53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1334 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1046  protein of unknown function DUF1549  47.44 
 
 		 1066 aa  981    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0815  hypothetical protein  43.26 
 
 		 1074 aa  860    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5932  protein of unknown function DUF1549  51.99 
 
 		 1182 aa  687    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.453716  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0517  protein of unknown function DUF1549  39.62 
 
 		 1063 aa  733    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0333  protein of unknown function DUF1549  49.12 
 
 		 1074 aa  998    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0087202 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0378  protein of unknown function DUF1549  39.02 
 
 		 1067 aa  737    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00109161  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1334  protein of unknown function DUF1549  100 
 
 		 1068 aa  2226    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2950  protein of unknown function DUF1549  39.94 
 
 		 1046 aa  726    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.798695  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2203  protein of unknown function DUF1549  45.82 
 
 		 1091 aa  944    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1595  protein of unknown function DUF1549  57.3 
 
 		 765 aa  442  9.999999999999999e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.599315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0959  protein of unknown function DUF1549  59.35 
 
 		 776 aa  436  1e-120  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.185846 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1978  protein of unknown function DUF1549  54.75 
 
 		 772 aa  417  9.999999999999999e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.558738  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3229  protein of unknown function DUF1549  45.18 
 
 		 1171 aa  343  7e-93  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1796  protein of unknown function DUF1549  48.82 
 
 		 1013 aa  339  1.9999999999999998e-91  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3702  protein of unknown function DUF1549  47.13 
 
 		 922 aa  321  5e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5453  protein of unknown function DUF1549  47.52 
 
 		 924 aa  317  6e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.996886  normal  0.769679 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2715  protein of unknown function DUF1549  46.2 
 
 		 911 aa  309  2.0000000000000002e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.328097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4084  protein of unknown function DUF1549  45.69 
 
 		 917 aa  307  8.000000000000001e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0328965  normal  0.233316 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1526  protein of unknown function DUF1549  39.95 
 
 		 888 aa  286  2.0000000000000002e-75  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.093283  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3921  protein of unknown function DUF1549  40.79 
 
 		 1097 aa  250  1e-64  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3131  protein of unknown function DUF1549  48.95 
 
 		 792 aa  236  2.0000000000000002e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0775  protein of unknown function DUF1549  34.11 
 
 		 883 aa  232  3e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.68888  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2165  protein of unknown function DUF1549  36.52 
 
 		 963 aa  231  5e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0575  hypothetical protein  45.31 
 
 		 782 aa  220  1e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2794  protein of unknown function DUF1549  38.98 
 
 		 1129 aa  213  1e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0191241  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1739  protein of unknown function DUF1549  35.06 
 
 		 805 aa  212  3e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3816  protein of unknown function DUF1549  33.77 
 
 		 984 aa  205  3e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1890  protein of unknown function DUF1549  32.1 
 
 		 922 aa  198  4.0000000000000005e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1120  protein of unknown function DUF1549  30.52 
 
 		 841 aa  124  9.999999999999999e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0957  protein of unknown function DUF1549  31.04 
 
 		 785 aa  122  3.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.244644 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1040  protein of unknown function DUF1549  30.86 
 
 		 768 aa  114  9e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0289706  normal  0.181219 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3971  protein of unknown function DUF1549  26.3 
 
 		 759 aa  99.4  3e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1151  protein of unknown function DUF1549  29.95 
 
 		 1737 aa  95.1  6e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3719  protein of unknown function DUF1549  27.11 
 
 		 725 aa  89.7  3e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4094  protein of unknown function DUF1549  26.89 
 
 		 998 aa  85.5  0.000000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0525  protein of unknown function DUF1549  26.29 
 
 		 893 aa  84.7  0.000000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.491399  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1450  protein of unknown function DUF1549  26.17 
 
 		 833 aa  84.7  0.000000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2090  protein of unknown function DUF1549  26.29 
 
 		 1178 aa  80.1  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0353884  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1727  protein of unknown function DUF1549  27.09 
 
 		 565 aa  76.3  0.000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0522  protein of unknown function DUF1549  24.4 
 
 		 626 aa  67  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1826  protein of unknown function DUF1549  24.49 
 
 		 562 aa  58.9  0.0000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.353964  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2184  Planctomycete cytochrome C  29.27 
 
 		 646 aa  55.8  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2712  hypothetical protein  37.37 
 
 		 468 aa  54.7  0.000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3699  hypothetical protein  36.36 
 
 		 503 aa  53.1  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.478102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1976  Planctomycete cytochrome C  34.31 
 
 		 724 aa  52.4  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.187596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5931  Leucine-rich repeat, ribonuclease inhibitor subtype  37 
 
 		 507 aa  50.8  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0299  Planctomycete cytochrome C  30.85 
 
 		 147 aa  50.1  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1624  hypothetical protein  29.17 
 
 		 646 aa  49.7  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0141  hypothetical protein  40 
 
 		 251 aa  49.3  0.0004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1925  triple helix repeat-containing collagen  24.46 
 
 		 492 aa  48.9  0.0005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3685  triple helix repeat-containing collagen  24.46 
 
 		 493 aa  48.5  0.0007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0574  fibronectin, type III domain-containing protein  35.87 
 
 		 4433 aa  47.8  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4814  putative transmembrane protein  24.61 
 
 		 757 aa  46.2  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>