140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3545 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_0936  Alpha-N-arabinofuranosidase  73.16 
 
 
546 aa  788    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.789253 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3545  Alpha-N-arabinofuranosidase  100 
 
 
547 aa  1123    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0270111  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1710  Alpha-N-arabinofuranosidase  54.03 
 
 
541 aa  595  1e-169  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.783601  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2329  Xylan 1,4-beta-xylosidase  52.28 
 
 
537 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.80101  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2090  Alpha-N-arabinofuranosidase  52.2 
 
 
537 aa  561  1e-158  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00759162  normal  0.572245 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0289  xylan 1,4-beta-xylosidase  54.33 
 
 
532 aa  553  1e-156  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000021727  normal  0.556687 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2409  hypothetical protein  52.45 
 
 
541 aa  545  1e-153  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1143  Alpha-L-arabinofuranosidase  52.15 
 
 
523 aa  538  9.999999999999999e-153  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07864  conserved hypothetical protein  52.43 
 
 
540 aa  525  1e-148  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0157749  normal  0.535242 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0457  Alpha-N-arabinofuranosidase  47.25 
 
 
539 aa  486  1e-136  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0354643 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3334  Alpha-N-arabinofuranosidase  47.07 
 
 
536 aa  477  1e-133  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.783434  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1616  alpha-L-arabinofuranosidase  46.77 
 
 
550 aa  467  9.999999999999999e-131  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.347525  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3398  glycoside hydrolase family protein  43.87 
 
 
514 aa  449  1e-125  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0740676  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1878  beta-xylosidase  41.89 
 
 
539 aa  401  9.999999999999999e-111  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2996  Alpha-N-arabinofuranosidase  40.11 
 
 
559 aa  390  1e-107  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2504  Xylan 1,4-beta-xylosidase  37.26 
 
 
558 aa  372  1e-102  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1291  Beta-xylosidase  34.11 
 
 
553 aa  323  7e-87  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0848  Beta-xylosidase  32.98 
 
 
552 aa  308  1.0000000000000001e-82  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.168219  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2518  glycoside hydrolase family protein  38.79 
 
 
516 aa  308  2.0000000000000002e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0191  glycoside hydrolase family protein  34.39 
 
 
512 aa  290  6e-77  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3438  glycoside hydrolase family 43  35.3 
 
 
519 aa  277  3e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.990127  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2318  alpha-N-arabinofuranosidase  38.66 
 
 
512 aa  262  1e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.389032  normal  0.249416 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0842  Alpha-L-arabinofuranosidase  35.21 
 
 
546 aa  250  5e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.122484  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3011  Alpha-N-arabinofuranosidase  34.09 
 
 
538 aa  246  6e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1400  glycoside hydrolase family 43  34.86 
 
 
517 aa  242  2e-62  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.587173  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4322  glycoside hydrolase family protein  35.44 
 
 
581 aa  238  2e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3228  glycoside hydrolase family protein  35.45 
 
 
563 aa  233  6e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00674596  normal  0.0120766 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1655  translation initiation factor IF-1  33.89 
 
 
566 aa  233  1e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0976225  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0598  Alpha-L-arabinofuranosidase  33.21 
 
 
577 aa  222  1.9999999999999999e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.628109 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0875  glycoside hydrolase family protein  30.41 
 
 
636 aa  218  2.9999999999999998e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000412559  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20520  beta-xylosidase  41.32 
 
 
542 aa  213  5.999999999999999e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.129044  normal  0.254652 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1423  Xylan 1,4-beta-xylosidase  30.05 
 
 
558 aa  206  1e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.423704 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3599  glycoside hydrolase family 43  37.04 
 
 
497 aa  204  5e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0127437  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3048  Alpha-N-arabinofuranosidase  40.63 
 
 
515 aa  204  5e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0608814  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2699  glycoside hydrolase family 43  33.49 
 
 
496 aa  203  8e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.276179  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3569  glycoside hydrolase family 43  36.84 
 
 
484 aa  202  9.999999999999999e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0058203  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03855  xylosidase; arabinosidase  32.34 
 
 
556 aa  199  1.0000000000000001e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3880  glycoside hydrolase family protein  29.83 
 
 
571 aa  194  3e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4681  glycoside hydrolase family protein  40.52 
 
 
492 aa  193  5e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.026787  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2532  glycoside hydrolase family 43  39.41 
 
 
586 aa  189  2e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0430  glycoside hydrolase family 43  40.33 
 
 
497 aa  184  5.0000000000000004e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.710686 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2459  Xylan 1,4-beta-xylosidase  40.13 
 
 
488 aa  176  9.999999999999999e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0431  glycoside hydrolase family protein  39.4 
 
 
451 aa  173  5.999999999999999e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2028  glycoside hydrolase family protein  29.21 
 
 
498 aa  171  3e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21180  beta-xylosidase  37.58 
 
 
526 aa  168  2e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.851115  normal  0.166078 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08477  xylosidase : arabinofuranosidase (AFU_orthologue; AFUA_2G13190)  29.12 
 
 
546 aa  166  6.9999999999999995e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06751  glycosyl hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G06110)  28.57 
 
 
591 aa  162  1e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.326162 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4249  glycoside hydrolase family protein  25.1 
 
 
532 aa  158  3e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.158619  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1150  glycoside hydrolase family 43  26.22 
 
 
560 aa  152  1e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4289  glycoside hydrolase family protein  29.21 
 
 
572 aa  146  1e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.786059  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3811  glycoside hydrolase family 43  25.74 
 
 
535 aa  145  2e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4788  Xylan 1,4-beta-xylosidase  26.18 
 
 
562 aa  141  3e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.771274  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5511  glycoside hydrolase family 43  28.91 
 
 
536 aa  141  3e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0274092 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3622  Xylan 1,4-beta-xylosidase  26.34 
 
 
540 aa  140  4.999999999999999e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.573352  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0700  glycoside hydrolase family 43  26.98 
 
 
522 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1500  glycoside hydrolase family 43  25.87 
 
 
551 aa  137  6.0000000000000005e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.36043 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2914  glycoside hydrolase family protein  32.23 
 
 
547 aa  135  1.9999999999999998e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0935  glycoside hydrolase family 43  27.07 
 
 
522 aa  135  3e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3042  twin-arginine translocation pathway signal  26.34 
 
 
537 aa  134  3.9999999999999996e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.351967  normal  0.568346 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3351  glycoside hydrolase family 43  28 
 
 
522 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4021  glycoside hydrolase family protein  27.6 
 
 
537 aa  130  6e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.701147 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3718  glycoside hydrolase family protein  29.25 
 
 
504 aa  130  9.000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.456589  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2044  beta-xylosidase/alpha-L-arabinofuranosidase- like protein  25.4 
 
 
1474 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3522  glycoside hydrolase family protein  27.89 
 
 
534 aa  124  6e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.653851  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2108  glycoside hydrolase family 43  26.03 
 
 
650 aa  122  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000141623  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3531  glycoside hydrolase family 43  27.68 
 
 
511 aa  120  6e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.185955 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3237  glycoside hydrolase family protein  26.32 
 
 
1195 aa  119  9.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.414155 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1233  Carbohydrate binding family 6  24.2 
 
 
746 aa  118  3e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.555313  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0501  glycoside hydrolase family 43  29.66 
 
 
525 aa  116  8.999999999999998e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00998877 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1435  glycoside hydrolase family 43  29.32 
 
 
545 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2632  glycoside hydrolase family protein  25.61 
 
 
543 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0211688  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2413  glycoside hydrolase family protein  26.32 
 
 
521 aa  110  5e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.333908  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2114  glycoside hydrolase family 43  26.13 
 
 
518 aa  109  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.554254  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1068  glycoside hydrolase family 43  23.87 
 
 
797 aa  107  8e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000256501  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2041  polyfunctional acetylxylan esterase/b-xylosidase/a-L-arabinofuranosidase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 43 protein and carbohydrate esterase family 6 protein  25.91 
 
 
1585 aa  106  9e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1251  glycoside hydrolase family protein  30.4 
 
 
665 aa  104  5e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0182  glycoside hydrolase family 43  26.07 
 
 
1338 aa  103  1e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29240  beta-xylosidase  28.3 
 
 
527 aa  99.4  2e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1879  beta-xylosidase  29.1 
 
 
590 aa  99  2e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3875  glycoside hydrolase family protein  22.46 
 
 
518 aa  96.3  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1257  glycoside hydrolase family 43  25.13 
 
 
500 aa  96.7  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1420  glycoside hydrolase family 43  24.46 
 
 
530 aa  94.7  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.394008  normal  0.931127 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03261  xylosidase  28.8 
 
 
365 aa  92.8  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.687612  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3302  glycoside hydrolase family 43  26.54 
 
 
532 aa  89.4  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00567592  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2723  glycoside hydrolase family protein  30.5 
 
 
345 aa  85.9  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.469303  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1524  glycoside hydrolase family 43  25.42 
 
 
524 aa  84.3  0.000000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1280  glycoside hydrolase family 43  25.48 
 
 
691 aa  84  0.000000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.286369  hitchhiker  0.00183728 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6044  glycoside hydrolase family 43  23.8 
 
 
501 aa  81.3  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.845022  normal  0.0554344 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3360  glycoside hydrolase family 43  28.85 
 
 
522 aa  81.3  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0779432 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0650  glycoside hydrolase family 43  25.32 
 
 
495 aa  79.3  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0713148  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2639  glycoside hydrolase family 43  24.57 
 
 
472 aa  79  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.431626  normal  0.0143862 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07275  xylosidase/glycosyl hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G00930)  24.79 
 
 
503 aa  78.6  0.0000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000188631  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02633  conserved hypothetical protein  43.02 
 
 
110 aa  75.5  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.947242 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0193  glycoside hydrolase family 43  25.93 
 
 
324 aa  76.3  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00680352  normal  0.581709 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2384  glycoside hydrolase family 43  25.24 
 
 
330 aa  72.8  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3618  glycoside hydrolase family protein  26.15 
 
 
508 aa  72.8  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000797588  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6730  glycoside hydrolase family 43  24.37 
 
 
323 aa  72.4  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575675  normal  0.920031 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01043  conserved hypothetical protein  35.09 
 
 
343 aa  66.2  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1390  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  25.85 
 
 
341 aa  66.2  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.287204  normal  0.664348 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2449  glycoside hydrolase family 43  26.48 
 
 
537 aa  65.1  0.000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114761  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>