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3903  glycoside hydrolase family protein  31.31 
 
 
340 aa  86.7  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.969992  normal  0.175565 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3599  glycoside hydrolase family 43  27.8 
 
 
497 aa  86.7  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0127437  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2392  glycoside hydrolase family 43  27.33 
 
 
306 aa  83.6  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000540158  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3042  twin-arginine translocation pathway signal  25.95 
 
 
537 aa  83.6  0.00000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.351967  normal  0.568346 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5511  glycoside hydrolase family 43  26.82 
 
 
536 aa  83.6  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0274092 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4289  glycoside hydrolase family protein  25.89 
 
 
572 aa  82.4  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.786059  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3569  glycoside hydrolase family 43  27.83 
 
 
484 aa  82  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0058203  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0191  glycoside hydrolase family protein  26.59 
 
 
512 aa  82  0.00000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0989  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  35.12 
 
 
334 aa  81.6  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0127699  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3531  glycoside hydrolase family 43  27.3 
 
 
511 aa  80.9  0.00000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.185955 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0510  glycoside hydrolase family 43  27.33 
 
 
456 aa  80.9  0.00000000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0180422  hitchhiker  0.00320544 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4021  glycoside hydrolase family protein  27.27 
 
 
537 aa  80.9  0.00000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.701147 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2866  glycoside hydrolase family 43  27.32 
 
 
487 aa  80.5  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.141314  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4249  glycoside hydrolase family protein  26.54 
 
 
532 aa  79.7  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.158619  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4788  Xylan 1,4-beta-xylosidase  25.9 
 
 
562 aa  79.7  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.771274  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1400  glycoside hydrolase family 43  28.57 
 
 
517 aa  79.7  0.0000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.587173  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0516  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  29.67 
 
 
366 aa  79  0.0000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000112186  decreased coverage  0.000226611 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0015  alpha-L-arabinofuranosidase B  26.35 
 
 
707 aa  79  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3048  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.9 
 
 
515 aa  78.6  0.0000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0608814  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0501  glycoside hydrolase family 43  27.65 
 
 
525 aa  78.2  0.0000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00998877 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3522  glycoside hydrolase family protein  24.8 
 
 
534 aa  77.8  0.0000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.653851  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2722  glycoside hydrolase family protein  29.09 
 
 
310 aa  77  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.123508  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2518  glycoside hydrolase family protein  24.71 
 
 
516 aa  77  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2028  glycoside hydrolase family protein  27 
 
 
498 aa  77  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2384  glycoside hydrolase family 43  26.67 
 
 
330 aa  76.6  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2632  glycoside hydrolase family protein  26.82 
 
 
543 aa  76.3  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0211688  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2914  glycoside hydrolase family protein  27.88 
 
 
547 aa  75.5  0.000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2723  glycoside hydrolase family protein  28.71 
 
 
345 aa  75.5  0.000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.469303  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3622  Xylan 1,4-beta-xylosidase  26.48 
 
 
540 aa  74.7  0.000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.573352  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0700  glycoside hydrolase family 43  25.89 
 
 
522 aa  74.7  0.000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1150  glycoside hydrolase family 43  27.76 
 
 
560 aa  74.7  0.000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2699  glycoside hydrolase family 43  27.51 
 
 
496 aa  74.3  0.000000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.276179  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4681  glycoside hydrolase family protein  27.41 
 
 
492 aa  73.9  0.000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.026787  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0935  glycoside hydrolase family 43  25.47 
 
 
522 aa  73.6  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2459  Xylan 1,4-beta-xylosidase  26.01 
 
 
488 aa  73.2  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20580  glycoside hydrolase family 43  26.42 
 
 
315 aa  72  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3351  glycoside hydrolase family 43  24.36 
 
 
522 aa  72.4  0.00000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6081  glycoside hydrolase family 43  27.78 
 
 
480 aa  72  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4281  glycoside hydrolase family protein  28.15 
 
 
304 aa  71.6  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.394059  normal  0.201547 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3811  glycoside hydrolase family 43  26.36 
 
 
535 aa  71.6  0.00000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1366  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.63 
 
 
648 aa  71.2  0.00000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.226192 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1435  glycoside hydrolase family 43  27.13 
 
 
545 aa  71.2  0.00000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2318  alpha-N-arabinofuranosidase  26.36 
 
 
512 aa  71.2  0.00000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.389032  normal  0.249416 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0628  glycoside hydrolase family 43  25.26 
 
 
505 aa  70.9  0.00000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03855  xylosidase; arabinosidase  23.78 
 
 
556 aa  70.9  0.00000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03044  Endo-arabinanase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFU2]  28.66 
 
 
386 aa  70.1  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29240  beta-xylosidase  25.86 
 
 
527 aa  70.1  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20520  beta-xylosidase  27.61 
 
 
542 aa  70.1  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.129044  normal  0.254652 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0430  glycoside hydrolase family 43  25 
 
 
497 aa  70.5  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.710686 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2556  glycoside hydrolase family 43  23.66 
 
 
319 aa  69.7  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.149373  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2532  glycoside hydrolase family 43  24.05 
 
 
586 aa  68.2  0.0000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0302  glycoside hydrolase family 5  55.07 
 
 
481 aa  67.4  0.0000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0480106  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08477  xylosidase : arabinofuranosidase (AFU_orthologue; AFUA_2G13190)  27.27 
 
 
546 aa  67.4  0.0000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6730  glycoside hydrolase family 43  28.57 
 
 
323 aa  66.6  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575675  normal  0.920031 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0193  glycoside hydrolase family 43  28.45 
 
 
324 aa  65.9  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00680352  normal  0.581709 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6022  glycoside hydrolase family 43  26.83 
 
 
319 aa  66.2  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1999  glycoside hydrolase family protein  27.32 
 
 
1121 aa  66.6  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000101187  decreased coverage  0.0000000170847 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21180  beta-xylosidase  26.54 
 
 
526 aa  65.9  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.851115  normal  0.166078 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0598  Alpha-L-arabinofuranosidase  24.92 
 
 
577 aa  65.1  0.000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.628109 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2086  beta-xylosidase-like protein  27.04 
 
 
1121 aa  65.1  0.000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00280414  decreased coverage  0.0000000469917 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1976  glycoside hydrolase family protein  26.91 
 
 
1121 aa  65.1  0.000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00565193  hitchhiker  0.00420486 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08007  Endo-alpha-1,5-arabinanasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AUM3]  29.76 
 
 
320 aa  64.3  0.000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.766445 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0875  glycoside hydrolase family protein  24.7 
 
 
636 aa  64.3  0.000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000412559  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06352  Endo-alpha-1,5-L-arabinanasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AZC8]  25.69 
 
 
400 aa  63.2  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.605603  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1500  glycoside hydrolase family 43  25.3 
 
 
551 aa  63.5  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.36043 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>