115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_01459 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_01459  xylosidase; arabinosidase  100 
 
 
527 aa  1068    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.928055  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2447  putative xylosidase  38.88 
 
 
468 aa  267  4e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.320135 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2837  glycoside hydrolase family 43  44.27 
 
 
348 aa  234  2.0000000000000002e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.61366  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10919  hypothetical protein  37.69 
 
 
383 aa  184  5.0000000000000004e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0280473  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1235  Carbohydrate binding family 6  36.09 
 
 
509 aa  181  2.9999999999999997e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00440741  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1231  Carbohydrate binding family 6  37.06 
 
 
524 aa  179  1e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0177163  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2196  carbohydrate-binding family 6 protein  37.26 
 
 
533 aa  177  5e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0455  Carbohydrate binding family 6  36.21 
 
 
618 aa  175  1.9999999999999998e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1982  glycoside hydrolase family protein  34.97 
 
 
315 aa  172  1e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000010784  normal  0.0338284 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2069  glycoside hydrolase family protein  34.66 
 
 
315 aa  171  4e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000027007  hitchhiker  0.0000035019 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1992  glycoside hydrolase family protein  34.66 
 
 
315 aa  169  1e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000493506  unclonable  0.0000204974 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3213  glycoside hydrolase family 43  38.58 
 
 
464 aa  166  8e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.331095  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0823  glycoside hydrolase family 43  34.9 
 
 
302 aa  158  2e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.328209 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2063  glycoside hydrolase family protein  33.43 
 
 
311 aa  152  1e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000284349  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2143  glycoside hydrolase family 43  34.68 
 
 
311 aa  150  4e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.209046  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3612  methionine biosynthesis MetW  33.04 
 
 
1186 aa  149  1.0000000000000001e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0161329  hitchhiker  0.00479901 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4501  Alpha-N-arabinofuranosidase  34.71 
 
 
316 aa  144  4e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.570213  normal  0.69004 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0789  endo-1,4-beta-xylanase D precursor  31.35 
 
 
317 aa  136  9.999999999999999e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0130439  normal  0.452031 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0810  carbohydrate-binding family 6 protein  31.16 
 
 
450 aa  133  7.999999999999999e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.034958  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2614  glycoside hydrolase family 43  28.29 
 
 
326 aa  130  4.0000000000000003e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3276  carbohydrate-binding family 6 protein  34.72 
 
 
401 aa  129  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3224  Alpha-N-arabinofuranosidase  30 
 
 
444 aa  129  2.0000000000000002e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.136595  normal  0.135367 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0946  SecY protein  30.25 
 
 
317 aa  128  3e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.409307  hitchhiker  0.0000724629 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3728  Alpha-L-arabinofuranosidase  30.54 
 
 
383 aa  125  3e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1271  carbohydrate-binding family 6 protein  30.64 
 
 
679 aa  124  3e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16970  beta-xylosidase  32.47 
 
 
313 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.374085 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1323  Alpha-N-arabinofuranosidase  30.75 
 
 
330 aa  120  6e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0375  Alpha-N-arabinofuranosidase  31.4 
 
 
320 aa  118  1.9999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.194615 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1229  Carbohydrate binding family 6  30.99 
 
 
535 aa  119  1.9999999999999998e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.166566  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0795  Xylan 1,4-beta-xylosidase  29.38 
 
 
346 aa  119  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000173963  normal  0.0629112 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1998  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.99 
 
 
344 aa  117  3.9999999999999997e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1928  Carbohydrate-binding CenC domain protein  32.8 
 
 
712 aa  115  1.0000000000000001e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0353  Xylan 1,4-beta-xylosidase  28.1 
 
 
346 aa  113  7.000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0822  Alpha-L-arabinofuranosidase  31.31 
 
 
385 aa  113  8.000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000000000001862  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4846  Xylan 1,4-beta-xylosidase  29.26 
 
 
367 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0960373  hitchhiker  0.00474985 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03869  beta-xylosidase (1,4-beta-D-xylan xylohydrolase) (Xylan1,4-beta-xylosidase) (Exo-beta-(1,4)-xylanase)  30.21 
 
 
344 aa  109  1e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2866  glycoside hydrolase family 43  32 
 
 
487 aa  106  9e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.141314  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01458  hypothetical protein  33.7 
 
 
1419 aa  100  8e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.523698  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0182  glycoside hydrolase family 43  30.16 
 
 
1338 aa  99.4  2e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2384  glycoside hydrolase family 43  28.49 
 
 
330 aa  93.6  8e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3109  glycoside hydrolase family protein  28.82 
 
 
644 aa  93.2  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0551  Xylan 1,4-beta-xylosidase  28.71 
 
 
335 aa  92.4  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000239269 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01477  beta-1,4-xylosidase (Eurofung)  24.8 
 
 
404 aa  90.5  6e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6730  glycoside hydrolase family 43  29.41 
 
 
323 aa  89.7  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575675  normal  0.920031 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0193  glycoside hydrolase family 43  27.74 
 
 
324 aa  88.2  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00680352  normal  0.581709 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01870  xylosidase/arabinosidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04480)  31.98 
 
 
344 aa  86.7  0.000000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2482  glycoside hydrolase family 43  24.93 
 
 
384 aa  77  0.0000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.24102 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1660  carbohydrate binding domain/beta-xylosidase family protein  24.5 
 
 
667 aa  76.3  0.000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.324921  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2027  glycoside hydrolase family protein  24.46 
 
 
325 aa  75.1  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.808853  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0531  Alpha-N-arabinofuranosidase  25 
 
 
471 aa  74.7  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0536  glycoside hydrolase family 43  26.69 
 
 
393 aa  73.9  0.000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.812392 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20580  glycoside hydrolase family 43  28.4 
 
 
315 aa  73.6  0.000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0206  glycoside hydrolase family 43  28.57 
 
 
304 aa  72  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  0.253285 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1390  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  29.92 
 
 
341 aa  68.2  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.287204  normal  0.664348 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1011  glycoside hydrolase family 43  25.68 
 
 
471 aa  68.6  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0359  glycoside hydrolase family protein  25.97 
 
 
506 aa  66.2  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0212595 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2392  glycoside hydrolase family 43  27.52 
 
 
306 aa  65.9  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000540158  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2051  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  26.17 
 
 
357 aa  62.8  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4496  glycoside hydrolase family 43  26.22 
 
 
503 aa  62.8  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0241272  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0786  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  25.85 
 
 
346 aa  59.7  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000141301  normal  0.447167 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0739  glycoside hydrolase family protein  28.42 
 
 
348 aa  59.3  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4703  glycoside hydrolase family 43  23.74 
 
 
341 aa  58.9  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.184013  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0473  glycoside hydrolase family 43  24.79 
 
 
829 aa  58.5  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.658009  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2556  glycoside hydrolase family 43  23.61 
 
 
319 aa  57.8  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.149373  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2448  putative secreted protein  30.94 
 
 
1363 aa  58.2  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.903982 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2156  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  26.48 
 
 
352 aa  57  0.0000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000116592  hitchhiker  0.00999646 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1995  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  26.8 
 
 
355 aa  56.2  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000026265  hitchhiker  0.0000968585 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1980  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  27.2 
 
 
355 aa  56.6  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000532018  hitchhiker  0.000349844 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2082  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  26.8 
 
 
356 aa  56.6  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000230744  hitchhiker  0.000000189943 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0664  glycoside hydrolase family protein  29.91 
 
 
476 aa  55.1  0.000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0628  glycoside hydrolase family 43  27.27 
 
 
505 aa  55.1  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1622  glycoside hydrolase family 43  23.62 
 
 
703 aa  54.7  0.000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.372812  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2723  glycoside hydrolase family protein  26.32 
 
 
345 aa  53.9  0.000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.469303  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06352  Endo-alpha-1,5-L-arabinanasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AZC8]  29.19 
 
 
400 aa  53.9  0.000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.605603  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0639  glycoside hydrolase family protein  29.06 
 
 
475 aa  53.9  0.000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000370471  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3438  glycoside hydrolase family 43  25.26 
 
 
519 aa  53.5  0.000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.990127  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4504  glycoside hydrolase family 43  25.6 
 
 
510 aa  53.5  0.000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0737  glycoside hydrolase family protein  24.44 
 
 
345 aa  53.1  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.612706  normal  0.340405 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4996  protein of unknown function DUF1680  25.95 
 
 
800 aa  53.1  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0292235  normal  0.0722722 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2449  glycoside hydrolase family 43  24.6 
 
 
537 aa  52.8  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114761  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3109  glycoside hydrolase family protein  28.57 
 
 
348 aa  52.8  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.158232 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3403  glycoside hydrolase family 43  25.61 
 
 
357 aa  52.4  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000194853  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5511  glycoside hydrolase family 43  28.96 
 
 
536 aa  52.4  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0274092 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4788  Xylan 1,4-beta-xylosidase  28.96 
 
 
562 aa  51.6  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.771274  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1143  Alpha-L-arabinofuranosidase  26.53 
 
 
523 aa  50.8  0.00005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2639  glycoside hydrolase family 43  25.99 
 
 
472 aa  51.2  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.431626  normal  0.0143862 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6022  glycoside hydrolase family 43  28 
 
 
319 aa  50.8  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1623  glycoside hydrolase family 43  25 
 
 
804 aa  50.8  0.00006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0299424  normal  0.680345 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29390  beta-xylosidase  27.19 
 
 
494 aa  50.8  0.00007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.838648  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2971  glycoside hydrolase family 43  27.44 
 
 
855 aa  50.4  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0529993 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0015  alpha-L-arabinofuranosidase B  26.74 
 
 
707 aa  50.1  0.00009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1616  alpha-L-arabinofuranosidase  26.69 
 
 
550 aa  50.1  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.347525  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3750  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  32.8 
 
 
319 aa  49.7  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00407758  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4284  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  25.79 
 
 
327 aa  48.9  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3932  glycoside hydrolase family 43  30.68 
 
 
456 aa  48.9  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.325517  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0637  glycoside hydrolase family protein  31.09 
 
 
471 aa  48.5  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000622549  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1500  glycoside hydrolase family 43  28.51 
 
 
551 aa  48.5  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.36043 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2813  glycoside hydrolase family 43  29.24 
 
 
331 aa  48.5  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0257715  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1729  glycoside hydrolase family 43  25.6 
 
 
472 aa  48.1  0.0004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.101805  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20520  beta-xylosidase  25.37 
 
 
542 aa  47.8  0.0006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.129044  normal  0.254652 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>