133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3522 on replicon NC_009427
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_3042  twin-arginine translocation pathway signal  72.17 
 
 		 537 aa  782    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.351967  normal  0.568346 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3522  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 534 aa  1082    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.653851  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4021  glycoside hydrolase family protein  64.75 
 
 		 537 aa  699    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.701147 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3811  glycoside hydrolase family 43  51.02 
 
 		 535 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3622  Xylan 1,4-beta-xylosidase  51.12 
 
 		 540 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.573352  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2914  glycoside hydrolase family protein  51.01 
 
 		 547 aa  534  1e-150  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1435  glycoside hydrolase family 43  49.62 
 
 		 545 aa  532  1e-150  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3531  glycoside hydrolase family 43  52.08 
 
 		 511 aa  503  1e-141  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.185955 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03261  xylosidase  56.34 
 
 		 365 aa  315  9.999999999999999e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.687612  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3599  glycoside hydrolase family 43  32.09 
 
 		 497 aa  164  4.0000000000000004e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0127437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0191  glycoside hydrolase family protein  27.72 
 
 		 512 aa  156  8e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3228  glycoside hydrolase family protein  29.67 
 
 		 563 aa  155  2e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00674596  normal  0.0120766 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1143  Alpha-L-arabinofuranosidase  31.99 
 
 		 523 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3398  glycoside hydrolase family protein  30.49 
 
 		 514 aa  148  2.0000000000000003e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0740676  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0875  glycoside hydrolase family protein  29.88 
 
 		 636 aa  145  1e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000412559  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3569  glycoside hydrolase family 43  31.62 
 
 		 484 aa  145  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0058203  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4322  glycoside hydrolase family protein  29.35 
 
 		 581 aa  143  8e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2028  glycoside hydrolase family protein  26.94 
 
 		 498 aa  141  1.9999999999999998e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1616  alpha-L-arabinofuranosidase  30.07 
 
 		 550 aa  140  7e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.347525  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1400  glycoside hydrolase family 43  29.8 
 
 		 517 aa  136  9.999999999999999e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.587173  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0936  Alpha-N-arabinofuranosidase  34.39 
 
 		 546 aa  132  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.789253 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1710  Alpha-N-arabinofuranosidase  30.14 
 
 		 541 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.783601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0598  Alpha-L-arabinofuranosidase  25.88 
 
 		 577 aa  129  2.0000000000000002e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.628109 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3438  glycoside hydrolase family 43  31.01 
 
 		 519 aa  128  2.0000000000000002e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.990127  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2699  glycoside hydrolase family 43  28.91 
 
 		 496 aa  126  1e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.276179  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2532  glycoside hydrolase family 43  29.39 
 
 		 586 aa  125  2e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0289  xylan 1,4-beta-xylosidase  30.07 
 
 		 532 aa  124  3e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000021727  normal  0.556687 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3545  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.89 
 
 		 547 aa  124  5e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0270111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0430  glycoside hydrolase family 43  33.68 
 
 		 497 aa  123  8e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.710686 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1423  Xylan 1,4-beta-xylosidase  24.68 
 
 		 558 aa  123  9e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.423704 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2318  alpha-N-arabinofuranosidase  28.81 
 
 		 512 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.389032  normal  0.249416 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21180  beta-xylosidase  30.05 
 
 		 526 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.851115  normal  0.166078 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3334  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.49 
 
 		 536 aa  121  3e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.783434  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2518  glycoside hydrolase family protein  25.69 
 
 		 516 aa  120  4.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3011  Alpha-N-arabinofuranosidase  30.56 
 
 		 538 aa  120  4.9999999999999996e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2504  Xylan 1,4-beta-xylosidase  27.03 
 
 		 558 aa  119  9.999999999999999e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0935  glycoside hydrolase family 43  27.09 
 
 		 522 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0457  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.65 
 
 		 539 aa  118  3e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0354643 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2459  Xylan 1,4-beta-xylosidase  30.63 
 
 		 488 aa  118  3e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0700  glycoside hydrolase family 43  26.27 
 
 		 522 aa  118  3e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1150  glycoside hydrolase family 43  31.65 
 
 		 560 aa  118  3e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0431  glycoside hydrolase family protein  31.6 
 
 		 451 aa  117  5e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3360  glycoside hydrolase family 43  26.81 
 
 		 522 aa  117  7.999999999999999e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0779432 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2329  Xylan 1,4-beta-xylosidase  30.53 
 
 		 537 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.80101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2090  Alpha-N-arabinofuranosidase  32.05 
 
 		 537 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00759162  normal  0.572245 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4289  glycoside hydrolase family protein  32.71 
 
 		 572 aa  114  3e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.786059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4788  Xylan 1,4-beta-xylosidase  28.94 
 
 		 562 aa  114  4.0000000000000004e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.771274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03855  xylosidase; arabinosidase  26.13 
 
 		 556 aa  113  9e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07864  conserved hypothetical protein  26.46 
 
 		 540 aa  113  1.0000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0157749  normal  0.535242 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3048  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.87 
 
 		 515 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0608814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20520  beta-xylosidase  29.63 
 
 		 542 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.129044  normal  0.254652 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1655  translation initiation factor IF-1  25.19 
 
 		 566 aa  111  3e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0976225  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1500  glycoside hydrolase family 43  29.43 
 
 		 551 aa  111  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.36043 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4249  glycoside hydrolase family protein  29.06 
 
 		 532 aa  111  4.0000000000000004e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.158619  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4681  glycoside hydrolase family protein  28.92 
 
 		 492 aa  111  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.026787  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3237  glycoside hydrolase family protein  30.18 
 
 		 1195 aa  111  4.0000000000000004e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414155 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0848  Beta-xylosidase  26.76 
 
 		 552 aa  110  5e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.168219  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2409  hypothetical protein  30.63 
 
 		 541 aa  110  5e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5511  glycoside hydrolase family 43  29.57 
 
 		 536 aa  108  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0274092 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1878  beta-xylosidase  27.22 
 
 		 539 aa  107  5e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3351  glycoside hydrolase family 43  28.8 
 
 		 522 aa  104  3e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1524  glycoside hydrolase family 43  26.42 
 
 		 524 aa  105  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1291  Beta-xylosidase  26.5 
 
 		 553 aa  104  5e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08477  xylosidase : arabinofuranosidase (AFU_orthologue; AFUA_2G13190)  25.91 
 
 		 546 aa  103  7e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0501  glycoside hydrolase family 43  29.22 
 
 		 525 aa  103  7e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00998877 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29240  beta-xylosidase  30.29 
 
 		 527 aa  100  9e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2632  glycoside hydrolase family protein  28.96 
 
 		 543 aa  98.2  3e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0211688  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0842  Alpha-L-arabinofuranosidase  24.68 
 
 		 546 aa  97.8  4e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.122484  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3880  glycoside hydrolase family protein  23.06 
 
 		 571 aa  93.2  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2108  glycoside hydrolase family 43  25.21 
 
 		 650 aa  92.4  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000141623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3718  glycoside hydrolase family protein  28.41 
 
 		 504 aa  91.7  3e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.456589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2044  beta-xylosidase/alpha-L-arabinofuranosidase- like protein  24.43 
 
 		 1474 aa  90.5  7e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2996  Alpha-N-arabinofuranosidase  24.64 
 
 		 559 aa  90.5  8e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2639  glycoside hydrolase family 43  24.12 
 
 		 472 aa  90.1  9e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.431626  normal  0.0143862 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0650  glycoside hydrolase family 43  23.95 
 
 		 495 aa  85.9  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0713148  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2413  glycoside hydrolase family protein  26.87 
 
 		 521 aa  82.8  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.333908  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6044  glycoside hydrolase family 43  24.63 
 
 		 501 aa  83.2  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.845022  normal  0.0554344 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06751  glycosyl hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G06110)  25.35 
 
 		 591 aa  81.3  0.00000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.326162 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2423  glycoside hydrolase family 43  24.8 
 
 		 699 aa  78.2  0.0000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3875  glycoside hydrolase family protein  24.47 
 
 		 518 aa  76.6  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1251  glycoside hydrolase family protein  26.9 
 
 		 665 aa  75.9  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0737  glycoside hydrolase family protein  26.56 
 
 		 345 aa  74.3  0.000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.612706  normal  0.340405 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1233  Carbohydrate binding family 6  24.05 
 
 		 746 aa  74.3  0.000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.555313  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0182  glycoside hydrolase family 43  25 
 
 		 1338 aa  73.9  0.000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1420  glycoside hydrolase family 43  27.69 
 
 		 530 aa  73.2  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.394008  normal  0.931127 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2051  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  27.54 
 
 		 357 aa  70.1  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1068  glycoside hydrolase family 43  24.3 
 
 		 797 aa  68.9  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000256501  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01043  conserved hypothetical protein  32.43 
 
 		 343 aa  67.8  0.0000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1661  endo-1,4-beta-xylanase/Beta-xylosidase  27.06 
 
 		 901 aa  66.6  0.0000000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1879  beta-xylosidase  28.28 
 
 		 590 aa  66.6  0.000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2723  glycoside hydrolase family protein  29.12 
 
 		 345 aa  65.5  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.469303  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1390  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  24.91 
 
 		 341 aa  64.3  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.287204  normal  0.664348 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2114  glycoside hydrolase family 43  26.38 
 
 		 518 aa  63.9  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.554254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2156  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  24.01 
 
 		 352 aa  63.5  0.000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000116592  hitchhiker  0.00999646 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1980  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  24.52 
 
 		 355 aa  63.2  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000532018  hitchhiker  0.000349844 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2082  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  24.52 
 
 		 356 aa  63.2  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000230744  hitchhiker  0.000000189943 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1995  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  23.16 
 
 		 355 aa  61.2  0.00000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000026265  hitchhiker  0.0000968585 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0206  glycoside hydrolase family 43  28.95 
 
 		 304 aa  58.2  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  0.253285 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0473  glycoside hydrolase family 43  27.08 
 
 		 829 aa  58.5  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.658009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4284  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  23.67 
 
 		 327 aa  58.5  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>