179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5511 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1500  glycoside hydrolase family 43  62.36 
 
 		 551 aa  723    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.36043 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5511  glycoside hydrolase family 43  100 
 
 		 536 aa  1114    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0274092 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1150  glycoside hydrolase family 43  63.5 
 
 		 560 aa  726    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4788  Xylan 1,4-beta-xylosidase  67.37 
 
 		 562 aa  759    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.771274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4249  glycoside hydrolase family protein  56.74 
 
 		 532 aa  622  1e-177  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.158619  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4289  glycoside hydrolase family protein  49.82 
 
 		 572 aa  529  1e-149  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.786059  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0700  glycoside hydrolase family 43  49.12 
 
 		 522 aa  498  1e-139  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0935  glycoside hydrolase family 43  48.82 
 
 		 522 aa  489  1e-137  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3351  glycoside hydrolase family 43  47.63 
 
 		 522 aa  479  1e-134  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2632  glycoside hydrolase family protein  43.88 
 
 		 543 aa  454  1.0000000000000001e-126  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0211688  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0501  glycoside hydrolase family 43  44.86 
 
 		 525 aa  436  1e-121  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00998877 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29240  beta-xylosidase  38.87 
 
 		 527 aa  359  7e-98  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3718  glycoside hydrolase family protein  39.02 
 
 		 504 aa  329  6e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.456589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1233  Carbohydrate binding family 6  33.09 
 
 		 746 aa  258  2e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.555313  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3237  glycoside hydrolase family protein  31.95 
 
 		 1195 aa  230  5e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414155 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2413  glycoside hydrolase family protein  30.19 
 
 		 521 aa  204  3e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.333908  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1251  glycoside hydrolase family protein  29.43 
 
 		 665 aa  197  4.0000000000000005e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0598  Alpha-L-arabinofuranosidase  29.04 
 
 		 577 aa  183  8.000000000000001e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.628109 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2041  polyfunctional acetylxylan esterase/b-xylosidase/a-L-arabinofuranosidase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 43 protein and carbohydrate esterase family 6 protein  28.52 
 
 		 1585 aa  182  1e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1280  glycoside hydrolase family 43  28.38 
 
 		 691 aa  175  1.9999999999999998e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.286369  hitchhiker  0.00183728 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1420  glycoside hydrolase family 43  27.89 
 
 		 530 aa  167  4e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.394008  normal  0.931127 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1257  glycoside hydrolase family 43  27.67 
 
 		 500 aa  167  5e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0191  glycoside hydrolase family protein  29.29 
 
 		 512 aa  166  6.9999999999999995e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3302  glycoside hydrolase family 43  30.35 
 
 		 532 aa  166  1.0000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00567592  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2114  glycoside hydrolase family 43  28.57 
 
 		 518 aa  164  5.0000000000000005e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.554254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3875  glycoside hydrolase family protein  27.22 
 
 		 518 aa  162  2e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1616  alpha-L-arabinofuranosidase  27.24 
 
 		 550 aa  159  1e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.347525  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0182  glycoside hydrolase family 43  32.41 
 
 		 1338 aa  157  4e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1655  translation initiation factor IF-1  28.36 
 
 		 566 aa  156  7e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0976225  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3438  glycoside hydrolase family 43  27.49 
 
 		 519 aa  152  1e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.990127  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07275  xylosidase/glycosyl hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G00930)  27.74 
 
 		 503 aa  152  2e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000188631  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2318  alpha-N-arabinofuranosidase  25.9 
 
 		 512 aa  151  2e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.389032  normal  0.249416 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0842  Alpha-L-arabinofuranosidase  26.08 
 
 		 546 aa  151  3e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.122484  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3228  glycoside hydrolase family protein  27.48 
 
 		 563 aa  146  8.000000000000001e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00674596  normal  0.0120766 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2108  glycoside hydrolase family 43  27.8 
 
 		 650 aa  145  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000141623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2504  Xylan 1,4-beta-xylosidase  24.2 
 
 		 558 aa  142  9.999999999999999e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1143  Alpha-L-arabinofuranosidase  28.34 
 
 		 523 aa  141  3e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3545  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.91 
 
 		 547 aa  141  3e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0270111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2518  glycoside hydrolase family protein  26.62 
 
 		 516 aa  140  4.999999999999999e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1423  Xylan 1,4-beta-xylosidase  28.16 
 
 		 558 aa  140  4.999999999999999e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.423704 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0875  glycoside hydrolase family protein  28.32 
 
 		 636 aa  139  8.999999999999999e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000412559  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03855  xylosidase; arabinosidase  25.79 
 
 		 556 aa  138  2e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2914  glycoside hydrolase family protein  33.43 
 
 		 547 aa  136  9.999999999999999e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3398  glycoside hydrolase family protein  25 
 
 		 514 aa  135  1.9999999999999998e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0740676  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0936  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.85 
 
 		 546 aa  135  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.789253 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3011  Alpha-N-arabinofuranosidase  23.59 
 
 		 538 aa  135  3e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2532  glycoside hydrolase family 43  32.31 
 
 		 586 aa  134  5e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2028  glycoside hydrolase family protein  29.95 
 
 		 498 aa  134  5e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0289  xylan 1,4-beta-xylosidase  28.18 
 
 		 532 aa  134  6e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000021727  normal  0.556687 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2409  hypothetical protein  26.94 
 
 		 541 aa  133  6.999999999999999e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4681  glycoside hydrolase family protein  27.46 
 
 		 492 aa  133  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.026787  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3334  Alpha-N-arabinofuranosidase  24.86 
 
 		 536 aa  132  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.783434  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1400  glycoside hydrolase family 43  30.26 
 
 		 517 aa  131  4.0000000000000003e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.587173  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4322  glycoside hydrolase family protein  28.54 
 
 		 581 aa  130  4.0000000000000003e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2699  glycoside hydrolase family 43  26.1 
 
 		 496 aa  129  1.0000000000000001e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.276179  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2329  Xylan 1,4-beta-xylosidase  24.91 
 
 		 537 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.80101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3599  glycoside hydrolase family 43  30.56 
 
 		 497 aa  128  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0127437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20520  beta-xylosidase  32.19 
 
 		 542 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.129044  normal  0.254652 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1710  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.86 
 
 		 541 aa  125  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.783601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4021  glycoside hydrolase family protein  31.98 
 
 		 537 aa  125  3e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.701147 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2090  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.05 
 
 		 537 aa  124  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00759162  normal  0.572245 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3618  glycoside hydrolase family protein  26.2 
 
 		 508 aa  124  6e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000797588  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2044  beta-xylosidase/alpha-L-arabinofuranosidase- like protein  27.36 
 
 		 1474 aa  123  8e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3811  glycoside hydrolase family 43  26.82 
 
 		 535 aa  122  9.999999999999999e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3531  glycoside hydrolase family 43  32.62 
 
 		 511 aa  122  9.999999999999999e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.185955 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0457  Alpha-N-arabinofuranosidase  23.85 
 
 		 539 aa  122  1.9999999999999998e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0354643 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0430  glycoside hydrolase family 43  31.94 
 
 		 497 aa  122  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.710686 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2459  Xylan 1,4-beta-xylosidase  30.85 
 
 		 488 aa  120  4.9999999999999996e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0431  glycoside hydrolase family protein  31.85 
 
 		 451 aa  119  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21180  beta-xylosidase  29.35 
 
 		 526 aa  119  9.999999999999999e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.851115  normal  0.166078 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3042  twin-arginine translocation pathway signal  30.77 
 
 		 537 aa  117  6e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.351967  normal  0.568346 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3622  Xylan 1,4-beta-xylosidase  26.09 
 
 		 540 aa  116  7.999999999999999e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.573352  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3048  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.17 
 
 		 515 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0608814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1291  Beta-xylosidase  22.74 
 
 		 553 aa  116  1.0000000000000001e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3569  glycoside hydrolase family 43  26.14 
 
 		 484 aa  116  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0058203  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2996  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.64 
 
 		 559 aa  115  2.0000000000000002e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07864  conserved hypothetical protein  28.71 
 
 		 540 aa  114  5e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0157749  normal  0.535242 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2639  glycoside hydrolase family 43  25.94 
 
 		 472 aa  113  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.431626  normal  0.0143862 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1435  glycoside hydrolase family 43  34.4 
 
 		 545 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0848  Beta-xylosidase  23.92 
 
 		 552 aa  111  3e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.168219  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3522  glycoside hydrolase family protein  29.57 
 
 		 534 aa  108  2e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.653851  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1878  beta-xylosidase  26.1 
 
 		 539 aa  108  3e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0650  glycoside hydrolase family 43  24.85 
 
 		 495 aa  105  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0713148  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03261  xylosidase  32.63 
 
 		 365 aa  101  4e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.687612  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3880  glycoside hydrolase family protein  23.13 
 
 		 571 aa  97.4  5e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06751  glycosyl hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G06110)  23.49 
 
 		 591 aa  96.7  1e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.326162 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1068  glycoside hydrolase family 43  27.01 
 
 		 797 aa  95.9  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000256501  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08477  xylosidase : arabinofuranosidase (AFU_orthologue; AFUA_2G13190)  32.46 
 
 		 546 aa  93.2  1e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4504  glycoside hydrolase family 43  26.6 
 
 		 510 aa  88.6  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1524  glycoside hydrolase family 43  27.59 
 
 		 524 aa  86.3  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3360  glycoside hydrolase family 43  24.29 
 
 		 522 aa  85.5  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0779432 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2423  glycoside hydrolase family 43  26.76 
 
 		 699 aa  83.2  0.00000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4703  glycoside hydrolase family 43  26.42 
 
 		 341 aa  82.8  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.184013  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1661  endo-1,4-beta-xylanase/Beta-xylosidase  26.55 
 
 		 901 aa  82  0.00000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1390  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  27.78 
 
 		 341 aa  81.3  0.00000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.287204  normal  0.664348 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6044  glycoside hydrolase family 43  22.88 
 
 		 501 aa  79.3  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.845022  normal  0.0554344 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3403  glycoside hydrolase family 43  25.88 
 
 		 357 aa  79.3  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000194853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0206  glycoside hydrolase family 43  26.16 
 
 		 304 aa  78.2  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  0.253285 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1729  glycoside hydrolase family 43  25.24 
 
 		 472 aa  75.9  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.101805  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2449  glycoside hydrolase family 43  28.04 
 
 		 537 aa  72.4  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114761  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>