95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3302 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3302  glycoside hydrolase family 43  100 
 
 		 532 aa  1084    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00567592  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1280  glycoside hydrolase family 43  70.74 
 
 		 691 aa  727    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.286369  hitchhiker  0.00183728 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07275  xylosidase/glycosyl hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G00930)  56.49 
 
 		 503 aa  589  1e-167  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000188631  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1233  Carbohydrate binding family 6  37.24 
 
 		 746 aa  280  7e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.555313  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1251  glycoside hydrolase family protein  33.75 
 
 		 665 aa  256  9e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3875  glycoside hydrolase family protein  32.21 
 
 		 518 aa  251  2e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1420  glycoside hydrolase family 43  34.98 
 
 		 530 aa  251  2e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.394008  normal  0.931127 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1257  glycoside hydrolase family 43  32.09 
 
 		 500 aa  241  2e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2041  polyfunctional acetylxylan esterase/b-xylosidase/a-L-arabinofuranosidase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 43 protein and carbohydrate esterase family 6 protein  32.08 
 
 		 1585 aa  240  4e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2114  glycoside hydrolase family 43  32.36 
 
 		 518 aa  234  4.0000000000000004e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.554254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3237  glycoside hydrolase family protein  34.37 
 
 		 1195 aa  229  1e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414155 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3618  glycoside hydrolase family protein  30.43 
 
 		 508 aa  219  1e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000797588  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3718  glycoside hydrolase family protein  34.53 
 
 		 504 aa  205  1e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.456589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2413  glycoside hydrolase family protein  30.11 
 
 		 521 aa  205  2e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.333908  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4249  glycoside hydrolase family protein  28.63 
 
 		 532 aa  183  6e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.158619  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4289  glycoside hydrolase family protein  30.77 
 
 		 572 aa  183  6e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.786059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0501  glycoside hydrolase family 43  31.76 
 
 		 525 aa  178  3e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00998877 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1150  glycoside hydrolase family 43  30.65 
 
 		 560 aa  173  7.999999999999999e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1500  glycoside hydrolase family 43  30.26 
 
 		 551 aa  169  2e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.36043 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5511  glycoside hydrolase family 43  30.35 
 
 		 536 aa  166  1.0000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0274092 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4788  Xylan 1,4-beta-xylosidase  30.39 
 
 		 562 aa  164  5.0000000000000005e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.771274  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0182  glycoside hydrolase family 43  32.03 
 
 		 1338 aa  157  5.0000000000000005e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2632  glycoside hydrolase family protein  26.92 
 
 		 543 aa  156  8e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0211688  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0700  glycoside hydrolase family 43  28.28 
 
 		 522 aa  150  4e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0935  glycoside hydrolase family 43  27.89 
 
 		 522 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29240  beta-xylosidase  29.95 
 
 		 527 aa  145  2e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3351  glycoside hydrolase family 43  28.23 
 
 		 522 aa  144  4e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0191  glycoside hydrolase family protein  28.71 
 
 		 512 aa  120  7e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0598  Alpha-L-arabinofuranosidase  25.59 
 
 		 577 aa  112  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.628109 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0289  xylan 1,4-beta-xylosidase  25.46 
 
 		 532 aa  109  1e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000021727  normal  0.556687 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1143  Alpha-L-arabinofuranosidase  27.05 
 
 		 523 aa  105  2e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1661  endo-1,4-beta-xylanase/Beta-xylosidase  28.91 
 
 		 901 aa  105  2e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1400  glycoside hydrolase family 43  28.54 
 
 		 517 aa  102  1e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.587173  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1616  alpha-L-arabinofuranosidase  25.43 
 
 		 550 aa  100  8e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.347525  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4322  glycoside hydrolase family protein  27.69 
 
 		 581 aa  97.4  6e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0842  Alpha-L-arabinofuranosidase  23.69 
 
 		 546 aa  92.8  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.122484  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3228  glycoside hydrolase family protein  26.32 
 
 		 563 aa  90.5  6e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00674596  normal  0.0120766 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0875  glycoside hydrolase family protein  23.9 
 
 		 636 aa  90.1  9e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000412559  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3438  glycoside hydrolase family 43  27.03 
 
 		 519 aa  89.7  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.990127  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3545  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.54 
 
 		 547 aa  89.4  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0270111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2699  glycoside hydrolase family 43  28.3 
 
 		 496 aa  89  2e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.276179  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3048  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.04 
 
 		 515 aa  87.8  5e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0608814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0848  Beta-xylosidase  25.22 
 
 		 552 aa  85.5  0.000000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.168219  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3334  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.99 
 
 		 536 aa  85.5  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.783434  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2914  glycoside hydrolase family protein  26.02 
 
 		 547 aa  82.4  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20520  beta-xylosidase  29.63 
 
 		 542 aa  81.6  0.00000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.129044  normal  0.254652 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1423  Xylan 1,4-beta-xylosidase  22.35 
 
 		 558 aa  80.9  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.423704 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2318  alpha-N-arabinofuranosidase  26.42 
 
 		 512 aa  80.5  0.00000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.389032  normal  0.249416 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2518  glycoside hydrolase family protein  26.39 
 
 		 516 aa  79.7  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0457  Alpha-N-arabinofuranosidase  23.52 
 
 		 539 aa  77.4  0.0000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0354643 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3398  glycoside hydrolase family protein  22.42 
 
 		 514 aa  76.3  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0740676  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2044  beta-xylosidase/alpha-L-arabinofuranosidase- like protein  24.49 
 
 		 1474 aa  75.5  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2996  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.66 
 
 		 559 aa  74.7  0.000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1710  Alpha-N-arabinofuranosidase  24.38 
 
 		 541 aa  74.3  0.000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.783601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1655  translation initiation factor IF-1  24.37 
 
 		 566 aa  72.8  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0976225  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3531  glycoside hydrolase family 43  25.71 
 
 		 511 aa  72  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.185955 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0430  glycoside hydrolase family 43  29.41 
 
 		 497 aa  71.6  0.00000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.710686 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21180  beta-xylosidase  25.99 
 
 		 526 aa  72  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.851115  normal  0.166078 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2028  glycoside hydrolase family protein  24.5 
 
 		 498 aa  71.2  0.00000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07864  conserved hypothetical protein  24.52 
 
 		 540 aa  70.9  0.00000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0157749  normal  0.535242 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2504  Xylan 1,4-beta-xylosidase  21.25 
 
 		 558 aa  70.5  0.00000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0936  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.71 
 
 		 546 aa  70.5  0.00000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.789253 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1291  Beta-xylosidase  25.08 
 
 		 553 aa  70.1  0.00000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0431  glycoside hydrolase family protein  26.71 
 
 		 451 aa  69.7  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2108  glycoside hydrolase family 43  23.11 
 
 		 650 aa  69.7  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000141623  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2459  Xylan 1,4-beta-xylosidase  26.57 
 
 		 488 aa  69.3  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3599  glycoside hydrolase family 43  25.42 
 
 		 497 aa  68.9  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0127437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2090  Alpha-N-arabinofuranosidase  24.17 
 
 		 537 aa  68.6  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00759162  normal  0.572245 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4681  glycoside hydrolase family protein  25.49 
 
 		 492 aa  67.8  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.026787  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1878  beta-xylosidase  25.62 
 
 		 539 aa  67  0.0000000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2329  Xylan 1,4-beta-xylosidase  24.38 
 
 		 537 aa  65.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.80101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3569  glycoside hydrolase family 43  24.7 
 
 		 484 aa  64.7  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0058203  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3360  glycoside hydrolase family 43  27.27 
 
 		 522 aa  64.7  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0779432 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03855  xylosidase; arabinosidase  25.06 
 
 		 556 aa  64.7  0.000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1524  glycoside hydrolase family 43  28.02 
 
 		 524 aa  64.7  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4021  glycoside hydrolase family protein  26.1 
 
 		 537 aa  63.9  0.000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.701147 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3011  Alpha-N-arabinofuranosidase  24.74 
 
 		 538 aa  63.5  0.000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2409  hypothetical protein  23.12 
 
 		 541 aa  62.8  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3042  twin-arginine translocation pathway signal  24.53 
 
 		 537 aa  62.8  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.351967  normal  0.568346 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3622  Xylan 1,4-beta-xylosidase  25.25 
 
 		 540 aa  58.9  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.573352  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6044  glycoside hydrolase family 43  24.18 
 
 		 501 aa  57  0.0000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.845022  normal  0.0554344 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06751  glycosyl hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G06110)  31.11 
 
 		 591 aa  56.6  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.326162 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3811  glycoside hydrolase family 43  24.92 
 
 		 535 aa  56.2  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2392  glycoside hydrolase family 43  27.61 
 
 		 306 aa  55.1  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000540158  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2532  glycoside hydrolase family 43  23.31 
 
 		 586 aa  55.5  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1435  glycoside hydrolase family 43  24.59 
 
 		 545 aa  55.1  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0650  glycoside hydrolase family 43  38.27 
 
 		 495 aa  54.3  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0713148  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3880  glycoside hydrolase family protein  21.33 
 
 		 571 aa  53.5  0.000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2639  glycoside hydrolase family 43  22.29 
 
 		 472 aa  49.3  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.431626  normal  0.0143862 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3522  glycoside hydrolase family protein  24.7 
 
 		 534 aa  49.3  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.653851  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2866  glycoside hydrolase family 43  23.76 
 
 		 487 aa  48.1  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.141314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1068  glycoside hydrolase family 43  24.42 
 
 		 797 aa  47.8  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000256501  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0455  Carbohydrate binding family 6  24.75 
 
 		 618 aa  46.2  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4703  glycoside hydrolase family 43  25 
 
 		 341 aa  45.1  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.184013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0206  glycoside hydrolase family 43  25.42 
 
 		 304 aa  44.7  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  0.253285 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>