35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5918 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_5918  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  100 
 
 		 306 aa  612  9.999999999999999e-175  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.521345 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1123  LamG domain-containing protein  28.3 
 
 		 318 aa  84  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.156274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0367  VCBS  34.02 
 
 		 6678 aa  82  0.00000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.410615 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3963  LamG domain-containing protein  30.19 
 
 		 309 aa  79  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.308542  normal  0.276199 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1124  LamG domain-containing protein  28.35 
 
 		 369 aa  77.8  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.615457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3964  LamG domain-containing protein  28.3 
 
 		 364 aa  72.8  0.000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.278047 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1461  hypothetical protein  31.96 
 
 		 786 aa  71.2  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.132626 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  32.42 
 
 		 11716 aa  70.1  0.00000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1999  LamG domain-containing protein  28.74 
 
 		 3907 aa  68.2  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3962  laminin G  30.16 
 
 		 401 aa  66.2  0.0000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.278975 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0170  outer membrane adhesin like proteiin  26.84 
 
 		 3699 aa  64.3  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.388732 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4189  Ig family protein  27.1 
 
 		 2503 aa  64.3  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2928  hypothetical protein  34.96 
 
 		 678 aa  62.8  0.000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.000841145  normal  0.163305 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1016  thrombospondin type 3 repeat-containing protein  28.5 
 
 		 1265 aa  62.8  0.000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0201  laminin G, domain-containing 2  31.19 
 
 		 793 aa  62.4  0.000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.317242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0166  putative outer membrane adhesin like proteiin  26.41 
 
 		 3699 aa  62  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3871  laminin G, domain-containing 2  30 
 
 		 1159 aa  62  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2169  LamG domain-containing protein  31.95 
 
 		 4357 aa  60.8  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1122  laminin G  28.74 
 
 		 406 aa  60.1  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4731  hypothetical protein  32.04 
 
 		 2223 aa  56.2  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1960  two component regulator propeller domain-containing protein  26.29 
 
 		 2374 aa  52.4  0.000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3169  LamG domain-containing protein  30.43 
 
 		 339 aa  52.4  0.000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0682  Fibronectin type III domain protein  26.8 
 
 		 1735 aa  52  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14743  predicted protein  52.08 
 
 		 1900 aa  49.3  0.00007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0619314 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0515  hypothetical protein  29.46 
 
 		 283 aa  49.3  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3504  hypothetical protein  27.75 
 
 		 1164 aa  48.5  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0293  hypothetical protein  31.85 
 
 		 1260 aa  48.9  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00245165  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1620  patatin  24.4 
 
 		 686 aa  47.4  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.128083  normal  0.0419711 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3011  LamG domain-containing protein  34.15 
 
 		 4761 aa  45.4  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4267  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  24.28 
 
 		 236 aa  45.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.958159 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2506  S-layer-like domain-containing protein  27.89 
 
 		 1013 aa  45.1  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2755  hypothetical protein  30.84 
 
 		 564 aa  43.5  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7437  hypothetical protein  28.14 
 
 		 1101 aa  43.9  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0806  hypothetical protein  24.74 
 
 		 1107 aa  42.4  0.01  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0805  hypothetical protein  24.57 
 
 		 202 aa  42.4  0.01  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>