191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2384 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_2384  glycoside hydrolase family 43  100 
 
 
330 aa  678    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0193  glycoside hydrolase family 43  78.66 
 
 
324 aa  520  1e-146  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00680352  normal  0.581709 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6730  glycoside hydrolase family 43  71.62 
 
 
323 aa  468  1.0000000000000001e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575675  normal  0.920031 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01870  xylosidase/arabinosidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04480)  44.35 
 
 
344 aa  281  1e-74  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3109  glycoside hydrolase family protein  40.18 
 
 
644 aa  192  6e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16970  beta-xylosidase  39.56 
 
 
313 aa  189  7e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.374085 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2866  glycoside hydrolase family 43  39.19 
 
 
487 aa  183  3e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.141314  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0810  carbohydrate-binding family 6 protein  33.04 
 
 
450 aa  152  1e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.034958  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1229  Carbohydrate binding family 6  30.72 
 
 
535 aa  145  7.0000000000000006e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.166566  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0946  SecY protein  32.74 
 
 
317 aa  143  4e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.409307  hitchhiker  0.0000724629 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1235  Carbohydrate binding family 6  29.32 
 
 
509 aa  143  4e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00440741  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3612  methionine biosynthesis MetW  33.23 
 
 
1186 aa  135  9.999999999999999e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0161329  hitchhiker  0.00479901 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1271  carbohydrate-binding family 6 protein  32.59 
 
 
679 aa  132  7.999999999999999e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3224  Alpha-N-arabinofuranosidase  32.9 
 
 
444 aa  128  1.0000000000000001e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.136595  normal  0.135367 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2196  carbohydrate-binding family 6 protein  30.55 
 
 
533 aa  124  3e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2837  glycoside hydrolase family 43  31.15 
 
 
348 aa  120  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.61366  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1231  Carbohydrate binding family 6  29.58 
 
 
524 aa  119  4.9999999999999996e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0177163  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2447  putative xylosidase  32.02 
 
 
468 aa  119  4.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.320135 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0823  glycoside hydrolase family 43  29.97 
 
 
302 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.328209 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0789  endo-1,4-beta-xylanase D precursor  30.54 
 
 
317 aa  113  5e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0130439  normal  0.452031 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0375  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.92 
 
 
320 aa  113  5e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.194615 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1982  glycoside hydrolase family protein  27.54 
 
 
315 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000010784  normal  0.0338284 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2482  glycoside hydrolase family 43  29.21 
 
 
384 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.24102 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1992  glycoside hydrolase family protein  27.54 
 
 
315 aa  109  5e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000493506  unclonable  0.0000204974 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2069  glycoside hydrolase family protein  27.25 
 
 
315 aa  110  5e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000027007  hitchhiker  0.0000035019 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3276  carbohydrate-binding family 6 protein  33.6 
 
 
401 aa  110  5e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0536  glycoside hydrolase family 43  29.04 
 
 
393 aa  108  9.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.812392 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2143  glycoside hydrolase family 43  29.13 
 
 
311 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.209046  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2063  glycoside hydrolase family protein  29.3 
 
 
311 aa  108  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000284349  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0206  glycoside hydrolase family 43  31.39 
 
 
304 aa  107  4e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  0.253285 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20580  glycoside hydrolase family 43  28.86 
 
 
315 aa  105  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4846  Xylan 1,4-beta-xylosidase  27.51 
 
 
367 aa  103  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0960373  hitchhiker  0.00474985 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3903  glycoside hydrolase family protein  30.7 
 
 
340 aa  103  3e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.969992  normal  0.175565 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10919  hypothetical protein  27.09 
 
 
383 aa  103  5e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0280473  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0455  Carbohydrate binding family 6  28.48 
 
 
618 aa  102  7e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0795  Xylan 1,4-beta-xylosidase  28.3 
 
 
346 aa  101  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000173963  normal  0.0629112 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2022  glycoside hydrolase family 43  27.81 
 
 
334 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2722  glycoside hydrolase family protein  29.79 
 
 
310 aa  98.6  1e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.123508  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2723  glycoside hydrolase family protein  31.68 
 
 
345 aa  98.6  1e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.469303  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2027  glycoside hydrolase family protein  27.38 
 
 
325 aa  98.6  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.808853  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3213  glycoside hydrolase family 43  27.01 
 
 
464 aa  98.6  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.331095  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1323  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.99 
 
 
330 aa  97.8  2e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1998  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.74 
 
 
344 aa  97.8  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4501  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.04 
 
 
316 aa  95.9  8e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.570213  normal  0.69004 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2614  glycoside hydrolase family 43  27.3 
 
 
326 aa  95.9  8e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01459  xylosidase; arabinosidase  28.49 
 
 
527 aa  93.6  4e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.928055  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3728  Alpha-L-arabinofuranosidase  26.33 
 
 
383 aa  92.8  7e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0822  Alpha-L-arabinofuranosidase  26.61 
 
 
385 aa  91.7  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000000000001862  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0353  Xylan 1,4-beta-xylosidase  29.67 
 
 
346 aa  90.1  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0182  glycoside hydrolase family 43  28.32 
 
 
1338 aa  90.5  4e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0507  glycoside hydrolase family 43  33.21 
 
 
337 aa  89.4  8e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.412329 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6022  glycoside hydrolase family 43  26.39 
 
 
319 aa  88.6  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1928  Carbohydrate-binding CenC domain protein  27.64 
 
 
712 aa  88.6  1e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03869  beta-xylosidase (1,4-beta-D-xylan xylohydrolase) (Xylan1,4-beta-xylosidase) (Exo-beta-(1,4)-xylanase)  27.08 
 
 
344 aa  87  4e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1660  carbohydrate binding domain/beta-xylosidase family protein  27.52 
 
 
667 aa  83.6  0.000000000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.324921  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2392  glycoside hydrolase family 43  28.1 
 
 
306 aa  82.8  0.000000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000540158  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4289  glycoside hydrolase family protein  28.85 
 
 
572 aa  80.5  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.786059  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0745  glycoside hydrolase family 43  28.46 
 
 
327 aa  79.7  0.00000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.465475  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0551  Xylan 1,4-beta-xylosidase  24.71 
 
 
335 aa  79.3  0.00000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000239269 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1115  family 43 glycoside hydrolase  28.57 
 
 
338 aa  77.8  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2423  glycoside hydrolase family 43  27.37 
 
 
699 aa  77.8  0.0000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0739  glycoside hydrolase family protein  27.54 
 
 
348 aa  76.6  0.0000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2971  glycoside hydrolase family 43  24.91 
 
 
855 aa  75.1  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0529993 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2556  glycoside hydrolase family 43  26.28 
 
 
319 aa  75.1  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.149373  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3545  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.24 
 
 
547 aa  72.8  0.000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0270111  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0737  glycoside hydrolase family protein  27.69 
 
 
345 aa  70.1  0.00000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.612706  normal  0.340405 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1143  Alpha-L-arabinofuranosidase  25.71 
 
 
523 aa  69.3  0.00000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1302  putative beta-xylosidase  24.06 
 
 
713 aa  69.3  0.00000000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0598  Alpha-L-arabinofuranosidase  25.34 
 
 
577 aa  68.9  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.628109 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07864  conserved hypothetical protein  25.33 
 
 
540 aa  67.8  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0157749  normal  0.535242 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2639  glycoside hydrolase family 43  28.03 
 
 
472 aa  67.8  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.431626  normal  0.0143862 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1655  translation initiation factor IF-1  28 
 
 
566 aa  67.4  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0976225  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0628  glycoside hydrolase family 43  25.61 
 
 
505 aa  67.8  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3395  glycoside hydrolase family 43  23.17 
 
 
355 aa  66.6  0.0000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0650  glycoside hydrolase family 43  25.45 
 
 
495 aa  66.2  0.0000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0713148  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0359  glycoside hydrolase family protein  22.45 
 
 
506 aa  65.9  0.0000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0212595 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4703  glycoside hydrolase family 43  27.48 
 
 
341 aa  66.2  0.0000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.184013  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03855  xylosidase; arabinosidase  27.18 
 
 
556 aa  65.9  0.0000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1400  glycoside hydrolase family 43  25.78 
 
 
517 aa  65.5  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.587173  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1729  glycoside hydrolase family 43  28.03 
 
 
472 aa  65.5  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.101805  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2044  beta-xylosidase/alpha-L-arabinofuranosidase- like protein  24.7 
 
 
1474 aa  64.3  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0531  Alpha-N-arabinofuranosidase  24.79 
 
 
471 aa  64.7  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0473  glycoside hydrolase family 43  26.69 
 
 
829 aa  64.7  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.658009  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20520  beta-xylosidase  25.16 
 
 
542 aa  64.3  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.129044  normal  0.254652 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0936  Alpha-N-arabinofuranosidase  24.3 
 
 
546 aa  63.9  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.789253 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6044  glycoside hydrolase family 43  23.91 
 
 
501 aa  63.5  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.845022  normal  0.0554344 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3334  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.05 
 
 
536 aa  62.8  0.000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.783434  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1291  Beta-xylosidase  24.49 
 
 
553 aa  62  0.00000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1710  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.32 
 
 
541 aa  62  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.783601  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3976  glycoside hydrolase family protein  27.73 
 
 
376 aa  61.6  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4504  glycoside hydrolase family 43  26.13 
 
 
510 aa  61.6  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2156  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  26.48 
 
 
352 aa  61.6  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000116592  hitchhiker  0.00999646 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2996  Alpha-N-arabinofuranosidase  23.87 
 
 
559 aa  60.8  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4281  glycoside hydrolase family protein  25.96 
 
 
304 aa  60.8  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.394059  normal  0.201547 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29240  beta-xylosidase  23.68 
 
 
527 aa  60.5  0.00000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2318  alpha-N-arabinofuranosidase  25.84 
 
 
512 aa  60.5  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.389032  normal  0.249416 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1524  glycoside hydrolase family 43  26.12 
 
 
524 aa  60.5  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2532  glycoside hydrolase family 43  26.03 
 
 
586 aa  59.3  0.00000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2090  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.24 
 
 
537 aa  59.3  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00759162  normal  0.572245 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2529  Alpha-N-arabinofuranosidase  24.59 
 
 
355 aa  58.5  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0997912 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>