169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_2051 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_2051  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  100 
 
 
357 aa  740    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2156  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  84.03 
 
 
352 aa  629  1e-179  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000116592  hitchhiker  0.00999646 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1980  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  81.51 
 
 
355 aa  619  1e-176  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000532018  hitchhiker  0.000349844 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2082  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  81.23 
 
 
356 aa  617  1e-176  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000230744  hitchhiker  0.000000189943 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1995  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  80.39 
 
 
355 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000026265  hitchhiker  0.0000968585 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1390  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  66.67 
 
 
341 aa  458  9.999999999999999e-129  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.287204  normal  0.664348 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0786  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  61.01 
 
 
346 aa  423  1e-117  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000141301  normal  0.447167 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4284  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  53.16 
 
 
327 aa  349  3e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2732  glycoside hydrolase family 43  46.96 
 
 
315 aa  278  1e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04520  beta-xylosidase  43.44 
 
 
491 aa  224  2e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.130696  normal  0.0670778 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2201  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  41.23 
 
 
343 aa  224  3e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0179  cellulose-binding family II  41.1 
 
 
598 aa  220  3e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00318302 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1014  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  40.88 
 
 
472 aa  212  7.999999999999999e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000194163  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3750  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  39.13 
 
 
319 aa  207  3e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00407758  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0516  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  36.84 
 
 
366 aa  207  3e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000112186  decreased coverage  0.000226611 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2813  glycoside hydrolase family 43  38.61 
 
 
331 aa  206  4e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0257715  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0989  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  39.14 
 
 
334 aa  193  4e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0127699  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0078  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  36.93 
 
 
379 aa  172  5.999999999999999e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.144884  normal  0.277265 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1729  glycoside hydrolase family 43  33.84 
 
 
472 aa  157  3e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.101805  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2449  glycoside hydrolase family 43  31.76 
 
 
537 aa  133  6e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114761  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4703  glycoside hydrolase family 43  30.53 
 
 
341 aa  129  8.000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.184013  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02534  endoarabinanase (Eurofung)  32.16 
 
 
380 aa  128  1.0000000000000001e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06352  Endo-alpha-1,5-L-arabinanasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AZC8]  28.57 
 
 
400 aa  126  5e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.605603  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3403  glycoside hydrolase family 43  31.49 
 
 
357 aa  126  5e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000194853  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03044  Endo-arabinanase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFU2]  30.45 
 
 
386 aa  124  3e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4496  glycoside hydrolase family 43  32.85 
 
 
503 aa  122  9e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0241272  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2423  glycoside hydrolase family 43  27.25 
 
 
699 aa  120  3.9999999999999996e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4504  glycoside hydrolase family 43  28.52 
 
 
510 aa  112  7.000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0637  glycoside hydrolase family protein  29.07 
 
 
471 aa  109  7.000000000000001e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000622549  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08007  Endo-alpha-1,5-arabinanasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AUM3]  30.48 
 
 
320 aa  106  6e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.766445 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0639  glycoside hydrolase family protein  26.93 
 
 
475 aa  105  1e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000370471  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0662  glycoside hydrolase family protein  29.06 
 
 
471 aa  105  1e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000191922  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0664  glycoside hydrolase family protein  26.33 
 
 
476 aa  103  5e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6081  glycoside hydrolase family 43  30.04 
 
 
480 aa  103  6e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0015  alpha-L-arabinofuranosidase B  28.25 
 
 
707 aa  102  8e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0510  glycoside hydrolase family 43  27.57 
 
 
456 aa  97.4  3e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0180422  hitchhiker  0.00320544 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1393  immunoglobulin I-set domain-containing protein  26.67 
 
 
810 aa  97.4  3e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2728  hypothetical protein  28.21 
 
 
848 aa  95.5  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1524  glycoside hydrolase family 43  28.16 
 
 
524 aa  94.7  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6044  glycoside hydrolase family 43  29.05 
 
 
501 aa  94  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.845022  normal  0.0554344 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2809  ATPase  26.36 
 
 
789 aa  93.6  5e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.153749  decreased coverage  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1999  glycoside hydrolase family protein  27.22 
 
 
1121 aa  92.4  1e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000101187  decreased coverage  0.0000000170847 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1623  glycoside hydrolase family 43  28.52 
 
 
804 aa  91.7  2e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0299424  normal  0.680345 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1976  glycoside hydrolase family protein  27.37 
 
 
1121 aa  90.5  4e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00565193  hitchhiker  0.00420486 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3292  glycoside hydrolase family 43  26.89 
 
 
488 aa  90.5  4e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.223704  hitchhiker  0.00299224 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3360  glycoside hydrolase family 43  28.34 
 
 
522 aa  90.1  6e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0779432 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1622  glycoside hydrolase family 43  28.52 
 
 
703 aa  90.1  6e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.372812  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2086  beta-xylosidase-like protein  27.17 
 
 
1121 aa  89.4  9e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00280414  decreased coverage  0.0000000469917 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2047  glycoside hydrolase family protein  28.53 
 
 
1112 aa  88.2  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000114958  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29390  beta-xylosidase  24.58 
 
 
494 aa  86.3  9e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.838648  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0473  glycoside hydrolase family 43  27.43 
 
 
829 aa  84  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.658009  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2161  glycoside hydrolase family protein  26.72 
 
 
1143 aa  84  0.000000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000526501  hitchhiker  0.0000457644 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1543  beta-xylosidase  25.14 
 
 
531 aa  82.4  0.00000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.000200892  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0737  glycoside hydrolase family protein  26.11 
 
 
345 aa  79.7  0.00000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.612706  normal  0.340405 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3042  twin-arginine translocation pathway signal  26.37 
 
 
537 aa  77.4  0.0000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.351967  normal  0.568346 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4021  glycoside hydrolase family protein  26.99 
 
 
537 aa  75.5  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.701147 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2196  carbohydrate-binding family 6 protein  26.95 
 
 
533 aa  73.2  0.000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2639  glycoside hydrolase family 43  26.21 
 
 
472 aa  72.4  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.431626  normal  0.0143862 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1542  beta-xylosidase  23.47 
 
 
581 aa  71.6  0.00000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2866  glycoside hydrolase family 43  26.56 
 
 
487 aa  70.9  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.141314  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3522  glycoside hydrolase family protein  27.54 
 
 
534 aa  70.5  0.00000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.653851  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1231  Carbohydrate binding family 6  26.83 
 
 
524 aa  69.7  0.00000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0177163  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3317  Beta-xylosidase-like  25.43 
 
 
1174 aa  68.9  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00018095  hitchhiker  0.000000702951 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1235  Carbohydrate binding family 6  25.82 
 
 
509 aa  68.2  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00440741  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0650  glycoside hydrolase family 43  25 
 
 
495 aa  67.4  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0713148  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0193  glycoside hydrolase family 43  26.9 
 
 
324 aa  67  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00680352  normal  0.581709 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5511  glycoside hydrolase family 43  26.12 
 
 
536 aa  66.2  0.0000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0274092 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3622  Xylan 1,4-beta-xylosidase  23.99 
 
 
540 aa  65.5  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.573352  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3531  glycoside hydrolase family 43  23.59 
 
 
511 aa  65.5  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.185955 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10919  hypothetical protein  24.09 
 
 
383 aa  64.7  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0280473  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1435  glycoside hydrolase family 43  22.8 
 
 
545 aa  64.3  0.000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3811  glycoside hydrolase family 43  23.36 
 
 
535 aa  63.2  0.000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3599  glycoside hydrolase family 43  25.22 
 
 
497 aa  63.2  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0127437  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01459  xylosidase; arabinosidase  26.17 
 
 
527 aa  62.8  0.000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.928055  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1400  glycoside hydrolase family 43  25.88 
 
 
517 aa  61.6  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.587173  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2914  glycoside hydrolase family protein  23.67 
 
 
547 aa  61.2  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1143  Alpha-L-arabinofuranosidase  24.04 
 
 
523 aa  60.8  0.00000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2837  glycoside hydrolase family 43  24.35 
 
 
348 aa  61.2  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.61366  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1992  glycoside hydrolase family protein  24.73 
 
 
315 aa  60.5  0.00000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000493506  unclonable  0.0000204974 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6022  glycoside hydrolase family 43  25.15 
 
 
319 aa  60.5  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1982  glycoside hydrolase family protein  24.73 
 
 
315 aa  60.5  0.00000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000010784  normal  0.0338284 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3276  carbohydrate-binding family 6 protein  27.67 
 
 
401 aa  60.1  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2723  glycoside hydrolase family protein  25 
 
 
345 aa  60.1  0.00000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.469303  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2392  glycoside hydrolase family 43  25.61 
 
 
306 aa  59.7  0.00000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000540158  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2518  glycoside hydrolase family protein  24.29 
 
 
516 aa  59.7  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4788  Xylan 1,4-beta-xylosidase  26.07 
 
 
562 aa  59.7  0.00000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.771274  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2318  alpha-N-arabinofuranosidase  23.57 
 
 
512 aa  59.7  0.00000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.389032  normal  0.249416 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0191  glycoside hydrolase family protein  24.43 
 
 
512 aa  59.7  0.00000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0810  carbohydrate-binding family 6 protein  23.57 
 
 
450 aa  58.5  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.034958  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0289  xylan 1,4-beta-xylosidase  24.84 
 
 
532 aa  58.2  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000021727  normal  0.556687 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0430  glycoside hydrolase family 43  26.09 
 
 
497 aa  58.2  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.710686 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0536  glycoside hydrolase family 43  25.73 
 
 
393 aa  57.8  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.812392 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3011  Alpha-N-arabinofuranosidase  24.84 
 
 
538 aa  57.8  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2022  glycoside hydrolase family 43  26.09 
 
 
334 aa  57.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3569  glycoside hydrolase family 43  24.35 
 
 
484 aa  57.4  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0058203  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6730  glycoside hydrolase family 43  24.6 
 
 
323 aa  57.4  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575675  normal  0.920031 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0507  glycoside hydrolase family 43  25 
 
 
337 aa  57.4  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.412329 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0501  glycoside hydrolase family 43  24 
 
 
525 aa  57.4  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00998877 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2447  putative xylosidase  23.11 
 
 
468 aa  57  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.320135 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2069  glycoside hydrolase family protein  24.37 
 
 
315 aa  57  0.0000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000027007  hitchhiker  0.0000035019 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>