228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0015 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_0015  alpha-L-arabinofuranosidase B  100 
 
 
707 aa  1462    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0639  glycoside hydrolase family protein  61.74 
 
 
475 aa  569  1e-161  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000370471  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0664  glycoside hydrolase family protein  61.16 
 
 
476 aa  565  1e-160  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0662  glycoside hydrolase family protein  56.58 
 
 
471 aa  520  1e-146  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000191922  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0637  glycoside hydrolase family protein  55.26 
 
 
471 aa  511  1e-143  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000622549  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2809  ATPase  53.85 
 
 
789 aa  494  9.999999999999999e-139  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.153749  decreased coverage  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1623  glycoside hydrolase family 43  53.1 
 
 
804 aa  487  1e-136  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0299424  normal  0.680345 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1393  immunoglobulin I-set domain-containing protein  50.87 
 
 
810 aa  468  9.999999999999999e-131  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1622  glycoside hydrolase family 43  52.21 
 
 
703 aa  452  1.0000000000000001e-126  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.372812  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3292  glycoside hydrolase family 43  48.79 
 
 
488 aa  452  1e-125  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.223704  hitchhiker  0.00299224 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29390  beta-xylosidase  45.33 
 
 
494 aa  424  1e-117  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.838648  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2161  glycoside hydrolase family protein  43.4 
 
 
1143 aa  397  1e-109  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000526501  hitchhiker  0.0000457644 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1999  glycoside hydrolase family protein  45.57 
 
 
1121 aa  390  1e-107  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000101187  decreased coverage  0.0000000170847 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1976  glycoside hydrolase family protein  45.57 
 
 
1121 aa  390  1e-107  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00565193  hitchhiker  0.00420486 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2086  beta-xylosidase-like protein  46.32 
 
 
1121 aa  390  1e-107  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00280414  decreased coverage  0.0000000469917 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2047  glycoside hydrolase family protein  46.47 
 
 
1112 aa  392  1e-107  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000114958  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2728  hypothetical protein  39.31 
 
 
848 aa  358  2.9999999999999997e-97  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3317  Beta-xylosidase-like  37.32 
 
 
1174 aa  320  3.9999999999999996e-86  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00018095  hitchhiker  0.000000702951 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2138  glycoside hydrolase family protein  72.46 
 
 
580 aa  247  6e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2139  alpha-L-arabinofuranosidase B  76.26 
 
 
982 aa  229  1e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1543  beta-xylosidase  31.76 
 
 
531 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.000200892  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1729  glycoside hydrolase family 43  31.8 
 
 
472 aa  211  4e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.101805  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1542  beta-xylosidase  25.71 
 
 
581 aa  153  1e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1273  alpha-L-arabinofuranosidase B  52.31 
 
 
481 aa  137  8e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0510  glycoside hydrolase family 43  28.04 
 
 
456 aa  135  3e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0180422  hitchhiker  0.00320544 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1971  alpha-L-arabinofuranosidase B  48.89 
 
 
478 aa  127  8.000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000055654  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0062  alpha-L-arabinofuranosidase B  48.46 
 
 
854 aa  125  2e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.649597  normal  0.531326 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1390  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  25.96 
 
 
341 aa  102  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.287204  normal  0.664348 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2051  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  28.25 
 
 
357 aa  102  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1995  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  27.81 
 
 
355 aa  102  3e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000026265  hitchhiker  0.0000968585 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1980  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  27.81 
 
 
355 aa  101  4e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000532018  hitchhiker  0.000349844 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2082  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  27.53 
 
 
356 aa  99.4  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000230744  hitchhiker  0.000000189943 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2732  glycoside hydrolase family 43  26.39 
 
 
315 aa  99.4  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2156  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  26.05 
 
 
352 aa  98.2  5e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000116592  hitchhiker  0.00999646 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3403  glycoside hydrolase family 43  26.4 
 
 
357 aa  97.1  9e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000194853  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2201  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  27.54 
 
 
343 aa  96.3  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2813  glycoside hydrolase family 43  26.05 
 
 
331 aa  94.4  7e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0257715  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0786  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  24.08 
 
 
346 aa  91.7  4e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000141301  normal  0.447167 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1963  glycoside hydrolase family protein  51.14 
 
 
837 aa  87.4  8e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.658538  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0912  glycoside hydrolase family protein  56.58 
 
 
1077 aa  87  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3750  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  26.43 
 
 
319 aa  86.7  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00407758  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2879  cellulosome enzyme, dockerin type I  60.61 
 
 
511 aa  86.7  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.42565  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0821  coagulation factor 5/8 type-like protein  51.16 
 
 
558 aa  85.9  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000172205  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2137  cellulosome enzyme, dockerin type I  44.25 
 
 
790 aa  84.7  0.000000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0989  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  28.74 
 
 
334 aa  83.2  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0127699  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2193  carbohydrate-binding family 6 protein  61.9 
 
 
948 aa  83.2  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.43679  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1014  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  28.29 
 
 
472 aa  81.6  0.00000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000194163  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0179  cellulose-binding family II  27.08 
 
 
598 aa  81.6  0.00000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00318302 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1240  Carbohydrate binding family 6  41.59 
 
 
780 aa  81.3  0.00000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000268081  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2449  glycoside hydrolase family 43  26.85 
 
 
537 aa  80.9  0.00000000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114761  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01571  Alpha-L-arabinofuranosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:O74288]  39.02 
 
 
510 aa  79.7  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.611829 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2423  glycoside hydrolase family 43  26.35 
 
 
699 aa  79  0.0000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2972  glycoside hydrolase family protein  40 
 
 
683 aa  79  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04520  beta-xylosidase  28.9 
 
 
491 aa  78.6  0.0000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.130696  normal  0.0670778 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4703  glycoside hydrolase family 43  25.63 
 
 
341 aa  77.8  0.0000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.184013  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1890  cellulosome enzyme, dockerin type I  50.57 
 
 
710 aa  76.6  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1271  carbohydrate-binding family 6 protein  60.32 
 
 
679 aa  76.3  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5160  Xylan 1,4-beta-xylosidase  40.37 
 
 
519 aa  75.9  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0027116 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2549  cellulosome enzyme, dockerin type I  60.61 
 
 
324 aa  76.3  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03044  Endo-arabinanase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFU2]  26.49 
 
 
386 aa  75.9  0.000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0516  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  25.39 
 
 
366 aa  75.5  0.000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000112186  decreased coverage  0.000226611 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2811  glycoside hydrolase family protein  50 
 
 
591 aa  75.1  0.000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4496  glycoside hydrolase family 43  25.84 
 
 
503 aa  74.7  0.000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0241272  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0543  glycoside hydrolase family protein  51.39 
 
 
739 aa  74.7  0.000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4284  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  27.47 
 
 
327 aa  74.3  0.000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0737  glycoside hydrolase family protein  24.73 
 
 
345 aa  73.6  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.612706  normal  0.340405 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1858  Alpha-N-arabinofuranosidase  31.34 
 
 
505 aa  73.9  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0578  glycoside hydrolase family protein  46.75 
 
 
736 aa  73.6  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0797  glycoside hydrolase family protein  50.65 
 
 
814 aa  73.2  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0625  glycoside hydrolase family protein  29.81 
 
 
710 aa  72  0.00000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2197  carbohydrate-binding family 6 protein  53.97 
 
 
928 aa  72  0.00000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.71663  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1398  cellulosome enzyme, dockerin type I  46.25 
 
 
842 aa  71.2  0.00000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.461235  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0044  cellulosome enzyme, dockerin type I  55.93 
 
 
533 aa  70.1  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0239  cellulosome enzyme, dockerin type I  44.74 
 
 
1051 aa  70.1  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1207  cellulosome protein dockerin type I  45.83 
 
 
873 aa  70.5  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0640  cellulosome enzyme, dockerin type I  43.88 
 
 
582 aa  70.1  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2179  Pectate lyase/Amb allergen  32.7 
 
 
922 aa  70.1  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2194  carbohydrate-binding family 6 protein  52.38 
 
 
501 aa  70.1  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.29628  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3132  cellulosome enzyme, dockerin type I  49.23 
 
 
411 aa  70.1  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0274  glycoside hydrolase family protein  47.22 
 
 
563 aa  69.7  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00113767  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1838  glycoside hydrolase family protein  51.43 
 
 
619 aa  69.3  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.561717  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06352  Endo-alpha-1,5-L-arabinanasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AZC8]  24.66 
 
 
400 aa  68.9  0.0000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.605603  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0729  cellulosome enzyme, dockerin type I  46.84 
 
 
537 aa  68.9  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0473  glycoside hydrolase family 43  22.22 
 
 
829 aa  69.3  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.658009  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2038  cellulosome enzyme, dockerin type I  43.9 
 
 
807 aa  68.9  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0412  glycoside hydrolase family protein  52.11 
 
 
895 aa  68.2  0.0000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000331233  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2089  glycoside hydrolase family protein  47.56 
 
 
741 aa  68.2  0.0000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000609917  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2392  glycoside hydrolase family 43  25.78 
 
 
306 aa  68.2  0.0000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000540158  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0825  glycoside hydrolase family protein  52.94 
 
 
649 aa  67.8  0.0000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2761  glycoside hydrolase family protein  46.15 
 
 
707 aa  67.8  0.0000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000261631  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1872  alpha-L-arabinofuranosidase B  33.33 
 
 
980 aa  67.4  0.0000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2949  pectinesterase  46.88 
 
 
567 aa  67.4  0.0000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.765546  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2195  carbohydrate-binding family 6 protein  46.03 
 
 
965 aa  67  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.862232  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2196  carbohydrate-binding family 6 protein  50 
 
 
533 aa  67  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2950  Pectate lyase/Amb allergen  42.67 
 
 
554 aa  66.2  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.821566  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0190  proteinase inhibitor I4, serpin  45.07 
 
 
600 aa  65.9  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.927493  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0246  carbohydrate-binding family 6 protein  46.51 
 
 
820 aa  65.5  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0920  cellulosome protein dockerin type I  48.57 
 
 
391 aa  65.9  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1233  Carbohydrate binding family 6  47.69 
 
 
746 aa  65.5  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.555313  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3141  lipolytic enzyme, G-D-S-L  44.74 
 
 
831 aa  65.5  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>