More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1235 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_1235  Carbohydrate binding family 6  100 
 
 		 509 aa  1044    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00440741  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1231  Carbohydrate binding family 6  71.26 
 
 		 524 aa  766    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0177163  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2196  carbohydrate-binding family 6 protein  61.13 
 
 		 533 aa  640    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0455  Carbohydrate binding family 6  54.02 
 
 		 618 aa  494  9.999999999999999e-139  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3213  glycoside hydrolase family 43  51.25 
 
 		 464 aa  477  1e-133  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.331095  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1229  Carbohydrate binding family 6  46.85 
 
 		 535 aa  432  1e-120  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.166566  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10919  hypothetical protein  56.91 
 
 		 383 aa  427  1e-118  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0280473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1271  carbohydrate-binding family 6 protein  46.83 
 
 		 679 aa  363  5.0000000000000005e-99  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3276  carbohydrate-binding family 6 protein  48.64 
 
 		 401 aa  335  1e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3612  methionine biosynthesis MetW  39.33 
 
 		 1186 aa  300  3e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0161329  hitchhiker  0.00479901 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1232  Carbohydrate binding family 6  66.18 
 
 		 490 aa  270  4e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.122742  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1982  glycoside hydrolase family protein  45.34 
 
 		 315 aa  261  2e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000010784  normal  0.0338284 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1656  Carbohydrate binding family 6  65.96 
 
 		 951 aa  261  2e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00148801  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1992  glycoside hydrolase family protein  45.34 
 
 		 315 aa  260  4e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000493506  unclonable  0.0000204974 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2069  glycoside hydrolase family protein  44.41 
 
 		 315 aa  258  2e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000027007  hitchhiker  0.0000035019 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2837  glycoside hydrolase family 43  42.81 
 
 		 348 aa  252  9.000000000000001e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.61366  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2143  glycoside hydrolase family 43  43.91 
 
 		 311 aa  244  3e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.209046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2063  glycoside hydrolase family protein  44.87 
 
 		 311 aa  244  3.9999999999999997e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000284349  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0789  endo-1,4-beta-xylanase D precursor  46.36 
 
 		 317 aa  241  2e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0130439  normal  0.452031 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2447  putative xylosidase  43.79 
 
 		 468 aa  241  2e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.320135 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0823  glycoside hydrolase family 43  40.27 
 
 		 302 aa  228  2e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.328209 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1239  Carbohydrate binding family 6  54.98 
 
 		 1015 aa  224  3e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000298242  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0810  carbohydrate-binding family 6 protein  31.86 
 
 		 450 aa  224  3e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.034958  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3224  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.43 
 
 		 444 aa  221  1.9999999999999999e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.136595  normal  0.135367 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1928  Carbohydrate-binding CenC domain protein  34.27 
 
 		 712 aa  219  8.999999999999998e-56  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2195  carbohydrate-binding family 6 protein  51.72 
 
 		 965 aa  215  1.9999999999999998e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.862232  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2194  carbohydrate-binding family 6 protein  50.5 
 
 		 501 aa  207  3e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.29628  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1237  Carbohydrate binding family 6  52.59 
 
 		 604 aa  206  8e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0649618  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2197  carbohydrate-binding family 6 protein  52.06 
 
 		 928 aa  204  4e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.71663  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1238  Carbohydrate binding family 6  52.06 
 
 		 1122 aa  200  6e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000137164  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1234  Carbohydrate binding family 6  39.53 
 
 		 536 aa  199  1.0000000000000001e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.115461  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1233  Carbohydrate binding family 6  52.02 
 
 		 746 aa  197  5.000000000000001e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.555313  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1240  Carbohydrate binding family 6  39 
 
 		 780 aa  196  1e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000268081  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1230  Carbohydrate binding family 6  51.24 
 
 		 541 aa  191  2e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000323294  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0182  glycoside hydrolase family 43  32.49 
 
 		 1338 aa  189  8e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1241  Carbohydrate binding family 6  50.23 
 
 		 1164 aa  183  5.0000000000000004e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01459  xylosidase; arabinosidase  36.09 
 
 		 527 aa  181  2e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.928055  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0946  SecY protein  37.38 
 
 		 317 aa  180  4.999999999999999e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.409307  hitchhiker  0.0000724629 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1242  Carbohydrate binding family 6  37.03 
 
 		 629 aa  175  1.9999999999999998e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.679314  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2866  glycoside hydrolase family 43  37.71 
 
 		 487 aa  168  2e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.141314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4501  Alpha-N-arabinofuranosidase  34.47 
 
 		 316 aa  160  5e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.570213  normal  0.69004 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2614  glycoside hydrolase family 43  32.31 
 
 		 326 aa  153  5.9999999999999996e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0795  Xylan 1,4-beta-xylosidase  33.64 
 
 		 346 aa  150  6e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000173963  normal  0.0629112 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0353  Xylan 1,4-beta-xylosidase  30.81 
 
 		 346 aa  147  3e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6730  glycoside hydrolase family 43  31.23 
 
 		 323 aa  147  5e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575675  normal  0.920031 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1660  carbohydrate binding domain/beta-xylosidase family protein  28.92 
 
 		 667 aa  146  8.000000000000001e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.324921  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2972  glycoside hydrolase family protein  40.58 
 
 		 683 aa  146  1e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0193  glycoside hydrolase family 43  32.45 
 
 		 324 aa  145  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00680352  normal  0.581709 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2795  hypothetical protein  55.64 
 
 		 912 aa  144  3e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00123137  hitchhiker  0.0000146968 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0375  Alpha-N-arabinofuranosidase  30.91 
 
 		 320 aa  144  3e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.194615 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2384  glycoside hydrolase family 43  29.32 
 
 		 330 aa  143  7e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3728  Alpha-L-arabinofuranosidase  31.33 
 
 		 383 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1323  Alpha-N-arabinofuranosidase  30.15 
 
 		 330 aa  142  1.9999999999999998e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16970  beta-xylosidase  33.93 
 
 		 313 aa  140  6e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.374085 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1963  glycoside hydrolase family protein  35.96 
 
 		 837 aa  139  2e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.658538  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3012  carbohydrate-binding family 6 protein  37.85 
 
 		 630 aa  138  2e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01870  xylosidase/arabinosidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04480)  28.16 
 
 		 344 aa  137  6.0000000000000005e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3109  glycoside hydrolase family protein  32.7 
 
 		 644 aa  137  6.0000000000000005e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03869  beta-xylosidase (1,4-beta-D-xylan xylohydrolase) (Xylan1,4-beta-xylosidase) (Exo-beta-(1,4)-xylanase)  29.91 
 
 		 344 aa  136  9.999999999999999e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4846  Xylan 1,4-beta-xylosidase  31.79 
 
 		 367 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0960373  hitchhiker  0.00474985 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0822  Alpha-L-arabinofuranosidase  29.91 
 
 		 385 aa  134  3e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000000000001862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1998  Alpha-N-arabinofuranosidase  30 
 
 		 344 aa  134  3e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01477  beta-1,4-xylosidase (Eurofung)  26.84 
 
 		 404 aa  128  2.0000000000000002e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0551  Xylan 1,4-beta-xylosidase  28.12 
 
 		 335 aa  127  3e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000239269 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1911  carbohydrate-binding family 6 protein  42.21 
 
 		 1290 aa  110  7.000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.374482  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2027  glycoside hydrolase family protein  30.95 
 
 		 325 aa  104  3e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.808853  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4050  carbohydrate-binding family 6 protein  40.6 
 
 		 479 aa  101  4e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.567483  normal  0.0446183 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2723  glycoside hydrolase family protein  30.66 
 
 		 345 aa  98.2  3e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.469303  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0129  carbohydrate-binding family 6 protein  43.31 
 
 		 469 aa  97.1  6e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.235369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0531  Alpha-N-arabinofuranosidase  25 
 
 		 471 aa  97.1  7e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0843  carbohydrate binding family 6  41.41 
 
 		 470 aa  92.4  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.392015 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3674  carbohydrate-binding family 6 protein  41.35 
 
 		 479 aa  92.4  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1077  Carbohydrate binding family 6  42.86 
 
 		 464 aa  90.5  7e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20580  glycoside hydrolase family 43  26.21 
 
 		 315 aa  89  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0650  glycoside hydrolase family 43  26.43 
 
 		 495 aa  87.4  5e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0713148  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2392  glycoside hydrolase family 43  32.14 
 
 		 306 aa  87.8  5e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000540158  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2639  glycoside hydrolase family 43  28.46 
 
 		 472 aa  87.8  5e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.431626  normal  0.0143862 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5224  Carbohydrate binding family 6  38.69 
 
 		 566 aa  87.4  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.105995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2556  glycoside hydrolase family 43  30.18 
 
 		 319 aa  86.3  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.149373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0216  hypothetical protein  41.13 
 
 		 630 aa  83.6  0.000000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.80342 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0206  glycoside hydrolase family 43  30.87 
 
 		 304 aa  82.8  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  0.253285 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2482  glycoside hydrolase family 43  26.5 
 
 		 384 aa  82  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.24102 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7912  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  38.46 
 
 		 953 aa  82.4  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.241269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1011  glycoside hydrolase family 43  26.1 
 
 		 471 aa  80.5  0.00000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0661  Ricin B lectin  23.62 
 
 		 571 aa  80.5  0.00000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2971  glycoside hydrolase family 43  26.99 
 
 		 855 aa  80.5  0.00000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0529993 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0931  glycoside hydrolase family 10  55.07 
 
 		 423 aa  79  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.514764  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0536  glycoside hydrolase family 43  30 
 
 		 393 aa  79  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.812392 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3787  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  35.4 
 
 		 945 aa  78.6  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.339008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2494  hypothetical protein  41.13 
 
 		 610 aa  78.6  0.0000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1972  glycoside hydrolase family 43  30.15 
 
 		 501 aa  78.6  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0628  glycoside hydrolase family 43  28.02 
 
 		 505 aa  77  0.0000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0737  glycoside hydrolase family protein  26.45 
 
 		 345 aa  75.1  0.000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.612706  normal  0.340405 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1524  glycoside hydrolase family 43  25.22 
 
 		 524 aa  75.1  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4545  glycoside hydrolase family 16  37.01 
 
 		 383 aa  74.7  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3753  Carbohydrate binding family 6  37.25 
 
 		 639 aa  73.6  0.000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000661715 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2395  lipolytic protein G-D-S-L family  52.38 
 
 		 311 aa  73.2  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00016801  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2722  glycoside hydrolase family protein  25.37 
 
 		 310 aa  72.4  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.123508  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6022  glycoside hydrolase family 43  28.91 
 
 		 319 aa  72.4  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0435  cellulosome enzyme, dockerin type I  46.88 
 
 		 350 aa  70.1  0.00000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>