141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2532 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_2532  glycoside hydrolase family 43  100 
 
 		 586 aa  1178    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4681  glycoside hydrolase family protein  51.07 
 
 		 492 aa  468  9.999999999999999e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.026787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21180  beta-xylosidase  46.98 
 
 		 526 aa  414  1e-114  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.851115  normal  0.166078 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0431  glycoside hydrolase family protein  45.44 
 
 		 451 aa  386  1e-106  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3599  glycoside hydrolase family 43  43.77 
 
 		 497 aa  369  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0127437  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2459  Xylan 1,4-beta-xylosidase  43.51 
 
 		 488 aa  353  5e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3569  glycoside hydrolase family 43  41.72 
 
 		 484 aa  352  1e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0058203  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0430  glycoside hydrolase family 43  39.55 
 
 		 497 aa  301  3e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.710686 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1400  glycoside hydrolase family 43  37.55 
 
 		 517 aa  277  3e-73  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.587173  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2699  glycoside hydrolase family 43  49.47 
 
 		 496 aa  262  1e-68  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.276179  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2518  glycoside hydrolase family protein  32.64 
 
 		 516 aa  249  8e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2028  glycoside hydrolase family protein  31.61 
 
 		 498 aa  246  6e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3011  Alpha-N-arabinofuranosidase  41.53 
 
 		 538 aa  245  9.999999999999999e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3438  glycoside hydrolase family 43  43.64 
 
 		 519 aa  239  1e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.990127  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2318  alpha-N-arabinofuranosidase  34.63 
 
 		 512 aa  231  3e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.389032  normal  0.249416 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3048  Alpha-N-arabinofuranosidase  42.62 
 
 		 515 aa  220  5e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0608814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3228  glycoside hydrolase family protein  32.77 
 
 		 563 aa  211  3e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00674596  normal  0.0120766 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1655  translation initiation factor IF-1  40.66 
 
 		 566 aa  209  1e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0976225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0598  Alpha-L-arabinofuranosidase  38.99 
 
 		 577 aa  208  2e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.628109 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0936  Alpha-N-arabinofuranosidase  42.02 
 
 		 546 aa  202  1.9999999999999998e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.789253 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03855  xylosidase; arabinosidase  31.01 
 
 		 556 aa  201  3e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20520  beta-xylosidase  35.56 
 
 		 542 aa  199  1.0000000000000001e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.129044  normal  0.254652 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0289  xylan 1,4-beta-xylosidase  40.59 
 
 		 532 aa  198  3e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000021727  normal  0.556687 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0842  Alpha-L-arabinofuranosidase  39.72 
 
 		 546 aa  197  6e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.122484  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4322  glycoside hydrolase family protein  38.64 
 
 		 581 aa  195  2e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1423  Xylan 1,4-beta-xylosidase  26.88 
 
 		 558 aa  195  2e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.423704 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1616  alpha-L-arabinofuranosidase  41.08 
 
 		 550 aa  194  3e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.347525  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3398  glycoside hydrolase family protein  30.41 
 
 		 514 aa  191  5e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0740676  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3334  Alpha-N-arabinofuranosidase  38.11 
 
 		 536 aa  189  9e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.783434  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3545  Alpha-N-arabinofuranosidase  39.41 
 
 		 547 aa  189  1e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0270111  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07864  conserved hypothetical protein  40.97 
 
 		 540 aa  185  2.0000000000000003e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0157749  normal  0.535242 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1878  beta-xylosidase  36.65 
 
 		 539 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08477  xylosidase : arabinofuranosidase (AFU_orthologue; AFUA_2G13190)  38.7 
 
 		 546 aa  182  1e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0457  Alpha-N-arabinofuranosidase  35.96 
 
 		 539 aa  182  1e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0354643 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3880  glycoside hydrolase family protein  27.01 
 
 		 571 aa  183  1e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0191  glycoside hydrolase family protein  31.4 
 
 		 512 aa  181  2.9999999999999997e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1143  Alpha-L-arabinofuranosidase  38.98 
 
 		 523 aa  180  8e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2409  hypothetical protein  37.7 
 
 		 541 aa  179  9e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2996  Alpha-N-arabinofuranosidase  35.14 
 
 		 559 aa  179  1e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0875  glycoside hydrolase family protein  32.76 
 
 		 636 aa  175  1.9999999999999998e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000412559  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1710  Alpha-N-arabinofuranosidase  38.31 
 
 		 541 aa  174  5e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.783601  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2329  Xylan 1,4-beta-xylosidase  39.78 
 
 		 537 aa  172  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.80101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2090  Alpha-N-arabinofuranosidase  39.78 
 
 		 537 aa  171  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00759162  normal  0.572245 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1291  Beta-xylosidase  27.25 
 
 		 553 aa  157  7e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2504  Xylan 1,4-beta-xylosidase  28.47 
 
 		 558 aa  154  4e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0848  Beta-xylosidase  25.43 
 
 		 552 aa  142  1.9999999999999998e-32  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.168219  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1879  beta-xylosidase  27.23 
 
 		 590 aa  141  3e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2914  glycoside hydrolase family protein  28.82 
 
 		 547 aa  140  6e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06751  glycosyl hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G06110)  33.02 
 
 		 591 aa  136  9.999999999999999e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.326162 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4021  glycoside hydrolase family protein  29.1 
 
 		 537 aa  136  9.999999999999999e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.701147 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5511  glycoside hydrolase family 43  32.31 
 
 		 536 aa  134  6e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0274092 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4289  glycoside hydrolase family protein  33 
 
 		 572 aa  130  8.000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.786059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4788  Xylan 1,4-beta-xylosidase  29.19 
 
 		 562 aa  130  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.771274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3522  glycoside hydrolase family protein  28.57 
 
 		 534 aa  128  3e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.653851  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0935  glycoside hydrolase family 43  29.72 
 
 		 522 aa  122  9.999999999999999e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0700  glycoside hydrolase family 43  30.13 
 
 		 522 aa  123  9.999999999999999e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1500  glycoside hydrolase family 43  27.85 
 
 		 551 aa  122  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.36043 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1435  glycoside hydrolase family 43  27.19 
 
 		 545 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3622  Xylan 1,4-beta-xylosidase  26.81 
 
 		 540 aa  120  7e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.573352  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29240  beta-xylosidase  33.45 
 
 		 527 aa  120  7e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3811  glycoside hydrolase family 43  27.08 
 
 		 535 aa  119  9.999999999999999e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3042  twin-arginine translocation pathway signal  27.86 
 
 		 537 aa  119  1.9999999999999998e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.351967  normal  0.568346 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0182  glycoside hydrolase family 43  26.86 
 
 		 1338 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1150  glycoside hydrolase family 43  26.13 
 
 		 560 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03261  xylosidase  29.65 
 
 		 365 aa  111  3e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.687612  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0501  glycoside hydrolase family 43  30.65 
 
 		 525 aa  112  3e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00998877 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3531  glycoside hydrolase family 43  30.94 
 
 		 511 aa  111  3e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.185955 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3718  glycoside hydrolase family protein  34.39 
 
 		 504 aa  107  5e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.456589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2114  glycoside hydrolase family 43  29.27 
 
 		 518 aa  107  7e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.554254  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3351  glycoside hydrolase family 43  26.23 
 
 		 522 aa  107  7e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0650  glycoside hydrolase family 43  28.53 
 
 		 495 aa  105  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0713148  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4249  glycoside hydrolase family protein  27.05 
 
 		 532 aa  99  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.158619  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2632  glycoside hydrolase family protein  26.9 
 
 		 543 aa  98.6  3e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0211688  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3360  glycoside hydrolase family 43  28.08 
 
 		 522 aa  98.6  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0779432 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3237  glycoside hydrolase family protein  27.9 
 
 		 1195 aa  97.4  6e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414155 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1251  glycoside hydrolase family protein  27.65 
 
 		 665 aa  96.7  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1420  glycoside hydrolase family 43  27.76 
 
 		 530 aa  96.3  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.394008  normal  0.931127 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3875  glycoside hydrolase family protein  26.76 
 
 		 518 aa  90.1  9e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1524  glycoside hydrolase family 43  25.51 
 
 		 524 aa  90.1  9e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2413  glycoside hydrolase family protein  28.44 
 
 		 521 aa  90.1  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.333908  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2041  polyfunctional acetylxylan esterase/b-xylosidase/a-L-arabinofuranosidase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 43 protein and carbohydrate esterase family 6 protein  26.1 
 
 		 1585 aa  85.9  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01043  conserved hypothetical protein  39.69 
 
 		 343 aa  85.1  0.000000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6044  glycoside hydrolase family 43  23.99 
 
 		 501 aa  85.1  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.845022  normal  0.0554344 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1233  Carbohydrate binding family 6  26.61 
 
 		 746 aa  84.7  0.000000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.555313  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2723  glycoside hydrolase family protein  30.26 
 
 		 345 aa  82.8  0.00000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.469303  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1257  glycoside hydrolase family 43  23.87 
 
 		 500 aa  82.8  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2639  glycoside hydrolase family 43  25.95 
 
 		 472 aa  82  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.431626  normal  0.0143862 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2044  beta-xylosidase/alpha-L-arabinofuranosidase- like protein  26.64 
 
 		 1474 aa  81.3  0.00000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3618  glycoside hydrolase family protein  24.49 
 
 		 508 aa  80.5  0.00000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000797588  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2108  glycoside hydrolase family 43  29.58 
 
 		 650 aa  80.1  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000141623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0206  glycoside hydrolase family 43  29.47 
 
 		 304 aa  80.1  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  0.253285 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1068  glycoside hydrolase family 43  26.64 
 
 		 797 aa  78.2  0.0000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000256501  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1280  glycoside hydrolase family 43  24.75 
 
 		 691 aa  68.9  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.286369  hitchhiker  0.00183728 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2423  glycoside hydrolase family 43  24.05 
 
 		 699 aa  69.3  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2392  glycoside hydrolase family 43  27.51 
 
 		 306 aa  66.6  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000540158  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2971  glycoside hydrolase family 43  25.29 
 
 		 855 aa  63.9  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0529993 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0193  glycoside hydrolase family 43  25.75 
 
 		 324 aa  63.2  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00680352  normal  0.581709 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0628  glycoside hydrolase family 43  29.74 
 
 		 505 aa  62.8  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2027  glycoside hydrolase family protein  23.45 
 
 		 325 aa  62.4  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.808853  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2384  glycoside hydrolase family 43  26.03 
 
 		 330 aa  59.3  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>