More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1233 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_1233  Carbohydrate binding family 6  100 
 
 		 746 aa  1526    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.555313  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3237  glycoside hydrolase family protein  38.81 
 
 		 1195 aa  347  4e-94  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414155 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1234  Carbohydrate binding family 6  74.55 
 
 		 536 aa  329  1.0000000000000001e-88  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.115461  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2041  polyfunctional acetylxylan esterase/b-xylosidase/a-L-arabinofuranosidase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 43 protein and carbohydrate esterase family 6 protein  37.83 
 
 		 1585 aa  327  6e-88  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1420  glycoside hydrolase family 43  38.15 
 
 		 530 aa  325  1e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.394008  normal  0.931127 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1230  Carbohydrate binding family 6  66.67 
 
 		 541 aa  323  6e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000323294  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1251  glycoside hydrolase family protein  34.23 
 
 		 665 aa  322  1.9999999999999998e-86  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1240  Carbohydrate binding family 6  71.43 
 
 		 780 aa  315  1.9999999999999998e-84  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000268081  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3875  glycoside hydrolase family protein  34.98 
 
 		 518 aa  294  3e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2413  glycoside hydrolase family protein  33.08 
 
 		 521 aa  293  7e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.333908  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1238  Carbohydrate binding family 6  68.45 
 
 		 1122 aa  292  2e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000137164  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1237  Carbohydrate binding family 6  69.46 
 
 		 604 aa  291  2e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0649618  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2114  glycoside hydrolase family 43  34.94 
 
 		 518 aa  285  2.0000000000000002e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.554254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1239  Carbohydrate binding family 6  65.57 
 
 		 1015 aa  282  1e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000298242  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3302  glycoside hydrolase family 43  37.24 
 
 		 532 aa  280  1e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00567592  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1280  glycoside hydrolase family 43  36.26 
 
 		 691 aa  273  6e-72  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.286369  hitchhiker  0.00183728 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1257  glycoside hydrolase family 43  33.86 
 
 		 500 aa  270  8e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4249  glycoside hydrolase family protein  32.07 
 
 		 532 aa  268  2e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.158619  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4788  Xylan 1,4-beta-xylosidase  34.48 
 
 		 562 aa  267  4e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.771274  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1241  Carbohydrate binding family 6  66.34 
 
 		 1164 aa  264  4e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3718  glycoside hydrolase family protein  34.57 
 
 		 504 aa  259  9e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.456589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5511  glycoside hydrolase family 43  33.09 
 
 		 536 aa  258  3e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0274092 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1242  Carbohydrate binding family 6  67.98 
 
 		 629 aa  257  7e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.679314  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1150  glycoside hydrolase family 43  35.01 
 
 		 560 aa  254  4.0000000000000004e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4289  glycoside hydrolase family protein  31.53 
 
 		 572 aa  251  2e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.786059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2632  glycoside hydrolase family protein  31.22 
 
 		 543 aa  252  2e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0211688  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1500  glycoside hydrolase family 43  33.58 
 
 		 551 aa  239  1e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.36043 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07275  xylosidase/glycosyl hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G00930)  34.71 
 
 		 503 aa  239  2e-61  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000188631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2195  carbohydrate-binding family 6 protein  55.71 
 
 		 965 aa  236  2.0000000000000002e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.862232  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0700  glycoside hydrolase family 43  29.81 
 
 		 522 aa  231  5e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3618  glycoside hydrolase family protein  31.2 
 
 		 508 aa  226  1e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000797588  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0935  glycoside hydrolase family 43  29.48 
 
 		 522 aa  224  3e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1232  Carbohydrate binding family 6  56.13 
 
 		 490 aa  224  6e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.122742  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2197  carbohydrate-binding family 6 protein  51.09 
 
 		 928 aa  223  9.999999999999999e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.71663  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2194  carbohydrate-binding family 6 protein  53.17 
 
 		 501 aa  221  3e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.29628  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1656  Carbohydrate binding family 6  54.97 
 
 		 951 aa  213  1e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00148801  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3351  glycoside hydrolase family 43  29.57 
 
 		 522 aa  211  3e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1231  Carbohydrate binding family 6  53.17 
 
 		 524 aa  204  4e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0177163  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0182  glycoside hydrolase family 43  37.15 
 
 		 1338 aa  202  1.9999999999999998e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1235  Carbohydrate binding family 6  52.02 
 
 		 509 aa  197  8.000000000000001e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00440741  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1229  Carbohydrate binding family 6  52.04 
 
 		 535 aa  187  6e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.166566  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0501  glycoside hydrolase family 43  31.24 
 
 		 525 aa  182  2e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00998877 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0191  glycoside hydrolase family protein  29.34 
 
 		 512 aa  182  2e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1271  carbohydrate-binding family 6 protein  46.77 
 
 		 679 aa  174  5e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2196  carbohydrate-binding family 6 protein  46.15 
 
 		 533 aa  171  4e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2108  glycoside hydrolase family 43  24.06 
 
 		 650 aa  159  1e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000141623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1963  glycoside hydrolase family protein  42.72 
 
 		 837 aa  160  1e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.658538  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2972  glycoside hydrolase family protein  40.28 
 
 		 683 aa  159  2e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29240  beta-xylosidase  28.01 
 
 		 527 aa  155  2e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2044  beta-xylosidase/alpha-L-arabinofuranosidase- like protein  27.25 
 
 		 1474 aa  155  4e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3012  carbohydrate-binding family 6 protein  39.82 
 
 		 630 aa  154  5.9999999999999996e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3438  glycoside hydrolase family 43  30.39 
 
 		 519 aa  153  8.999999999999999e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.990127  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1616  alpha-L-arabinofuranosidase  25.27 
 
 		 550 aa  147  9e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.347525  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1068  glycoside hydrolase family 43  23.85 
 
 		 797 aa  145  2e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000256501  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2795  hypothetical protein  52.31 
 
 		 912 aa  143  9.999999999999999e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00123137  hitchhiker  0.0000146968 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0875  glycoside hydrolase family protein  27.17 
 
 		 636 aa  141  4.999999999999999e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000412559  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1655  translation initiation factor IF-1  27.95 
 
 		 566 aa  139  2e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0976225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2518  glycoside hydrolase family protein  26.2 
 
 		 516 aa  137  6.0000000000000005e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2318  alpha-N-arabinofuranosidase  25.4 
 
 		 512 aa  137  8e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.389032  normal  0.249416 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0598  Alpha-L-arabinofuranosidase  26.74 
 
 		 577 aa  133  1.0000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.628109 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3398  glycoside hydrolase family protein  26.4 
 
 		 514 aa  132  2.0000000000000002e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0740676  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03855  xylosidase; arabinosidase  28.05 
 
 		 556 aa  131  4.0000000000000003e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1400  glycoside hydrolase family 43  26.31 
 
 		 517 aa  130  7.000000000000001e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.587173  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1143  Alpha-L-arabinofuranosidase  29.07 
 
 		 523 aa  130  9.000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3213  glycoside hydrolase family 43  44.03 
 
 		 464 aa  129  3e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.331095  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0457  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.18 
 
 		 539 aa  128  3e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0354643 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0455  Carbohydrate binding family 6  47.18 
 
 		 618 aa  127  7e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3011  Alpha-N-arabinofuranosidase  32.43 
 
 		 538 aa  127  7e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1661  endo-1,4-beta-xylanase/Beta-xylosidase  31.82 
 
 		 901 aa  127  1e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4322  glycoside hydrolase family protein  29.28 
 
 		 581 aa  125  2e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2329  Xylan 1,4-beta-xylosidase  25.13 
 
 		 537 aa  125  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.80101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2090  Alpha-N-arabinofuranosidase  24.96 
 
 		 537 aa  125  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00759162  normal  0.572245 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3334  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.62 
 
 		 536 aa  122  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.783434  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3228  glycoside hydrolase family protein  29.08 
 
 		 563 aa  123  1.9999999999999998e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00674596  normal  0.0120766 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0289  xylan 1,4-beta-xylosidase  26.37 
 
 		 532 aa  121  3.9999999999999996e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000021727  normal  0.556687 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1423  Xylan 1,4-beta-xylosidase  31.72 
 
 		 558 aa  120  9e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.423704 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0842  Alpha-L-arabinofuranosidase  25.18 
 
 		 546 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.122484  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3545  Alpha-N-arabinofuranosidase  24.2 
 
 		 547 aa  118  3.9999999999999997e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0270111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1911  carbohydrate-binding family 6 protein  43.75 
 
 		 1290 aa  117  5e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.374482  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3048  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.87 
 
 		 515 aa  117  6e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0608814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2699  glycoside hydrolase family 43  24.79 
 
 		 496 aa  112  3e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.276179  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1710  Alpha-N-arabinofuranosidase  23.8 
 
 		 541 aa  109  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.783601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0129  carbohydrate-binding family 6 protein  40 
 
 		 469 aa  108  3e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.235369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3880  glycoside hydrolase family protein  24.95 
 
 		 571 aa  108  4e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0936  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.2 
 
 		 546 aa  105  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.789253 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2409  hypothetical protein  27.01 
 
 		 541 aa  105  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3599  glycoside hydrolase family 43  22.39 
 
 		 497 aa  104  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0127437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3569  glycoside hydrolase family 43  23.83 
 
 		 484 aa  104  6e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0058203  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5224  Carbohydrate binding family 6  44.53 
 
 		 566 aa  103  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.105995  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0430  glycoside hydrolase family 43  26.22 
 
 		 497 aa  102  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.710686 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4050  carbohydrate-binding family 6 protein  42.31 
 
 		 479 aa  103  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.567483  normal  0.0446183 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3811  glycoside hydrolase family 43  27.02 
 
 		 535 aa  101  5e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20520  beta-xylosidase  24.49 
 
 		 542 aa  100  1e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.129044  normal  0.254652 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0843  carbohydrate binding family 6  41.41 
 
 		 470 aa  97.1  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.392015 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4681  glycoside hydrolase family protein  24.08 
 
 		 492 aa  94.7  5e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.026787  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1878  beta-xylosidase  26.63 
 
 		 539 aa  92.8  2e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3674  carbohydrate-binding family 6 protein  42.31 
 
 		 479 aa  92.8  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3531  glycoside hydrolase family 43  25.05 
 
 		 511 aa  91.7  5e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.185955 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07864  conserved hypothetical protein  31.28 
 
 		 540 aa  90.9  7e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0157749  normal  0.535242 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3622  Xylan 1,4-beta-xylosidase  26.33 
 
 		 540 aa  90.1  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.573352  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>