160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0473 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_0473  glycoside hydrolase family 43  100 
 
 
829 aa  1629    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.658009  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4703  glycoside hydrolase family 43  32.35 
 
 
341 aa  162  2e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.184013  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3403  glycoside hydrolase family 43  29.89 
 
 
357 aa  161  5e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000194853  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0737  glycoside hydrolase family protein  31.28 
 
 
345 aa  144  6e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.612706  normal  0.340405 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2423  glycoside hydrolase family 43  31.2 
 
 
699 aa  144  9e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4504  glycoside hydrolase family 43  29.09 
 
 
510 aa  139  2e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2449  glycoside hydrolase family 43  29.95 
 
 
537 aa  132  3e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114761  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1729  glycoside hydrolase family 43  27.74 
 
 
472 aa  121  3.9999999999999996e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.101805  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4496  glycoside hydrolase family 43  30.95 
 
 
503 aa  119  1.9999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0241272  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04520  beta-xylosidase  30.4 
 
 
491 aa  103  1e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.130696  normal  0.0670778 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2813  glycoside hydrolase family 43  28.57 
 
 
331 aa  102  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0257715  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0786  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  28.07 
 
 
346 aa  100  8e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000141301  normal  0.447167 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2732  glycoside hydrolase family 43  28.52 
 
 
315 aa  98.2  5e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1390  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  28.18 
 
 
341 aa  96.3  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.287204  normal  0.664348 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4284  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  27.07 
 
 
327 aa  94.7  6e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0078  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  31.4 
 
 
379 aa  89.7  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.144884  normal  0.277265 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1995  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  25.76 
 
 
355 aa  87  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000026265  hitchhiker  0.0000968585 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2082  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  26.44 
 
 
356 aa  86.3  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000230744  hitchhiker  0.000000189943 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2156  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  27.27 
 
 
352 aa  86.7  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000116592  hitchhiker  0.00999646 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0507  glycoside hydrolase family 43  25.95 
 
 
337 aa  85.9  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.412329 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0650  glycoside hydrolase family 43  25.87 
 
 
495 aa  85.5  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0713148  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1980  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  26.14 
 
 
355 aa  84.3  0.000000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000532018  hitchhiker  0.000349844 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2051  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  27.43 
 
 
357 aa  84.3  0.000000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2809  ATPase  25 
 
 
789 aa  80.9  0.00000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.153749  decreased coverage  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1976  glycoside hydrolase family protein  25.91 
 
 
1121 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00565193  hitchhiker  0.00420486 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3750  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  30.33 
 
 
319 aa  80.9  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00407758  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1999  glycoside hydrolase family protein  26.7 
 
 
1121 aa  79.3  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000101187  decreased coverage  0.0000000170847 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0206  glycoside hydrolase family 43  26.65 
 
 
304 aa  79  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  0.253285 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1014  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  27.84 
 
 
472 aa  78.2  0.0000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000194163  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3612  methionine biosynthesis MetW  27.21 
 
 
1186 aa  78.6  0.0000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0161329  hitchhiker  0.00479901 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2086  beta-xylosidase-like protein  25.46 
 
 
1121 aa  76.3  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00280414  decreased coverage  0.0000000469917 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2201  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  30.93 
 
 
343 aa  76.6  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2047  glycoside hydrolase family protein  25.13 
 
 
1112 aa  76.6  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000114958  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20580  glycoside hydrolase family 43  24.23 
 
 
315 aa  74.7  0.000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0536  glycoside hydrolase family 43  23.6 
 
 
393 aa  73.6  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.812392 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2699  glycoside hydrolase family 43  24.55 
 
 
496 aa  72.4  0.00000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.276179  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06352  Endo-alpha-1,5-L-arabinanasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AZC8]  25.39 
 
 
400 aa  72  0.00000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.605603  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6044  glycoside hydrolase family 43  25.78 
 
 
501 aa  71.6  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.845022  normal  0.0554344 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2392  glycoside hydrolase family 43  26.25 
 
 
306 aa  70.9  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000540158  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3048  Alpha-N-arabinofuranosidase  24.44 
 
 
515 aa  70.1  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0608814  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6081  glycoside hydrolase family 43  29.91 
 
 
480 aa  69.7  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2161  glycoside hydrolase family protein  26.37 
 
 
1143 aa  69.3  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000526501  hitchhiker  0.0000457644 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4788  Xylan 1,4-beta-xylosidase  26.05 
 
 
562 aa  68.9  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.771274  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0753  glycoside hydrolase family protein  29.65 
 
 
465 aa  68.6  0.0000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4289  glycoside hydrolase family protein  26.61 
 
 
572 aa  68.9  0.0000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.786059  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2022  glycoside hydrolase family 43  23.86 
 
 
334 aa  68.9  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0193  glycoside hydrolase family 43  26.54 
 
 
324 aa  68.6  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00680352  normal  0.581709 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3042  twin-arginine translocation pathway signal  29.74 
 
 
537 aa  68.6  0.0000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.351967  normal  0.568346 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5511  glycoside hydrolase family 43  25.74 
 
 
536 aa  68.2  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0274092 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3622  Xylan 1,4-beta-xylosidase  22.47 
 
 
540 aa  68.2  0.0000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.573352  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3109  glycoside hydrolase family protein  26.54 
 
 
644 aa  67.8  0.0000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1235  Carbohydrate binding family 6  24.64 
 
 
509 aa  67.4  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00440741  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2482  glycoside hydrolase family 43  23.94 
 
 
384 aa  66.6  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.24102 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2728  hypothetical protein  23.24 
 
 
848 aa  66.6  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1150  glycoside hydrolase family 43  25.21 
 
 
560 aa  66.2  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0739  glycoside hydrolase family protein  26.04 
 
 
348 aa  66.2  0.000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0179  cellulose-binding family II  27.43 
 
 
598 aa  65.9  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00318302 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0510  glycoside hydrolase family 43  26.42 
 
 
456 aa  65.9  0.000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0180422  hitchhiker  0.00320544 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3811  glycoside hydrolase family 43  22.31 
 
 
535 aa  65.5  0.000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4249  glycoside hydrolase family protein  25.41 
 
 
532 aa  65.5  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.158619  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0989  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  29.95 
 
 
334 aa  65.5  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0127699  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0015  alpha-L-arabinofuranosidase B  22.51 
 
 
707 aa  64.7  0.000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2384  glycoside hydrolase family 43  26.69 
 
 
330 aa  64.7  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2914  glycoside hydrolase family protein  24.79 
 
 
547 aa  64.3  0.000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3317  Beta-xylosidase-like  27.88 
 
 
1174 aa  63.5  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00018095  hitchhiker  0.000000702951 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2723  glycoside hydrolase family protein  26.14 
 
 
345 aa  63.9  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.469303  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0516  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  24 
 
 
366 aa  63.5  0.00000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000112186  decreased coverage  0.000226611 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20520  beta-xylosidase  25.47 
 
 
542 aa  63.2  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.129044  normal  0.254652 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1393  immunoglobulin I-set domain-containing protein  26.75 
 
 
810 aa  63.5  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6730  glycoside hydrolase family 43  25.71 
 
 
323 aa  63.5  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575675  normal  0.920031 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0875  glycoside hydrolase family protein  23.53 
 
 
636 aa  62  0.00000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000412559  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2632  glycoside hydrolase family protein  23.16 
 
 
543 aa  62  0.00000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0211688  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3903  glycoside hydrolase family protein  25.98 
 
 
340 aa  61.6  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.969992  normal  0.175565 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0810  carbohydrate-binding family 6 protein  24.84 
 
 
450 aa  61.6  0.00000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.034958  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3292  glycoside hydrolase family 43  27.31 
 
 
488 aa  61.2  0.00000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.223704  hitchhiker  0.00299224 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3224  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.07 
 
 
444 aa  61.2  0.00000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.136595  normal  0.135367 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1500  glycoside hydrolase family 43  24.09 
 
 
551 aa  61.2  0.00000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.36043 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2639  glycoside hydrolase family 43  23.85 
 
 
472 aa  60.8  0.00000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.431626  normal  0.0143862 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02534  endoarabinanase (Eurofung)  27.37 
 
 
380 aa  60.5  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21180  beta-xylosidase  24.73 
 
 
526 aa  60.8  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.851115  normal  0.166078 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3599  glycoside hydrolase family 43  23.69 
 
 
497 aa  60.8  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0127437  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1400  glycoside hydrolase family 43  29.19 
 
 
517 aa  60.5  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.587173  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3011  Alpha-N-arabinofuranosidase  24.47 
 
 
538 aa  60.5  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03261  xylosidase  31.13 
 
 
365 aa  60.5  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.687612  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3531  glycoside hydrolase family 43  24.02 
 
 
511 aa  60.5  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.185955 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0637  glycoside hydrolase family protein  24.1 
 
 
471 aa  60.1  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000622549  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0191  glycoside hydrolase family protein  23.98 
 
 
512 aa  59.7  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3438  glycoside hydrolase family 43  23.82 
 
 
519 aa  59.7  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.990127  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1623  glycoside hydrolase family 43  24.09 
 
 
804 aa  59.3  0.0000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0299424  normal  0.680345 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0501  glycoside hydrolase family 43  26.9 
 
 
525 aa  59.3  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00998877 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1435  glycoside hydrolase family 43  23.85 
 
 
545 aa  59.3  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1524  glycoside hydrolase family 43  25.36 
 
 
524 aa  59.3  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01459  xylosidase; arabinosidase  24.79 
 
 
527 aa  58.9  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.928055  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3522  glycoside hydrolase family protein  27.08 
 
 
534 aa  58.5  0.0000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.653851  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2866  glycoside hydrolase family 43  24.04 
 
 
487 aa  58.2  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.141314  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1622  glycoside hydrolase family 43  23.57 
 
 
703 aa  57.8  0.0000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.372812  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3360  glycoside hydrolase family 43  23.94 
 
 
522 aa  57  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0779432 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2722  glycoside hydrolase family protein  26.1 
 
 
310 aa  57  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.123508  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3398  glycoside hydrolase family protein  23.4 
 
 
514 aa  56.2  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0740676  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3351  glycoside hydrolase family 43  24.37 
 
 
522 aa  57  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>