133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_2996 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009436  Ent638_2996  Alpha-N-arabinofuranosidase  100 
 
 
559 aa  1154    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1878  beta-xylosidase  69.46 
 
 
539 aa  782    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3334  Alpha-N-arabinofuranosidase  46.67 
 
 
536 aa  473  1e-132  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.783434  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0457  Alpha-N-arabinofuranosidase  43.85 
 
 
539 aa  458  9.999999999999999e-129  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0354643 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0289  xylan 1,4-beta-xylosidase  42.81 
 
 
532 aa  417  9.999999999999999e-116  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000021727  normal  0.556687 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1143  Alpha-L-arabinofuranosidase  42.46 
 
 
523 aa  413  1e-114  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3545  Alpha-N-arabinofuranosidase  40.11 
 
 
547 aa  390  1e-107  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0270111  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0936  Alpha-N-arabinofuranosidase  39.74 
 
 
546 aa  385  1e-105  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.789253 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1616  alpha-L-arabinofuranosidase  39.71 
 
 
550 aa  379  1e-104  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.347525  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1710  Alpha-N-arabinofuranosidase  40.43 
 
 
541 aa  381  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.783601  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2090  Alpha-N-arabinofuranosidase  41.12 
 
 
537 aa  382  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00759162  normal  0.572245 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2329  Xylan 1,4-beta-xylosidase  41 
 
 
537 aa  381  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.80101  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2409  hypothetical protein  41.58 
 
 
541 aa  377  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07864  conserved hypothetical protein  39.34 
 
 
540 aa  374  1e-102  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0157749  normal  0.535242 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3398  glycoside hydrolase family protein  37.71 
 
 
514 aa  352  1e-95  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0740676  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2504  Xylan 1,4-beta-xylosidase  33.22 
 
 
558 aa  290  5.0000000000000004e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1291  Beta-xylosidase  34.46 
 
 
553 aa  276  7e-73  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0848  Beta-xylosidase  33.51 
 
 
552 aa  254  3e-66  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.168219  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2518  glycoside hydrolase family protein  30.22 
 
 
516 aa  217  5e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3438  glycoside hydrolase family 43  31.57 
 
 
519 aa  211  3e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.990127  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0598  Alpha-L-arabinofuranosidase  29.94 
 
 
577 aa  209  8e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.628109 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0191  glycoside hydrolase family protein  31.59 
 
 
512 aa  204  3e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2318  alpha-N-arabinofuranosidase  31.94 
 
 
512 aa  203  8e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.389032  normal  0.249416 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1400  glycoside hydrolase family 43  29.32 
 
 
517 aa  202  9.999999999999999e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.587173  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3011  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.93 
 
 
538 aa  200  7e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0875  glycoside hydrolase family protein  29.6 
 
 
636 aa  196  1e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000412559  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3228  glycoside hydrolase family protein  30.02 
 
 
563 aa  191  2.9999999999999997e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00674596  normal  0.0120766 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3599  glycoside hydrolase family 43  33.67 
 
 
497 aa  185  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0127437  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0842  Alpha-L-arabinofuranosidase  28.36 
 
 
546 aa  182  1e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.122484  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2699  glycoside hydrolase family 43  32.55 
 
 
496 aa  180  7e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.276179  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2532  glycoside hydrolase family 43  35.43 
 
 
586 aa  179  2e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3569  glycoside hydrolase family 43  28.74 
 
 
484 aa  178  2e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0058203  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3048  Alpha-N-arabinofuranosidase  33.99 
 
 
515 aa  175  1.9999999999999998e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0608814  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4322  glycoside hydrolase family protein  30.91 
 
 
581 aa  172  1e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2459  Xylan 1,4-beta-xylosidase  38.31 
 
 
488 aa  172  2e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0430  glycoside hydrolase family 43  38.21 
 
 
497 aa  171  3e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.710686 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1423  Xylan 1,4-beta-xylosidase  27.19 
 
 
558 aa  169  9e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.423704 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1655  translation initiation factor IF-1  29.53 
 
 
566 aa  169  1e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0976225  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2028  glycoside hydrolase family protein  27.78 
 
 
498 aa  168  2.9999999999999998e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4681  glycoside hydrolase family protein  34.56 
 
 
492 aa  167  5e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.026787  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20520  beta-xylosidase  34.69 
 
 
542 aa  163  6e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.129044  normal  0.254652 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21180  beta-xylosidase  31.24 
 
 
526 aa  157  5.0000000000000005e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.851115  normal  0.166078 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03855  xylosidase; arabinosidase  28.04 
 
 
556 aa  155  2e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08477  xylosidase : arabinofuranosidase (AFU_orthologue; AFUA_2G13190)  28.94 
 
 
546 aa  154  2.9999999999999998e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3880  glycoside hydrolase family protein  27.21 
 
 
571 aa  153  7e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0431  glycoside hydrolase family protein  34.08 
 
 
451 aa  151  3e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06751  glycosyl hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G06110)  29.87 
 
 
591 aa  141  3.9999999999999997e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.326162 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2044  beta-xylosidase/alpha-L-arabinofuranosidase- like protein  26.33 
 
 
1474 aa  124  4e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3042  twin-arginine translocation pathway signal  24.31 
 
 
537 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.351967  normal  0.568346 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3622  Xylan 1,4-beta-xylosidase  26.44 
 
 
540 aa  118  3.9999999999999997e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.573352  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2108  glycoside hydrolase family 43  29.22 
 
 
650 aa  117  6.9999999999999995e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000141623  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4289  glycoside hydrolase family protein  25.34 
 
 
572 aa  116  1.0000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.786059  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5511  glycoside hydrolase family 43  25.64 
 
 
536 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0274092 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3811  glycoside hydrolase family 43  26.34 
 
 
535 aa  114  5e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4021  glycoside hydrolase family protein  27.06 
 
 
537 aa  113  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.701147 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1500  glycoside hydrolase family 43  33.78 
 
 
551 aa  113  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.36043 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4249  glycoside hydrolase family protein  25.18 
 
 
532 aa  112  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.158619  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2632  glycoside hydrolase family protein  24.95 
 
 
543 aa  112  2.0000000000000002e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0211688  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1150  glycoside hydrolase family 43  27.43 
 
 
560 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0501  glycoside hydrolase family 43  27.48 
 
 
525 aa  111  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00998877 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4788  Xylan 1,4-beta-xylosidase  25.74 
 
 
562 aa  110  9.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.771274  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1879  beta-xylosidase  28.27 
 
 
590 aa  109  1e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1068  glycoside hydrolase family 43  24.81 
 
 
797 aa  106  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000256501  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0700  glycoside hydrolase family 43  26.7 
 
 
522 aa  106  1e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3531  glycoside hydrolase family 43  23.58 
 
 
511 aa  105  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.185955 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0182  glycoside hydrolase family 43  26.05 
 
 
1338 aa  103  9e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0935  glycoside hydrolase family 43  30.49 
 
 
522 aa  101  3e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2914  glycoside hydrolase family protein  24.01 
 
 
547 aa  99.8  1e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29240  beta-xylosidase  27.48 
 
 
527 aa  95.5  2e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1435  glycoside hydrolase family 43  24.94 
 
 
545 aa  95.1  3e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3351  glycoside hydrolase family 43  31.39 
 
 
522 aa  95.1  3e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1251  glycoside hydrolase family protein  26.11 
 
 
665 aa  94.7  4e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2114  glycoside hydrolase family 43  29.28 
 
 
518 aa  91.3  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.554254  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3237  glycoside hydrolase family protein  26.72 
 
 
1195 aa  91.3  4e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.414155 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3360  glycoside hydrolase family 43  25.76 
 
 
522 aa  90.9  5e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0779432 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3718  glycoside hydrolase family protein  24.58 
 
 
504 aa  90.5  7e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.456589  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3522  glycoside hydrolase family protein  24.64 
 
 
534 aa  90.5  8e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.653851  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3618  glycoside hydrolase family protein  29.59 
 
 
508 aa  88.2  4e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000797588  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07275  xylosidase/glycosyl hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G00930)  24.6 
 
 
503 aa  86.3  0.000000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000188631  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1233  Carbohydrate binding family 6  32.54 
 
 
746 aa  84.7  0.000000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.555313  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0650  glycoside hydrolase family 43  25.45 
 
 
495 aa  84  0.000000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0713148  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2413  glycoside hydrolase family protein  26.6 
 
 
521 aa  84  0.000000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.333908  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1420  glycoside hydrolase family 43  27.22 
 
 
530 aa  81.6  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.394008  normal  0.931127 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1280  glycoside hydrolase family 43  23.81 
 
 
691 aa  80.9  0.00000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.286369  hitchhiker  0.00183728 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1257  glycoside hydrolase family 43  29.56 
 
 
500 aa  80.5  0.00000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1524  glycoside hydrolase family 43  25.84 
 
 
524 aa  79.3  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2041  polyfunctional acetylxylan esterase/b-xylosidase/a-L-arabinofuranosidase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 43 protein and carbohydrate esterase family 6 protein  29.15 
 
 
1585 aa  79  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3875  glycoside hydrolase family protein  27.12 
 
 
518 aa  78.6  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3302  glycoside hydrolase family 43  28.66 
 
 
532 aa  74.7  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00567592  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6044  glycoside hydrolase family 43  26.69 
 
 
501 aa  74.3  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.845022  normal  0.0554344 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01043  conserved hypothetical protein  34.96 
 
 
343 aa  66.6  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2138  glycoside hydrolase family protein  26.38 
 
 
580 aa  63.2  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03261  xylosidase  27.82 
 
 
365 aa  63.2  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.687612  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2384  glycoside hydrolase family 43  23.87 
 
 
330 aa  60.8  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0193  glycoside hydrolase family 43  25.98 
 
 
324 aa  60.5  0.00000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00680352  normal  0.581709 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0745  glycoside hydrolase family 43  25.36 
 
 
327 aa  58.9  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.465475  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6730  glycoside hydrolase family 43  24.47 
 
 
323 aa  58.5  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575675  normal  0.920031 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2027  glycoside hydrolase family protein  27.32 
 
 
325 aa  58.5  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.808853  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2639  glycoside hydrolase family 43  24.44 
 
 
472 aa  58.2  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.431626  normal  0.0143862 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0810  carbohydrate-binding family 6 protein  26.61 
 
 
450 aa  57.8  0.0000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.034958  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>