More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1231 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_1235  Carbohydrate binding family 6  71.26 
 
 		 509 aa  766    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00440741  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1231  Carbohydrate binding family 6  100 
 
 		 524 aa  1075    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0177163  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2196  carbohydrate-binding family 6 protein  68.86 
 
 		 533 aa  754    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0455  Carbohydrate binding family 6  62.59 
 
 		 618 aa  582  1.0000000000000001e-165  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3213  glycoside hydrolase family 43  60.37 
 
 		 464 aa  556  1e-157  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.331095  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10919  hypothetical protein  60.72 
 
 		 383 aa  477  1e-133  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0280473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1229  Carbohydrate binding family 6  44.28 
 
 		 535 aa  420  1e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.166566  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1271  carbohydrate-binding family 6 protein  45.65 
 
 		 679 aa  364  3e-99  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3276  carbohydrate-binding family 6 protein  48.79 
 
 		 401 aa  352  8e-96  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3612  methionine biosynthesis MetW  39.39 
 
 		 1186 aa  301  2e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0161329  hitchhiker  0.00479901 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1982  glycoside hydrolase family protein  44.24 
 
 		 315 aa  271  2.9999999999999997e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000010784  normal  0.0338284 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1992  glycoside hydrolase family protein  44.24 
 
 		 315 aa  270  4e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000493506  unclonable  0.0000204974 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1232  Carbohydrate binding family 6  66 
 
 		 490 aa  269  8e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.122742  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2069  glycoside hydrolase family protein  43.33 
 
 		 315 aa  268  2e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000027007  hitchhiker  0.0000035019 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2143  glycoside hydrolase family 43  44.51 
 
 		 311 aa  260  3e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.209046  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1656  Carbohydrate binding family 6  65.79 
 
 		 951 aa  261  3e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00148801  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2063  glycoside hydrolase family protein  44.79 
 
 		 311 aa  257  3e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000284349  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0789  endo-1,4-beta-xylanase D precursor  44.55 
 
 		 317 aa  256  5e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0130439  normal  0.452031 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2837  glycoside hydrolase family 43  45.31 
 
 		 348 aa  243  5e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.61366  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2447  putative xylosidase  44.55 
 
 		 468 aa  241  2e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.320135 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0823  glycoside hydrolase family 43  39.02 
 
 		 302 aa  232  2e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.328209 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1239  Carbohydrate binding family 6  53.95 
 
 		 1015 aa  229  1e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000298242  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2195  carbohydrate-binding family 6 protein  51.9 
 
 		 965 aa  228  2e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.862232  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1928  Carbohydrate-binding CenC domain protein  33.07 
 
 		 712 aa  223  4.9999999999999996e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0810  carbohydrate-binding family 6 protein  31.09 
 
 		 450 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.034958  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2194  carbohydrate-binding family 6 protein  51.26 
 
 		 501 aa  212  1e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.29628  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1238  Carbohydrate binding family 6  53.03 
 
 		 1122 aa  209  7e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000137164  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2197  carbohydrate-binding family 6 protein  50.76 
 
 		 928 aa  209  1e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.71663  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1237  Carbohydrate binding family 6  54.31 
 
 		 604 aa  207  3e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0649618  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1233  Carbohydrate binding family 6  53.17 
 
 		 746 aa  204  2e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.555313  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1234  Carbohydrate binding family 6  49.77 
 
 		 536 aa  198  2.0000000000000003e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.115461  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3224  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.42 
 
 		 444 aa  194  3e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.136595  normal  0.135367 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1230  Carbohydrate binding family 6  51.74 
 
 		 541 aa  194  3e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000323294  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1240  Carbohydrate binding family 6  49.76 
 
 		 780 aa  190  5e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000268081  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1241  Carbohydrate binding family 6  51.76 
 
 		 1164 aa  190  5e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0182  glycoside hydrolase family 43  31.14 
 
 		 1338 aa  189  8e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01459  xylosidase; arabinosidase  37.06 
 
 		 527 aa  179  1e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.928055  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0946  SecY protein  34.14 
 
 		 317 aa  175  1.9999999999999998e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.409307  hitchhiker  0.0000724629 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1242  Carbohydrate binding family 6  46.51 
 
 		 629 aa  175  1.9999999999999998e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.679314  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2866  glycoside hydrolase family 43  36.12 
 
 		 487 aa  160  4e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.141314  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2614  glycoside hydrolase family 43  31.89 
 
 		 326 aa  157  6e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3728  Alpha-L-arabinofuranosidase  32.59 
 
 		 383 aa  150  4e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4501  Alpha-N-arabinofuranosidase  32.04 
 
 		 316 aa  150  7e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.570213  normal  0.69004 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2972  glycoside hydrolase family protein  39.81 
 
 		 683 aa  147  5e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1660  carbohydrate binding domain/beta-xylosidase family protein  29.32 
 
 		 667 aa  144  3e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.324921  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1323  Alpha-N-arabinofuranosidase  31.08 
 
 		 330 aa  144  3e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0795  Xylan 1,4-beta-xylosidase  31.69 
 
 		 346 aa  144  3e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000173963  normal  0.0629112 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1998  Alpha-N-arabinofuranosidase  30 
 
 		 344 aa  144  4e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0822  Alpha-L-arabinofuranosidase  31.37 
 
 		 385 aa  143  7e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000000000001862  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0375  Alpha-N-arabinofuranosidase  30.79 
 
 		 320 aa  142  9.999999999999999e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.194615 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2795  hypothetical protein  50 
 
 		 912 aa  142  1.9999999999999998e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00123137  hitchhiker  0.0000146968 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1963  glycoside hydrolase family protein  40.68 
 
 		 837 aa  140  3.9999999999999997e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.658538  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0353  Xylan 1,4-beta-xylosidase  31.17 
 
 		 346 aa  140  7e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4846  Xylan 1,4-beta-xylosidase  31.61 
 
 		 367 aa  137  5e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0960373  hitchhiker  0.00474985 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03869  beta-xylosidase (1,4-beta-D-xylan xylohydrolase) (Xylan1,4-beta-xylosidase) (Exo-beta-(1,4)-xylanase)  30.09 
 
 		 344 aa  134  6e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01477  beta-1,4-xylosidase (Eurofung)  27.14 
 
 		 404 aa  127  3e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3012  carbohydrate-binding family 6 protein  37.13 
 
 		 630 aa  127  3e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6730  glycoside hydrolase family 43  29.64 
 
 		 323 aa  125  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575675  normal  0.920031 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16970  beta-xylosidase  32.89 
 
 		 313 aa  125  2e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.374085 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3109  glycoside hydrolase family protein  31.91 
 
 		 644 aa  124  4e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0193  glycoside hydrolase family 43  30.13 
 
 		 324 aa  119  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00680352  normal  0.581709 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2384  glycoside hydrolase family 43  29.58 
 
 		 330 aa  119  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0551  Xylan 1,4-beta-xylosidase  28.71 
 
 		 335 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000239269 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01870  xylosidase/arabinosidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04480)  28.36 
 
 		 344 aa  112  2.0000000000000002e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1911  carbohydrate-binding family 6 protein  36.27 
 
 		 1290 aa  111  3e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.374482  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2027  glycoside hydrolase family protein  32.96 
 
 		 325 aa  103  6e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.808853  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4050  carbohydrate-binding family 6 protein  42.64 
 
 		 479 aa  97.4  6e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.567483  normal  0.0446183 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0129  carbohydrate-binding family 6 protein  42.52 
 
 		 469 aa  93.6  7e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.235369  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0843  carbohydrate binding family 6  41.73 
 
 		 470 aa  87.4  5e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.392015 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3674  carbohydrate-binding family 6 protein  41.22 
 
 		 479 aa  87.4  6e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1077  Carbohydrate binding family 6  41.98 
 
 		 464 aa  85.9  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0531  Alpha-N-arabinofuranosidase  22.98 
 
 		 471 aa  82.8  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0931  glycoside hydrolase family 10  55.07 
 
 		 423 aa  81.6  0.00000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.514764  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5224  Carbohydrate binding family 6  37.5 
 
 		 566 aa  80.9  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.105995  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2395  lipolytic protein G-D-S-L family  48.65 
 
 		 311 aa  80.1  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00016801  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3787  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  37.72 
 
 		 945 aa  80.1  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.339008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2494  hypothetical protein  40.91 
 
 		 610 aa  79  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0649  cellulosome protein dockerin type I  50 
 
 		 532 aa  78.6  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2482  glycoside hydrolase family 43  26.92 
 
 		 384 aa  79  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.24102 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2723  glycoside hydrolase family protein  30.3 
 
 		 345 aa  79  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.469303  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1400  glycosyl hydrolase 53  53.73 
 
 		 415 aa  79.3  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.195161  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0216  hypothetical protein  37.1 
 
 		 630 aa  78.2  0.0000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.80342 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20580  glycoside hydrolase family 43  26.06 
 
 		 315 aa  78.6  0.0000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0536  glycoside hydrolase family 43  31.33 
 
 		 393 aa  78.2  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.812392 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7912  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  39.5 
 
 		 953 aa  76.6  0.0000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.241269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0435  cellulosome enzyme, dockerin type I  45.95 
 
 		 350 aa  75.5  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2556  glycoside hydrolase family 43  26.83 
 
 		 319 aa  75.9  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.149373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1398  cellulosome enzyme, dockerin type I  47.76 
 
 		 842 aa  75.1  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.461235  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6022  glycoside hydrolase family 43  27.76 
 
 		 319 aa  74.3  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1011  glycoside hydrolase family 43  27.44 
 
 		 471 aa  73.6  0.000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2322  protein of unknown function DUF1080  35.37 
 
 		 1444 aa  71.2  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.205839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4175  glycoside hydrolase family protein  30.04 
 
 		 541 aa  69.7  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0206  glycoside hydrolase family 43  26.87 
 
 		 304 aa  69.7  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  0.253285 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2639  glycoside hydrolase family 43  25.1 
 
 		 472 aa  69.7  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.431626  normal  0.0143862 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2051  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  26.83 
 
 		 357 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2949  pectinesterase  37.5 
 
 		 567 aa  68.9  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.765546  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0731  glycoside hydrolase family 9  53.73 
 
 		 725 aa  68.2  0.0000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2812  glycoside hydrolase family protein  47.76 
 
 		 611 aa  67.8  0.0000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.283645  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0258  cellulosome enzyme, dockerin type I  40 
 
 		 469 aa  67.4  0.0000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000567445  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0417  cellulosome protein dockerin type I  39.39 
 
 		 848 aa  67.4  0.0000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000135998  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>