60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4267 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4267  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  100 
 
 		 236 aa  490  1e-137  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.958159 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4268  hypothetical protein  35.56 
 
 		 313 aa  112  4.0000000000000004e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.963406 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4794  hypothetical protein  31.49 
 
 		 429 aa  104  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0109518 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3200  hypothetical protein  29.07 
 
 		 307 aa  75.1  0.0000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00274431  normal  0.134727 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2755  hypothetical protein  30.74 
 
 		 564 aa  68.9  0.00000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1189  regulator of chromosome condensation, RCC1  27.52 
 
 		 1679 aa  68.6  0.00000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1737  hypothetical protein  23.23 
 
 		 251 aa  65.1  0.0000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000179479  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0641  hypothetical protein  25.19 
 
 		 258 aa  64.3  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000324507  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0667  LamG domain-containing protein  23.44 
 
 		 247 aa  63.9  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1112  LamG domain-containing protein  28.27 
 
 		 471 aa  63.5  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4996  protein of unknown function DUF1680  33.64 
 
 		 846 aa  63.5  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0569195 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0642  LamG domain-containing protein  25.11 
 
 		 247 aa  63.5  0.000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000110792  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0666  hypothetical protein  24.8 
 
 		 258 aa  61.6  0.000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2966  PKD domain containing protein  26.1 
 
 		 531 aa  58.2  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.506413 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1738  hypothetical protein  25.29 
 
 		 249 aa  57.4  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000000306198  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0083  LamG domain-containing protein  28.04 
 
 		 430 aa  56.6  0.0000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0638  hypothetical protein  25.49 
 
 		 250 aa  55.8  0.0000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000613219  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3263  VcfQ-like protein  25.24 
 
 		 1072 aa  55.5  0.0000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1017  hypothetical protein  42.35 
 
 		 252 aa  55.1  0.0000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6366  putative transmembrane protein  29.56 
 
 		 739 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1047  hypothetical protein  28.31 
 
 		 316 aa  53.9  0.000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0665  hypothetical protein  22.85 
 
 		 250 aa  53.5  0.000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2915  cell wall/surface repeat protein  25.42 
 
 		 1310 aa  53.5  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1990  tail collar domain-containing protein  28.43 
 
 		 865 aa  53.1  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0663  hypothetical protein  25.97 
 
 		 250 aa  52.8  0.000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.351278  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0890  PKD domain containing protein  32.91 
 
 		 2066 aa  52  0.000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0241772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0640  hypothetical protein  23.22 
 
 		 250 aa  52  0.000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000266751  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2131  Laminin G sub domain 2  27.45 
 
 		 981 aa  51.2  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6069  LamG domain-containing protein  28.22 
 
 		 739 aa  51.2  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14310  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  25.43 
 
 		 864 aa  49.7  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4814  putative transmembrane protein  27.63 
 
 		 757 aa  49.7  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2974  metallophosphoesterase  27.86 
 
 		 643 aa  49.7  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.668826  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3385  hypothetical protein  30.68 
 
 		 1931 aa  49.3  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.807986 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1999  LamG domain-containing protein  29.57 
 
 		 3907 aa  48.5  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2169  LamG domain-containing protein  30.19 
 
 		 4357 aa  48.1  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1146  hypothetical protein  28.1 
 
 		 1504 aa  47.8  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1976  glycoside hydrolase family protein  24.79 
 
 		 1121 aa  47.4  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00565193  hitchhiker  0.00420486 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2161  glycoside hydrolase family protein  22.86 
 
 		 1143 aa  47.8  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000526501  hitchhiker  0.0000457644 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0396  VcfQ-like protein  25.32 
 
 		 1306 aa  47  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0201  laminin G, domain-containing 2  28.49 
 
 		 793 aa  46.6  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.317242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1976  hypothetical protein  29.27 
 
 		 1367 aa  45.8  0.0005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.000800417  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4562  hypothetical protein  22.71 
 
 		 1576 aa  45.8  0.0006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1999  glycoside hydrolase family protein  24.36 
 
 		 1121 aa  45.8  0.0006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000101187  decreased coverage  0.0000000170847 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.65 
 
 		 11716 aa  45.8  0.0006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3011  LamG domain-containing protein  27.55 
 
 		 4761 aa  45.4  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2086  beta-xylosidase-like protein  25 
 
 		 1121 aa  45.4  0.0008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00280414  decreased coverage  0.0000000469917 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3871  laminin G, domain-containing 2  29.93 
 
 		 1159 aa  43.5  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2728  hypothetical protein  26.13 
 
 		 848 aa  43.5  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1932  outer membrane protein  23.79 
 
 		 424 aa  42.7  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.259358 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5918  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  26.71 
 
 		 306 aa  42.7  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.521345 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3504  hypothetical protein  29.87 
 
 		 1164 aa  42.4  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0997  PKD domain containing protein  29.63 
 
 		 1150 aa  42.4  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.014339 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0574  fibronectin, type III domain-containing protein  36.05 
 
 		 4433 aa  42  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1692  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  33.33 
 
 		 523 aa  42.4  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.363459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0333  protein of unknown function DUF1549  22.98 
 
 		 1074 aa  42.4  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0087202 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2047  glycoside hydrolase family protein  22.41 
 
 		 1112 aa  42  0.008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000114958  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02880  PDK repeat-containing protein  30.68 
 
 		 1916 aa  42  0.008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0294  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  23.04 
 
 		 1967 aa  42  0.008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.630839  hitchhiker  0.000980746 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0368  Ricin B lectin  29.33 
 
 		 1577 aa  42  0.009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.18771  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2469  fibronectin, type III  33.77 
 
 		 3507 aa  42  0.009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>