121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0639 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_0637  glycoside hydrolase family protein  69.39 
 
 		 471 aa  677    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000622549  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0639  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 475 aa  982    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000370471  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0662  glycoside hydrolase family protein  67.78 
 
 		 471 aa  673    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000191922  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0664  glycoside hydrolase family protein  94.35 
 
 		 476 aa  909    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0015  alpha-L-arabinofuranosidase B  61.74 
 
 		 707 aa  570  1e-161  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2809  ATPase  50.11 
 
 		 789 aa  467  9.999999999999999e-131  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.153749  decreased coverage  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1393  immunoglobulin I-set domain-containing protein  49.15 
 
 		 810 aa  448  1.0000000000000001e-124  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1623  glycoside hydrolase family 43  46.84 
 
 		 804 aa  443  1e-123  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0299424  normal  0.680345 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3292  glycoside hydrolase family 43  48.44 
 
 		 488 aa  433  1e-120  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.223704  hitchhiker  0.00299224 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1622  glycoside hydrolase family 43  48.69 
 
 		 703 aa  419  1e-116  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.372812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29390  beta-xylosidase  46.14 
 
 		 494 aa  407  1.0000000000000001e-112  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.838648  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1976  glycoside hydrolase family protein  46.55 
 
 		 1121 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00565193  hitchhiker  0.00420486 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1999  glycoside hydrolase family protein  46.34 
 
 		 1121 aa  396  1e-109  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000101187  decreased coverage  0.0000000170847 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2086  beta-xylosidase-like protein  46.55 
 
 		 1121 aa  398  1e-109  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00280414  decreased coverage  0.0000000469917 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2047  glycoside hydrolase family protein  45.41 
 
 		 1112 aa  388  1e-106  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000114958  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2161  glycoside hydrolase family protein  42.23 
 
 		 1143 aa  376  1e-103  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000526501  hitchhiker  0.0000457644 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2728  hypothetical protein  39.38 
 
 		 848 aa  356  3.9999999999999996e-97  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3317  Beta-xylosidase-like  40.39 
 
 		 1174 aa  346  6e-94  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00018095  hitchhiker  0.000000702951 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1543  beta-xylosidase  31.94 
 
 		 531 aa  207  3e-52  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.000200892  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1729  glycoside hydrolase family 43  29.19 
 
 		 472 aa  190  5e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.101805  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1542  beta-xylosidase  31.2 
 
 		 581 aa  156  6e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0510  glycoside hydrolase family 43  25.55 
 
 		 456 aa  108  2e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0180422  hitchhiker  0.00320544 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2732  glycoside hydrolase family 43  31.39 
 
 		 315 aa  107  4e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2051  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  26.93 
 
 		 357 aa  105  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0786  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  26.14 
 
 		 346 aa  103  9e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000141301  normal  0.447167 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0179  cellulose-binding family II  31.31 
 
 		 598 aa  102  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00318302 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4284  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  30.42 
 
 		 327 aa  101  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1390  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  27.65 
 
 		 341 aa  100  5e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.287204  normal  0.664348 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2813  glycoside hydrolase family 43  30.67 
 
 		 331 aa  99  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0257715  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2156  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  25.8 
 
 		 352 aa  97.8  3e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000116592  hitchhiker  0.00999646 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2201  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  28.96 
 
 		 343 aa  98.2  3e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1995  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  29.14 
 
 		 355 aa  97.8  4e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000026265  hitchhiker  0.0000968585 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1980  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  28.62 
 
 		 355 aa  97.1  6e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000532018  hitchhiker  0.000349844 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2082  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  28.28 
 
 		 356 aa  95.1  3e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000230744  hitchhiker  0.000000189943 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04520  beta-xylosidase  30.27 
 
 		 491 aa  94.4  4e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.130696  normal  0.0670778 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0989  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  31.52 
 
 		 334 aa  86.7  8e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0127699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3750  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  27.82 
 
 		 319 aa  84.7  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00407758  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1014  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  29.39 
 
 		 472 aa  82  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000194163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4703  glycoside hydrolase family 43  26.16 
 
 		 341 aa  82  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.184013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3403  glycoside hydrolase family 43  26.22 
 
 		 357 aa  77.8  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000194853  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03044  Endo-arabinanase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFU2]  26.3 
 
 		 386 aa  73.9  0.000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06352  Endo-alpha-1,5-L-arabinanasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AZC8]  26.88 
 
 		 400 aa  73.2  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.605603  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4496  glycoside hydrolase family 43  25.72 
 
 		 503 aa  72.8  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0241272  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2449  glycoside hydrolase family 43  26.58 
 
 		 537 aa  71.6  0.00000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114761  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1291  Beta-xylosidase  26.51 
 
 		 553 aa  65.5  0.000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2392  glycoside hydrolase family 43  30.97 
 
 		 306 aa  63.5  0.000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000540158  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6044  glycoside hydrolase family 43  27.7 
 
 		 501 aa  62.8  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.845022  normal  0.0554344 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0516  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  26.1 
 
 		 366 aa  63.2  0.00000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000112186  decreased coverage  0.000226611 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0191  glycoside hydrolase family protein  27.46 
 
 		 512 aa  62.4  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0206  glycoside hydrolase family 43  23.18 
 
 		 304 aa  62  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  0.253285 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2423  glycoside hydrolase family 43  28.99 
 
 		 699 aa  60.8  0.00000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5511  glycoside hydrolase family 43  26.82 
 
 		 536 aa  60.1  0.00000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0274092 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1235  Carbohydrate binding family 6  25.19 
 
 		 509 aa  59.3  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00440741  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0193  glycoside hydrolase family 43  25.91 
 
 		 324 aa  59.7  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00680352  normal  0.581709 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0628  glycoside hydrolase family 43  25.97 
 
 		 505 aa  59.7  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0737  glycoside hydrolase family protein  24.41 
 
 		 345 aa  58.9  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.612706  normal  0.340405 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6730  glycoside hydrolase family 43  27.52 
 
 		 323 aa  58.5  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575675  normal  0.920031 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1524  glycoside hydrolase family 43  24.81 
 
 		 524 aa  56.6  0.0000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2723  glycoside hydrolase family protein  26.62 
 
 		 345 aa  55.8  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.469303  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0078  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  29.29 
 
 		 379 aa  56.2  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.144884  normal  0.277265 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0473  glycoside hydrolase family 43  23.16 
 
 		 829 aa  55.5  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.658009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1982  glycoside hydrolase family protein  26.49 
 
 		 315 aa  54.7  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000010784  normal  0.0338284 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6081  glycoside hydrolase family 43  31.58 
 
 		 480 aa  55.1  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1992  glycoside hydrolase family protein  26.49 
 
 		 315 aa  54.7  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000493506  unclonable  0.0000204974 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0753  glycoside hydrolase family protein  26.04 
 
 		 465 aa  53.9  0.000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3276  carbohydrate-binding family 6 protein  26.39 
 
 		 401 aa  53.9  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01459  xylosidase; arabinosidase  29.06 
 
 		 527 aa  53.9  0.000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.928055  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2069  glycoside hydrolase family protein  26.49 
 
 		 315 aa  53.5  0.000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000027007  hitchhiker  0.0000035019 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0507  glycoside hydrolase family 43  25.1 
 
 		 337 aa  53.1  0.000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.412329 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1231  Carbohydrate binding family 6  25.52 
 
 		 524 aa  52.8  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0177163  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2722  glycoside hydrolase family protein  25.45 
 
 		 310 aa  52  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.123508  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0289  xylan 1,4-beta-xylosidase  22.39 
 
 		 532 aa  52  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000021727  normal  0.556687 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0700  glycoside hydrolase family 43  22.89 
 
 		 522 aa  52  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1500  glycoside hydrolase family 43  27.24 
 
 		 551 aa  52  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.36043 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0935  glycoside hydrolase family 43  24.9 
 
 		 522 aa  52.4  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16970  beta-xylosidase  26.7 
 
 		 313 aa  51.2  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.374085 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0739  glycoside hydrolase family protein  21.27 
 
 		 348 aa  50.8  0.00005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3360  glycoside hydrolase family 43  24.49 
 
 		 522 aa  50.8  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0779432 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0875  glycoside hydrolase family protein  27.78 
 
 		 636 aa  51.2  0.00005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000412559  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3213  glycoside hydrolase family 43  24.88 
 
 		 464 aa  50.8  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.331095  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3109  glycoside hydrolase family protein  29.69 
 
 		 644 aa  50.1  0.00008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4021  glycoside hydrolase family protein  27.24 
 
 		 537 aa  50.1  0.00008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.701147 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2447  putative xylosidase  24.8 
 
 		 468 aa  49.7  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.320135 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0650  glycoside hydrolase family 43  31.9 
 
 		 495 aa  49.7  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0713148  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2866  glycoside hydrolase family 43  25.42 
 
 		 487 aa  49.7  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.141314  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10919  hypothetical protein  27.17 
 
 		 383 aa  49.3  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0280473  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02534  endoarabinanase (Eurofung)  25.44 
 
 		 380 aa  49.3  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4788  Xylan 1,4-beta-xylosidase  26.32 
 
 		 562 aa  48.9  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.771274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2639  glycoside hydrolase family 43  24.9 
 
 		 472 aa  49.3  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.431626  normal  0.0143862 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3334  Alpha-N-arabinofuranosidase  23.69 
 
 		 536 aa  48.1  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.783434  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3224  Alpha-N-arabinofuranosidase  24.06 
 
 		 444 aa  48.5  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.136595  normal  0.135367 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1229  Carbohydrate binding family 6  23.87 
 
 		 535 aa  48.5  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.166566  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2504  Xylan 1,4-beta-xylosidase  22.16 
 
 		 558 aa  48.5  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2409  hypothetical protein  22.34 
 
 		 541 aa  47.8  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4504  glycoside hydrolase family 43  24.11 
 
 		 510 aa  47.8  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1143  Alpha-L-arabinofuranosidase  24.22 
 
 		 523 aa  47.4  0.0006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3932  glycoside hydrolase family 43  30.36 
 
 		 456 aa  47.4  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.325517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0789  endo-1,4-beta-xylanase D precursor  27.95 
 
 		 317 aa  47  0.0007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0130439  normal  0.452031 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3599  glycoside hydrolase family 43  22.69 
 
 		 497 aa  47  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0127437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2698  glycoside hydrolase family 43  27.93 
 
 		 369 aa  47  0.0009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.898004  normal  0.338928 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>