193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2639 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2639  glycoside hydrolase family 43  100 
 
 		 472 aa  984    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.431626  normal  0.0143862 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0650  glycoside hydrolase family 43  52.87 
 
 		 495 aa  518  1e-146  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0713148  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3360  glycoside hydrolase family 43  33.88 
 
 		 522 aa  280  5e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0779432 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6044  glycoside hydrolase family 43  35.77 
 
 		 501 aa  272  1e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.845022  normal  0.0554344 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1524  glycoside hydrolase family 43  33.05 
 
 		 524 aa  266  8e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2392  glycoside hydrolase family 43  36.5 
 
 		 306 aa  156  8e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000540158  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2723  glycoside hydrolase family protein  36.13 
 
 		 345 aa  155  1e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.469303  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0206  glycoside hydrolase family 43  33.45 
 
 		 304 aa  135  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  0.253285 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0739  glycoside hydrolase family protein  34.05 
 
 		 348 aa  135  9.999999999999999e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2914  glycoside hydrolase family protein  27.22 
 
 		 547 aa  122  9.999999999999999e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0737  glycoside hydrolase family protein  34.42 
 
 		 345 aa  122  9.999999999999999e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.612706  normal  0.340405 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3228  glycoside hydrolase family protein  25.16 
 
 		 563 aa  120  6e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00674596  normal  0.0120766 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3622  Xylan 1,4-beta-xylosidase  27.4 
 
 		 540 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.573352  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0507  glycoside hydrolase family 43  33.9 
 
 		 337 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.412329 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3811  glycoside hydrolase family 43  26.77 
 
 		 535 aa  114  3e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2518  glycoside hydrolase family protein  26.06 
 
 		 516 aa  113  6e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2423  glycoside hydrolase family 43  27.96 
 
 		 699 aa  113  7.000000000000001e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5511  glycoside hydrolase family 43  25.94 
 
 		 536 aa  113  8.000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0274092 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4021  glycoside hydrolase family protein  29.43 
 
 		 537 aa  112  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.701147 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3042  twin-arginine translocation pathway signal  28.2 
 
 		 537 aa  108  2e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.351967  normal  0.568346 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3438  glycoside hydrolase family 43  26.51 
 
 		 519 aa  107  4e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.990127  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1435  glycoside hydrolase family 43  28.62 
 
 		 545 aa  104  4e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3932  glycoside hydrolase family 43  31.32 
 
 		 456 aa  103  5e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.325517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2722  glycoside hydrolase family protein  29.14 
 
 		 310 aa  103  8e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.123508  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0598  Alpha-L-arabinofuranosidase  24.85 
 
 		 577 aa  100  5e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.628109 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20580  glycoside hydrolase family 43  29.68 
 
 		 315 aa  100  8e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03855  xylosidase; arabinosidase  25 
 
 		 556 aa  99.8  9e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4504  glycoside hydrolase family 43  27.02 
 
 		 510 aa  99.8  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4249  glycoside hydrolase family protein  24.58 
 
 		 532 aa  98.6  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.158619  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3569  glycoside hydrolase family 43  25.25 
 
 		 484 aa  98.6  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0058203  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2698  glycoside hydrolase family 43  33.04 
 
 		 369 aa  97.4  5e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.898004  normal  0.338928 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0191  glycoside hydrolase family protein  25.05 
 
 		 512 aa  97.1  6e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4703  glycoside hydrolase family 43  29.03 
 
 		 341 aa  96.7  9e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.184013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4281  glycoside hydrolase family protein  32.05 
 
 		 304 aa  96.3  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.394059  normal  0.201547 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1423  Xylan 1,4-beta-xylosidase  24.55 
 
 		 558 aa  95.1  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.423704 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0628  glycoside hydrolase family 43  27.87 
 
 		 505 aa  95.1  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0875  glycoside hydrolase family protein  27.74 
 
 		 636 aa  94.7  3e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000412559  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07864  conserved hypothetical protein  22.98 
 
 		 540 aa  93.2  8e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0157749  normal  0.535242 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1616  alpha-L-arabinofuranosidase  23.66 
 
 		 550 aa  93.2  8e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.347525  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2022  glycoside hydrolase family 43  27.66 
 
 		 334 aa  93.2  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1143  Alpha-L-arabinofuranosidase  25.43 
 
 		 523 aa  93.2  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0753  glycoside hydrolase family protein  35.87 
 
 		 465 aa  92.8  1e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3903  glycoside hydrolase family protein  29.28 
 
 		 340 aa  92.8  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.969992  normal  0.175565 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2027  glycoside hydrolase family protein  26.94 
 
 		 325 aa  92  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.808853  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0842  Alpha-L-arabinofuranosidase  23.6 
 
 		 546 aa  91.7  3e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.122484  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10919  hypothetical protein  28.29 
 
 		 383 aa  90.9  4e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0280473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0289  xylan 1,4-beta-xylosidase  22.72 
 
 		 532 aa  91.3  4e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000021727  normal  0.556687 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3522  glycoside hydrolase family protein  24.12 
 
 		 534 aa  90.1  7e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.653851  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4788  Xylan 1,4-beta-xylosidase  23.31 
 
 		 562 aa  88.6  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.771274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1500  glycoside hydrolase family 43  22.87 
 
 		 551 aa  89  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.36043 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3403  glycoside hydrolase family 43  28.83 
 
 		 357 aa  88.6  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000194853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3011  Alpha-N-arabinofuranosidase  23.69 
 
 		 538 aa  88.2  3e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1235  Carbohydrate binding family 6  28.46 
 
 		 509 aa  87.8  4e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00440741  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1150  glycoside hydrolase family 43  23.95 
 
 		 560 aa  86.7  9e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2449  glycoside hydrolase family 43  25.17 
 
 		 537 aa  85.9  0.000000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114761  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3531  glycoside hydrolase family 43  27.55 
 
 		 511 aa  85.9  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.185955 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3599  glycoside hydrolase family 43  23.85 
 
 		 497 aa  86.3  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0127437  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2318  alpha-N-arabinofuranosidase  23.34 
 
 		 512 aa  85.5  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.389032  normal  0.249416 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2866  glycoside hydrolase family 43  29.64 
 
 		 487 aa  85.5  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.141314  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1390  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  26.35 
 
 		 341 aa  84.3  0.000000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.287204  normal  0.664348 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3880  glycoside hydrolase family protein  22.36 
 
 		 571 aa  82.4  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2028  glycoside hydrolase family protein  24.95 
 
 		 498 aa  82.8  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6022  glycoside hydrolase family 43  25.7 
 
 		 319 aa  83.2  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4289  glycoside hydrolase family protein  23.64 
 
 		 572 aa  83.2  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.786059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2532  glycoside hydrolase family 43  25.95 
 
 		 586 aa  81.6  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0501  glycoside hydrolase family 43  23.26 
 
 		 525 aa  81.3  0.00000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00998877 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1655  translation initiation factor IF-1  22.69 
 
 		 566 aa  80.9  0.00000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0976225  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0936  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.16 
 
 		 546 aa  79.7  0.00000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.789253 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1980  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  27.82 
 
 		 355 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000532018  hitchhiker  0.000349844 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3398  glycoside hydrolase family protein  24.66 
 
 		 514 aa  79.3  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0740676  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0700  glycoside hydrolase family 43  23.03 
 
 		 522 aa  78.6  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1995  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  27.82 
 
 		 355 aa  79  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000026265  hitchhiker  0.0000968585 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2082  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  27.82 
 
 		 356 aa  79  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000230744  hitchhiker  0.000000189943 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3545  Alpha-N-arabinofuranosidase  24.57 
 
 		 547 aa  79  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0270111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3718  glycoside hydrolase family protein  23.69 
 
 		 504 aa  78.6  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.456589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29240  beta-xylosidase  29.32 
 
 		 527 aa  78.2  0.0000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4322  glycoside hydrolase family protein  26.47 
 
 		 581 aa  78.2  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2504  Xylan 1,4-beta-xylosidase  22.88 
 
 		 558 aa  77.4  0.0000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2459  Xylan 1,4-beta-xylosidase  26.3 
 
 		 488 aa  77.4  0.0000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6730  glycoside hydrolase family 43  28.43 
 
 		 323 aa  76.6  0.0000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575675  normal  0.920031 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03261  xylosidase  26.64 
 
 		 365 aa  76.6  0.0000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.687612  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2556  glycoside hydrolase family 43  26.95 
 
 		 319 aa  76.6  0.0000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.149373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4496  glycoside hydrolase family 43  25.63 
 
 		 503 aa  76.6  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0241272  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3048  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.4 
 
 		 515 aa  75.9  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0608814  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0455  Carbohydrate binding family 6  25.94 
 
 		 618 aa  75.5  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0935  glycoside hydrolase family 43  23.28 
 
 		 522 aa  74.3  0.000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2156  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  25.35 
 
 		 352 aa  74.3  0.000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000116592  hitchhiker  0.00999646 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3976  glycoside hydrolase family protein  27.35 
 
 		 376 aa  72  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2051  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  26.21 
 
 		 357 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1729  glycoside hydrolase family 43  25 
 
 		 472 aa  72.4  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.101805  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0431  glycoside hydrolase family protein  26.04 
 
 		 451 aa  71.2  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3109  glycoside hydrolase family protein  27.69 
 
 		 644 aa  71.2  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2329  Xylan 1,4-beta-xylosidase  23.14 
 
 		 537 aa  70.9  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.80101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2482  glycoside hydrolase family 43  25.23 
 
 		 384 aa  71.2  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.24102 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1710  Alpha-N-arabinofuranosidase  24.51 
 
 		 541 aa  71.2  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.783601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2632  glycoside hydrolase family protein  20.95 
 
 		 543 aa  70.9  0.00000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0211688  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1291  Beta-xylosidase  23.31 
 
 		 553 aa  70.5  0.00000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2699  glycoside hydrolase family 43  21.69 
 
 		 496 aa  70.1  0.00000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.276179  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4681  glycoside hydrolase family protein  25.25 
 
 		 492 aa  70.1  0.00000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.026787  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0430  glycoside hydrolase family 43  29.48 
 
 		 497 aa  70.1  0.00000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.710686 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>