288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2041 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_2040  esterase-like protein  78.81 
 
 		 1002 aa  959    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.400928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2041  polyfunctional acetylxylan esterase/b-xylosidase/a-L-arabinofuranosidase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 43 protein and carbohydrate esterase family 6 protein  100 
 
 		 1585 aa  3192    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2042  CHU large protein, xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 5 protein  99 
 
 		 1217 aa  1460    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2043  xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 10 protein  79.61 
 
 		 1247 aa  1192    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2044  beta-xylosidase/alpha-L-arabinofuranosidase- like protein  97.5 
 
 		 1474 aa  1422    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1420  glycoside hydrolase family 43  54.93 
 
 		 530 aa  605  1.0000000000000001e-171  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.394008  normal  0.931127 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2114  glycoside hydrolase family 43  55.56 
 
 		 518 aa  593  1e-167  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.554254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3875  glycoside hydrolase family protein  53 
 
 		 518 aa  565  1.0000000000000001e-159  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1238  beta-xylosidase/endoglucanase  47.84 
 
 		 1275 aa  514  1e-144  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1257  glycoside hydrolase family 43  44.53 
 
 		 500 aa  440  9.999999999999999e-123  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1239  bifunctional acetylxylan esterase/xylanase, CBM4 module, glycoside hydrolase family 10 protein and carbohydrate esterase family 6 protein  59.07 
 
 		 1414 aa  339  2.9999999999999997e-91  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.830301 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3878  putative esterase  59.63 
 
 		 560 aa  336  2e-90  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3727  b-glycosidase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 8 protein  38.12 
 
 		 1223 aa  332  4e-89  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0598979  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1233  Carbohydrate binding family 6  37.83 
 
 		 746 aa  327  1e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.555313  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1418  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  60 
 
 		 284 aa  327  2e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0892539  normal  0.540193 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1051  endoglucanase-related protein  51.16 
 
 		 1295 aa  312  2.9999999999999997e-83  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.222685 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3618  glycoside hydrolase family protein  35.6 
 
 		 508 aa  305  6.000000000000001e-81  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000797588  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1240  bifunctional xylanase/esterase; CBM9 module, glycoside hydrolase family 8 protein and carbohydrate esterase family 4 protein  44.42 
 
 		 1748 aa  298  8e-79  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.267391  normal  0.341436 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0182  glycoside hydrolase family 43  49.84 
 
 		 1338 aa  295  7e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1251  glycoside hydrolase family protein  33.27 
 
 		 665 aa  283  2e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2379  xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 11 protein  41.91 
 
 		 1160 aa  277  1.0000000000000001e-72  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000600941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3237  glycoside hydrolase family protein  32.94 
 
 		 1195 aa  269  2.9999999999999995e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414155 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1157  rhamnogalacturonan lyase  52.11 
 
 		 1266 aa  261  8e-68  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.219501  normal  0.380242 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2413  glycoside hydrolase family protein  31.76 
 
 		 521 aa  242  4e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.333908  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3302  glycoside hydrolase family 43  32.08 
 
 		 532 aa  240  2e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00567592  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1280  glycoside hydrolase family 43  33.6 
 
 		 691 aa  234  7.000000000000001e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.286369  hitchhiker  0.00183728 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07275  xylosidase/glycosyl hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G00930)  29.98 
 
 		 503 aa  233  2e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000188631  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2390  Carbohydrate-binding family V/XII  44.92 
 
 		 523 aa  212  4e-53  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.254143  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4788  Xylan 1,4-beta-xylosidase  30.86 
 
 		 562 aa  197  1e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.771274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3718  glycoside hydrolase family protein  30.46 
 
 		 504 aa  194  1e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.456589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1155  xyloglucanase  44.18 
 
 		 1288 aa  193  2e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1661  endo-1,4-beta-xylanase/Beta-xylosidase  35.07 
 
 		 901 aa  189  4e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2149  glycoside hydrolase family 5 protein  51.06 
 
 		 1108 aa  189  5e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000532282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2593  conserved repeat domain protein  41.62 
 
 		 3793 aa  188  7e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.073398 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1221  glucose/sorbosone dehydrogenase-related  35.79 
 
 		 1657 aa  188  7e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.141757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4249  glycoside hydrolase family protein  29.25 
 
 		 532 aa  187  2.0000000000000003e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.158619  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1150  glycoside hydrolase family 43  29.48 
 
 		 560 aa  183  2.9999999999999997e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4289  glycoside hydrolase family protein  26.75 
 
 		 572 aa  183  2.9999999999999997e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.786059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5511  glycoside hydrolase family 43  28.52 
 
 		 536 aa  182  4.999999999999999e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0274092 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1162  pectate lyase  44.16 
 
 		 991 aa  176  2.9999999999999996e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1500  glycoside hydrolase family 43  28.17 
 
 		 551 aa  174  1e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.36043 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2632  glycoside hydrolase family protein  26.17 
 
 		 543 aa  164  1e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0211688  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1240  Carbohydrate binding family 6  38.67 
 
 		 780 aa  160  3e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000268081  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0700  glycoside hydrolase family 43  27.08 
 
 		 522 aa  155  4e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1655  translation initiation factor IF-1  28.14 
 
 		 566 aa  153  3e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0976225  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0501  glycoside hydrolase family 43  27.74 
 
 		 525 aa  147  2e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00998877 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29240  beta-xylosidase  26.86 
 
 		 527 aa  144  9.999999999999999e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0935  glycoside hydrolase family 43  26.34 
 
 		 522 aa  143  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3351  glycoside hydrolase family 43  27.68 
 
 		 522 aa  144  1.9999999999999998e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2922  hypothetical protein  27.68 
 
 		 1329 aa  137  9.999999999999999e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0297077  normal  0.114251 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2528  hypothetical protein  36.67 
 
 		 2270 aa  134  1.0000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0191  glycoside hydrolase family protein  25.43 
 
 		 512 aa  127  2e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1690  hypothetical protein  31.86 
 
 		 2713 aa  127  2e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3438  glycoside hydrolase family 43  26.03 
 
 		 519 aa  122  3.9999999999999996e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.990127  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4979  Carbohydrate-binding family 9  37.72 
 
 		 1418 aa  122  3.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.502529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3011  Alpha-N-arabinofuranosidase  24.73 
 
 		 538 aa  122  4.9999999999999996e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0353  beta-mannanase  34.94 
 
 		 815 aa  122  7.999999999999999e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.3888  normal  0.500644 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1616  alpha-L-arabinofuranosidase  26.19 
 
 		 550 aa  119  3.9999999999999997e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.347525  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2518  glycoside hydrolase family protein  25.95 
 
 		 516 aa  118  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1423  Xylan 1,4-beta-xylosidase  24.86 
 
 		 558 aa  117  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.423704 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3228  glycoside hydrolase family protein  26.09 
 
 		 563 aa  117  1.0000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00674596  normal  0.0120766 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2852  beta-glycosidase-like protein  30.72 
 
 		 1152 aa  115  5e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.359276  normal  0.0739949 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3334  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.3 
 
 		 536 aa  112  7.000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.783434  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0936  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.64 
 
 		 546 aa  109  4e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.789253 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0875  glycoside hydrolase family protein  27.49 
 
 		 636 aa  109  4e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000412559  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4322  glycoside hydrolase family protein  26.2 
 
 		 581 aa  108  6e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03855  xylosidase; arabinosidase  26.35 
 
 		 556 aa  108  1e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2329  Xylan 1,4-beta-xylosidase  25.59 
 
 		 537 aa  107  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.80101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3545  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.91 
 
 		 547 aa  106  4e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0270111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2090  Alpha-N-arabinofuranosidase  25 
 
 		 537 aa  105  9e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00759162  normal  0.572245 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0598  Alpha-L-arabinofuranosidase  24.42 
 
 		 577 aa  104  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.628109 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0457  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.67 
 
 		 539 aa  103  3e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0354643 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3880  glycoside hydrolase family protein  24 
 
 		 571 aa  102  6e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2108  glycoside hydrolase family 43  25.27 
 
 		 650 aa  102  7e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000141623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0289  xylan 1,4-beta-xylosidase  25.72 
 
 		 532 aa  101  9e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000021727  normal  0.556687 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1143  Alpha-L-arabinofuranosidase  29.19 
 
 		 523 aa  101  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2555  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  30.97 
 
 		 264 aa  101  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000000880484  normal  0.133865 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3048  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.59 
 
 		 515 aa  100  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0608814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4090  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  25.34 
 
 		 1068 aa  100  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1710  Alpha-N-arabinofuranosidase  24.91 
 
 		 541 aa  98.2  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.783601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3849  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  31.42 
 
 		 276 aa  97.1  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0854  immunoglobulin I-set domain-containing protein  29.59 
 
 		 1607 aa  95.1  8e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0597  hypothetical protein  27.27 
 
 		 1547 aa  95.1  9e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.881109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3398  glycoside hydrolase family protein  24.48 
 
 		 514 aa  94.7  1e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0740676  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5096  hypothetical protein  27.59 
 
 		 989 aa  94.7  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1400  glycoside hydrolase family 43  25.75 
 
 		 517 aa  94.4  2e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.587173  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1549  endo-1,4-beta-xylanase  31.35 
 
 		 1020 aa  90.5  3e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0176143  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0643  Carbohydrate-binding family 9  31.02 
 
 		 215 aa  89.7  4e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000132287  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2318  alpha-N-arabinofuranosidase  26.99 
 
 		 512 aa  89.7  4e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.389032  normal  0.249416 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2320  glycoside hydrolase family 10  35.48 
 
 		 1050 aa  89.4  5e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1068  glycoside hydrolase family 43  25.5 
 
 		 797 aa  89  8e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000256501  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2409  hypothetical protein  23.86 
 
 		 541 aa  87.8  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2225  gliding motility-related protein; adhesin AidA-related  30.15 
 
 		 2402 aa  86.3  0.000000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1486  multicopper oxidase type 2  48.6 
 
 		 1601 aa  85.1  0.000000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.131565  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2532  glycoside hydrolase family 43  26.1 
 
 		 586 aa  85.1  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2510  Carbohydrate-binding family 9  32.49 
 
 		 626 aa  84  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0863  endo-1,4-beta-xylanase  28.65 
 
 		 1059 aa  83.6  0.00000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0885  endo-1,4-beta-xylanase  28.65 
 
 		 1059 aa  83.6  0.00000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.389282  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2399  hypothetical protein  41.32 
 
 		 1406 aa  83.2  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2184  Chitinase  53.68 
 
 		 1362 aa  83.2  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00723588 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>