125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1623 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1622  glycoside hydrolase family 43  72.84 
 
 		 703 aa  709    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.372812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1623  glycoside hydrolase family 43  100 
 
 		 804 aa  1635    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0299424  normal  0.680345 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2728  hypothetical protein  42.86 
 
 		 848 aa  632  1e-179  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2047  glycoside hydrolase family protein  42.25 
 
 		 1112 aa  565  1.0000000000000001e-159  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000114958  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2086  beta-xylosidase-like protein  41.85 
 
 		 1121 aa  561  1e-158  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00280414  decreased coverage  0.0000000469917 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1999  glycoside hydrolase family protein  41.59 
 
 		 1121 aa  557  1e-157  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000101187  decreased coverage  0.0000000170847 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1976  glycoside hydrolase family protein  41.59 
 
 		 1121 aa  556  1e-157  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00565193  hitchhiker  0.00420486 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2161  glycoside hydrolase family protein  39.95 
 
 		 1143 aa  550  1e-155  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000526501  hitchhiker  0.0000457644 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3317  Beta-xylosidase-like  36.44 
 
 		 1174 aa  504  1e-141  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00018095  hitchhiker  0.000000702951 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0015  alpha-L-arabinofuranosidase B  53.1 
 
 		 707 aa  488  1e-136  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3292  glycoside hydrolase family 43  48.82 
 
 		 488 aa  469  1.0000000000000001e-131  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.223704  hitchhiker  0.00299224 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29390  beta-xylosidase  50.43 
 
 		 494 aa  471  1.0000000000000001e-131  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.838648  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2809  ATPase  47.67 
 
 		 789 aa  452  1e-125  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.153749  decreased coverage  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0639  glycoside hydrolase family protein  46.84 
 
 		 475 aa  443  1e-123  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000370471  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0664  glycoside hydrolase family protein  48.37 
 
 		 476 aa  444  1e-123  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1393  immunoglobulin I-set domain-containing protein  44.49 
 
 		 810 aa  429  1e-119  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0662  glycoside hydrolase family protein  43.76 
 
 		 471 aa  394  1e-108  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000191922  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0637  glycoside hydrolase family protein  43.22 
 
 		 471 aa  391  1e-107  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000622549  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1738  hypothetical protein  44.83 
 
 		 249 aa  197  5.000000000000001e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000000306198  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1729  glycoside hydrolase family 43  28.42 
 
 		 472 aa  183  1e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.101805  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1737  hypothetical protein  41.89 
 
 		 251 aa  180  1e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000179479  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1543  beta-xylosidase  30.32 
 
 		 531 aa  170  1e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.000200892  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0667  LamG domain-containing protein  40 
 
 		 247 aa  156  2e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0642  LamG domain-containing protein  39.57 
 
 		 247 aa  152  3e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000110792  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0638  hypothetical protein  40.09 
 
 		 250 aa  151  5e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000613219  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0666  hypothetical protein  40.54 
 
 		 258 aa  147  7.0000000000000006e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0641  hypothetical protein  40.09 
 
 		 258 aa  145  2e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000324507  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0663  hypothetical protein  39.22 
 
 		 250 aa  145  2e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.351278  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1542  beta-xylosidase  29.37 
 
 		 581 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0510  glycoside hydrolase family 43  28.35 
 
 		 456 aa  127  9e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0180422  hitchhiker  0.00320544 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0640  hypothetical protein  35.62 
 
 		 250 aa  125  4e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000266751  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0665  hypothetical protein  34.7 
 
 		 250 aa  123  1.9999999999999998e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2201  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  30.2 
 
 		 343 aa  94  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2051  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  28.52 
 
 		 357 aa  92  4e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2813  glycoside hydrolase family 43  27.07 
 
 		 331 aa  89.7  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0257715  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2156  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  28.67 
 
 		 352 aa  89  3e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000116592  hitchhiker  0.00999646 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0179  cellulose-binding family II  29.8 
 
 		 598 aa  87.8  8e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00318302 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1995  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  26.8 
 
 		 355 aa  85.9  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000026265  hitchhiker  0.0000968585 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1980  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  30.03 
 
 		 355 aa  85.5  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000532018  hitchhiker  0.000349844 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1390  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  26.09 
 
 		 341 aa  85.5  0.000000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.287204  normal  0.664348 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2082  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  30.03 
 
 		 356 aa  84.7  0.000000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000230744  hitchhiker  0.000000189943 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2732  glycoside hydrolase family 43  29.55 
 
 		 315 aa  84  0.000000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3750  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  27.73 
 
 		 319 aa  82.8  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00407758  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3403  glycoside hydrolase family 43  28.15 
 
 		 357 aa  82.8  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000194853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04520  beta-xylosidase  30.53 
 
 		 491 aa  81.6  0.00000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.130696  normal  0.0670778 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4284  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  28.73 
 
 		 327 aa  79.3  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0786  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  23.63 
 
 		 346 aa  79  0.0000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000141301  normal  0.447167 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2449  glycoside hydrolase family 43  26.93 
 
 		 537 aa  77.4  0.0000000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114761  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4703  glycoside hydrolase family 43  29.41 
 
 		 341 aa  76.3  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.184013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4496  glycoside hydrolase family 43  26.34 
 
 		 503 aa  74.7  0.000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0241272  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1014  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  29.13 
 
 		 472 aa  73.9  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000194163  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0989  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  29.5 
 
 		 334 aa  72.4  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0127699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4996  protein of unknown function DUF1680  29.63 
 
 		 846 aa  67.4  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0569195 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0516  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  27.81 
 
 		 366 aa  65.9  0.000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000112186  decreased coverage  0.000226611 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2392  glycoside hydrolase family 43  25.39 
 
 		 306 aa  65.5  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000540158  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1856  hypothetical protein  29.94 
 
 		 739 aa  64.3  0.000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0763554  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0078  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  32.63 
 
 		 379 aa  64.3  0.000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.144884  normal  0.277265 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1547  S-layer domain protein  42.55 
 
 		 3320 aa  62  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06352  Endo-alpha-1,5-L-arabinanasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AZC8]  23.67 
 
 		 400 aa  59.7  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.605603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6069  LamG domain-containing protein  29.25 
 
 		 739 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0473  glycoside hydrolase family 43  25.35 
 
 		 829 aa  59.3  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.658009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6366  putative transmembrane protein  25.68 
 
 		 739 aa  57.4  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2506  S-layer-like domain-containing protein  26.09 
 
 		 1013 aa  57.4  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1235  Carbohydrate binding family 6  23.59 
 
 		 509 aa  57  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00440741  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03044  Endo-arabinanase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFU2]  26.15 
 
 		 386 aa  56.2  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0628  glycoside hydrolase family 43  24.09 
 
 		 505 aa  56.2  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0700  glycoside hydrolase family 43  24.6 
 
 		 522 aa  55.8  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2423  glycoside hydrolase family 43  26.21 
 
 		 699 aa  55.5  0.000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1982  glycoside hydrolase family protein  25.73 
 
 		 315 aa  54.7  0.000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000010784  normal  0.0338284 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1992  glycoside hydrolase family protein  25.6 
 
 		 315 aa  54.7  0.000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000493506  unclonable  0.0000204974 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2069  glycoside hydrolase family protein  25.24 
 
 		 315 aa  53.5  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000027007  hitchhiker  0.0000035019 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2966  PKD domain containing protein  23.23 
 
 		 531 aa  53.9  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.506413 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0935  glycoside hydrolase family 43  25.2 
 
 		 522 aa  53.9  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2723  glycoside hydrolase family protein  25.76 
 
 		 345 aa  53.1  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.469303  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3011  LamG domain-containing protein  28.92 
 
 		 4761 aa  53.1  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5511  glycoside hydrolase family 43  25 
 
 		 536 aa  53.1  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0274092 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2498  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.95 
 
 		 599 aa  52.4  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.855406 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2143  glycoside hydrolase family 43  28.46 
 
 		 311 aa  52.4  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.209046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1524  glycoside hydrolase family 43  26.14 
 
 		 524 aa  52.4  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10919  hypothetical protein  22.64 
 
 		 383 aa  52  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0280473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1500  glycoside hydrolase family 43  27.02 
 
 		 551 aa  51.6  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.36043 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2915  cell wall/surface repeat protein  26.83 
 
 		 1310 aa  50.8  0.00009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02534  endoarabinanase (Eurofung)  29.03 
 
 		 380 aa  50.4  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01652  putative transmembrane protein  27.8 
 
 		 767 aa  50.8  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.993678  normal  0.0258768 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2196  carbohydrate-binding family 6 protein  25.76 
 
 		 533 aa  50.4  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0191  glycoside hydrolase family protein  27.99 
 
 		 512 aa  50.4  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01459  xylosidase; arabinosidase  25 
 
 		 527 aa  50.8  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.928055  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4088  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  28.11 
 
 		 754 aa  50.8  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6081  glycoside hydrolase family 43  33.33 
 
 		 480 aa  50.8  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4788  Xylan 1,4-beta-xylosidase  26.53 
 
 		 562 aa  49.7  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.771274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0850  hypothetical protein  37.14 
 
 		 428 aa  49.7  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0290611  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1231  Carbohydrate binding family 6  23.13 
 
 		 524 aa  49.3  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0177163  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0455  Carbohydrate binding family 6  21.7 
 
 		 618 aa  49.3  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3213  glycoside hydrolase family 43  22.7 
 
 		 464 aa  49.3  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.331095  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0875  glycoside hydrolase family protein  26.24 
 
 		 636 aa  48.9  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000412559  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0206  glycoside hydrolase family 43  25.56 
 
 		 304 aa  48.5  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  0.253285 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2504  Xylan 1,4-beta-xylosidase  23.85 
 
 		 558 aa  48.5  0.0005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2063  glycoside hydrolase family protein  24.84 
 
 		 311 aa  48.1  0.0006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000284349  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1150  glycoside hydrolase family 43  26.92 
 
 		 560 aa  48.1  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2998  S-layer domain-containing protein  47.06 
 
 		 926 aa  47.8  0.0007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>