41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_6119 on replicon NC_008544
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6601  LamG domain-containing protein  97.71 
 
 		 741 aa  1442    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.595168 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5754  LamG-like jellyroll fold  100 
 
 		 741 aa  1519    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6119  LamG domain-containing protein  100 
 
 		 741 aa  1519    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.153451 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4814  putative transmembrane protein  36.65 
 
 		 757 aa  438  1e-121  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01652  putative transmembrane protein  37.87 
 
 		 767 aa  431  1e-119  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.993678  normal  0.0258768 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0704  Fibronectin type III domain protein  37.01 
 
 		 718 aa  412  1e-113  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6069  LamG domain-containing protein  36.43 
 
 		 739 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6366  putative transmembrane protein  36.57 
 
 		 739 aa  398  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07279  GPI anchored protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G01300)  34 
 
 		 387 aa  136  1.9999999999999998e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3959  hypothetical protein  29.59 
 
 		 1066 aa  132  3e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.383952  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3946  hypothetical protein  28.33 
 
 		 555 aa  123  9.999999999999999e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1017  protein of unknown function DUF1080  25.38 
 
 		 786 aa  100  9e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0838366  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2675  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  26.91 
 
 		 834 aa  86.7  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.343316 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0899  hypothetical protein  40 
 
 		 155 aa  79.7  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.606509  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4996  protein of unknown function DUF1680  30.17 
 
 		 846 aa  78.2  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0569195 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2728  hypothetical protein  27.5 
 
 		 848 aa  73.6  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0704  16S rRNA dimethylase  24.68 
 
 		 675 aa  72.8  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0625805 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4617  protein of unknown function DUF1680  26.95 
 
 		 1025 aa  68.6  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0602011  normal  0.370298 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1738  hypothetical protein  28.92 
 
 		 249 aa  60.5  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000000306198  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2506  S-layer-like domain-containing protein  24.59 
 
 		 1013 aa  59.3  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03486  conserved hypothetical protein  26.64 
 
 		 361 aa  56.6  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0641  hypothetical protein  24.63 
 
 		 258 aa  55.1  0.000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000324507  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2161  glycoside hydrolase family protein  25.91 
 
 		 1143 aa  53.1  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000526501  hitchhiker  0.0000457644 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0666  hypothetical protein  24.14 
 
 		 258 aa  52.4  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  26.7 
 
 		 11716 aa  48.1  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2047  glycoside hydrolase family protein  24.72 
 
 		 1112 aa  48.1  0.0006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000114958  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1622  glycoside hydrolase family 43  23.56 
 
 		 703 aa  47.8  0.0007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.372812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3317  Beta-xylosidase-like  35.71 
 
 		 1174 aa  47  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00018095  hitchhiker  0.000000702951 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2124  glycosyl transferase family 51  28.07 
 
 		 934 aa  47  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.563834  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1623  glycoside hydrolase family 43  22.42 
 
 		 804 aa  47  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0299424  normal  0.680345 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3960  hypothetical protein  22 
 
 		 405 aa  46.2  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0698754  normal  0.0204382 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2193  carbohydrate-binding family 6 protein  24.86 
 
 		 948 aa  46.2  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.43679  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1754  hypothetical protein  22 
 
 		 386 aa  46.6  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1543  cellulosome anchoring protein cohesin region  32.29 
 
 		 782 aa  45.8  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000430269  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1976  glycoside hydrolase family protein  24.88 
 
 		 1121 aa  45.8  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00565193  hitchhiker  0.00420486 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2086  beta-xylosidase-like protein  24.88 
 
 		 1121 aa  45.4  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00280414  decreased coverage  0.0000000469917 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2467  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.87 
 
 		 1064 aa  45.1  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1999  glycoside hydrolase family protein  24.4 
 
 		 1121 aa  45.1  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000101187  decreased coverage  0.0000000170847 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0642  LamG domain-containing protein  25.68 
 
 		 247 aa  44.3  0.008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000110792  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0667  LamG domain-containing protein  25.14 
 
 		 247 aa  43.9  0.01  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2966  PKD domain containing protein  23.38 
 
 		 531 aa  43.9  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.506413 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>