137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0936 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_0936  Alpha-N-arabinofuranosidase  100 
 
 		 546 aa  1116    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.789253 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3545  Alpha-N-arabinofuranosidase  73.16 
 
 		 547 aa  812    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0270111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1710  Alpha-N-arabinofuranosidase  54.7 
 
 		 541 aa  568  1e-160  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.783601  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2329  Xylan 1,4-beta-xylosidase  52.66 
 
 		 537 aa  552  1e-156  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.80101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0289  xylan 1,4-beta-xylosidase  54.1 
 
 		 532 aa  551  1e-156  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000021727  normal  0.556687 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2090  Alpha-N-arabinofuranosidase  52.66 
 
 		 537 aa  549  1e-155  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00759162  normal  0.572245 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1143  Alpha-L-arabinofuranosidase  53.48 
 
 		 523 aa  546  1e-154  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2409  hypothetical protein  52.62 
 
 		 541 aa  536  1e-151  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07864  conserved hypothetical protein  52.7 
 
 		 540 aa  521  1e-146  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0157749  normal  0.535242 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1616  alpha-L-arabinofuranosidase  49.35 
 
 		 550 aa  482  1e-135  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.347525  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0457  Alpha-N-arabinofuranosidase  47.06 
 
 		 539 aa  477  1e-133  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0354643 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3334  Alpha-N-arabinofuranosidase  46.22 
 
 		 536 aa  464  1e-129  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.783434  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3398  glycoside hydrolase family protein  44.32 
 
 		 514 aa  456  1e-127  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0740676  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2996  Alpha-N-arabinofuranosidase  39.93 
 
 		 559 aa  390  1e-107  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1878  beta-xylosidase  40.95 
 
 		 539 aa  384  1e-105  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2504  Xylan 1,4-beta-xylosidase  35.45 
 
 		 558 aa  342  7e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1291  Beta-xylosidase  33.82 
 
 		 553 aa  312  1e-83  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2518  glycoside hydrolase family protein  35.96 
 
 		 516 aa  299  7e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0191  glycoside hydrolase family protein  34.76 
 
 		 512 aa  290  6e-77  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0848  Beta-xylosidase  32.98 
 
 		 552 aa  283  5.000000000000001e-75  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.168219  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3438  glycoside hydrolase family 43  34.38 
 
 		 519 aa  277  3e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.990127  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1400  glycoside hydrolase family 43  40.56 
 
 		 517 aa  258  2e-67  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.587173  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2318  alpha-N-arabinofuranosidase  36.73 
 
 		 512 aa  254  4.0000000000000004e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.389032  normal  0.249416 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3011  Alpha-N-arabinofuranosidase  33.27 
 
 		 538 aa  251  2e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3228  glycoside hydrolase family protein  35.27 
 
 		 563 aa  246  6.999999999999999e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00674596  normal  0.0120766 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0875  glycoside hydrolase family protein  31.11 
 
 		 636 aa  240  5e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000412559  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1655  translation initiation factor IF-1  33.58 
 
 		 566 aa  233  9e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0976225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0842  Alpha-L-arabinofuranosidase  33.15 
 
 		 546 aa  231  2e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.122484  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0598  Alpha-L-arabinofuranosidase  33.39 
 
 		 577 aa  230  5e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.628109 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4322  glycoside hydrolase family protein  33.15 
 
 		 581 aa  230  5e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3599  glycoside hydrolase family 43  35.49 
 
 		 497 aa  224  2e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0127437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3569  glycoside hydrolase family 43  38.85 
 
 		 484 aa  224  4e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0058203  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2699  glycoside hydrolase family 43  33.46 
 
 		 496 aa  218  2e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.276179  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1423  Xylan 1,4-beta-xylosidase  29.73 
 
 		 558 aa  214  1.9999999999999998e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.423704 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3048  Alpha-N-arabinofuranosidase  37.5 
 
 		 515 aa  212  2e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0608814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20520  beta-xylosidase  40.42 
 
 		 542 aa  211  3e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.129044  normal  0.254652 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03855  xylosidase; arabinosidase  32.66 
 
 		 556 aa  209  8e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2532  glycoside hydrolase family 43  42.02 
 
 		 586 aa  201  3.9999999999999996e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2028  glycoside hydrolase family protein  28.76 
 
 		 498 aa  192  2e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3880  glycoside hydrolase family protein  27.73 
 
 		 571 aa  189  1e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2459  Xylan 1,4-beta-xylosidase  40.5 
 
 		 488 aa  186  1.0000000000000001e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0430  glycoside hydrolase family 43  40.67 
 
 		 497 aa  183  8.000000000000001e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.710686 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4681  glycoside hydrolase family protein  38.89 
 
 		 492 aa  180  7e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.026787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21180  beta-xylosidase  39.6 
 
 		 526 aa  179  1e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.851115  normal  0.166078 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0431  glycoside hydrolase family protein  38.74 
 
 		 451 aa  173  6.999999999999999e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4289  glycoside hydrolase family protein  29.09 
 
 		 572 aa  173  7.999999999999999e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.786059  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08477  xylosidase : arabinofuranosidase (AFU_orthologue; AFUA_2G13190)  32.27 
 
 		 546 aa  160  5e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4249  glycoside hydrolase family protein  25.9 
 
 		 532 aa  157  6e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.158619  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4788  Xylan 1,4-beta-xylosidase  26.55 
 
 		 562 aa  152  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.771274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1150  glycoside hydrolase family 43  27.77 
 
 		 560 aa  152  2e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3811  glycoside hydrolase family 43  28.6 
 
 		 535 aa  151  3e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3622  Xylan 1,4-beta-xylosidase  28.6 
 
 		 540 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.573352  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0700  glycoside hydrolase family 43  28.23 
 
 		 522 aa  145  3e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5511  glycoside hydrolase family 43  26.33 
 
 		 536 aa  143  8e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0274092 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3351  glycoside hydrolase family 43  29.4 
 
 		 522 aa  143  9e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06751  glycosyl hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G06110)  30.29 
 
 		 591 aa  142  1.9999999999999998e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.326162 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1500  glycoside hydrolase family 43  26.41 
 
 		 551 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.36043 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0935  glycoside hydrolase family 43  28.28 
 
 		 522 aa  138  2e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3042  twin-arginine translocation pathway signal  29.98 
 
 		 537 aa  137  4e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.351967  normal  0.568346 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1068  glycoside hydrolase family 43  29.17 
 
 		 797 aa  136  9e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000256501  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2413  glycoside hydrolase family protein  28.03 
 
 		 521 aa  136  9.999999999999999e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.333908  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3531  glycoside hydrolase family 43  28.19 
 
 		 511 aa  134  5e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.185955 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3522  glycoside hydrolase family protein  34.05 
 
 		 534 aa  133  9e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.653851  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4021  glycoside hydrolase family protein  28.17 
 
 		 537 aa  131  4.0000000000000003e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.701147 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3718  glycoside hydrolase family protein  28.95 
 
 		 504 aa  130  6e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.456589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3237  glycoside hydrolase family protein  27.08 
 
 		 1195 aa  129  1.0000000000000001e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414155 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1420  glycoside hydrolase family 43  28.73 
 
 		 530 aa  129  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.394008  normal  0.931127 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2914  glycoside hydrolase family protein  33.23 
 
 		 547 aa  128  3e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1435  glycoside hydrolase family 43  29.28 
 
 		 545 aa  127  5e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2632  glycoside hydrolase family protein  26.9 
 
 		 543 aa  127  6e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0211688  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0501  glycoside hydrolase family 43  30.08 
 
 		 525 aa  126  1e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00998877 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2114  glycoside hydrolase family 43  27.87 
 
 		 518 aa  126  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.554254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2044  beta-xylosidase/alpha-L-arabinofuranosidase- like protein  25.46 
 
 		 1474 aa  125  2e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1251  glycoside hydrolase family protein  27.99 
 
 		 665 aa  121  3.9999999999999996e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0182  glycoside hydrolase family 43  29.28 
 
 		 1338 aa  116  1.0000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1233  Carbohydrate binding family 6  26.38 
 
 		 746 aa  115  3e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.555313  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2041  polyfunctional acetylxylan esterase/b-xylosidase/a-L-arabinofuranosidase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 43 protein and carbohydrate esterase family 6 protein  26.55 
 
 		 1585 aa  113  8.000000000000001e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2108  glycoside hydrolase family 43  24.45 
 
 		 650 aa  112  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000141623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1879  beta-xylosidase  28 
 
 		 590 aa  109  1e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3875  glycoside hydrolase family protein  24.5 
 
 		 518 aa  102  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29240  beta-xylosidase  28.85 
 
 		 527 aa  101  4e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03261  xylosidase  30.2 
 
 		 365 aa  95.5  2e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.687612  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0650  glycoside hydrolase family 43  27.55 
 
 		 495 aa  92.8  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0713148  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1257  glycoside hydrolase family 43  24.51 
 
 		 500 aa  87.4  6e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6044  glycoside hydrolase family 43  24.21 
 
 		 501 aa  87  9e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.845022  normal  0.0554344 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3360  glycoside hydrolase family 43  26.37 
 
 		 522 aa  86.3  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0779432 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3302  glycoside hydrolase family 43  25.4 
 
 		 532 aa  86.7  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00567592  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1661  endo-1,4-beta-xylanase/Beta-xylosidase  27.69 
 
 		 901 aa  85.9  0.000000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01043  conserved hypothetical protein  39.47 
 
 		 343 aa  84.3  0.000000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2639  glycoside hydrolase family 43  24.46 
 
 		 472 aa  82.4  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.431626  normal  0.0143862 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2723  glycoside hydrolase family protein  28.47 
 
 		 345 aa  79.7  0.0000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.469303  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1524  glycoside hydrolase family 43  25.37 
 
 		 524 aa  79  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02633  conserved hypothetical protein  53.85 
 
 		 110 aa  78.6  0.0000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.947242 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1280  glycoside hydrolase family 43  25.42 
 
 		 691 aa  76.6  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.286369  hitchhiker  0.00183728 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3618  glycoside hydrolase family protein  24.6 
 
 		 508 aa  73.2  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000797588  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07275  xylosidase/glycosyl hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G00930)  23.82 
 
 		 503 aa  68.9  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000188631  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0193  glycoside hydrolase family 43  24.92 
 
 		 324 aa  68.2  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00680352  normal  0.581709 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6730  glycoside hydrolase family 43  24.5 
 
 		 323 aa  65.9  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575675  normal  0.920031 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2384  glycoside hydrolase family 43  24.3 
 
 		 330 aa  63.9  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2027  glycoside hydrolase family protein  24.71 
 
 		 325 aa  62  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.808853  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>