92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_2161 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_2086  beta-xylosidase-like protein  65.81 
 
 		 1121 aa  1520    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00280414  decreased coverage  0.0000000469917 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2047  glycoside hydrolase family protein  66.29 
 
 		 1112 aa  1514    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000114958  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1976  glycoside hydrolase family protein  66.44 
 
 		 1121 aa  1536    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00565193  hitchhiker  0.00420486 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2161  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 1143 aa  2329    Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000526501  hitchhiker  0.0000457644 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1999  glycoside hydrolase family protein  66.61 
 
 		 1121 aa  1542    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000101187  decreased coverage  0.0000000170847 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3317  Beta-xylosidase-like  45.28 
 
 		 1174 aa  992    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00018095  hitchhiker  0.000000702951 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2728  hypothetical protein  40.53 
 
 		 848 aa  607  9.999999999999999e-173  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1623  glycoside hydrolase family 43  39.17 
 
 		 804 aa  527  1e-148  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0299424  normal  0.680345 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0015  alpha-L-arabinofuranosidase B  44.38 
 
 		 707 aa  392  1e-107  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0664  glycoside hydrolase family protein  42.42 
 
 		 476 aa  375  1e-102  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0639  glycoside hydrolase family protein  42.23 
 
 		 475 aa  375  1e-102  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000370471  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0662  glycoside hydrolase family protein  41.4 
 
 		 471 aa  370  1e-101  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000191922  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2809  ATPase  40.24 
 
 		 789 aa  370  1e-100  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.153749  decreased coverage  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0637  glycoside hydrolase family protein  41.72 
 
 		 471 aa  368  1e-100  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000622549  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1393  immunoglobulin I-set domain-containing protein  38.2 
 
 		 810 aa  365  2e-99  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3292  glycoside hydrolase family 43  39.92 
 
 		 488 aa  338  1.9999999999999998e-91  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.223704  hitchhiker  0.00299224 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29390  beta-xylosidase  36.07 
 
 		 494 aa  308  4.0000000000000004e-82  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.838648  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1622  glycoside hydrolase family 43  38.12 
 
 		 703 aa  308  4.0000000000000004e-82  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.372812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1729  glycoside hydrolase family 43  29.17 
 
 		 472 aa  199  3e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.101805  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1543  beta-xylosidase  30.98 
 
 		 531 aa  176  1.9999999999999998e-42  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.000200892  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1738  hypothetical protein  43.6 
 
 		 249 aa  175  3.9999999999999995e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000000306198  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1737  hypothetical protein  42.79 
 
 		 251 aa  164  1e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000179479  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0638  hypothetical protein  39.46 
 
 		 250 aa  157  9e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000613219  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1542  beta-xylosidase  29.8 
 
 		 581 aa  150  1.0000000000000001e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0663  hypothetical protein  37.67 
 
 		 250 aa  148  5e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.351278  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0667  LamG domain-containing protein  37.95 
 
 		 247 aa  138  5e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0642  LamG domain-containing protein  36.61 
 
 		 247 aa  137  9.999999999999999e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000110792  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0641  hypothetical protein  35.56 
 
 		 258 aa  132  3e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000324507  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0666  hypothetical protein  34.82 
 
 		 258 aa  129  4.0000000000000003e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0640  hypothetical protein  34.16 
 
 		 250 aa  127  1e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000266751  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0665  hypothetical protein  33.61 
 
 		 250 aa  123  1.9999999999999998e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0510  glycoside hydrolase family 43  24.67 
 
 		 456 aa  91.3  1e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0180422  hitchhiker  0.00320544 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0786  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  25.95 
 
 		 346 aa  87  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000141301  normal  0.447167 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2813  glycoside hydrolase family 43  25.62 
 
 		 331 aa  84  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0257715  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2051  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  26.72 
 
 		 357 aa  84  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2732  glycoside hydrolase family 43  25.92 
 
 		 315 aa  83.6  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1390  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  25.45 
 
 		 341 aa  82  0.00000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.287204  normal  0.664348 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2156  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  25.19 
 
 		 352 aa  79.7  0.0000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000116592  hitchhiker  0.00999646 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2201  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  27.64 
 
 		 343 aa  75.5  0.000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1856  hypothetical protein  27.39 
 
 		 739 aa  74.3  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0763554  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3403  glycoside hydrolase family 43  28.57 
 
 		 357 aa  73.6  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000194853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4703  glycoside hydrolase family 43  23.4 
 
 		 341 aa  72.8  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.184013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2449  glycoside hydrolase family 43  25 
 
 		 537 aa  72.8  0.00000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114761  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03044  Endo-arabinanase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFU2]  27.1 
 
 		 386 aa  72.8  0.00000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4284  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  26.33 
 
 		 327 aa  72  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2082  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  24.24 
 
 		 356 aa  70.5  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000230744  hitchhiker  0.000000189943 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1995  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  24.49 
 
 		 355 aa  70.1  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000026265  hitchhiker  0.0000968585 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1980  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  24.24 
 
 		 355 aa  69.7  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000532018  hitchhiker  0.000349844 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0473  glycoside hydrolase family 43  26.37 
 
 		 829 aa  69.3  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.658009  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0179  cellulose-binding family II  25.53 
 
 		 598 aa  68.9  0.0000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00318302 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2169  LamG domain-containing protein  25.1 
 
 		 4357 aa  62.8  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4496  glycoside hydrolase family 43  26.04 
 
 		 503 aa  62.4  0.00000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0241272  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1547  S-layer domain protein  37.37 
 
 		 3320 aa  61.6  0.00000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04520  beta-xylosidase  28.5 
 
 		 491 aa  60.8  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.130696  normal  0.0670778 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3750  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  23.55 
 
 		 319 aa  60.5  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00407758  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1014  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  34.92 
 
 		 472 aa  59.7  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000194163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2966  PKD domain containing protein  26.51 
 
 		 531 aa  58.9  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.506413 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06352  Endo-alpha-1,5-L-arabinanasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AZC8]  28.16 
 
 		 400 aa  58.9  0.0000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.605603  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6081  glycoside hydrolase family 43  32.03 
 
 		 480 aa  57  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2423  glycoside hydrolase family 43  27.97 
 
 		 699 aa  57.4  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0516  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  25.15 
 
 		 366 aa  55.8  0.000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000112186  decreased coverage  0.000226611 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0989  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  27.92 
 
 		 334 aa  54.7  0.000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0127699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5754  LamG-like jellyroll fold  25.91 
 
 		 741 aa  53.1  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6044  glycoside hydrolase family 43  26.91 
 
 		 501 aa  52.8  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.845022  normal  0.0554344 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1999  LamG domain-containing protein  22.69 
 
 		 3907 aa  53.1  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6119  LamG domain-containing protein  25.91 
 
 		 741 aa  53.1  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.153451 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1990  tail collar domain-containing protein  23.23 
 
 		 865 aa  53.1  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6730  glycoside hydrolase family 43  28.43 
 
 		 323 aa  52.4  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575675  normal  0.920031 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0193  glycoside hydrolase family 43  28.22 
 
 		 324 aa  52.4  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00680352  normal  0.581709 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2866  glycoside hydrolase family 43  21.18 
 
 		 487 aa  52  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.141314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6366  putative transmembrane protein  26.74 
 
 		 739 aa  51.6  0.00009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6601  LamG domain-containing protein  25.84 
 
 		 741 aa  51.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.595168 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2998  S-layer domain-containing protein  52.38 
 
 		 926 aa  50.8  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3011  LamG domain-containing protein  23.08 
 
 		 4761 aa  50.4  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4267  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  22.22 
 
 		 236 aa  50.1  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.958159 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0396  VcfQ-like protein  24.66 
 
 		 1306 aa  49.7  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2506  S-layer-like domain-containing protein  28.88 
 
 		 1013 aa  49.7  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0078  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  27.82 
 
 		 379 aa  49.3  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.144884  normal  0.277265 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6069  LamG domain-containing protein  26.06 
 
 		 739 aa  48.9  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3200  hypothetical protein  25.66 
 
 		 307 aa  48.5  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00274431  normal  0.134727 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2914  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  26.01 
 
 		 1035 aa  48.5  0.0007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1087  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.83 
 
 		 598 aa  48.5  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000962589  normal  0.110672 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4996  protein of unknown function DUF1680  24.32 
 
 		 846 aa  48.1  0.0009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0569195 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5363  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  26.97 
 
 		 265 aa  47.8  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0573653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0850  hypothetical protein  33.08 
 
 		 428 aa  47.8  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0290611  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1017  hypothetical protein  25.76 
 
 		 252 aa  47  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3020  hypothetical protein  54.72 
 
 		 1250 aa  45.8  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.54139  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0810  carbohydrate-binding family 6 protein  26.8 
 
 		 450 aa  45.8  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.034958  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4095  hypothetical protein  30.12 
 
 		 467 aa  45.8  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.375722 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2886  hypothetical protein  30.12 
 
 		 467 aa  45.8  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.742312 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1047  hypothetical protein  24.26 
 
 		 316 aa  45.1  0.008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4088  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  23.81 
 
 		 754 aa  45.1  0.008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>