135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2090 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_1710  Alpha-N-arabinofuranosidase  78.54 
 
 		 541 aa  883    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.783601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2090  Alpha-N-arabinofuranosidase  100 
 
 		 537 aa  1117    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00759162  normal  0.572245 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2409  hypothetical protein  75.23 
 
 		 541 aa  841    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2329  Xylan 1,4-beta-xylosidase  94.97 
 
 		 537 aa  1075    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.80101  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07864  conserved hypothetical protein  59.74 
 
 		 540 aa  617  1e-175  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0157749  normal  0.535242 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3545  Alpha-N-arabinofuranosidase  52.2 
 
 		 547 aa  561  1e-158  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0270111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0936  Alpha-N-arabinofuranosidase  52.02 
 
 		 546 aa  545  1e-154  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.789253 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0289  xylan 1,4-beta-xylosidase  50.92 
 
 		 532 aa  500  1e-140  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000021727  normal  0.556687 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1143  Alpha-L-arabinofuranosidase  48.07 
 
 		 523 aa  476  1e-133  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0457  Alpha-N-arabinofuranosidase  45.26 
 
 		 539 aa  449  1e-125  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0354643 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3334  Alpha-N-arabinofuranosidase  45.17 
 
 		 536 aa  444  1e-123  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.783434  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3398  glycoside hydrolase family protein  44.24 
 
 		 514 aa  434  1e-120  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0740676  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1616  alpha-L-arabinofuranosidase  44.63 
 
 		 550 aa  427  1e-118  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.347525  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1878  beta-xylosidase  44.08 
 
 		 539 aa  404  1e-111  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2996  Alpha-N-arabinofuranosidase  41.12 
 
 		 559 aa  382  1e-104  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2504  Xylan 1,4-beta-xylosidase  35.56 
 
 		 558 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1291  Beta-xylosidase  34.22 
 
 		 553 aa  305  1.0000000000000001e-81  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0848  Beta-xylosidase  33.33 
 
 		 552 aa  291  2e-77  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.168219  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3438  glycoside hydrolase family 43  34.87 
 
 		 519 aa  273  7e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.990127  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2518  glycoside hydrolase family protein  35.65 
 
 		 516 aa  266  8e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1400  glycoside hydrolase family 43  37.56 
 
 		 517 aa  240  5.999999999999999e-62  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.587173  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3228  glycoside hydrolase family protein  34.07 
 
 		 563 aa  230  5e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00674596  normal  0.0120766 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0191  glycoside hydrolase family protein  29.52 
 
 		 512 aa  228  2e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3011  Alpha-N-arabinofuranosidase  31.23 
 
 		 538 aa  226  8e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4322  glycoside hydrolase family protein  33.45 
 
 		 581 aa  221  1.9999999999999999e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2318  alpha-N-arabinofuranosidase  34.73 
 
 		 512 aa  221  3e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.389032  normal  0.249416 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03855  xylosidase; arabinosidase  32.33 
 
 		 556 aa  210  5e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0598  Alpha-L-arabinofuranosidase  31.08 
 
 		 577 aa  209  1e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.628109 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1423  Xylan 1,4-beta-xylosidase  29.91 
 
 		 558 aa  206  1e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.423704 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1655  translation initiation factor IF-1  31.7 
 
 		 566 aa  204  4e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0976225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0842  Alpha-L-arabinofuranosidase  31.05 
 
 		 546 aa  203  7e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.122484  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3048  Alpha-N-arabinofuranosidase  38.65 
 
 		 515 aa  203  8e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0608814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3599  glycoside hydrolase family 43  32.61 
 
 		 497 aa  202  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0127437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2028  glycoside hydrolase family protein  28.22 
 
 		 498 aa  197  5.000000000000001e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0875  glycoside hydrolase family protein  28.6 
 
 		 636 aa  194  4e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000412559  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20520  beta-xylosidase  37.58 
 
 		 542 aa  188  2e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.129044  normal  0.254652 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4681  glycoside hydrolase family protein  38.89 
 
 		 492 aa  187  3e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.026787  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0430  glycoside hydrolase family 43  34.25 
 
 		 497 aa  179  1e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.710686 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3569  glycoside hydrolase family 43  31.15 
 
 		 484 aa  179  1e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0058203  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2699  glycoside hydrolase family 43  32.4 
 
 		 496 aa  178  2e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.276179  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2459  Xylan 1,4-beta-xylosidase  34.65 
 
 		 488 aa  174  2.9999999999999996e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2532  glycoside hydrolase family 43  39.78 
 
 		 586 aa  171  4e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0431  glycoside hydrolase family protein  36.65 
 
 		 451 aa  168  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21180  beta-xylosidase  38.59 
 
 		 526 aa  163  7e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.851115  normal  0.166078 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3880  glycoside hydrolase family protein  26.97 
 
 		 571 aa  162  2e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08477  xylosidase : arabinofuranosidase (AFU_orthologue; AFUA_2G13190)  27.89 
 
 		 546 aa  159  8e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06751  glycosyl hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G06110)  30.85 
 
 		 591 aa  139  1e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.326162 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0700  glycoside hydrolase family 43  26.72 
 
 		 522 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0935  glycoside hydrolase family 43  25.82 
 
 		 522 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4249  glycoside hydrolase family protein  24.59 
 
 		 532 aa  132  2.0000000000000002e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.158619  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3718  glycoside hydrolase family protein  27.32 
 
 		 504 aa  130  5.0000000000000004e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.456589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4788  Xylan 1,4-beta-xylosidase  25.75 
 
 		 562 aa  130  7.000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.771274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1150  glycoside hydrolase family 43  25.49 
 
 		 560 aa  128  3e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4289  glycoside hydrolase family protein  26.86 
 
 		 572 aa  126  1e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.786059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1233  Carbohydrate binding family 6  24.96 
 
 		 746 aa  125  2e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.555313  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5511  glycoside hydrolase family 43  27.05 
 
 		 536 aa  124  3e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0274092 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3042  twin-arginine translocation pathway signal  30.42 
 
 		 537 aa  124  4e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.351967  normal  0.568346 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0182  glycoside hydrolase family 43  32.09 
 
 		 1338 aa  123  9e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3351  glycoside hydrolase family 43  27.82 
 
 		 522 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3811  glycoside hydrolase family 43  27.83 
 
 		 535 aa  121  3e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4021  glycoside hydrolase family protein  29.09 
 
 		 537 aa  120  6e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.701147 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2413  glycoside hydrolase family protein  29.68 
 
 		 521 aa  120  7e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.333908  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3622  Xylan 1,4-beta-xylosidase  26.87 
 
 		 540 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.573352  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3522  glycoside hydrolase family protein  32.05 
 
 		 534 aa  116  1.0000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.653851  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2632  glycoside hydrolase family protein  29.57 
 
 		 543 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0211688  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3237  glycoside hydrolase family protein  27.68 
 
 		 1195 aa  114  4.0000000000000004e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414155 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1500  glycoside hydrolase family 43  24.78 
 
 		 551 aa  114  6e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.36043 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1068  glycoside hydrolase family 43  26.93 
 
 		 797 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000256501  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2108  glycoside hydrolase family 43  24.68 
 
 		 650 aa  112  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000141623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3531  glycoside hydrolase family 43  30.67 
 
 		 511 aa  111  3e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.185955 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2114  glycoside hydrolase family 43  26.65 
 
 		 518 aa  111  4.0000000000000004e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.554254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2914  glycoside hydrolase family protein  31.13 
 
 		 547 aa  109  2e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2044  beta-xylosidase/alpha-L-arabinofuranosidase- like protein  26.65 
 
 		 1474 aa  107  7e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0501  glycoside hydrolase family 43  27.34 
 
 		 525 aa  106  1e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00998877 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2041  polyfunctional acetylxylan esterase/b-xylosidase/a-L-arabinofuranosidase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 43 protein and carbohydrate esterase family 6 protein  25 
 
 		 1585 aa  105  2e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1420  glycoside hydrolase family 43  25.36 
 
 		 530 aa  102  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.394008  normal  0.931127 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1435  glycoside hydrolase family 43  28.39 
 
 		 545 aa  100  6e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1879  beta-xylosidase  30.8 
 
 		 590 aa  99  2e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29240  beta-xylosidase  25.94 
 
 		 527 aa  97.4  6e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1251  glycoside hydrolase family protein  25.22 
 
 		 665 aa  92.4  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3875  glycoside hydrolase family protein  23.05 
 
 		 518 aa  88.6  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3360  glycoside hydrolase family 43  25.32 
 
 		 522 aa  88.6  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0779432 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1257  glycoside hydrolase family 43  23.65 
 
 		 500 aa  87.8  4e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02633  conserved hypothetical protein  44.55 
 
 		 110 aa  85.5  0.000000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.947242 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1524  glycoside hydrolase family 43  24.28 
 
 		 524 aa  85.1  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03261  xylosidase  29.29 
 
 		 365 aa  77.4  0.0000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.687612  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1280  glycoside hydrolase family 43  25.34 
 
 		 691 aa  77.8  0.0000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.286369  hitchhiker  0.00183728 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01043  conserved hypothetical protein  26.42 
 
 		 343 aa  68.9  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2027  glycoside hydrolase family protein  23.29 
 
 		 325 aa  68.6  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.808853  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3302  glycoside hydrolase family 43  24.17 
 
 		 532 aa  68.6  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00567592  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2639  glycoside hydrolase family 43  23.19 
 
 		 472 aa  68.2  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.431626  normal  0.0143862 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07275  xylosidase/glycosyl hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G00930)  24.68 
 
 		 503 aa  65.1  0.000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000188631  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0650  glycoside hydrolase family 43  24.92 
 
 		 495 aa  65.1  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0713148  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6044  glycoside hydrolase family 43  22.74 
 
 		 501 aa  62.8  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.845022  normal  0.0554344 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1661  endo-1,4-beta-xylanase/Beta-xylosidase  24.05 
 
 		 901 aa  63.2  0.00000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6730  glycoside hydrolase family 43  23.87 
 
 		 323 aa  61.6  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575675  normal  0.920031 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0193  glycoside hydrolase family 43  25.34 
 
 		 324 aa  62  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00680352  normal  0.581709 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3903  glycoside hydrolase family protein  27.25 
 
 		 340 aa  61.6  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.969992  normal  0.175565 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0810  carbohydrate-binding family 6 protein  27.59 
 
 		 450 aa  60.5  0.00000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.034958  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2813  glycoside hydrolase family 43  26.47 
 
 		 331 aa  60.5  0.00000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0257715  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>