84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4814 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0704  Fibronectin type III domain protein  50.37 
 
 		 718 aa  637    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6069  LamG domain-containing protein  57.41 
 
 		 739 aa  811    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01652  putative transmembrane protein  66.27 
 
 		 767 aa  975    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.993678  normal  0.0258768 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4814  putative transmembrane protein  100 
 
 		 757 aa  1543    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6366  putative transmembrane protein  58.49 
 
 		 739 aa  820    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6119  LamG domain-containing protein  36.65 
 
 		 741 aa  436  1e-120  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.153451 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5754  LamG-like jellyroll fold  36.65 
 
 		 741 aa  436  1e-120  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6601  LamG domain-containing protein  36.65 
 
 		 741 aa  432  1e-119  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.595168 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07279  GPI anchored protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G01300)  42.08 
 
 		 387 aa  260  6e-68  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3946  hypothetical protein  39.8 
 
 		 555 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4996  protein of unknown function DUF1680  45.79 
 
 		 846 aa  166  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0569195 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3959  hypothetical protein  32.24 
 
 		 1066 aa  164  7e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.383952  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0899  hypothetical protein  52.41 
 
 		 155 aa  143  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.606509  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2675  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  28.61 
 
 		 834 aa  136  9.999999999999999e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.343316 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2506  S-layer-like domain-containing protein  38.03 
 
 		 1013 aa  112  3e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1017  protein of unknown function DUF1080  27.25 
 
 		 786 aa  107  8e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0838366  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0704  16S rRNA dimethylase  26.14 
 
 		 675 aa  95.9  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0625805 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03486  conserved hypothetical protein  27.19 
 
 		 361 aa  89.7  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01850  Ig-like domain-containing protein  33.33 
 
 		 1323 aa  88.6  4e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.854355  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1859  protein of unknown function DUF1680  33.33 
 
 		 736 aa  86.7  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4617  protein of unknown function DUF1680  28.49 
 
 		 1025 aa  74.7  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0602011  normal  0.370298 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3960  hypothetical protein  26.54 
 
 		 405 aa  73.6  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0698754  normal  0.0204382 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1754  hypothetical protein  24.3 
 
 		 386 aa  72.4  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3385  hypothetical protein  28.38 
 
 		 1931 aa  71.2  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.807986 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1543  cellulosome anchoring protein cohesin region  49.43 
 
 		 782 aa  67.8  0.0000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000430269  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1856  hypothetical protein  30.59 
 
 		 739 aa  67.4  0.0000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0763554  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1047  hypothetical protein  26.19 
 
 		 316 aa  63.5  0.00000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1017  hypothetical protein  25.85 
 
 		 252 aa  63.5  0.00000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3011  LamG domain-containing protein  29.65 
 
 		 4761 aa  62.8  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1781  alpha amylase, catalytic region  45.74 
 
 		 1847 aa  61.6  0.00000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.238609  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2469  fibronectin, type III  29.57 
 
 		 3507 aa  61.2  0.00000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2728  hypothetical protein  26.56 
 
 		 848 aa  60.1  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14310  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  28.7 
 
 		 864 aa  59.7  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2467  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  28.57 
 
 		 1064 aa  60.1  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2755  hypothetical protein  33.65 
 
 		 564 aa  58.2  0.0000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2169  LamG domain-containing protein  28.74 
 
 		 4357 aa  57.8  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1976  hypothetical protein  26.76 
 
 		 1367 aa  57.4  0.0000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.000800417  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3263  VcfQ-like protein  30.83 
 
 		 1072 aa  57  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0574  fibronectin, type III domain-containing protein  28.34 
 
 		 4433 aa  56.6  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2327  alpha amylase catalytic region  38.46 
 
 		 1401 aa  55.1  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.775797  normal  0.294215 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1919  Chitinase-like protein  40 
 
 		 680 aa  55.5  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1773  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  28.38 
 
 		 288 aa  54.7  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.327647  normal  0.115704 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1622  glycoside hydrolase family 43  28.1 
 
 		 703 aa  53.5  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.372812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2193  carbohydrate-binding family 6 protein  31.45 
 
 		 948 aa  52.8  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.43679  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1747  hypothetical protein  40 
 
 		 1139 aa  52.4  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000564232 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0640  hypothetical protein  29.02 
 
 		 250 aa  52.8  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000266751  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  30.14 
 
 		 3027 aa  52  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2452  alpha amylase, catalytic region  38.35 
 
 		 1401 aa  52  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0187956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2278  alpha amylase catalytic region  36.15 
 
 		 1307 aa  51.2  0.00006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.792883  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3704  PA14 domain protein  27.73 
 
 		 2334 aa  50.4  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.205023 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2131  Laminin G sub domain 2  28.15 
 
 		 981 aa  50.1  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4267  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  27.63 
 
 		 236 aa  49.7  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.958159 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3317  Beta-xylosidase-like  27.41 
 
 		 1174 aa  50.1  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00018095  hitchhiker  0.000000702951 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0641  hypothetical protein  25.83 
 
 		 258 aa  48.9  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000324507  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4562  hypothetical protein  24.37 
 
 		 1576 aa  49.3  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1737  hypothetical protein  26.12 
 
 		 251 aa  48.9  0.0004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000179479  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0793  hypothetical protein  26.79 
 
 		 255 aa  48.9  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.748318 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0665  hypothetical protein  28.76 
 
 		 250 aa  48.9  0.0004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0083  LamG domain-containing protein  25.7 
 
 		 430 aa  48.5  0.0005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1189  regulator of chromosome condensation, RCC1  26.79 
 
 		 1679 aa  48.1  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0293  hypothetical protein  24.31 
 
 		 1260 aa  47.8  0.0007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00245165  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0642  LamG domain-containing protein  25.11 
 
 		 247 aa  47.8  0.0008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000110792  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  25.97 
 
 		 11716 aa  47.8  0.0008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0327  Peptidase S53 propeptide  39.05 
 
 		 1199 aa  47.8  0.0008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0684029  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3023  endoglucanase-like  36.59 
 
 		 869 aa  47.8  0.0009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0367  VCBS  26.47 
 
 		 6678 aa  47.4  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.410615 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0638  hypothetical protein  26.83 
 
 		 250 aa  47  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000613219  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1625  hypothetical protein  24.65 
 
 		 354 aa  46.6  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04160  beta-1,3-glucanase  34.41 
 
 		 1067 aa  46.6  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0396  VcfQ-like protein  27.95 
 
 		 1306 aa  46.2  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0666  hypothetical protein  26.79 
 
 		 258 aa  46.6  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2022  fibronectin, type III domain-containing protein  42.22 
 
 		 683 aa  46.6  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00638663  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6157  Fibronectin type III domain protein  32.31 
 
 		 918 aa  45.8  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.622603  normal  0.669224 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4289  glycoside hydrolase family 5  35.56 
 
 		 717 aa  45.8  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.162807  normal  0.0359435 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1334  protein of unknown function DUF1549  24.61 
 
 		 1068 aa  45.8  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0667  LamG domain-containing protein  24.68 
 
 		 247 aa  45.8  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2915  cell wall/surface repeat protein  27.27 
 
 		 1310 aa  45.4  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7437  hypothetical protein  26.29 
 
 		 1101 aa  45.4  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4870  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  27.27 
 
 		 1147 aa  45.1  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000290642  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2914  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  29.38 
 
 		 1035 aa  44.3  0.007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0642  Fibronectin type III domain protein  40.45 
 
 		 692 aa  44.3  0.007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.022056  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2261  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  35.16 
 
 		 647 aa  44.7  0.007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00906111  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2760  hypothetical protein  27.8 
 
 		 385 aa  44.3  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.120597 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1051  endoglucanase-related protein  26.51 
 
 		 1295 aa  44.3  0.008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.222685 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>