69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1543 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_1543  beta-xylosidase  100 
 
 		 531 aa  1097    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.000200892  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1542  beta-xylosidase  46.28 
 
 		 581 aa  477  1e-133  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2728  hypothetical protein  31.44 
 
 		 848 aa  249  8e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1999  glycoside hydrolase family protein  33.45 
 
 		 1121 aa  229  1e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000101187  decreased coverage  0.0000000170847 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2086  beta-xylosidase-like protein  33.82 
 
 		 1121 aa  228  2e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00280414  decreased coverage  0.0000000469917 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1976  glycoside hydrolase family protein  33.27 
 
 		 1121 aa  226  1e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00565193  hitchhiker  0.00420486 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0637  glycoside hydrolase family protein  33.33 
 
 		 471 aa  224  4e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000622549  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0662  glycoside hydrolase family protein  33.18 
 
 		 471 aa  222  9.999999999999999e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000191922  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0015  alpha-L-arabinofuranosidase B  31.84 
 
 		 707 aa  218  1e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0639  glycoside hydrolase family protein  31.94 
 
 		 475 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000370471  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0664  glycoside hydrolase family protein  32.24 
 
 		 476 aa  211  2e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2809  ATPase  30.55 
 
 		 789 aa  204  4e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.153749  decreased coverage  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2047  glycoside hydrolase family protein  30.45 
 
 		 1112 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000114958  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1393  immunoglobulin I-set domain-containing protein  30.14 
 
 		 810 aa  186  1.0000000000000001e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2161  glycoside hydrolase family protein  30.98 
 
 		 1143 aa  184  3e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000526501  hitchhiker  0.0000457644 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29390  beta-xylosidase  28.69 
 
 		 494 aa  176  7e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.838648  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3317  Beta-xylosidase-like  30.05 
 
 		 1174 aa  174  2.9999999999999996e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00018095  hitchhiker  0.000000702951 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1623  glycoside hydrolase family 43  29.01 
 
 		 804 aa  174  2.9999999999999996e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0299424  normal  0.680345 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3292  glycoside hydrolase family 43  28.11 
 
 		 488 aa  174  3.9999999999999995e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.223704  hitchhiker  0.00299224 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1622  glycoside hydrolase family 43  29.13 
 
 		 703 aa  160  6e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.372812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1729  glycoside hydrolase family 43  31.15 
 
 		 472 aa  148  3e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.101805  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0510  glycoside hydrolase family 43  28.19 
 
 		 456 aa  121  3e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0180422  hitchhiker  0.00320544 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1995  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  25.14 
 
 		 355 aa  89.4  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000026265  hitchhiker  0.0000968585 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1980  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  24.86 
 
 		 355 aa  88.6  3e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000532018  hitchhiker  0.000349844 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2082  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  24.86 
 
 		 356 aa  87.8  4e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000230744  hitchhiker  0.000000189943 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2051  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  25.3 
 
 		 357 aa  85.1  0.000000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2813  glycoside hydrolase family 43  26.28 
 
 		 331 aa  81.3  0.00000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0257715  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1390  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  23.7 
 
 		 341 aa  80.9  0.00000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.287204  normal  0.664348 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4284  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  26.51 
 
 		 327 aa  80.5  0.00000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2732  glycoside hydrolase family 43  23.9 
 
 		 315 aa  79.7  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2156  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  23.89 
 
 		 352 aa  77  0.0000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000116592  hitchhiker  0.00999646 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0786  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  25.56 
 
 		 346 aa  74.7  0.000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000141301  normal  0.447167 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2201  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  22.81 
 
 		 343 aa  70.1  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0989  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  27.61 
 
 		 334 aa  66.6  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0127699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04520  beta-xylosidase  33.33 
 
 		 491 aa  65.9  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.130696  normal  0.0670778 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3750  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  26.42 
 
 		 319 aa  65.9  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00407758  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2449  glycoside hydrolase family 43  24.05 
 
 		 537 aa  65.5  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114761  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1014  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  34.17 
 
 		 472 aa  65.1  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000194163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6081  glycoside hydrolase family 43  24.76 
 
 		 480 aa  65.1  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0516  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  28.71 
 
 		 366 aa  62.8  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000112186  decreased coverage  0.000226611 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3569  glycoside hydrolase family 43  20.57 
 
 		 484 aa  55.1  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0058203  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0179  cellulose-binding family II  22.29 
 
 		 598 aa  54.7  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00318302 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0078  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  24.71 
 
 		 379 aa  53.5  0.000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.144884  normal  0.277265 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4496  glycoside hydrolase family 43  22.57 
 
 		 503 aa  53.1  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0241272  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0473  glycoside hydrolase family 43  28.82 
 
 		 829 aa  52.4  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.658009  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2329  Xylan 1,4-beta-xylosidase  25.81 
 
 		 537 aa  51.6  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.80101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2504  Xylan 1,4-beta-xylosidase  25.52 
 
 		 558 aa  51.6  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4504  glycoside hydrolase family 43  24.13 
 
 		 510 aa  50.8  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2090  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.09 
 
 		 537 aa  50.4  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00759162  normal  0.572245 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03044  Endo-arabinanase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFU2]  21.71 
 
 		 386 aa  49.7  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0289  xylan 1,4-beta-xylosidase  23.84 
 
 		 532 aa  49.7  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000021727  normal  0.556687 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2409  hypothetical protein  25.78 
 
 		 541 aa  49.7  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1291  Beta-xylosidase  30.37 
 
 		 553 aa  49.3  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4289  glycoside hydrolase family protein  24.9 
 
 		 572 aa  49.3  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.786059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2423  glycoside hydrolase family 43  24.73 
 
 		 699 aa  48.5  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4703  glycoside hydrolase family 43  23.56 
 
 		 341 aa  48.1  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.184013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2996  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.07 
 
 		 559 aa  47.4  0.0006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1878  beta-xylosidase  26.36 
 
 		 539 aa  47  0.0008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0936  Alpha-N-arabinofuranosidase  22.06 
 
 		 546 aa  47  0.0009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.789253 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0431  glycoside hydrolase family protein  20.58 
 
 		 451 aa  45.8  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0430  glycoside hydrolase family 43  20.47 
 
 		 497 aa  45.8  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.710686 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3334  Alpha-N-arabinofuranosidase  23.94 
 
 		 536 aa  45.4  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.783434  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6044  glycoside hydrolase family 43  22.22 
 
 		 501 aa  44.7  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.845022  normal  0.0554344 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06352  Endo-alpha-1,5-L-arabinanasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AZC8]  22.16 
 
 		 400 aa  44.7  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.605603  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3599  glycoside hydrolase family 43  21.43 
 
 		 497 aa  44.7  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0127437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3545  Alpha-N-arabinofuranosidase  23.81 
 
 		 547 aa  44.3  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0270111  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07864  conserved hypothetical protein  23.3 
 
 		 540 aa  44.3  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0157749  normal  0.535242 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20520  beta-xylosidase  21.76 
 
 		 542 aa  43.9  0.007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.129044  normal  0.254652 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3622  Xylan 1,4-beta-xylosidase  21.36 
 
 		 540 aa  43.5  0.009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.573352  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>