155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_0430 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_0430  glycoside hydrolase family 43  100 
 
 		 497 aa  993    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.710686 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2459  Xylan 1,4-beta-xylosidase  43.26 
 
 		 488 aa  342  8e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3569  glycoside hydrolase family 43  43.23 
 
 		 484 aa  334  2e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0058203  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3599  glycoside hydrolase family 43  41.73 
 
 		 497 aa  331  2e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0127437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21180  beta-xylosidase  42.25 
 
 		 526 aa  328  2.0000000000000001e-88  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.851115  normal  0.166078 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4681  glycoside hydrolase family protein  41.05 
 
 		 492 aa  312  6.999999999999999e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.026787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2532  glycoside hydrolase family 43  39.65 
 
 		 586 aa  290  6e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0431  glycoside hydrolase family protein  39.69 
 
 		 451 aa  275  1.0000000000000001e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2028  glycoside hydrolase family protein  32.4 
 
 		 498 aa  245  9.999999999999999e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3438  glycoside hydrolase family 43  33.72 
 
 		 519 aa  241  2e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.990127  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2699  glycoside hydrolase family 43  34.61 
 
 		 496 aa  241  2.9999999999999997e-62  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.276179  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1400  glycoside hydrolase family 43  47.02 
 
 		 517 aa  241  2.9999999999999997e-62  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.587173  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2318  alpha-N-arabinofuranosidase  34.39 
 
 		 512 aa  240  4e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.389032  normal  0.249416 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3011  Alpha-N-arabinofuranosidase  42.81 
 
 		 538 aa  238  1e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3048  Alpha-N-arabinofuranosidase  37.42 
 
 		 515 aa  233  5e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0608814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20520  beta-xylosidase  43.16 
 
 		 542 aa  222  9.999999999999999e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.129044  normal  0.254652 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2518  glycoside hydrolase family protein  42.41 
 
 		 516 aa  220  5e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3228  glycoside hydrolase family protein  34.35 
 
 		 563 aa  216  9.999999999999999e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00674596  normal  0.0120766 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03855  xylosidase; arabinosidase  34.17 
 
 		 556 aa  209  8e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0598  Alpha-L-arabinofuranosidase  34.9 
 
 		 577 aa  206  6e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.628109 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1655  translation initiation factor IF-1  35.9 
 
 		 566 aa  206  1e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0976225  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3334  Alpha-N-arabinofuranosidase  40.38 
 
 		 536 aa  204  2e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.783434  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0191  glycoside hydrolase family protein  37.63 
 
 		 512 aa  203  6e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08477  xylosidase : arabinofuranosidase (AFU_orthologue; AFUA_2G13190)  37.5 
 
 		 546 aa  202  9.999999999999999e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1423  Xylan 1,4-beta-xylosidase  28.23 
 
 		 558 aa  197  4.0000000000000005e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.423704 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3398  glycoside hydrolase family protein  39.37 
 
 		 514 aa  196  1e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0740676  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0289  xylan 1,4-beta-xylosidase  32.95 
 
 		 532 aa  196  1e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000021727  normal  0.556687 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1143  Alpha-L-arabinofuranosidase  39.74 
 
 		 523 aa  194  3e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4322  glycoside hydrolase family protein  34.31 
 
 		 581 aa  194  4e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07864  conserved hypothetical protein  35.58 
 
 		 540 aa  193  5e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0157749  normal  0.535242 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0457  Alpha-N-arabinofuranosidase  33.33 
 
 		 539 aa  189  1e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0354643 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1616  alpha-L-arabinofuranosidase  35.49 
 
 		 550 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.347525  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2409  hypothetical protein  32.83 
 
 		 541 aa  186  1.0000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2504  Xylan 1,4-beta-xylosidase  35.19 
 
 		 558 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0936  Alpha-N-arabinofuranosidase  40.53 
 
 		 546 aa  184  4.0000000000000006e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.789253 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3545  Alpha-N-arabinofuranosidase  40.33 
 
 		 547 aa  184  4.0000000000000006e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0270111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0842  Alpha-L-arabinofuranosidase  38.95 
 
 		 546 aa  179  1e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.122484  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2090  Alpha-N-arabinofuranosidase  34.25 
 
 		 537 aa  179  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00759162  normal  0.572245 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0875  glycoside hydrolase family protein  30.67 
 
 		 636 aa  178  2e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000412559  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1878  beta-xylosidase  38.16 
 
 		 539 aa  177  4e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3880  glycoside hydrolase family protein  30.25 
 
 		 571 aa  174  2.9999999999999996e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06751  glycosyl hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G06110)  40.69 
 
 		 591 aa  172  1e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.326162 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1710  Alpha-N-arabinofuranosidase  37.14 
 
 		 541 aa  172  2e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.783601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2996  Alpha-N-arabinofuranosidase  38.21 
 
 		 559 aa  171  3e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2329  Xylan 1,4-beta-xylosidase  32.5 
 
 		 537 aa  168  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.80101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1291  Beta-xylosidase  26.32 
 
 		 553 aa  156  9e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0848  Beta-xylosidase  25.63 
 
 		 552 aa  149  2.0000000000000003e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.168219  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3622  Xylan 1,4-beta-xylosidase  32.54 
 
 		 540 aa  136  7.000000000000001e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.573352  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0700  glycoside hydrolase family 43  32.52 
 
 		 522 aa  134  3e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0935  glycoside hydrolase family 43  32.87 
 
 		 522 aa  133  6.999999999999999e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3811  glycoside hydrolase family 43  32.2 
 
 		 535 aa  133  9e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3531  glycoside hydrolase family 43  34.22 
 
 		 511 aa  133  9e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.185955 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4289  glycoside hydrolase family protein  34.64 
 
 		 572 aa  132  1.0000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.786059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1879  beta-xylosidase  29.97 
 
 		 590 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3042  twin-arginine translocation pathway signal  34.72 
 
 		 537 aa  131  3e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.351967  normal  0.568346 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2914  glycoside hydrolase family protein  32.88 
 
 		 547 aa  129  1.0000000000000001e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3522  glycoside hydrolase family protein  33.68 
 
 		 534 aa  124  6e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.653851  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4021  glycoside hydrolase family protein  34.97 
 
 		 537 aa  124  6e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.701147 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0182  glycoside hydrolase family 43  28.01 
 
 		 1338 aa  123  6e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5511  glycoside hydrolase family 43  31.94 
 
 		 536 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0274092 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3351  glycoside hydrolase family 43  31.82 
 
 		 522 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3718  glycoside hydrolase family protein  33.22 
 
 		 504 aa  119  9.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.456589  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1435  glycoside hydrolase family 43  31.95 
 
 		 545 aa  119  1.9999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0501  glycoside hydrolase family 43  33.68 
 
 		 525 aa  117  3e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00998877 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03261  xylosidase  33.21 
 
 		 365 aa  115  2.0000000000000002e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.687612  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29240  beta-xylosidase  33.33 
 
 		 527 aa  114  4.0000000000000004e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4788  Xylan 1,4-beta-xylosidase  32.42 
 
 		 562 aa  113  8.000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.771274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1150  glycoside hydrolase family 43  31.22 
 
 		 560 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3237  glycoside hydrolase family protein  31.47 
 
 		 1195 aa  112  2.0000000000000002e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414155 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2632  glycoside hydrolase family protein  31.9 
 
 		 543 aa  110  7.000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0211688  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1500  glycoside hydrolase family 43  28.98 
 
 		 551 aa  107  6e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.36043 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4249  glycoside hydrolase family protein  28.37 
 
 		 532 aa  105  3e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.158619  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1251  glycoside hydrolase family protein  29.14 
 
 		 665 aa  102  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1233  Carbohydrate binding family 6  26.22 
 
 		 746 aa  102  1e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.555313  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2413  glycoside hydrolase family protein  28.96 
 
 		 521 aa  99.8  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.333908  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2114  glycoside hydrolase family 43  26.03 
 
 		 518 aa  97.1  6e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.554254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1420  glycoside hydrolase family 43  27.04 
 
 		 530 aa  96.3  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.394008  normal  0.931127 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3875  glycoside hydrolase family protein  23.25 
 
 		 518 aa  84  0.000000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1257  glycoside hydrolase family 43  21.05 
 
 		 500 aa  83.2  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0206  glycoside hydrolase family 43  29.81 
 
 		 304 aa  82  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  0.253285 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01043  conserved hypothetical protein  37.3 
 
 		 343 aa  81.3  0.00000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2044  beta-xylosidase/alpha-L-arabinofuranosidase- like protein  29.47 
 
 		 1474 aa  81.3  0.00000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3618  glycoside hydrolase family protein  28.5 
 
 		 508 aa  80.9  0.00000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000797588  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1524  glycoside hydrolase family 43  26.4 
 
 		 524 aa  79.3  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6044  glycoside hydrolase family 43  25.57 
 
 		 501 aa  79.3  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.845022  normal  0.0554344 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3360  glycoside hydrolase family 43  25.82 
 
 		 522 aa  79  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0779432 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1280  glycoside hydrolase family 43  27.09 
 
 		 691 aa  78.6  0.0000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.286369  hitchhiker  0.00183728 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1729  glycoside hydrolase family 43  24.32 
 
 		 472 aa  76.3  0.000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.101805  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2108  glycoside hydrolase family 43  29.11 
 
 		 650 aa  76.3  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000141623  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07275  xylosidase/glycosyl hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G00930)  26.49 
 
 		 503 aa  74.7  0.000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000188631  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0650  glycoside hydrolase family 43  29.88 
 
 		 495 aa  74.3  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0713148  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0786  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  24.92 
 
 		 346 aa  72.8  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000141301  normal  0.447167 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3302  glycoside hydrolase family 43  29.41 
 
 		 532 aa  71.6  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00567592  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0737  glycoside hydrolase family protein  27.55 
 
 		 345 aa  71.2  0.00000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.612706  normal  0.340405 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1068  glycoside hydrolase family 43  24.68 
 
 		 797 aa  71.2  0.00000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000256501  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6022  glycoside hydrolase family 43  27.64 
 
 		 319 aa  70.9  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2423  glycoside hydrolase family 43  25 
 
 		 699 aa  70.9  0.00000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2639  glycoside hydrolase family 43  29.48 
 
 		 472 aa  70.1  0.00000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.431626  normal  0.0143862 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2041  polyfunctional acetylxylan esterase/b-xylosidase/a-L-arabinofuranosidase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 43 protein and carbohydrate esterase family 6 protein  24.49 
 
 		 1585 aa  68.9  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1390  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  25.71 
 
 		 341 aa  68.6  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.287204  normal  0.664348 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>