140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3011 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3011  Alpha-N-arabinofuranosidase  100 
 
 		 538 aa  1123    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3438  glycoside hydrolase family 43  44.92 
 
 		 519 aa  444  1e-123  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.990127  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2518  glycoside hydrolase family protein  41.74 
 
 		 516 aa  422  1e-116  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2318  alpha-N-arabinofuranosidase  39.89 
 
 		 512 aa  358  9.999999999999999e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.389032  normal  0.249416 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3048  Alpha-N-arabinofuranosidase  37.4 
 
 		 515 aa  339  7e-92  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0608814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1655  translation initiation factor IF-1  36.79 
 
 		 566 aa  337  3.9999999999999995e-91  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0976225  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3228  glycoside hydrolase family protein  37.12 
 
 		 563 aa  323  5e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00674596  normal  0.0120766 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0598  Alpha-L-arabinofuranosidase  35.29 
 
 		 577 aa  308  1.0000000000000001e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.628109 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3599  glycoside hydrolase family 43  36.55 
 
 		 497 aa  302  9e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0127437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4322  glycoside hydrolase family protein  35.08 
 
 		 581 aa  301  2e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1423  Xylan 1,4-beta-xylosidase  33.03 
 
 		 558 aa  300  6e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.423704 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03855  xylosidase; arabinosidase  35.21 
 
 		 556 aa  298  1e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0842  Alpha-L-arabinofuranosidase  36.03 
 
 		 546 aa  296  4e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.122484  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1400  glycoside hydrolase family 43  36.19 
 
 		 517 aa  296  7e-79  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.587173  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3569  glycoside hydrolase family 43  34.13 
 
 		 484 aa  288  2e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0058203  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2699  glycoside hydrolase family 43  36.28 
 
 		 496 aa  283  4.0000000000000003e-75  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.276179  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0191  glycoside hydrolase family protein  33.81 
 
 		 512 aa  280  3e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20520  beta-xylosidase  43.61 
 
 		 542 aa  278  1e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.129044  normal  0.254652 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3880  glycoside hydrolase family protein  34.48 
 
 		 571 aa  274  3e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2459  Xylan 1,4-beta-xylosidase  32.62 
 
 		 488 aa  263  8.999999999999999e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0431  glycoside hydrolase family protein  45.12 
 
 		 451 aa  262  1e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3398  glycoside hydrolase family protein  33.88 
 
 		 514 aa  256  7e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0740676  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21180  beta-xylosidase  34.97 
 
 		 526 aa  256  9e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.851115  normal  0.166078 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1616  alpha-L-arabinofuranosidase  34.29 
 
 		 550 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.347525  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4681  glycoside hydrolase family protein  45.17 
 
 		 492 aa  254  3e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.026787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0289  xylan 1,4-beta-xylosidase  33.45 
 
 		 532 aa  252  1e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000021727  normal  0.556687 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3334  Alpha-N-arabinofuranosidase  32.45 
 
 		 536 aa  249  7e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.783434  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0936  Alpha-N-arabinofuranosidase  33.27 
 
 		 546 aa  248  2e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.789253 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3545  Alpha-N-arabinofuranosidase  34.09 
 
 		 547 aa  246  6e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0270111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1143  Alpha-L-arabinofuranosidase  32.97 
 
 		 523 aa  246  6.999999999999999e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2532  glycoside hydrolase family 43  41.53 
 
 		 586 aa  245  1.9999999999999999e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0457  Alpha-N-arabinofuranosidase  32.04 
 
 		 539 aa  244  3.9999999999999997e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0354643 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0430  glycoside hydrolase family 43  42.81 
 
 		 497 aa  238  2e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.710686 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2409  hypothetical protein  32.3 
 
 		 541 aa  238  2e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1710  Alpha-N-arabinofuranosidase  30.86 
 
 		 541 aa  227  4e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.783601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0875  glycoside hydrolase family protein  29.87 
 
 		 636 aa  226  7e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000412559  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2090  Alpha-N-arabinofuranosidase  31.23 
 
 		 537 aa  226  8e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00759162  normal  0.572245 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1878  beta-xylosidase  31.22 
 
 		 539 aa  224  3e-57  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2329  Xylan 1,4-beta-xylosidase  31.16 
 
 		 537 aa  224  4e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.80101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2028  glycoside hydrolase family protein  31.7 
 
 		 498 aa  216  9e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07864  conserved hypothetical protein  31.69 
 
 		 540 aa  214  4.9999999999999996e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0157749  normal  0.535242 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08477  xylosidase : arabinofuranosidase (AFU_orthologue; AFUA_2G13190)  31.33 
 
 		 546 aa  209  1e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2996  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.93 
 
 		 559 aa  200  6e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1879  beta-xylosidase  26.85 
 
 		 590 aa  197  3e-49  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1291  Beta-xylosidase  30.66 
 
 		 553 aa  195  2e-48  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2504  Xylan 1,4-beta-xylosidase  28.01 
 
 		 558 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0848  Beta-xylosidase  28.62 
 
 		 552 aa  176  9.999999999999999e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.168219  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2632  glycoside hydrolase family protein  27.29 
 
 		 543 aa  169  1e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0211688  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06751  glycosyl hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G06110)  32.97 
 
 		 591 aa  167  5e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.326162 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4788  Xylan 1,4-beta-xylosidase  25.59 
 
 		 562 aa  166  1.0000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.771274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1500  glycoside hydrolase family 43  25.81 
 
 		 551 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.36043 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0182  glycoside hydrolase family 43  32.65 
 
 		 1338 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3351  glycoside hydrolase family 43  25.22 
 
 		 522 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29240  beta-xylosidase  30.19 
 
 		 527 aa  147  6e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1150  glycoside hydrolase family 43  26.18 
 
 		 560 aa  143  9e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4021  glycoside hydrolase family protein  32.31 
 
 		 537 aa  142  9.999999999999999e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.701147 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4289  glycoside hydrolase family protein  24.6 
 
 		 572 aa  142  9.999999999999999e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.786059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3042  twin-arginine translocation pathway signal  32.42 
 
 		 537 aa  141  3.9999999999999997e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.351967  normal  0.568346 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2114  glycoside hydrolase family 43  26.39 
 
 		 518 aa  141  3.9999999999999997e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.554254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2914  glycoside hydrolase family protein  34.11 
 
 		 547 aa  140  4.999999999999999e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0700  glycoside hydrolase family 43  25.32 
 
 		 522 aa  139  1e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0935  glycoside hydrolase family 43  31.49 
 
 		 522 aa  137  5e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5511  glycoside hydrolase family 43  23.59 
 
 		 536 aa  135  3e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0274092 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3622  Xylan 1,4-beta-xylosidase  30.97 
 
 		 540 aa  134  5e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.573352  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3811  glycoside hydrolase family 43  30.49 
 
 		 535 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2108  glycoside hydrolase family 43  24.39 
 
 		 650 aa  133  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000141623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3718  glycoside hydrolase family protein  24.45 
 
 		 504 aa  127  5e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.456589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1233  Carbohydrate binding family 6  32.43 
 
 		 746 aa  127  5e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.555313  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1420  glycoside hydrolase family 43  24.82 
 
 		 530 aa  125  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.394008  normal  0.931127 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3531  glycoside hydrolase family 43  31.46 
 
 		 511 aa  126  1e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.185955 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4249  glycoside hydrolase family protein  23.93 
 
 		 532 aa  125  2e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.158619  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0501  glycoside hydrolase family 43  25.93 
 
 		 525 aa  125  2e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00998877 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3875  glycoside hydrolase family protein  23.87 
 
 		 518 aa  124  3e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2044  beta-xylosidase/alpha-L-arabinofuranosidase- like protein  29.77 
 
 		 1474 aa  124  4e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1435  glycoside hydrolase family 43  30.89 
 
 		 545 aa  123  7e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2041  polyfunctional acetylxylan esterase/b-xylosidase/a-L-arabinofuranosidase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 43 protein and carbohydrate esterase family 6 protein  24.73 
 
 		 1585 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3237  glycoside hydrolase family protein  25.41 
 
 		 1195 aa  121  3e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414155 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3522  glycoside hydrolase family protein  30.23 
 
 		 534 aa  120  3.9999999999999996e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.653851  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03261  xylosidase  32.27 
 
 		 365 aa  117  3.9999999999999997e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.687612  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1251  glycoside hydrolase family protein  29.3 
 
 		 665 aa  115  2.0000000000000002e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3618  glycoside hydrolase family protein  27.95 
 
 		 508 aa  114  4.0000000000000004e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000797588  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2413  glycoside hydrolase family protein  28.62 
 
 		 521 aa  112  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.333908  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1257  glycoside hydrolase family 43  22.32 
 
 		 500 aa  111  4.0000000000000004e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1068  glycoside hydrolase family 43  22.72 
 
 		 797 aa  106  8e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000256501  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01043  conserved hypothetical protein  42.37 
 
 		 343 aa  93.6  9e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2639  glycoside hydrolase family 43  23.69 
 
 		 472 aa  88.2  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.431626  normal  0.0143862 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3360  glycoside hydrolase family 43  25 
 
 		 522 aa  87.4  5e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0779432 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0650  glycoside hydrolase family 43  27.6 
 
 		 495 aa  86.7  9e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0713148  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0206  glycoside hydrolase family 43  28.03 
 
 		 304 aa  80.5  0.00000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  0.253285 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1280  glycoside hydrolase family 43  22.81 
 
 		 691 aa  79  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.286369  hitchhiker  0.00183728 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2723  glycoside hydrolase family protein  27.84 
 
 		 345 aa  77.8  0.0000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.469303  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1661  endo-1,4-beta-xylanase/Beta-xylosidase  27.42 
 
 		 901 aa  77  0.0000000000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1524  glycoside hydrolase family 43  22.7 
 
 		 524 aa  76.6  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6022  glycoside hydrolase family 43  27.03 
 
 		 319 aa  74.3  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2027  glycoside hydrolase family protein  26.54 
 
 		 325 aa  73.2  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.808853  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07275  xylosidase/glycosyl hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G00930)  21.47 
 
 		 503 aa  69.7  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000188631  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6044  glycoside hydrolase family 43  22.57 
 
 		 501 aa  68.6  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.845022  normal  0.0554344 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2392  glycoside hydrolase family 43  25.74 
 
 		 306 aa  65.5  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000540158  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20580  glycoside hydrolase family 43  26.5 
 
 		 315 aa  63.9  0.000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3302  glycoside hydrolase family 43  24.74 
 
 		 532 aa  63.5  0.000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00567592  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>